hsa ------UUUACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGACACUAGGACCAUGUCUUGGUUUUUGCAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAAAGUAACAGCA miRbase UCSC ENSEMBL 3:186504461-186504566(+) -34.4 .....((((((((......(((.(((((..((((((((.((((((((...)))))))).)))))))).....))))).)))....))))))))............. ptr -------UUACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGACACUAGGACCAUGUCUUGGUUUUUGCAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAAAGUAACAGCA miRbase UCSC ENSEMBL 3:192369084-192369188(+) -34.4 ....((((((((......(((.(((((..((((((((.((((((((...)))))))).)))))))).....))))).)))....))))))))............. ggo ------UUUACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGACACUAGGACCAUGUCUUGGUUUUUGCAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAAAGUAACAGCA ENSEMBL 3:188572600-188572706(+) -34.4 .....((((((((......(((.(((((..((((((((.((((((((...)))))))).)))))))).....))))).)))....))))))))............. ppy ------UUUACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGACACUAGGACCAUGUCUUGGUUUUUGCAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAAAGUAACAGCA miRbase UCSC ENSEMBL 3:190576400-190576505(+) -34.4 .....((((((((......(((.(((((..((((((((.((((((((...)))))))).)))))))).....))))).)))....))))))))............. mml ------UUUACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGACACUAGGACUAUGUCUUGGUUUUUGCAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAAAGUAACAGCA UCSC ENSEMBL 2:179144219-179144325(+) -34.4 .....((((((((......(((.(((((..((((((((.((((((((...)))))))).)))))))).....))))).)))....))))))))............. cja ----------CCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGAUACUAGGACUGUAUCUUGGUUUUUGCAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAAAGUAACAGCA ENSEMBL Contig47:9930606-9930708(-) -32.6 .((((((((......(((.(((((..((((((((.(((((((.....))))))).)))))))).....))))).)))....))))))))............. tsy --------UACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGAAACUAAGA--CCAUCUUGGUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAAAGUAAC---- ENSEMBL GeneScaffold_5302:19746-19844(+) -33.8 ...((((((((......(((.(((((..(((((((((((((((.....))))))))))))))).....))))).)))....))))))))......... mmr ------UUUACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUACAGAAACUAGGACCAUGUCUUGGUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAGGAAGAAAAGUAAC---- ENSEMBL GeneScaffold_1243:81066-81168(+) -35.6 .....((((((((......(((.(((((..(((((((((((((((((...))))))))))))))))).....))))).)))....))))))))......... oga -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tbe ------UUUACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUAUAGAAACUAGGACUGUGUCUUGGUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAA----------- ENSEMBL GeneScaffold_1479:44237-44332(+) -34.0 .....((((((((......(((.(((((..(((((((((((((((((...))))))))))))))))).....))))).)))....)))))))).. cpo ------UUUACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGAAACUAGGAUCAUGUCUUGGUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAAAGUAAC---- UCSC ENSEMBL scaffold_7:51730941-51731043(+) -34.6 .....((((((((......(((.(((((..(((((((((((((((((...))))))))))))))))).....))))).)))....))))))))......... dor UGGAGAAAAACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAUAAUUGCAGAAACUUGAAUCCUGUUUUGGUUUCUGUAGUAAUGCUAGUGAAAGGAAAGUAUCUGCAGAG----------- ENSEMBL GeneScaffold_4008:306716-306819(-) -28.2 ((.(((...((.(((((.......(((((.((.((.((((((((((((.((((...)))).)))))))))))).)))))))))..))))).)).))).))... mmu ---------ACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGGAACUAAGAUUCUAUCUUGGUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAAAGUAAC---- UCSC ENSEMBL 16:23110829-23110928(+) -34.2 ..((((((((......(((.(((((..(((((((((((((((((...))))))))))))))))).....))))).)))....))))))))......... rno ------UUUACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUACAGGAACUAGGAUUAUAUCUUGGUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAGAGUAAC---- UCSC ENSEMBL 11:79954124-79954226(-) -33.9 .....((((((((......(((.(((((..(((((((((((((((((...))))))))))))))))).....))))).)))....))))))))......... str ------UUUACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGAAGCUAGGAUCAUAUCUUGGUUUUUGCAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAAAUUAAC---- ENSEMBL GeneScaffold_739:82018-82120(+) -36.3 .....((((((((......(((.(((((..(((((((((((((((((...))))))))))))))))).....))))).)))....))))))))......... opr ---------ACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUACAGAAACUGGGACCAUGUCUUGGUUUCUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAGGAAGAAAAG-------- ENSEMBL scaffold_3458:141092-141187(-) -38.0 ..((((((((......(((.(((((..(((((((((((..((((...))))..))))))))))).....))))).)))....))))))))..... ocu ---------ACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGAAACUAGGACCAUGUCUUGGUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAGAGUAAC---- ENSEMBL scaffold_6:16623809-16623908(+) -35.9 ..((((((((......(((.(((((..(((((((((((((((((...))))))))))))))))).....))))).)))....))))))))......... bta ------UUUACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUACAGAAACCAAGAU--AGCCUUGGUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAUUACACAAGAAGAA----------- UCSC ENSEMBL 1:82287572-82287666(-) -38.8 .....((((((((.(((..(((.(((((..(((((((((((((((.....))))))))))))))).....))))).))).))).)))))))).. ttr -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- vpa ------UUUACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUAUAGAAACUAGGAUCACAUCUUGGUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAGAGUAAC---- ENSEMBL GeneScaffold_451:227126-227228(+) -32.4 .....((((((((......(((.(((((..(((((((((((((((((...))))))))))))))))).....))))).)))....))))))))......... ssc ---------ACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUACAGAAACUAGGAUCACAUCUUGGUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAGAGUAAC---- ENSEMBL 13:94184153-94184252(+) -34.3 ..((((((((......(((.(((((..(((((((((((((((((...))))))))))))))))).....))))).)))....))))))))......... cfa ---------ACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGAAACUAGGAU--UGCCUUAGUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAAAGUAAC---- UCSC ENSEMBL 34:22366351-22366448(+) -33.2 ..((((((((......(((.(((((..(((((((((((((((.....))))))))))))))).....))))).)))....))))))))......... fca -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- eca ---------UCCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGAAACUAGGAUCACUUCUUGGUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAA---------- miRbase UCSC ENSEMBL 19:24793833-24793925(+) -34.9 ..((((((((......(((.(((((..((((((((((((((((.....)))))))))))))))).....))))).)))....))))))))... mlu --------UACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGAAACUAGGAUCACAUCUUGGUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAAAGUAAC---- ENSEMBL GeneScaffold_5017:110024-110124(-) -34.3 ...((((((((......(((.(((((..(((((((((((((((((...))))))))))))))))).....))))).)))....))))))))......... pva ---------ACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGAAACUAGGAUUACAUCUUGGUCUUUGUGAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAAAGUAAC---- ENSEMBL GeneScaffold_1008:50738-50837(+) -30.3 ..((((((((......(((.(((((..((..((((.((((((((...)))))))).))))..)).....))))).)))....))))))))......... eeu ----------CCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUACAGAAACUUUGAUUUCAUCUUGGUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAAAGUA------ ENSEMBL GeneScaffold_5582:1090-1186(+) -30.3 .((((((((......(((.(((((..((((((((((((..(((...)))..)))))))))))).....))))).)))....))))))))....... sar --------UACCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGAAACCAGGAAUACAUCUUGGUUUUUGCAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAAGAAGAAAAGUAAC---- ENSEMBL GeneScaffold_4540:21932-22032(+) -38.4 ...((((((((......(((.(((((..((((((((((((((((.....)))))))))))))))).....))))).)))....))))))))......... cho ----------CCUUCUUGUAA--AAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGAAACUAGGACCAUUUCUUAGUUUUUGUGAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAGGAAGAAAAGUAA----- ENSEMBL GeneScaffold_5097:7190-7287(+) -33.5 .((((((((......(((.(((((..((..((((((((((((.....))))))))))))..)).....))))).)))....))))))))........ ete ----------CCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUACAGAAACUGGGGCACUGUCUUGGUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAGGAAG------------- ENSEMBL scaffold_313097:39074-39163(-) -33.7 .((((((((......(((.(((((..(((((((((((..((((...))))..))))))))))).....))))).)))....)))))))) laf ----------CCUUCUUGUAU--AAGCACUGUGCUAAAAUUACAGAAACGAGGACUGUGUCUUGGUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-AGAGUAC-ACACAGGAAGAAAAGUAAC---- ENSEMBL scaffold_25:7275204-7275302(+) -33.5 .((((((((......(((.(((((..(((((((((((.(((((...))))).))))))))))).....))))).)))....))))))))......... pca -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- meu ------UUUACCUUCUUGUUUGAAAGCACUGUGCUAAAAUUGCAGAAAUUAAGGCCAUGUCUUGUUUUUUGUAAUAAUGCUAGC-ACAGUAU-AUACAAGAAGAA----------- ENSEMBL GeneScaffold_6359:19147-19244(+) -33.0 .....((((((((........(((((((((..((((((((((.((((((...)))))).)))))))))).....)))))))))....)))))))).. mdo ---------ACCUUCUUGUUUCAAAGCACUGUGCUAAAAUUGCAAAAAUUAAGGCAAUGCCUUGGUCUUUGUAAUAAUGCUAGC-ACAGUAU-AUACAAGAAGAA----------- UCSC ENSEMBL 7:206770107-206770201(-) -35.7 ..((((((((........(((((((((..((((((((.((((((((...)))))))).)))))))).....)))))))))....)))))))).. oan -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- gga ----------CCUUCUUGUCA--AAGCACUGUGCUAAAAUUACAGAAGCUGAGGCUGAGCUUUGGGUUCUGUAAUAAUGCUAGU-AGAGUAC-ACGCAAGAAGAA----------- UCSC ENSEMBL 9:17298783-17298874(+) -33.5 .((((((((......(((.(((((..(((((((((.(((((((...))))))).))))))))).....))))).)))....)))))))).. mga ---------ACCUUCUUGUUA--AAGCACUGUGCUAAAAUUACGGAAACUGAGGCUGAGCUUUGGUUUCUGUAAUAAUGCUAGU-AGAGUAC-ACGCAAGAAGAA----------- UCSC ENSEMBL 11:16562337-16562429(+) -35.3 ..((((((((......(((.(((((..(((((((((((..((((...))))..))))))))))).....))))).)))....)))))))).. tgu -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- aca -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- xtr -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dre -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- gac -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ola -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tru -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tni -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cin -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ********* ************* **** ** * ** ********* * ** * * ** ********* ****************** ** * ** ** * ** ********** * **** * ** ***** ********* ****************** **** ** * ******* ** *********** * **** * *** ****** ********* * ****************** **** *** * ******** ** ************ ****** ***** ****** *********** ****************** **** *** * *********** ************ ******* ***** ****** *********** ****************** **** *** ** ************ ************ ******* ***** ****** *********** ****************** ********* ** ************ ************ ******* ************ ************ ****************** ********* ** ************ ************ ******* ************ ************ ****************** ************ ************************* ******* ************ ************ ****************** ************ ************************* ******* ************ * ************ ****************** ************ ************************* ******* ************ **** ************ ****************** ************ * ************************* ******* ************ ***** ************ ******************************* ** ************************* ******* ******************* ************ ******************************* **************************** ******* ******************* ************ ******************************* **************************** ******* ******************* ************ ******************************** **************************** ******* ******************* ************* ************************************************************* ******* ******************* ************* ************************************************************* ******* ******************* ************* ************************************************************* ******* ******************* ************** ************************************************************* ******* ******************* *************** ************************************************************* ******* ******************* *************** ************************************************************* ******* ******************* *************** ************************************************************* ******* ******************* *************** ************************************************************* ******* ******************* *************** ************************************************************* ******* ******************* *************** ************************************************************* ******* ******************* *************** ************************************************************* ******* *********************** *************** ************************************************************* ******* *********************** *************** ************************************************************* ******* *********************** *************** ************************************************************* ******* *********************** *************** ************************************************************** ******* *********************** ********************************************************************************************************************