hsa -------UGAGCUGUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGCUGCUUC----- miRbase UCSC ENSEMBL 2:136422967-136423048(+)           -35.9         .((((.((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...)))))).)))).        
ptr -------UGAGCUGUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGCUGCUUC----- miRbase UCSC ENSEMBL 2b:139835031-139835112(+)          -35.9         .((((.((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...)))))).)))).        
ggo -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL 2b:22829388-22829458(+)            -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
ppy -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------         UCSC ENSEMBL 2b:24605747-24605817(+)            -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
mml -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------         UCSC ENSEMBL 13:116513194-116513264(-)          -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
cja -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL Contig22:2829791-2829861(+)        -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
tsy -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL GeneScaffold_370:85073-85143(+)    -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
mmr --------------------------------------------------------------------------------------------------                      
oga -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL GeneScaffold_242:181504-181574(+)  -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
tbe -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL GeneScaffold_228:301290-301360(+)  -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
cpo -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------         UCSC ENSEMBL scaffold_3:51243714-51243784(-)    -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
dor -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL GeneScaffold_287:62328-62398(+)    -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
mmu -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC----------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:130098938-130099007(+)           -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
rno -------UGAGCUGUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGCUGCUUC----- miRbase UCSC ENSEMBL 13:40907575-40907656(+)            -35.9         .((((.((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...)))))).)))).        
str -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--CUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL GeneScaffold_245:85392-85462(+)    -28.5               ((((((...(((((((...((((((..((((((......))))))))))))...)))))))...))))))              
opr -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL GeneScaffold_179:95122-95192(+)    -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
ocu -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL scaffold_1:67892969-67893039(-)    -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
bta -------UGAGCUGUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGCUGCUUC----- miRbase UCSC ENSEMBL 2:64640134-64640215(-)             -35.9         .((((.((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...)))))).)))).        
ttr -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL GeneScaffold_1083:421053-421123(+) -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
vpa -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL GeneScaffold_156:100334-100404(+)  -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
ssc -------UGAGCUGUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGCUGCUUC----- miRbase      ENSEMBL 15:14550874-14550955(-)            -35.9         .((((.((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...)))))).)))).        
cfa ---------------------CGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUU------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 19:41456811-41456866(+)            -25.2                      .(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...                     
fca -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL scaffold_159684:641-711(+)         -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
eca --------------------------------------------------------------------------------------------------                      
mlu -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL GeneScaffold_257:168095-168165(+)  -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
pva -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL GeneScaffold_1229:319316-319386(+) -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
eeu -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL GeneScaffold_387:55434-55504(+)    -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
sar -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUCCA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL GeneScaffold_6156:161451-161521(+) -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
cho -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUUUCAGCU----------              ENSEMBL scaffold_188317:3409-3481(+)       -30.2              ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))....)))))).             
ete -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL GeneScaffold_353:227028-227098(+)  -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
laf -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--CUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL scaffold_3:94543299-94543369(-)    -28.5               ((((((...(((((((...((((((..((((((......))))))))))))...)))))))...))))))              
pca -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--CUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL GeneScaffold_351:76622-76692(+)    -28.5               ((((((...(((((((...((((((..((((((......))))))))))))...)))))))...))))))              
meu -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------              ENSEMBL GeneScaffold_468:48486-48556(+)    -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
mdo -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAGCACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------         UCSC ENSEMBL 4:132653238-132653308(+)           -29.7               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
oan -------------GCUGGAUUCGGGGCCGAUACACGGUCUGAGGGG--UUUACG-AGUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGUU---------- miRbase UCSC ENSEMBL Contig290019:34-104(-)             -24.0              ((((((...(((((((((.....))).....(((((((..........)))))))))))))...)))))).              
gga -------UGAGCUGUUGAAUUCGGGGCCGUAACACUGUCUGAGAGG--UUUAUA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGCUGCUUC----- miRbase UCSC ENSEMBL 7:32228150-32228231(+)             -36.0         .((((.((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...)))))).)))).        
mga -------------GUUGAAUUCGGGGCCGUAACACUGUCUGAGAGG--UUUAUA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------         UCSC ENSEMBL 7:32979953-32980023(+)             -29.8               ((((((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))))))              
tgu ----------------GGAUUCGGGGCCGUAACACUGUCUGAGAGG--UUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGCUGCU------- miRbase      ENSEMBL 7:33186771-33186841(+)             -25.1              (((...(((((((...((((((..(((((((....)))))))))))))...)))))))...))).......              
aca -------------GUUGGAUUCGGGGCCGUAACACUGUCUGAGAGG--GUUACA-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGC-----------         UCSC ENSEMBL scaffold_181:1958406-1958476(-)    -28.2               ((((((...(((((((...((((((..((((((......))))))))))))...)))))))...))))))              
xtr -------UGAGCGGCUGGAACCGGGCCCGGAGCGCUGUCUGAGAGGG-UUUAAG-UUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUU-CAGUCUCUUC----- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_77:3010851-3010933(-)     -34.8        .(((.((((((((..(((.((((..((((((..((((((.......))))))))))))..)))).)))..)))))))).))).        
dre UGGAGGAGGAGUGCUGGGAGACGGGGCCGUGGCACUGUAUGAGAUUCAUGUAGGCUUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUUCCAGCCCUCACUGACA miRbase UCSC ENSEMBL 22:12383971-12384068(+)            -43.9 ((..((..(((.(((((((((.(((((((...((((((..((((.((.....)).))))..))))))...))))))).))))))))).))).))..))
gac ----------------GAGGAGGGGGCCGUUACACUGUCAGAGAUGUAGUCUGAGGGUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUC-CUG------------         UCSC ENSEMBL groupX:8103236-8103305(+)          -27.4               .((((((((((((...((((((..(((((...........)))))))))))...))))))))..)))).               
ola ----------------GAGGAGGGGGCCGUUACACUGUCAGAGAUGUACUCUGAGGGUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUC-CUG------------         UCSC ENSEMBL 11:21614184-21614253(-)            -27.9               .((((((((((((...(((((((((((.....))))))........)))))...))))))))..)))).               
tru --------------UAGAAGAGGGGGCCGUUACACUGUCAGAGAUGUAGUCUGAGGGUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUC-CUGCU----------         UCSC ENSEMBL scaffold_45:1006037-1006110(-)     -27.3             (((.(((((((((((...((((((..(((((...........)))))))))))...))))))))))).)))..             
tni -------------GCUGCAUACGGGGCCGGGACGCUGUUUGAGAGUCCACUAUG-AAUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUG-CAGC----------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:4160307-4160378(-)               -38.2              ((((((...((((((((..((((((..((((.((......)).))))))))))..))))))))...))))))             
cin --------------------------------------------------------------------------------------------------                      
csa --------------------------------------------------------------------------------------------------                      
dme --------------------------------------------------------------------------------------------------                      
cel --------------------------------------------------------------------------------------------------                      
                          *** ***   * * **  ***              ***********************                  
                    *     *******   * ****  ****             ************************  * *            
                    *     *******   ******* **** *   *       ************************  * *            
                    * *  *********  ************ *   **      ************************  * *            
                    * *  *********  **************   *** *   ************************  ***            
                    * *  *********  **************   *** * *************************** ****           
                 * ** ** ********** **************   *** * *************************** ****           
                 ****************** **************   *** * *************************** ****           
                 ****************** **************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** ****           
                 *********************************  ****** *************************** *****          
                 *********************************  ****** *************************** *****          
            ***  *********************************  ****** *************************** ***** ** *     
           ***** *********************************  ****** *************************** **********     
           ***************************************  ****** *************************** **********     
           ***************************************  ****** *************************** **********     
           *************************************** ******* *************************** **********     
           *************************************************************************** **********     
           *************************************************************************** **********     
    **************************************************************************************************