hsa CGGCCGGCCCUGGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCUCCCGGGUGGGUUC miRbase UCSC ENSEMBL 12:7073260-7073354(+) -48.9 .((((.((((.(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))..))))))).)))). ptr ------------------------------------------------------------------------------------------------ ggo CGGCCGGCCCUGGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGGUGGGUUC miRbase -50.8 .((((.((((.(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))).))).)))).)))). ppy UGGCCGGCCCUGGGUUCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGGUGGGUUC miRbase UCSC ENSEMBL 12:7200096-7200190(+) -49.3 .((((.((((.(((..((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))..))).)))).)))). mml UGGCCGGCCCUGGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGGUCGGUUU miRbase UCSC ENSEMBL 11:7147486-7147580(+) -53.6 .(((((((((.(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))).))).))))))))). cja -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL Contig622:144312-144384(-) -34.9 (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))))) tsy ------------------------------------------------------------------------------------------------ mmr -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL GeneScaffold_618:194721-194793(+) -34.9 (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))))) oga -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL GeneScaffold_1320:130519-130591(+) -34.9 (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))))) tbe ---------------CCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUGAUCGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCUC----------- ENSEMBL GeneScaffold_1360:29083-29152(+) -29.1 (((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))).... cpo -----------GGGUCCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGUUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ UCSC ENSEMBL scaffold_107:310106-310178(-) -33.8 (((.(((((((((((.((((((((((....((.......)).....))))))))))))))..)))))))))) dor ------------------------------------------------------------------------------------------------ mmu -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUGCAGUGUUGGAUGGUUGAAGUAUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ miRbase UCSC ENSEMBL 6:124667932-124668003(-) -34.4 (((.(((((((((((.((((((((((..((((.........)))).))))))))))))))..)))))))))) rno -GGCUGACUCUGAGUCCAUCUUC-CAGUGCAGUGUUGGAUGGUUGAAGUACGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGGUCAGUUC miRbase UCSC ENSEMBL 4:160840904-160840997(-) -40.7 (((((((((.....(((((((((((.((((((((((..((((.........)))).))))))))))))))..))))))).....))))))))). str -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCU--UUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL GeneScaffold_1478:28508-28578(+) -35.2 (((.(((((((((((.(((((((((((...((.....))...))).))))))))))))..)))))))))) opr -----------GGGUCCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUGAUUGGAAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL GeneScaffold_1208:355245-355317(+) -35.3 (((.(((((((((((.(((((((((((...(((....)))....))).))))))))))))..)))))))))) ocu ---------------CCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUACUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL scaffold_40:4696202-4696270(+) -29.1 (((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))... bta -GACCGGCUCUGGGUCCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUAAUGGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGCUGG---- miRbase UCSC ENSEMBL 5:10482928-10483017(-) -45.6 ..((((((..(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))..)))))) ttr ------------------------------------------------------------------------------------------------ vpa ------------------------------------------------------------------------------------------------ ssc ------------------------------------------------------------------------------------------------ cfa --GCCGGCUCUGGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAGUCACGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGG------- miRbase UCSC ENSEMBL 27:41110045-41110130(-) -41.2 .((((....(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))))))))). fca -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL GeneScaffold_88:217615-217687(+) -34.9 (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))))) eca -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ miRbase UCSC ENSEMBL 6:34423490-34423561(+) -34.9 (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))))) mlu -----------GGGCCCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUAAUCGCGAAGCUCCUAAGACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL GeneScaffold_2110:3768-3840(+) -30.4 (((((.(((((((((.(((((.(((((...((.......))...))).)).)))))))))..)))))))))) pva -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL GeneScaffold_923:32173-32245(+) -34.9 (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))))) eeu -----------GGGUCCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUGAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGC-------------- ENSEMBL GeneScaffold_3303:3501-3571(+) -29.2 ....(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))). sar ------------------------------------------------------------------------------------------------ cho ------------------------------------------------------------------------------------------------ ete ------------------------------------------------------------------------------------------------ laf -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUGGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL scaffold_15:51809546-51809618(+) -34.9 (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))))) pca ---------------CCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL GeneScaffold_122:65102-65170(+) -29.1 (((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))... meu ------------------------------------------------------------------------------------------------ mdo ----------UGGGGCCAUCUUC-CAGUACAGUGGUGGAUGGU--------GAAGCUUCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGCCC------------- miRbase UCSC ENSEMBL 8:108475859-108475922(+) -28.2 ..((((.(((((((((.((((((.((((.((.....)))))).))))))))))..))))))))) oan ------------------------------------------------------------------------------------------------ gga ---------CUGUGGGCAUCUUA-CUAGACAGUGCUGGAUUUCUUGGAUCUA----UUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUU-------------- UCSC ENSEMBL 21:2583290-2583358(-) -28.14 .....(((((((((((((((((((.((((..............)))).))))))))))))).)))))) mga ---------CUGUGGGCAUCUUA-CUAGACAGUGCUGGAUUUCUUGGAUCUA----UUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUU-------------- UCSC ENSEMBL 23:2750718-2750786(-) -28.14 .....(((((((((((((((((((.((((..............)))).))))))))))))).)))))) tgu --------UCUGUGGGCAUCUUA-CUAGACAGUGCUGGAUUUGCUGCCUCUA----CUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUU-------------- ENSEMBL 21:5894322-5894391(+) -27.34 ......(((((((((((((((((((.((((..............)))).))))))))))))).)))))) aca ------------------------------------------------------------------------------------------------ xtr ------------------------------------------------------------------------------------------------ dre ----GUCUCUAGGGUACAUCUUA-CCUGACAGUGCUUGGCUGUUCA-CUGAUG---UUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGCACUCUGGUGAC---- miRbase UCSC ENSEMBL 6:44230790-44230872(-) -35.9 (((.(((((((.(((((((((.(((((((.((((....((...))....))))))))))).))))).)))).))))))).))) gac ------------GAUCCAUCUUA-CCCGACAGUGCUGGAUUGUACGUCUGUUG---UUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUUUCCU---------- UCSC ENSEMBL groupXII:5709472-5709542(+) -27.1 ((..(((((((((.(((((((.((((....((....))...)))).))))))).))))).))))..)).. ola -------UCUAGGAUCCAUCUUA-CCUGACAGUGAUGGACUGUACAGCUGUUG---CUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUUUCCU---------- UCSC ENSEMBL 7:217693-217768(-) -31.4 ...((((..(((((((((.(((((((.((((....((....))...)))).))))))).))))).))))..)))) tru ----------AGGAUCCAUCUUA-CCCGACAGUGCUGGAUUGUACUACUGUUG---UUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUUUUCU---------- UCSC ENSEMBL scaffold_147:355851-355923(-) -29.2 ((((..(((((((((.(((((((.((((....((....))...)))).))))))).))))).))))..)))) tni ------------------------------------------------------------------------------------------------ cin ----------UGGU-GUAUCUUGGUCAUAUAGUGUUGUAGA-UUCAUG--------AUCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGCAUUCGACGUGUCUC- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_71:128547-128621(+) -23.8 .((((((((((..(((.(((((((..((((((...))))))))))))).)))..))))))))))........... csa --UUGGUCGUCGGUCGCAUCUUCAUCACGCGGUGUUCUAGAACUCAU----------UCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGCGAUCGGCGGCUACUU miRbase ENSEMBL reftig_613:31866-31949(+) -47.3 .(((((((((((((((((((.((((.(((((((..(((((....)))))))))))).)))).)))))))))))))))))))... dme ------------------------------------------------------------------------------------------------ cel ------------------------------------------------------------------------------------------------ ***** *** * **** ************ **** ****** ***** * ***************** **** ****** * ***** **** ***************** **** ****** * ****** **** ***************** **** * ****** * ****** ***** * * ***************** **** * ****** * ****** ***** ** * ***************** **** * ****** * ****** ***** ** * ***************** **** ** ******* * ****** ***** ** * ********************** *** ******** * ************ ** * * * ********************** *** ******** *** *************** * *** ***** ********************** * ************ *** *************** ** ************************************ ************ *** ****************** ************************************ ************ *** ******************************************************** ************ *** ******************************************************** ************ *** ******************************************************** ************ ************************************************************ ************ ************************************************************ ************ ************************************************************ ************ ************************************************************ ************ ************************************************************* ************ ************************************************************* ************* ************************************************************* ************* ************************************************************* ************** ************************************************************* ************** ************************************************************* * * * ************** ************************************************************* *** * * * ************** ****************************************************************** ********************** ****************************************************************** ** ********************** *********************************************************************** ********************** ************************************************************************ ********************** ************************************************************************ *********************** ************************************************************************ ************************************************************************************************