hsa -AGAAGGGCUAUCAGGCCAGCCUUCAGAGGACUCCAAGGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAUUUGAAAAAA-------CCACUGACCGUUGACUGUACCUUGGGGUCCUUA------------- miRbase UCSC ENSEMBL 9:127454721-127454830(+) -54.3 .((((((((....)))...))))).(((((((((((((.(((.((((((..(((((((.((((...........))))))))))))))))).))).))))))))))))).
ptr -AGAAGGGCUAUCAGGCCAGCCUUCAGAGGACUCCAAGGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAUUUGAAAAAA-------CCACUGACCGUUGACUGUACCUUGGGGUCCUUA------------- miRbase UCSC ENSEMBL 9:124391722-124391831(+) -54.3 .((((((((....)))...))))).(((((((((((((.(((.((((((..(((((((.((((...........))))))))))))))))).))).))))))))))))).
ggo -AGAAGGGCUAUCAGGCCAGGCUUCAGAGGACUCCAAGGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAUUUGAAAAAA-------CCACUGACCGUUGACUGUACCUUGGGGUCCUUA------------- miRbase -54.3 .((((((((....))))...)))).(((((((((((((.(((.((((((..(((((((.((((...........))))))))))))))))).))).))))))))))))).
ppy -AGAAGGGCUAUCAGGCCAGCCUUCAGAGGACUCCAAGGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAUUUGAAAAAA-------CCACUGACCGUUGACUGUACCUUGGGGUCCUUA------------- miRbase UCSC ENSEMBL 9:121588113-121588222(+) -54.3 .((((((((....)))...))))).(((((((((((((.(((.((((((..(((((((.((((...........))))))))))))))))).))).))))))))))))).
mml -AGAAGGGCUAUCAGGCCAGCCUUCAGAGGACUCCAAGGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAUUUGAAAAAA-------CCACUGACCGUUGACUGUACCUCGGGGUCCUUA------------- miRbase UCSC ENSEMBL 15:11055206-11055315(-) -50.2 .((((((((....)))...))))).(((((((((.(((.(((.((((((..(((((((.((((...........))))))))))))))))).))).))).))))))))).
cja ---------------------------------CCAAGGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAUUUGAAAAAAAA-----CCACUGACCGUUGACUGUACCUUG---------------------- ENSEMBL Contig217:1350827-1350898(+) -27.92 .(((((.(((.((((((..(((((((.((((.............))))))))))))))))).))).)))))
tsy --------------------------GGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-AAAAUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAUGGCUAACCA------------ ENSEMBL scaffold_499:98432-98520(+) -30.9 (((((((..((...(((.((((((..(((((((.((((.((.......)).))))))))))))))))).)))...))..))).)))).
mmr -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
oga --------------------------GGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-AAAAUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAUGGCUAACCA------------ ENSEMBL GeneScaffold_3076:487982-488070(-) -30.9 (((((((..((...(((.((((((..(((((((.((((.((.......)).))))))))))))))))).)))...))..))).)))).
tbe --------------------------GGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-AUAAUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAUGGCUAACCA------------ ENSEMBL GeneScaffold_3262:381923-382011(-) -30.9 (((((((..((...(((.((((((..(((((((.((((.((.......)).))))))))))))))))).)))...))..))).)))).
cpo --------------------------GGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-AAAAUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAUGGCCAACCA------------ UCSC ENSEMBL scaffold_12:23445086-23445174(+) -30.9 (((((((..((...(((.((((((..(((((((.((((.((.......)).))))))))))))))))).)))...))..)).))))).
dor ---------------------------------CCAUGGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAAUUAAAAAAGAAA----CCACCGACCGUUGACUGUACCUUGG--------------------- ENSEMBL scaffold_139113:669-742(-) -28.24 (((.((.(((.((((((..(((((((.((((..............))))))))))))))))).))).)).)))
mmu ---------------------------------CCAUGGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAUUCAAAAACAAAAAAA-CCACCGACCGUUGACUGUACCUUGG--------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 2:38708255-38708330(+) -28.73 (((.((.(((.((((((..(((((((.((((.................))))))))))))))))).))).)).)))
rno -AGAUGGGCAACCAAGGCAGCCUUAAGAGGACUCCAUGGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAUUCAAAAACAAAAAAAACCACCAACCGUUGACUGUACCUUGGGAUUCUUA------------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:18650904-18651020(+) -35.77 ....((....))((((...))))..(((((..(((.((.(((.((((((..((.((((.((((..................)))))))).)))))))).))).)).)))..))))).
str --------------------------GGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-AAAAUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAUGGCUAACCA------------ ENSEMBL GeneScaffold_616:165812-165900(-) -30.9 (((((((..((...(((.((((((..(((((((.((((.((.......)).))))))))))))))))).)))...))..))).)))).
opr --------------------------GGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGAAAUU-AAAAUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAUGGCUAACC------------- ENSEMBL GeneScaffold_513:263062-263149(-) -30.4 (((((((..((...(((.((((((..(((((((..(((((........)))))..))))))))))))).)))...))..))).))))
ocu --------------------------GGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-AAAAUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAUGGCUAACCA------------ ENSEMBL scaffold_46:2137237-2137325(+) -30.9 (((((((..((...(((.((((((..(((((((.((((.((.......)).))))))))))))))))).)))...))..))).)))).
bta UGCCAGGGCCAGGAC-CCAGUCUUCAGAGGACUCCAAGGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAUUUGAAAAAA-------CCACCGACCGUUGACUGUACCUUGGGUUCCUUA------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:99136761-99136870(+) -47.0 .....(((......)))........(((((..((((((.(((.((((((..(((((((.((((...........))))))))))))))))).))).))))))..))))).
ttr --------------------------GGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-AAAAUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAUGGCCAACCA------------ ENSEMBL GeneScaffold_1955:326273-326361(-) -30.9 (((((((..((...(((.((((((..(((((((.((((.((.......)).))))))))))))))))).)))...))..)).))))).
vpa --------------------------GGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUUUAAAAUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAUGGCCAACC------------- ENSEMBL GeneScaffold_1782:788568-788656(-) -29.5 (((((((..((...(((.((((((..(((((((.((((.((........)).))))))))))))))))).)))...))..)).)))))
ssc ------------------------------ACUCCAAGGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAUUUGAAAAAA-------CCACCGACCGUUGACUGUACCUUGGGGUUCUU-------------- miRbase ENSEMBL 1:280334006-280334085(+) -38.7 (((((((((.(((.((((((..(((((((.((((...........))))))))))))))))).))).)))))))))....
cfa ---------------------------------------AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAUUUGAAAAAA-------CCACCGACCGUUGACUGUACC------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 9:61643425-61643484(-) -23.2 .(((.((((((..(((((((.((((...........))))))))))))))))).)))...
fca --------------------------GGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-AAAAUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAUGGCUAACCA------------ ENSEMBL scaffold_128991:52062-52150(-) -30.9 (((((((..((...(((.((((((..(((((((.((((.((.......)).))))))))))))))))).)))...))..))).)))).
eca ----------------UGAGUCUGAGGGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-AAAAUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUGCCCUGUGGCUAGCCAUCCUCUCCUCCA miRbase UCSC ENSEMBL 30:26398918-26399027(-) -39.6 .(((...((((((.(((.(((...(((.((((((..(((((((.((((.((.......)).))))))))))))))))).)))...))).....))).))))))..)))..
mlu --------------------------GUUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-AAAGUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAUGGCUAACCA------------ ENSEMBL scaffold_130180:4797-4885(-) -27.6 (((.(((..((...(((.((((((..(((((((..(((((........)))))..))))))))))))).)))...))..))).)))..
pva --------------------------GGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-AAAGUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAUGGCUAACCG------------ ENSEMBL scaffold_5866:91346-91434(+) -31.2 (((((((..((...(((.((((((..(((((((..(((((........)))))..))))))))))))).)))...))..))).)))).
eeu -----------------------------------AAGGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAUUUGGAAAAAAA-----CCACCGACCGUUGACUGUACCUUG---------------------- ENSEMBL scaffold_332810:1199-1268(-) -27.92 ((((.(((.((((((..(((((((.((((.............))))))))))))))))).))).)))).
sar --------------------------GGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-AAAAUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAAGGCUACC-------------- ENSEMBL scaffold_247753:110665-110751(-) -29.7 (((.((((.((...(((.((((((..(((((((.((((.((.......)).))))))))))))))))).)))...)).)))).)))
cho --------------------------GGUUGCUUCAGAGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-AAAAUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAUGGCUAACCA------------ ENSEMBL scaffold_27452:9330-9418(+) -30.9 (((((((..((...(((.((((((..(((((((.((((.((.......)).))))))))))))))))).)))...))..))).)))).
ete ----------------------------GGACUCCAGAGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAUUUGAAAAAAAAAAAA-CCACUGACCGUUGACUGUACCUUGAGGUCC---------------- ENSEMBL scaffold_260511:550-636(+) -30.6 ((((..(((...(((.((((((..(((((((.((((....(((....)))...))))))))))))))))).)))...)))..))))
laf --------------------------GGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-AAAAUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAAGGCUAACCA------------ ENSEMBL scaffold_13:2235807-2235895(-) -31.7 ((((((((.((...(((.((((((..(((((((.((((.((.......)).))))))))))))))))).)))...)).)))).)))).
pca ------------------------------GCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAUU-AAAAUCAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUAUGGCUA---------------- ENSEMBL scaffold_24587:23958-24038(+) -27.0 (((..((...(((.((((((..(((((((.((((..(((....))).))))))))))))))))).)))...))..)))..
meu --------------------------GAUAACUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAGAUUUAAAAGAAA-----CCAUCGACCGUUGACUGUACCUUGAGGUUUAUCA------------ ENSEMBL Scaffold7330:38942-39030(+) -29.42 (((((((((((...(((.((((((..(((((((.((((.............))))))))))))))))).)))...)))))).))))).
mdo --------------------------GGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-AAAAUGAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUACAGCUAACCA------------ UCSC ENSEMBL 2:99873102-99873190(-) -28.92 (((((((..((...(((.((((((..(((((((.((((.............))))))))))))))))).)))...))..))).)))).
oan ------------------------------GCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-AAAGUAGAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUGCGGCAA---------------- UCSC ENSEMBL 4:46540194-46540274(+) -27.32 (((.(((...(((.((((((..(((((((.((((.............))))))))))))))))).)))...))).)))..
gga ----------------GCCAUCUUUGGAUAGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGAGAAC--UAAGAAAAA----CCAUCGACCGUUGACUGUACCUUGAGGU------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 17:10218497-10218587(+) -28.9 .(((....)))...(((((((...(((.((((((..(((((((.((((............))))))))))))))))).)))...)))))))
mga --------------------------GGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGAAUU-UAAGUGAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUCCAGCUAACCA------------ UCSC ENSEMBL 10:9291784-9291872(-) -29.2 (((((((..((...(((.((((((..(((((((.((((...((....))..))))))))))))))))).)))...))..))).)))).
tgu -----------------------------AGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGAGAAC--UAGAAAAAA----CCAUCGACCGUUGACUGUACCUU----------------------- miRbase ENSEMBL 17:10712187-10712259(+) -20.5 ...........(((.((((((..(((((((.((((............))))))))))))))))).))).....
aca --------------------------GGUUGCUUCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGGAUU-AAAGUGAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUCCAGCUAACCA------------ UCSC ENSEMBL scaffold_286:1630591-1630679(+) -28.92 (((((((..((...(((.((((((..(((((((.((((.............))))))))))))))))).)))...))..))).)))).
xtr ------------------------UUGAGGGCUUCAGAGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGAGAAAGUGUAAAAAUAUAAACCAUCGGCCGUUGACUGUACCCUGAGGCUUUUCA------------ miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_933:125246-125340(+) -32.79 ..(((((((((((...(((.((((((..(((((((.(((((................)))))))))))))))))).)))...)))))))))))..
dre ---------------------------------UUGGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUUGCGCUUCUGUAACAAA----CCAUCGACCGUUGACUGUACCCUGAGGGUGG--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 8:53595528-53595606(-) -25.0 .......(((.((((((..(((((((.((((((((....))))..))))))))))))))))).)))((((...))))..
gac --------------------------------CCCAGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUCUGCCAUGUUGGGAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCUGUGG------------------- UCSC ENSEMBL groupVIII:10666172-10666248(+) -27.1 (((((...(((.((((((..(((((((.((((...((......)).))))))))))))))))).)))...))).))
ola ------------------------------GCCUCGGCGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGUACAUACGAGAAAAAAA--CCAUCGACCGUUGACUGUGCCCUGCGGCU----------------- UCSC ENSEMBL 17:23707977-23708059(+) -29.49 (((.(((...(((.((((((..(((((((.((((................))))))))))))))))).)))...))).))).
tru --------------------------------CCCGGUGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGAGCUAAAUUGGAAAAA----CCAUCGACCGUUGAUUGUACCCCGUGGC------------------ UCSC ENSEMBL scaffold_43:1124007-1124084(-) -28.2 (((((...(((.((((((..(((((((.((((...((.....))..))))))))))))))))).)))...))).)).
tni -----------------CAGUUUUUUCAGGUCUUUGGGGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGGUGACUCAGAAAAAAA----CCAUCGAGCGUUGAGUGUACCUUUAGG------------------- miRbase UCSC ENSEMBL Un_random:58989020-58989110(-) -30.44 ..............(((..(((.(((((((((((..((((((.((((..............))))))))))))))))))))).)))..)))
cin -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
csa -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
************************* *** ****** *** **
************************** *** ********* *** **
*************************** *** ********* ******
*************************** * *** ********* ****** *
* *************************** * *** ********* ****** *
** *************************** * * *** ********* ****** *
** **************************** * * * *** ********* ****** *
** **************************** * * * * *** ********** ****** *
* ** **************************** * * * ** *** ********** ****** * *
** ** **************************** *** *** *** *** ********** ****** * **
** ** **************************** *** *** *** *** ********** ****** * **
** ** **************************** *** *** **** *** ********** ****** * **
** ** **************************** *** *** **** *** ********** ****** * **
** *** **************************** *** *** **** *** ********** ****** * **
** *** **************************** *** *** **** ************** ****** * **
* ** *** **************************** *** *** **** ************** ****** * **
* ****** **************************** *** *** **** ************** ****** * **
* ****** **************************** *** *** **** ************** ****** * **
* *********************************** *** *** **** ************** ******** **
* ************************************ *** **** **** ************** ******** **
* ************************************ *** **** **** ************** ******** ***
* ************************************ *** **** **** *********************** ****
* ************************************ *** **** **** ************************ ****
* * **************************************** ***** **** ************************ *****
* * **************************************** ********** ************************ ***** *
* ****************************************** ********** ************************ ***** **
******************************************************* ************************ ********
******************************************************* **********************************
******************************************************* **********************************
******************************************************* **********************************
******************************************************* **********************************
******************************************************* **********************************
******************************************************* **********************************
******************************************************* **********************************
* ******************************************************* **********************************
*** *** ******************************************************* **********************************
*** *** ******************************************************* **********************************
**** * * *** *** ******************************************************** **********************************
******** * ** ***** ************************************************************ **********************************
******************************************************************************** * **********************************
*********************************************************************************** **********************************
*********************************************************************************** **********************************
**********************************************************************************************************************
***********************************************************************************************************************************