hsa GAUGGCUGUGAGUUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUACAAU--CCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAAACAGAGCAAUUUCCUAGCCCUCACGA miRbase UCSC ENSEMBL 2:56216085-56216194(-) -41.1 ......((((((..(((((((((((((..(((.((((((((.(((....)))....)))))))).))).)))))))))((((......)))).......)))))))))). ptr GAUGGCUGUGAGUUGGCUUA-UCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUACAAU--CCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAAACUAAACAGAGCAAUUUCCUAGCCCUCACGA miRbase UCSC ENSEMBL 2a:57305668-57305776(-) -38.0 ((.(((((.(((...(((((((((((..(((.((((((((.(((....)))....)))))))).))).)))))))...........))))...))).))))).)).... ggo ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUACAAU--CCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- ENSEMBL 2a:57133560-57133632(+) -31.5 .((((.(((((((((..(((.((((((((.(((....)))....)))))))).))).))))))))).)))). ppy ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUACAAU--CCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- UCSC ENSEMBL 2a:55022412-55022484(+) -31.5 .((((.(((((((((..(((.((((((((.(((....)))....)))))))).))).))))))))).)))). mml GAUGGCUGUGAGUUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUACAAU--CCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUACGCUAAACAGAGCAAUUUCCUUGCCCUCGCGA miRbase UCSC ENSEMBL 13:56301816-56301925(-) -41.0 ......(((((((((((.(((((((((..(((.((((((((.(((....)))....)))))))).))).))))))))).))))).....((((.....)))).)))))). cja ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUACAAU--CCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- ENSEMBL Contig64:1057134-1057206(+) -31.5 .((((.(((((((((..(((.((((((((.(((....)))....)))))))).))).))))))))).)))). tsy ------------UUGGAUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUACAAU--CCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- ENSEMBL scaffold_481623:649-721(-) -27.7 .(((..(((((((((..(((.((((((((.(((....)))....)))))))).))).)))))))))..))). mmr ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- oga ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUACAAU--UCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- ENSEMBL scaffold_87303:4812-4884(-) -31.8 .((((.(((((((((..(((.((((((((..(((.....)))..)))))))).))).))))))))).)))). tbe ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGCUCCUGUAAU--CCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1551:207782-207854(-) -31.9 .((((.(((((((((..(((.((((((((.(((....)))....)))))))).))).))))))))).)))). cpo ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGCUCAUGUAAU--CCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_48:8647407-8647479(+) -31.9 .((((.(((((((((..(((.((((((((.(((....)))....)))))))).))).))))))))).)))). dor ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mmu ------------UUGGUUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUCCCUAUCAU--UCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:28657012-28657083(+) -30.0 .((((.(((((((((..(((.(((((((((((.......)))..)))))))).))).))))))))).)))). rno GUUAGCUAUGAGUUAGUUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUCCCUAUCAU--UCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAAACAGAGCAAUUUCCUUGACCUC---- miRbase UCSC ENSEMBL 14:109666081-109666186(+) -36.1 ....(((.((..(((((.(((((((((..(((.(((((((((((.......)))..)))))))).))).))))))))).))))).)).)))............... str ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUACAGU--CCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- ENSEMBL scaffold_119958:9328-9400(-) -32.6 .((((.(((((((((..(((.((((((((.(((....)))....)))))))).))).))))))))).)))). opr ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUAGUCUUCCAAU--CCCUCACAGUGGUCUCUGGGGUUAUGCUAA-------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_224:14006-14078(-) -29.96 .((((.(((((((((..(((.((((((((...............)))))))).))).))))))))).)))). ocu ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUAUUCAUACAAU--CCCUCACAGUGGUCUCUGGGGUUAUGCUAA-------------------------- ENSEMBL scaffold_2:30361155-30361227(-) -30.4 .((((.(((((((((..(((.((((((((..(((.....)))..)))))))).))).))))))))).)))). bta GAUGGCUGUGAGUUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUACAGU--CCUCCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAAACAGAGCAAUCUCCUUGCCCUCAUG- miRbase UCSC ENSEMBL 11:40146876-40146984(-) -39.0 (((.(((.((..(((((.(((((((((..(((.((((((((.(((....)))...)).)))))).))).))))))))).))))).)).))).))).............. ttr ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUACAAU--CCCCCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_906:183558-183630(-) -28.0 .((((.(((((((((..(((.((((((.(((((....)).)))...)))))).))).))))))))).)))). vpa ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ssc ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUACAAU--CCCCCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- ENSEMBL 3:79165864-79165936(+) -28.0 .((((.(((((((((..(((.((((((.(((((....)).)))...)))))).))).))))))))).)))). cfa GAUGGCUGUGAGUUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUACAAU--CCCCCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAAACAGAGCAAUAUCCUUGCCCU----- miRbase UCSC ENSEMBL 10:59909849-59909953(-) -36.0 (((((((.((..(((((.(((((((((..(((.((((((.(((((....)).)))...)))))).))).))))))))).))))).)).)))..))))........ fca ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUACAAU--CCCCCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1371:230297-230369(-) -28.0 .((((.(((((((((..(((.((((((.(((((....)).)))...)))))).))).))))))))).)))). eca ------------------UAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUA-AAU---CCCCACAGUGGUCUCUGGGAUUA-------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 15:44369414-44369471(+) -22.7 (((((((((..(((.((((((.(((........)))..)))))).))).))))))))) mlu ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUACAAU--CCCCCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- ENSEMBL scaffold_1270:64878-64950(-) -28.0 .((((.(((((((((..(((.((((((.(((((....)).)))...)))))).))).))))))))).)))). pva ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- eeu ------------UUGGUUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGCGAUAUUCAUACAAU--CCCCCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCCAAA------------------------- ENSEMBL scaffold_304608:15520-15593(+) -27.9 (((((.(((((((((..(((.((((((.(((.........)))...)))))).))).))))))))).))))). sar ----GCUAUGAGUUGGUUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUCAUACAAUUCCCCCCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAAACAGAGCA------------------ ENSEMBL scaffold_229366:87236-87326(+) -30.4 (((.((..(((((.(((((((((..(((.((((((.(((((....)))..))....)))))).))).))))))))).))))).)).))). cho ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUUAUAGAAU--CCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- ENSEMBL scaffold_21696:1155-1227(-) -31.9 .((((.(((((((((..(((.((((((((..((((...))))..)))))))).))).))))))))).)))). ete ---------------GCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGCUGUUCGUGCAAU--CC-UCACAGUGGCCUCUGGGACUAUGCUACA------------------------- ENSEMBL scaffold_189404:6728-6797(+) -29.0 ((.((.((((((..(((.((((((((.(((....)))...)))))))).))).)))))).)).)).... laf ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGCUGUUCGUACAAU--CCCUCACAGUGGUCCCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- ENSEMBL scaffold_52:6059040-6059112(+) -30.8 .((((.(((((((((..(((.((((((((.(((....)))....)))))))).))).))))))))).)))). pca ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGCUGUCCCUCCAGU--CCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUCGGC----------------------------- ENSEMBL scaffold_35166:4458-4527(-) -29.2 ...(((.((((((((..(((.(((((((((((......)))...)))))))).))).)))))))).))) meu ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUAUUAAUAAAUU--CCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- ENSEMBL Scaffold6573:29983-30055(+) -30.6 .((((.(((((((((..(((.((((((((..(((....)))...)))))))).))).))))))))).)))). mdo ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGAUGUUAAUAAAUU--CCCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- UCSC ENSEMBL 1:638493860-638493932(+) -30.9 .((((.(((((((((..(((.((((((((..(((....)))...)))))))).))).))))))))).)))). oan ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- gga ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGCAGUUAAUAAUU-----CUCACAGUGGUAUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- UCSC ENSEMBL 3:282832-282901(-) -29.4 .((((.(((((((((...((.((((((((.((((...)))))))))))).))..))))))))).)))). mga ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGGAGUUAAUAAUU-----CUCACAGUGGUAUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- UCSC ENSEMBL 2:2301792-2301861(+) -32.4 .((((.(((((((((...((.((((((((((........)))))))))).))..))))))))).)))). tgu --------UGAGUUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGCAGUUAAUA-ACU--CUCUCACAGUUGUAGCUGGGAUUAUGC----------------------------- miRbase ENSEMBL 3:28149612-28149683(+) -35.2 .......((.((((((((((((.((((((((((.((((...))))..)))))))))))))))))))))).)) aca ------------UUGGUUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGCAGUUUCCAAAUC--CUCUCACAGUGGUUUCUGGGAUUAUGCUA--------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_290:585983-586054(-) -27.3 .((((.(((((((((..(((.((((((((.((..........)))))))))).))).))))))))).)))) xtr ------------UUGGCUUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGCAGUUAAUAAAUU--AUCUCACAGUGGUCUCUGGGAUUAUACUAAA------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_242:1208456-1208529(+) -28.4 ((((..(((((((((..(((.((((((((.((((....))))..)))))))).))).)))))))))..)))). dre ------------UUGGCAUAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGUAGUGUUUUCAUCC-CUCUCACAGGCGCUGCUGGGGUUCUG------------------------------ UCSC ENSEMBL 22:31475115-31475184(-) -28.0 ....((.(((((((((.(((..(((((((..(((....)))....)))))))..)))))))))))).)) gac ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ola -----------UUUGGUGAAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGUCGUUCACUAGCUG-CUCUCACAAUGGCCUCUGGGAUUAUGCUAAAC------------------------ UCSC ENSEMBL 15:21350845-21350921(-) -27.5 (((((((.((((((((..(((...((((((..((......))....))))))...))).)))))))).))))))). tru ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tni ------------UUGGUGAAAUCUCAGCUGGCAA-CUGUGAGUCGUUCACUAGCUG-CUCUCACAAUGGCCUCUGGGAUUAUGCUAA-------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 17:5747758-5747830(+) -26.2 .(((((.((((((((..(((...((((((..((......))....))))))...))).)))))))).))))). cin ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa ---UGUCCCGGCUCAUUCUAAUCUCAGCUGGCAAUCUGUGAUUGGCUGAAAA--------UCACAGAUGCAGAUGGGAUUCUGAUGAGUCGGGA------------------- miRbase ENSEMBL reftig_16:3925105-3925187(+) -44.9 ..((((((((((((..(((((((.(((.((.(((((((((.......)))))))))))))).)))))))..)))))))))))) dme ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- * ************* ***** **** * **** * 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