hsa UGGAGGCCUUGCUGGUUUGGAAAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCAAGUUUAGAG--AUGCACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAAGCAGCGGACACUUCCA----- miRbase UCSC ENSEMBL 7:136587914-136588041(+) -54.4 .(((((..((((((.(((((((........((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).))))))))..))).))))))))))...))))). ptr -GGAGGCCUUGCUGGUUUGGAAAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCAAGUUUAGAG--AUGCACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAAGCAGCGGACACUUCCA----- miRbase UCSC ENSEMBL 7:137472012-137472138(+) -54.4 (((((..((((((.(((((((........((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).))))))))..))).))))))))))...))))). ggo ---------------------AAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCAAGUUUAGAG--AUGCACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAA--------------------- ENSEMBL 7:135486759-135486850(+) -38.7 ..((..((.((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).)))))))).))..)).. ppy UGGAGGCCUUGCUGGUUUGGAAAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCAAGUUUAGAG--AUGCACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACGAGCAGCGGACACUUCCA----- miRbase UCSC ENSEMBL 7:134014984-134015111(+) -54.3 ...(((((.....)))))((((.((((.....((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).))))))((((((....))))))))))..)))). mml UGGAGGCCUUGCUGGUUUGGAAAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCAAGUUUAGAG--AUGCACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAAGCAGCGGACACUUCCA----- miRbase UCSC ENSEMBL 3:174406300-174406427(+) -54.4 .(((((..((((((.(((((((........((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).))))))))..))).))))))))))...))))). cja ---------------------AAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCAAGUUUAGAG--AUGCACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACA---------------------- ENSEMBL Contig66:4068404-4068494(+) -38.7 ..((..((.((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).)))))))).))..)). tsy ---------------------AAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCAAGUUUAGAG--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAA--------------------- ENSEMBL scaffold_16355:18242-18333(+) -37.6 ..((..((.((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).)))))))).))..)).. mmr ---------------------AAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCAAGUUUAGAG--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAA--------------------- ENSEMBL scaffold_4238:91081-91172(+) -37.6 ..((..((.((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).)))))))).))..)).. oga ---------------------AAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCAAGUUUAGAG--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAA--------------------- ENSEMBL scaffold_92351:275196-275287(+) -37.6 ..((..((.((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).)))))))).))..)).. tbe ---------------------AAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGGUUAGAG--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAA--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_4889:310705-310796(+) -36.8 ..((..((.((((((((.(((((((((((((((.(((....(((...)))..))).)))))))))..)))))).)))))))).))..)).. cpo ---------------------AAGUUCAUUGUUCGGCACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGGUUAGAA--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUCGAGCUGUUCAUGAG-------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_10:11766903-11766995(-) -38.76 ....((((.((((((((.(((((((((((((((.(((...............))).)))))))))..)))))).)))))))).....)))). dor ---------------------AAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUAGAG--AUACACCAACCUGGAAGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCA------------------------ ENSEMBL scaffold_2357:43096-43184(+) -35.4 .........((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))).))).)))))).))))))))...... mmu -----------------UGGAAAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUAGAU--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGA-------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 6:36371742-36371825(+) -32.3 ...............((((((.(((((((((((((((.(((...((........))))).)))))))))..)))))).)))))) rno -----------------UGGAAAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUAGAU--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGA-------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 4:63815387-63815470(+) -32.3 ...............((((((.(((((((((((((((.(((...((........))))).)))))))))..)))))).)))))) str ---------------------AAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUAGAG--GUUAACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAA--------------------- ENSEMBL scaffold_105800:845-936(+) -37.8 ..((..((.((((((((.(((((((((((((((.(((.((........))..))).)))))))))..)))))).)))))))).))..)).. opr -----------------------GUUCAUUGUUCGGCACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUAGAG--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAA--------------------- ENSEMBL scaffold_1898:88806-88895(+) -36.9 ((..((.((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).)))))))).))..)).. ocu ---------------------AAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUAGAG--AUGCACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCAC----------------------- ENSEMBL scaffold_56:1159592-1159681(+) -39.3 .........((((((((.(((((((((((((((.(((..((((....)))).))).)))))))))..)))))).))))))))....... bta -UGGAGACUUGCUGGUUUGGAAAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUAGAG--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAAGCAGCGGACACUUCUA----- miRbase UCSC ENSEMBL 4:104248331-104248457(+) -49.3 .((((..((((((.(((((((........((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).))))))))..))).))))))))))...)))).. ttr ---------------------AAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCAUGUUUAGAG--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAA--------------------- ENSEMBL scaffold_82815:26641-26732(+) -38.6 ..((..((.((((((((.(((((((((((((((.(((..((((....)))).))).)))))))))..)))))).)))))))).))..)).. vpa ---------------------AAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUAGAG--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAA--------------------- ENSEMBL scaffold_1392:344567-344658(+) -37.6 ..((..((.((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).)))))))).))..)).. ssc ----------------------------UUGUUCGACACCAUGGAUCCCCAGGUGGGUCACGUUUCAAG--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUU-------------------------- miRbase ENSEMBL 18:10924562-10924640(+) -37.5 ..((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))).))).)))))).)))))))).... cfa --------------------AAAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUAGAG--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGA-------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 16:14579693-14579773(-) -32.6 ............((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).)))))) fca ---------------------AAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUAGAG--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAA--------------------- ENSEMBL scaffold_194287:477-568(+) -37.6 ..((..((.((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).)))))))).))..)).. eca --------------------------------UCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUAGAG--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGA-------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 4:90776976-90777044(+) -32.4 ((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).)))))) mlu ---------------------AAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUUCAG--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAA--------------------- ENSEMBL scaffold_152320:253954-254045(+) -37.6 ..((..((.((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).)))))))).))..)).. pva --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- eeu ---------------------AAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUUGAG--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCA------------------------ ENSEMBL scaffold_379006:35473-35561(-) -37.2 .........((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).))))))))...... sar ----------GCUGGCUUGGAAAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUAGAG--AUACACCAACCUGGAGUACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAAGC------------------- ENSEMBL scaffold_235819:111023-111127(-) -42.5 ....((((((((........((((((((.((((((.((((((((.(((...(((....)))..))).))))))))...)))))).))))))))..))).))))) cho ---------------------AAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUAGAG--AUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAA--------------------- ENSEMBL scaffold_867:35330-35421(+) -37.6 ..((..((.((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).)))))))).))..)).. ete --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- laf --------------------------CAUGGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGGUUACAG--GUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAA--------------------- ENSEMBL scaffold_83:5718010-5718096(-) -39.7 .(((((((((((.(((((((((((((((((((.((........)))).)).)))))))))..)))))).)))))))))))...... pca --------------------------CAUGGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGGUUACAG--GUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAA--------------------- ENSEMBL scaffold_12279:35622-35708(+) -39.7 .(((((((((((.(((((((((((((((((((.((........)))).)).)))))))))..)))))).)))))))))))...... meu ---------------------AAGUUCAUGGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUAGGUCAAGGUUAGAA--AUGUACCAACCUGGAGUACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCAC----------------------- ENSEMBL Scaffold44361:8190-8279(+) -39.2 ......(((((((((((.((((((.((((((((.(((((..........)).))).))))))))...)))))).))))))))))).... mdo --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- oan ---------GGGAGACUUGGAAAGUUCACGGUUCGACGCCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCAAGGUUAGAG--ACGCACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUCGAGCUGAUCACGAGCAACAGACGCAAGAGUCCCC miRbase UCSC ENSEMBL 10:8756531-8756654(+) -53.1 (((.(((((..........((((((((((.((((((((((((((((((((.........)))...)).)))))))))..)))))).)))))))))).......((.......))..)))))))) gga ---------------------AAGUUCAUGGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCAAGAUUAUAGAGAUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAA--------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:59948701-59948793(-) -40.5 ..((..(((((((((((.(((((((((((((((.(((....(((.....)))..))).)))))))))..)))))).)))))))))))..)).. mga ---------------------AAGUUCAUGGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCAAGAUUAUAGAGAUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAA--------------------- UCSC ENSEMBL 1:60703287-60703380(-) -40.5 ..((..(((((((((((.(((((((((((((((.(((....(((.....)))..))).)))))))))..)))))).)))))))))))..)).. tgu ----------------------AGUUCAUGCUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCAAGAUUAUAGAGAUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUCGAGCUGUUCA------------------------ ENSEMBL 1A:58337867-58337956(+) -37.9 .......(((.(((((.(((((((((((((((.(((....(((.....)))..))).)))))))))..)))))).))))))))...... aca -----------------------GUUCAUGCCUCAACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCAAGAUUAUAGAGAAACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAAGC------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_105:1509880-1509973(-) -35.53 ((.((.((.((((((.(((((((((((((((.(((.................))).)))))))))..)))))).))))))))))...)).... xtr --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dre --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- gac --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ola --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tru --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tni --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cin --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ** * ********* ****** ***** * ** * *********** ************ ** *** ************************ * ** * ************ ************ ** *** ***************************** * ** * * ************************** ** *** ****************************** * *** * ** ***************************** ****** ****************************** * *** ** ** ********************************* * ****** ****************************** * *** ** ** ************************************* ******* ****************************** * *** ** ** ************************************* ******** ****************************** * *** ** ** ************************************* ******** ****************************** * ****** ** ************************************* *************************************** * ****** ** ************************************** *************************************** ******** ***************************************** *************************************** ******** ***************************************** * *************************************** ******** ***************************************** * *************************************** ******** ******************************************* *************************************** ******** ******************************************* *************************************** ******** ******************************************* ************************************************ ******************************************* ************************************************ ******************************************* ************************************************ ******************************************* ************************************************ ******************************************* ************************************************ ******************************************* ************************************************ ******************************************* ************************************************ ******************************************* ************************************************ ******************************************* ************************************************ ******************************************* ************************************************ ******************************************* ************************************************* ******************************************* **************************************************** ******************************************** **************************************************** ********************************************* * * ***************************************************** ********************************************* ***** ***************************************************** ********************************************** * *** * * * ************************************************************** ********************************************************* * ********************************************************************************************************************************* ********************************************************************************************************************************** ********************************************************************************************************************************** ***************************************************************************************************************************************