hsa ACGAAUGGCUAUGCACUGCACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUACAC miRbase UCSC ENSEMBL X:109298557-109298654(+)           -55.2 ......((...((((((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))))))))))...)).....
ptr -CGAAUGGCUAUGCACUGCACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUACAC miRbase UCSC ENSEMBL X:109570428-109570524(+)           -55.2 .....((...((((((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))))))))))...))..... 
ggo ACGAAUGGCUAUGCACUGCACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUACAC              ENSEMBL X:107772239-107772337(+)           -55.2 ......((...((((((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))))))))))...)).....
ppy ----AUGGCUAUGCACUGCACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUACAC miRbase UCSC ENSEMBL X:109017184-109017277(+)           -55.2   ..((...((((((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))))))))))...)).....  
mml ACGAAUGGCUAUGCACUGCACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUGCAC miRbase UCSC ENSEMBL X:108770393-108770490(+)           -55.2 ......((...((((((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))))))))))...)).....
cja ACGAAUGGCUAUGCACUGCACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUACAC              ENSEMBL Contig69:5118661-5118759(-)        -55.2 ......((...((((((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))))))))))...)).....
tsy ACGAAUGGCUAUGCACUACACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUACAC              ENSEMBL scaffold_36835:10527-10625(+)      -48.6 ......((...((((((.(((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))).))))))...)).....
mmr ACGAAUGGCUAUGCACUGCACAACCCUAGGAGGGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUACAC              ENSEMBL GeneScaffold_2839:233894-233992(+) -55.2 ......((...((((((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))))))))))...)).....
oga ACGAAUGGCUAUGCACUGCACAACCCUAGGAGAAGGUGCCAUUCACAUAGACUGUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUACAC              ENSEMBL GeneScaffold_3342:77980-78078(+)   -53.82 ......((...((((((((((((((((((.....(((((((((((.............))))))))))).))))))))))))))))))...)).....
tbe ACGAAUGGCUAUGCACUGCACAACCCUGGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGGGCACAACCUACAC              ENSEMBL GeneScaffold_911:237843-237941(+)  -50.2 ......((...(((.((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).)))))))))))))).)))...)).....
cpo ACGAAUGGCUAUGCACUGCACAACCCUAGGAAGGGGUGCCAUUCACAUGGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGAAGUGUACAACCUACAC         UCSC ENSEMBL scaffold_46:10888934-10889032(-)   -46.9 ......((...((((((.(((((((((((.....(((((((((((.((........))))))))))))).))))))))))).))))))...)).....
dor ACGAACGGCUAUGCACUACACAACCCUAGGAAAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGUACAACCUACAC              ENSEMBL GeneScaffold_4295:53038-53136(+)   -46.9 ......((...((((((.(((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))).))))))...)).....
mmu AGGAACAGCUAUGUACUGCACAACCCUAGGAGGGGGUGCCAUUCACAUAGAGUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGUACAGCCUACAC miRbase UCSC ENSEMBL X:139173543-139173640(+)           -51.3 .......(((.((((((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).)))))))))))))))))).)))......
rno ----------AUGCACUGCACAACCCUAGGAGGGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGUACAA------- miRbase UCSC ENSEMBL X:35821324-35821404(-)             -51.7         .((((((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))))))))))...         
str ---------UAUGCACUGCACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUACAC              ENSEMBL GeneScaffold_995:50797-50886(+)    -53.7     ..((((((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))))))))))..........     
opr --------------------------------------------------------------------------------------------------                      
ocu ACGAACGGCUAUGCACUGCACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUACAC              ENSEMBL scaffold_25:5988807-5988905(+)     -55.5 ......((...((((((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))))))))))...)).....
bta --------------------------------------------------------------------------------------------------                      
ttr ACGAAUGGCUGUGCACUGCACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAAUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGGGCACAACCUACAC              ENSEMBL GeneScaffold_2127:67286-67384(+)   -57.0 ......((.(((((.((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).)))))))))))))).))))).)).....
vpa ACGAAUGGCUAUGCACUGCACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUGUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCA----------              ENSEMBL GeneScaffold_252:384010-384098(+)  -52.92      ...........((((((((((((((((((.....(((((((((((.............))))))))))).))))))))))))))))))     
ssc ---------UAUGCACUGCACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAAC------ miRbase                                                 -53.7        ..((((((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))))))))))....        
cfa -------------------ACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGC---------------- miRbase UCSC ENSEMBL X:86340979-86341041(+)             -34.1                  ((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))..                  
fca ACGAAUGGCUUUGCACUGCACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUACAC              ENSEMBL GeneScaffold_3105:94518-94616(+)   -55.2 ......((...((((((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))))))))))...)).....
eca ACGAAUGGCUAUGCACUGCACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUACAC miRbase UCSC ENSEMBL X:86921316-86921413(+)             -55.2 ......((...((((((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))))))))))...)).....
mlu -------GCUAUGCACUGCACAACCCUAGGAGAGUGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUACAC              ENSEMBL scaffold_192332:40636-40727(+)     -49.0    ....((((((((((((((((((......((((((((((..((.....))..))))))))))..))))))))))))))))))..........    
pva ------GGCUAUGUACUGCACAACCCUAGGAAUGUGUGCCAUUCACAUAGACUAAAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGUACAACCUACAC              ENSEMBL GeneScaffold_2432:104066-104158(+) -44.42    ((...((((((((((((((((((...((.((((((((((.............))))))))))))))))))))))))))))))...)).....   
eeu ACGAAUGGCUAUGCACUACACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUACAC              ENSEMBL GeneScaffold_5619:43282-43380(+)   -48.6 ......((...((((((.(((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))).))))))...)).....
sar ------------------CACAACCCUAGUAGAUGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAGCCUA---              ENSEMBL GeneScaffold_4575:41090-41167(+)   -36.3           ((((((((((((....(((((((((((..((.....))..)))))))))))))))))))))))..............           
cho --------------------------------------------------------------------------------------------------                      
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laf ACGAACGGCUAUGCACUGCACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUAUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUA---              ENSEMBL scaffold_32:21629042-21629137(-)   -55.5  ......((...((((((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).))))))))))))))))))...))..  
pca ACGAAUGGCUAUGCACUGCACAACCCUAGGAGAGGGUGCCAUUCACAUAGACUGUAAUUGAAUGGCGCCACUAGGGUUGUGCAGUGCACAACCUACAC              ENSEMBL GeneScaffold_4797:29564-29662(+)   -54.92 ......((...((((((((((((((((((.....(((((((((((.............))))))))))).))))))))))))))))))...)).....
meu --------------------------------------------------------------------------------------------------                      
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