miRviewer-mammals
miRviewer

miRviewer presents a global view of homologous miRNA genes in many species. miRviewer exhibits a comprehensive set of miRNA genes both from miRbase and candidate homologs identified using miRNAminer. miRviewer table shows conservation of miRNA genes, grouped by name, in addition to other information (see Help).

The table shows conservation of miRNA genes, grouped by name. Click on group name to see conservation for each miRNA and genomic location. Point cursor on miRNA to see summary of origin information. Symbols • indicate miRNAs present in miRbase (other miRNAs are newly discovered by miRNAminer.) Grey box indicates that the miRNA was not identified in this genome, under stringent parameters. Zoom out to see the full table by pressing Ctr- (or Mac-) a few times.

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Help


conservation 1.0 0.97 0.94 0.91 0.88 0.85 0.82 0.79 0.76 0.73 0.7 0.67 0.64 0.61 0.58 0.55 0.52 0.49 0.46 0.43 0.4

miRNA hsa ptr ggo ppy mml cja tsy mmr oga tbe cpo dor mmu rno str opr ocu bta ttr vpa ssc cfa fca eca mlu pva eeu sar cho dno ete laf pca meu mdo oan
Known/New 528/18 430/44 69/253 70/287 353/57 0/295 0/167 0/214 0/212 0/175 0/225 0/183 417/15 257/34 0/193 0/172 0/187 465/19 0/240 0/152 63/129 232/41 0/181 254/35 0/189 0/212 0/151 0/133 0/122 0/162 0/162 0/188 0/178 0/108 122/14 199/4
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Last update Apr 28, 2010