hsa --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGGGG------CUCUGCCCUG-CUAUGGGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 22:46508629-46508702(+) -34.4 (((.(((..((((((((((((((((((((((...)))))).........))))))))))))))))..))).)))
ptr ---------------GGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGGGG------CUCUGCCCUG-CUAUGGGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 22:45296681-45296753(+) -34.0 ((.(((..((((((((((((((((((((((...)))))).........))))))))))))))))..))).)).
ggo --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGGGG------CUCUGCCCUG-CUAUGGGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- ENSEMBL 22:30682337-30682411(+) -34.4 (((.(((..((((((((((((((((((((((...)))))).........))))))))))))))))..))).)))
ppy --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGGGG------CUCUGCCCUG-CUAUGGGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 22:41540745-41540818(+) -34.4 (((.(((..((((((((((((((((((((((...)))))).........))))))))))))))))..))).)))
mml --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGGGG------CUCUGCCCUG-CUAUGGGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 10:90121100-90121173(+) -34.4 (((.(((..((((((((((((((((((((((...)))))).........))))))))))))))))..))).)))
cja --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGGGG------CUCUGCCCUC-CUGUGGAGUAACUAUGCAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- ENSEMBL Contig802:120696-120770(+) -36.2 (((.(((..((((((((((((((((....(((((((......)))))))))))))))))))))))..))).)))
tsy ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mmr --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGGGG------CUCUGCCCUG-CUGUGGGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- ENSEMBL scaffold_54892:5312-5386(+) -34.4 (((.(((..((((((((((((((((((((((...)))))).........))))))))))))))))..))).)))
oga --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGGGG------CUGUGCCCUG-CUCUGGGAUAACUAUACAACCUACUGUCUUUCCU----------------- ENSEMBL GeneScaffold_4712:81161-81235(+) -37.5 (((.(((..((((((((((((((((.(((((........))))).....))))))))))))))))..))).)))
tbe ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cpo ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dor ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mmu -----------CCAGGUUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUAGAGU----------UACAUCAAGGGAGAUAACUGUACAGCCUCCUAGCUUUCCUUGG-------------- UCSC ENSEMBL 9:41344809-41344886(+) -30.3 (((((..(((.(((.(((((((((((((.........(((......)))))))))))))))).))).)))..)))))
rno -----------CCAGGCUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUAGAGU----------UACAACAAGGGAGAUAACUGUACAGCCUCCUAGCUUUCCUUGG-------------- UCSC ENSEMBL 8:44525779-44525856(+) -29.0 (((((..(((.(((.(((((((((((((.....................))))))))))))).))).)))..)))))
str ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
opr --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGGGG------CUCUGCCCUG-CUAUGGGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- ENSEMBL scaffold_12764:4350-4424(+) -34.4 (((.(((..((((((((((((((((((((((...)))))).........))))))))))))))))..))).)))
ocu --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGGGG------CUCCGCCCUG-CUAUGGGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- ENSEMBL scaffold_325:73629-73703(+) -34.4 (((.(((..((((((((((((((((((((((...)))))).........))))))))))))))))..))).)))
bta --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGGGG------CUCUGCCCUG-CUAUGGGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 5:123307212-123307285(+) -34.4 (((.(((..((((((((((((((((((((((...)))))).........))))))))))))))))..))).)))
ttr ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
vpa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ssc ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cfa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
fca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
eca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mlu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
pva --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGGGG------CUCUGCCCUG-CUAUGGGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- ENSEMBL scaffold_7110:52959-53033(-) -34.4 (((.(((..((((((((((((((((((((((...)))))).........))))))))))))))))..))).)))
eeu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
sar ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cho ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ete ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
laf --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGGGG------CUCUGCCCUG-CUUUGGGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- ENSEMBL scaffold_102:1353076-1353150(+) -34.4 (((.(((..((((((((((((((((((((((...)))))).........))))))))))))))))..))).)))
pca --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGGGG------CUCUGCCCUG-CUUUGGGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- ENSEMBL scaffold_274020:479-553(-) -34.4 (((.(((..((((((((((((((((((((((...)))))).........))))))))))))))))..))).)))
meu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mdo -------------GGGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGGGGGUCG--CUCCCUCUGU-CUGUGAGAUAACUAUACAGUCUACUGUCUUUCCC----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 8:11049697-11049775(-) -37.1 .(((.(((..(((((..((((((((..(((((.....)))))((((.....))))))))))))..)))))..))).)))
oan ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
gga --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUUAGGG-----UUAUGCCCUGCCUGUCAGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:73421272-73421347(+) -34.1 (((.(((..((((((((((((((((.(((((.....)))))..........))))))))))))))))..))).)))
mga ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tgu ----GACUUGUCUUGACUGAAGCAGCAAUCCUGCCCCAGCUCUGAAG-------AUGCCUGCACUGUGGGAUGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUUUUAGGGUCAU----------- miRbase ENSEMBL 12:771962-772053(+) -26.2 (((((.....(((((..(((((....(((((.((.(((...((.((....))))..))).)).)))))...))))).)))))...)))))..
aca --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUUAGGG-----UUCUGCCCUGCCUGUCACAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- UCSC ENSEMBL scaffold_433:1019394-1019470(-) -34.1 (((.(((..((((((((((((((((.(((((.....)))))..........))))))))))))))))..))).)))
xtr --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UUUAGUUGUGGG------UUGCACCCUGACGUUUGGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- UCSC ENSEMBL scaffold_908:26205-26280(+) -30.1 (((.(((..((((((((((.((((((((((.....)))..........))))))).))))))))))..))).)))
dre GAGACUGUCGUUUGGGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGAGGGU----UUA-ACCCUUGCUGUCAGAUAACUAUACAACUUACUGUCUUUCCCGAAGUGGCCGUAGUGUC miRbase UCSC ENSEMBL 4:18467967-18468073(-) -45.9 ((.((((((((((.(((.(((..((((((((((((((((((((((.....)))))).........))))))))))))))))..))).))).)))))))...))).))
gac ------------------GAGGUAGUAGAUUG--AAUAGUUGUGGGGUU---GUCUAACCUCUUUUUGAGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCC------------------ UCSC ENSEMBL groupXII:12165336-12165409(+) -27.7 (((..(((((((((.((((((((((((((....))))))........)))))))).)))))))))..)))...
ola --------------GGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUUAGGGG----UCAUGCCCUUCCUGUCAGAUAACUAUACAACUUACUGUCU---------------------- UCSC ENSEMBL 6:6146876-6146948(+) -28.3 .....((..((((((((((((((((..(((((.....)))))..........))))))))))))))))..))
tru ------------------GAGGUAGUAGAUUG--AAUAGUUGUGGGGUU---GUGUGACCUCUUAGUGAGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCU----------------- UCSC ENSEMBL scaffold_93:746505-746579(-) -28.6 (((..(((((((((.((((((((((((((....))))))........)))))))).)))))))))..)))....
tni ------------CAAGGUGAGGUAGUAGGUUG--UAUAGUUUGUGGGAUGGCUUGGAUCCUACUCAGAUUAUAACUAUACAGUCUAUUACCUUCCUUGAGAGGUACAAUG---- miRbase UCSC ENSEMBL 11:8661669-8661764(-) -40.2 (((((.((((((((((..(((((((((.(((((((.......))))))).........)))))))))..)))))))))))))))............
cin ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
csa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
** * ** * ** * * * * * *
********** *** ***** * ****** * ** * * ***
*********** *** ****** * ** ****** **** * ** *****
* *************** ******* ** ** * ************ ***** ******
** *************** ******** ** * *** * ************ *************
****************** ******** *** * *** ** * ************* **************
****************** ******** *** * **** ** ** ****************************
****************** ******** *** * ****** ** ** ****************************
****************** ******** *** * ****** ** ** ****************************
****************** ************ * ****** ** ** ****************************
****************** ************ ********* ** *******************************
****************** ************ ********** ** *******************************
****************** ************ ********** ** *******************************
****************** ************ ********** ** *******************************
****************** ************ ********** ** *******************************
****************** ************ ********** **********************************
****************** ************ ********** **********************************
****************** ************* ********** **********************************
****************** ************* ********** **********************************
****************** ************* ********** **********************************
****************** ************* *********************************************
****************** ************* *********************************************
****************** ************** *********************************************
********************* *************** ************************************************
* *********************** **************** ************************************************ * * *
******************************************************************************************************************