hsa ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUAU----UAGUCCGCACAAGCUUGUAUCUAUAGGUAUGUGUCUGUUAGG----------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:122022937-122023016(-) -25.8 ((((....((((.(((..(((((.(((.((((((...........)))))).))).)))))..))).)))).....)))) ptr ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUAU----UAGUCCGCACAAGCUUGUAUCUAUAGGUAUGUGUCUGUUAGG----------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:121082045-121082124(-) -25.8 ((((....((((.(((..(((((.(((.((((((...........)))))).))).)))))..))).)))).....)))) ggo ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUAU----UAGUCCGCACAAGCUUGUAUCUAUAGGUAUGUGUCUGUUAGG----------------------------------- miRbase -25.8 ((((....((((.(((..(((((.(((.((((((...........)))))).))).)))))..))).)))).....)))) ppy ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUAU----UAGUCCGCACAAGCUUGUAUCUAUAGGUAUGUGUCUGUUAGG----------------------------------- miRbase -25.8 ((((....((((.(((..(((((.(((.((((((...........)))))).))).)))))..))).)))).....)))) mml ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUAU----UAGUCCGCACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUUUUAGG----------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 14:120559995-120560074(-) -26.3 ((((....((((.(((..((((..(((.((((((...........)))))).)))..))))..))).)))).....)))) cja GAGGCCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGU----UAAUGUGCACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGUUAGGCAAUCUCA--------------------------- ENSEMBL Contig48:1267417-1267509(-) -32.7 ((((((((....((((.(((..((((..(((.((((((...........)))))).)))..))))..))).)))).....)))))...))). tsy ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----UAGUCCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGUUAGG----------------------------------- ENSEMBL scaffold_116:80624-80704(+) -28.1 ((((....((((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).)))).....)))) mmr ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----UAGUCCGCACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGUUAGG----------------------------------- ENSEMBL scaffold_525:267161-267241(-) -27.7 ((((....((((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).)))).....)))) oga ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGAUGA----UAGUCCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGGUAGG----------------------------------- ENSEMBL scaffold_111200:29887-29967(+) -27.4 ((((....((((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).)))).....)))) tbe ----CCUGCUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----UAGUCCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUCUGUGUCUGUUAGG----------------------------------- ENSEMBL scaffold_13395:81582-81662(+) -28.4 (((((...((((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).))))...)).))) cpo ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----UUGUCCACACAAGCUUGUGUCUACAGGUCUGUGUCUGUGAGG----------------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_19:26131474-26131554(+) -27.5 (((.....((((.(((.(((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))).))).))))......))) dor --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mmu ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGCUGA----UUCUGCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGUUAGG----------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 9:41339508-41339587(+) -27.9 ((((....((((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).)))).....)))) rno ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGCUGA----CCAUGCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGUUAGG----------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 8:44518670-44518749(+) -27.9 ((((....((((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).)))).....)))) str ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----UAGUCCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUCUGUGUCUGGUAGG----------------------------------- ENSEMBL scaffold_149717:97657-97737(+) -27.4 ((((....((((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).)))).....)))) opr ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----UAGUCCACACAAGCUUGUAUCUAUGGGUCUGUGUCUGUUAGG----------------------------------- ENSEMBL scaffold_919:279823-279903(-) -33.2 ((((....((((.((((((((((.(((.((((((.((......)))))))).))).)))))))))).)))).....)))) ocu ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----UAGUCCACACAAGCUUGCGUCUAUAGGUCUGUGUCUGUUAGG----------------------------------- ENSEMBL scaffold_3:61761351-61761431(-) -27.9 ((((....((((.(((..(((((.(((.((((((.((......)))))))).))).)))))..))).)))).....)))) bta ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGG----UAGUGCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGU--------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 15:31460951-31461026(-) -26.2 ........((((.(((..((((..(((.((((((((......)).)))))).)))..))))..))).))))..... ttr ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGAUGA----UAGCCCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGUGGGC----------------------------------- ENSEMBL scaffold_108492:55793-55873(+) -27.2 (((.....((((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).)))).....))). vpa --GGCCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----UCGUCUGCACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGU-GGGC---------------------------------- ENSEMBL scaffold_3191:86344-86426(+) -28.6 .((((.....((((.(((..((((..(((.((((((..((...))..)))))).)))..))))..))).)))).....)))) ssc -AGGCCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGCUGA----UAGUGCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGUG-------------------------------------- miRbase ENSEMBL 9:47702721-47702800(-) -26.6 .(((.....)))(((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).)))....... cfa ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGGUGA----UAGUCCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGUUAGG----------------------------------- UCSC ENSEMBL 5:15052357-15052437(+) -28.1 ((((....((((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).)))).....)))) fca ------------------ACCGAAGAUCCGAACU-GUGGUGA----UAGUCCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCU-UUAGGCAACCUCACAGACCGCGCGUGGGCUUUGCCUGUAU ENSEMBL scaffold_136841:28314-28413(-) -27.2 .............((...(((((.(((((((....((.((.((((..((((...((((....))))))))...)))))).)))))))))))))).)).. eca ----------------AACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----UAGUCCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUA------------------------------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 7:29549390-29549444(-) -20.4 .(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))). mlu ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----CAGU-CACACAAGUUUGCAUCUACAGGUAUGUGUCUGU--------------------------------------- ENSEMBL scaffold_181676:4406-4481(+) -30.9 ........((((.(((.((((((.((((((((((.((.....)))))))))))).)))))).))).))))..... pva ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGU----UAGUCCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGUUAGG----------------------------------- ENSEMBL scaffold_2394:45805-45885(+) -27.6 ((((....((((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).)))).....)))) eeu --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- sar --GGCCUGCUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGC----UCUUCUGCACAAGCUUGUGUCUAUAGGUCUGUGUCUGUUGGGC---------------------------------- ENSEMBL scaffold_259218:39995-40078(+) -28.7 .((((((...((((.(((..((((..(((.((((((...........)))))).)))..))))..))).))))...)).)))) cho ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----CAGUCCACACAAGCUCGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGUUAGG----------------------------------- ENSEMBL scaffold_2516:21186-21266(+) -30.2 ((((....((((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).)))).....)))) ete ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGG----UAGUCUGCACAAGCUUGUGUCUACAGGUAUGUGUCUGUUAGG----------------------------------- ENSEMBL scaffold_320791:76881-76961(+) -29.2 ((((....((((.(((.(((((..(((.((((((.(((....))))))))).)))..))))).))).)))).....)))) laf ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUAA----UAGUUCUCACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGUUAGGCA--------------------------------- ENSEMBL scaffold_58:10284313-10284395(-) -27.3 ((((....((((.(((..((((..(((.(((((((.........))))))).)))..))))..))).)))).....)))).. pca ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGG----UAGUUCACACAAGCUUGUGUCUGUGGGUAUGUGUCUGUUAGG----------------------------------- ENSEMBL scaffold_53364:12647-12727(+) -31.6 ((((....((((.(((((((((..(((.((((((.(((....))))))))).)))..))))))))).)))).....)))) meu ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----UAUUCCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGUCAGG----------------------------------- ENSEMBL Scaffold1323:22471-22551(+) -29.9 ((((....((((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).)))).....)))) mdo ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----UAUUCCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGUCAGG----------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 4:226180101-226180180(+) -29.9 ((((....((((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).)))).....)))) oan ---GCCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----UAUUCCACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGUGGGC----------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL Contig534:284953-285033(+) -30.2 ((((.....((((.(((..((((..(((.((((((.((......)))))))).)))..))))..))).)))).....)))) gga ----CCUGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUCA----UAUUCCACACAAGCUUGUAUCUAUAGGUAUGUGUCUGUCUGG----------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 24:3372894-3372973(+) -24.2 ........((((.(((..(((((.(((.((((((...........)))))).))).)))))..))).))))......... mga ------------CAUAAACCCGUAGAUCCGAUCUUGUGUUGAAA--CGCACUGCACAAGCUCGCUUCUAUGGGUCUGUGUCAG---------------------------------------- UCSC ENSEMBL 1:106116216-106116285(+) -29.8 ((((.(((((((((..(((.(((((((...........))))))).)))..))))))))).)))).... tgu ----CCUGCUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGCUCA----UAUUCCACACAAGCUUGUAUCUAUAGGUCUGUGGC------------------------------------------ ENSEMBL 24:3146871-3146944(-) -28.7 ......((((((.(((..(((((.(((.((((((...........)))))).))).)))))..))).)))))) aca ---GCUAGUUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGCUUC----UAUGUUACACAAGCUUGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGCUUGGC---------------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_521:850258-850340(+) -27.8 ((((((...((((.(((..((((..(((.((((((...........)))))).)))..))))..))).))))...)).)))) xtr -------GUUGCCAUAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGCUGUG---CCCCUCUCACAAGCUCGAGUGUGCGGGUCUGUGUCGGCUU------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_325:946793-946868(+) -30.3 ((((.((((.(((((((.((.(((.((((((............)))))).))).)).))))))).)))).)))).. dre -----CAGCUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGU----CUCUGUGCACAAGCUCGUGUCUAUAGGUAUGUGUCUGCGAGGUGA-------------------------------- UCSC ENSEMBL 5:28066598-28066680(+) -29.7 ((.((((((((.(((..((((..(((.((((((...........)))))).)))..))))..))).))))...)).)).)). gac ---------UGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----CUGGCUUCACAAGCUCGUGUCUAUAGGUAUGUGUCU----------------------------------------- UCSC ENSEMBL groupVII:18314895-18314964(-) -27.2 ...((((.(((..((((..(((.(((((((.........))))))).)))..))))..))).))))... ola ---GCCAGCUGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----CUGGCUGCGCAAGCUCGUAUCUAUAGGUAUGUGUCUUCCUGG----------------------------------- UCSC ENSEMBL 14:15650877-15650958(-) -28.8 .((((....((((.(((..(((((.(((.((((((...........)))))).))).)))))..))).)))).....)))) tru ---------UGCCACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----CUGGCCGCACAAGCUCGUAUCUAUAGGUAUGUGUCCGCCAGGCAA-------------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_6:2072094-2072172(+) -27.6 (((((((.(((..(((((.(((.((((((.((......)))))))).))).)))))..))).)))........)))). tni ------------CACAAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGGUGA----CUGGCCGCACAAGCUCGUAUCUAUAGGUAUGUG-------------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 7:5619635-5619697(-) -25.8 ((((.(((..(((((.(((.((((((.((......)))))))).))).)))))..))).)))) cin --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme -----CCAUUAACAGAAACCCGUAAAUCCGAACUUGUGCUGUUUUAUAUCUGUUACAAGACCGGCAUUAUGGGAGUCUGUCAAUGCAAACAACUGGUUUUUGGCA------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 2L:18471434-18471533(+) -26.9 .((((.(((((..(((((((..(((..(((((((............)).)))))..)))..)))))))..))))).)))).................... cel --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- *** * ****** ** *** * **** * * ** *************** ****** * ****** * * * * *** * ** ** *********************** * ******** * **** *** **** * ** *********************** * ******** * **** *** ****** * ** *********************** * ******** * ***** *** ****** ***************************** * ******** ** ********* ****** ***************************** * ******** ** ********* ****** * ***************************** * ******** ** ********* ******* * * ***************************** * ******** ** ********* ******** ** * ***************************** ** * *********** ********* ******** ** * ******************************** * * * *********** ****************** * ************************************* * * * *********** ****************** * ************************************* ** *** *********** ******************* ** ************************************* ** *** ******************************* ** ************************************* ****** ******************************* ** ************************************** ****** ******************************* ** ************************************** ****** ******************************* ** ************************************** ****** ******************************* *** ************************************** ****** ******************************* *** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** ************************************** ****************************************** *************************************** ******************************************* *************************************** ******************************************* *************************************** ******************************************* * **************************************** ********************************************* **************************************** ********************************************* ** ***************************************** ********************************************* **** ** ***************************************************************************************************************************