hsa ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUCU------ miRbase UCSC ENSEMBL 17:46657200-46657309(-) -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))......... ptr -------AUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUCU------ miRbase UCSC ENSEMBL 17:9157676-9157784(+) -32.39 ...(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))......... ggo ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUCU------ miRbase -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))......... ppy ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCCGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUUUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUCG------ miRbase -32.49 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))......... mml ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUC------- miRbase UCSC ENSEMBL 16:32809599-32809707(-) -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))........ cja ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUC------- ENSEMBL Contig190:1610678-1610787(+) -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))........ tsy ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUC------- ENSEMBL scaffold_223749:2136-2245(-) -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))........ mmr ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUC------- ENSEMBL GeneScaffold_1449:78849-78958(-) -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))........ oga ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUC------- ENSEMBL scaffold_116559:211243-211352(-) -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))........ tbe ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUC------- ENSEMBL scaffold_146639:50173-50282(-) -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))........ cpo ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGGUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UAUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUC------- UCSC ENSEMBL scaffold_53:8675038-8675147(+) -31.79 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))........ dor ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mmu ------GACCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUCA------ miRbase UCSC ENSEMBL 11:96178479-96178588(+) -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))......... rno ------GACCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUCA------ miRbase UCSC ENSEMBL 10:85049314-85049423(+) -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))......... str ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- opr ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUC------- ENSEMBL GeneScaffold_4174:84666-84775(-) -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))........ ocu ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUC------- ENSEMBL scaffold_23:16292163-16292272(+) -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))........ bta ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGAUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUC------- miRbase UCSC ENSEMBL 19:39116883-39116991(+) -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))........ ttr ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- vpa ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ssc -------------------UCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGA----------------------- miRbase ENSEMBL 12:22389424-22389503(-) -26.69 .((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).)))))))).... cfa ---------------------UAUAUAUACCCUGUAGAACCGAAUUUGUGUGGUAUCCAC----AUAGUCACAGAUUCGAUUCUAGGGGAAUAUAUGGU-------------------------- UCSC ENSEMBL 36:22985945-22986019(+) -27.4 (((((((.((((.(((((.((((((((((..((......))...)))))))))).))))))))).))))))).. fca ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUC------- ENSEMBL scaffold_151827:36577-36686(-) -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))........ eca ------AAGAUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUCA------ miRbase UCSC ENSEMBL 11:24629492-24629601(-) -32.99 ..(((((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...))).))...... mlu ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- pva ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUC------- ENSEMBL GeneScaffold_13:337002-337111(-) -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))........ eeu ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGUUAAGAAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCG---------- ENSEMBL scaffold_379338:35791-35898(-) -32.5 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((.((((....))))....)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))..... sar ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cho ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-A-GGAAUUU--UGUG-UCACAAAU-CGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGU-GACAUAAACACUC------------ ENSEMBL scaffold_60629:11633-11733(-) -27.8 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.(((.((((((((.((...)).)).))))))))).))))))))).)))))))).))))...)))... ete ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAGUUU--UGUGAUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUC------- ENSEMBL scaffold_297949:5621-5730(+) -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))........ laf ------GAUCUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGAUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGCUC------- ENSEMBL scaffold_31:19766929-19767038(+) -32.39 ....(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..))))...)))........ pca ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- meu ------GAUCUCUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAAUUGACAUAGACACUCCGCUCU------ ENSEMBL Scaffold129846:3939-4049(-) -31.49 ....(((.((((...(((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).)))))))...)))).)))........... mdo -------------CUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAAUUU--UGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUA------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 2:201156732-201156821(-) -32.29 .((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((................)))))))))).))))))))).))))))))..)))).. oan AAAGAAGAUAUGUCUGUCUUCUGUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-AAGGAGUUU--CGUGGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACUCCGGUCAUUUUUU miRbase UCSC ENSEMBL Contig81155:820-941(+) -34.4 (((((((((.(((.((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((...((....)).....)))))))))).))))))))).))))))))..))))...))).....))).)))))) gga --------------------CUAUAUGUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGUAAAGGAAGUU--G--GGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAG--------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL Un_random:379304-379377(-) -29.06 ((((((((.((((.(((((.((((((((((...............)))))))))).))))))))).)))))))) mga ------------UCUGUCUUCUAUAUGUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGUAAAGGAAGUU--G--GGUCACAAAUUCGUAUCUAGGGGAAUAUGUAGUUGACACAAACACU------------- UCSC ENSEMBL Un:35389663-35389759(+) -35.26 ..((((..((((((((.((((.(((((.((((((((((...............)))))))))).))))))))).))))))))..))))........ tgu ---------------------UAUAUAUACCCUGUAGAACCGAAUUUGUGUGAUAUUCAU----AUAGUCACAGAUUCGAUUCUAGGGGAAUAUAUG---------------------------- ENSEMBL 7:17079302-17079374(+) -27.9 (((((((.((((.(((((.((((((((((...(((....)))..)))))))))).))))))))).))))))) aca ------------UCUGUCUUCUGUAUGUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGUAAAAGAAACU--G--CGUCACAAAUUCGCGUCUAGGGGAAUAUGUAGUAGACACAAAC---------------- UCSC ENSEMBL scaffold_135:705491-705584(+) -34.8 ..(((((.((((((((.((((.(((((.((((((((((....((...))....)))))))))).))))))))).)))))))).)))))..... xtr ------GAUUUGCCUGUCCUCUGUAUGUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGUGAGCGCAAUC--A--UAUCACAAAUUCGUGUCUGGGGGGAUAUGCAGUUGACACAAACG--------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_334:535111-535210(-) -43.8 ..((((..((((..((((((((.((((.((((..(((((((((((((......)))...))))))))))..)))).))))))))))))..)))))))).. dre ----------UGUCUGUCAUCUAUAUAUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGU-----GAAUA--UACAGUCGCAAAUUCGUGUCUUGGGGAAUAUGUAGUUGACAUAAACACAACGC--------- miRbase UCSC ENSEMBL 12:20798875-20798973(-) -36.5 ....(((((.((((((((.(((((.(((..((((((((((............))))))))))..)))))))).)))))))).)))))............ gac ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ola --------------UGUCUUCUAUAUCUACCCUGUAGAUCCGGAUUUGUGUGACGGUCGAUGAAACAAUCACAAAUUCGCUUCUAGGGGAGUAUAUAGU-------------------------- UCSC ENSEMBL 8:24379816-24379901(+) -27.0 ......((((((((.((((.((((..((((((((((......((...))......))))))))))..)))))))))).)))))). tru ---------GCCACUGUCUUCUAUAUCUACCCUGUAGAUCCGGAUUUGUGUAAAAAUCAUUAAAGCAAUCACAAAUUCGCUUCUAGGGGAGUAUAUAGUGG------------------------ UCSC ENSEMBL scaffold_41:599555-599647(+) -28.11 .(((((((.....(((.((.((((.((((..((((((((((...................))))))))))..)))))))))))))))))))) tni ------------------------CUUCACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUGUAAACAUGACG---GAAGCUGCAAAUUCGGGUCUUGGGGAGGAUGU----------------------------- UCSC ENSEMBL 2:1745709-1745778(-) -28.02 ((((.(((...((((((((((((((((.............)).)))))))))))))).))))))).... cin ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- * **** **** *** ******** ** ** ** * * **** ** * *** *********** *** ******** ** ** ***** *** ***** *** * * *** ************************ * *********** *** ***** *** * ** *** ************************ * *********** ************* **** *** *** ************************ * * *********** ****************** **** *** *** ************************ * ** *********** ****************** * ***** *** *** ************************ ** * ** ************ ****************** ** ********* **************************** ****** ** ************* ****************** **** * ************************************** ****** ** *************************************** * ** *************************************** ****** ** **************************************** **** * *************************************** ********* ************************************************ * ***************************************** ********* ************************************************* * ***************************************** ********* **************************************************** ** ***************************************** ********* **************************************************** ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ********************************************* ********* ******************************************************* ******************************************************* ******************************************************* ******************************************************* ******************************************************** ******************************************************* ******************************************************** ******************************************************* ********************************************************* *****************************************************************************************************************************