hsa ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- miRbase UCSC ENSEMBL 8:9760898-9760982(-) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
ptr ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ggo ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- ENSEMBL 8:9555726-9555811(-) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
ppy ------------------------------------CCCUCUGC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAA-UGUCUAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGA------------ UCSC ENSEMBL 20:61545531-61545602(+) -27.2 ..((((..((((((((.(((..((((((((............))))))))..))).))))))))..)))).
mml ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- UCSC ENSEMBL 8:10818292-10818377(+) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
cja ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- ENSEMBL Contig281:1736353-1736438(-) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
tsy ------------------------------------UGCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAA-UGUC-AUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGC------------ ENSEMBL scaffold_9062:6442-6512(+) -29.7 .(((((..((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))..)))))
mmr ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUUUGAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAAAGGCACGCGGUGAAUGCCAAGAACGGGGCUG----- ENSEMBL scaffold_18863:11758-11845(-) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..(((((((((.............)))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
oga --------------------------------------CCCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAA-UGUC-AUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGCGGAG-------- ENSEMBL scaffold_103914:373031-373103(+) -27.2 (((((.((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))...))).))..
tbe --------------------------------------CCCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAA-UGUC-AUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGCGGAG-------- ENSEMBL scaffold_9514:66092-66164(+) -27.2 (((((.((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))...))).))..
cpo ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- UCSC ENSEMBL scaffold_1:66413088-66413173(+) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
dor ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- ENSEMBL GeneScaffold_5586:28367-28452(-) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
mmu ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- miRbase UCSC ENSEMBL 14:65209494-65209578(+) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
rno ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- miRbase UCSC ENSEMBL 15:43944536-43944620(+) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
str ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
opr ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- ENSEMBL scaffold_7597:41147-41232(-) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
ocu ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- ENSEMBL scaffold_4:40110264-40110349(+) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
bta ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- UCSC ENSEMBL 8:9359005-9359090(+) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
ttr ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- ENSEMBL scaffold_115631:54106-54191(+) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
vpa ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ssc ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- ENSEMBL 14:13279339-13279424(-) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
cfa ---------------------------------------------GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCA----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 25:31177031-31177089(+) -22.12 ((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..
fca ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- ENSEMBL scaffold_206902:275991-276076(+) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
eca --------------------------------------CCCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAA-UGUC-AUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGCGGAG-------- UCSC ENSEMBL 9:20522387-20522459(-) -27.2 (((((.((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))...))).))..
mlu ------------------------------AGGCCUCUCUCUCCCGUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGC------- ENSEMBL scaffold_166771:81091-81175(+) -32.12 ..(((((..(((...((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))
pva --------------------------------------CCCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAA-UGUC-AUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGCGGAG-------- ENSEMBL scaffold_4440:15472-15544(+) -27.2 (((((.((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))...))).))..
eeu --------------------------------------CCCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAA-UGUC-AUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGCGGAG-------- ENSEMBL scaffold_345118:5775-5847(-) -27.2 (((((.((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))...))).))..
sar ------------------------------------CCCUCUGC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAA-UGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGA------------ ENSEMBL scaffold_121817:304-375(+) -27.2 ..((((..((((((((.(((..((((((((............))))))))..))).))))))))..)))).
cho ---------------------------------UCUG-CCCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAA-UGUC-AUACAAAAAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGCGGAG-------- ENSEMBL scaffold_1460:24788-24864(+) -27.8 (((((.((..((((((((.(((..(((((((.....))))........)))..))).))))))))..)).))))).
ete ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- ENSEMBL scaffold_305196:8197-8282(-) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
laf ------------------------------------CCCUCUGC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAA-UGUCUAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGA------------ ENSEMBL scaffold_121:987723-987794(-) -27.2 ..((((..((((((((.(((..((((((((............))))))))..))).))))))))..)))).
pca ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- ENSEMBL scaffold_15971:28005-28090(+) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
meu ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- ENSEMBL Scaffold610703:30-115(-) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
mdo ------------------------------AGGCCUCUCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAAUGGGGCUG----- UCSC ENSEMBL 1:587846264-587846349(+) -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))).
oan ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
gga --------------------------------GCCUCUCUCUGC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAA-UGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGA------------ UCSC ENSEMBL 20:8681786-8681861(+) -28.7 ...(((((.((.((((((((.(((..((((((((............))))))))..))).)))))))))))))))
mga --------------------------------GCCCCAGCGUUUCGUGUUCACUGCAGACCUU-GAUUUCA-UGUC-ACACCAUUAA-GGCACGCAGUGAAUGCCAAAGGGGG---------- UCSC ENSEMBL 25:1921869-1921946(+) -27.82 .((((....(((.(((((((((((...(((((((.............)))))))...))))))))))).))))))).
tgu AGAGAGAGAGAGCGAGACAGAGCACUCUAAGGCUCUGACUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAA-UGUC-AUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGCGGAUC------- miRbase ENSEMBL 2:120492455-120492565(+) -38.8 ......((((.((........)).)))).....((((.((((..((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))..))))))))..
aca ------------------------------AGGCCCCUCUCUGC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCUAAGAACGAGGC------- UCSC ENSEMBL scaffold_370:613455-613538(+) -29.02 .....(((((((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))).
xtr ------------------------------------GACUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAA-UGUC-AUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGU------------ UCSC ENSEMBL scaffold_189:1874522-1874592(+) -28.4 .(((((..((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))..)))))
dre ------------------------------GGCUCUCGCUGUAC-GUGUUCACAGUGGACCUU-GAUUUAU-UGUAU-UUCAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAACAGCACAGCC------ miRbase UCSC ENSEMBL 2:25338635-25338716(-) -32.4 ((((...(((((..((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))..)))))..))))
gac -------------------------------------UCUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAA-UGUCU-UACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGA------------ UCSC ENSEMBL groupXXI:7414925-7414994(-) -28.7 (((((..((((((((.(((..(((((((((((....))).))))))))..))).))))))))..)))))
ola -----------------------------------UCUCUCCUC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGAGC---------- UCSC ENSEMBL 24:126718-126793(+) -28.82 .(((((...((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))...))))).
tru -----------------------------------UCUCUCCUC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAAAUGUCCAUACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGAGC---------- UCSC ENSEMBL scaffold_120:114025-114100(-) -28.82 .(((((...((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))...))))).
tni --------------------------------------CUCUCC-GUGUUCACAGCGGACCUU-GAUUUAA-UGUCU-UACAAUUAA-GGCACGCGGUGAAUGCCAAGAG------------- miRbase UCSC ENSEMBL 6:3469438-3469504(-) -26.8 ((((..((((((((.(((..(((((((((((....))).))))))))..))).))))))))..))))
cin ----------------------------------UAUGUUCGGUAGUAUUUAUUGUGGACCUU---GCUGUGUGACGUCACAAUAAG--GCACGCGGUGAAUGCCAACGAAUUUUU------- miRbase UCSC ENSEMBL 7q:6301475-6301551(+) -29.9 ...(((((...((((((((((((..(((((.((((......)))).)))))..))))))))))))...)))))....
csa ---------------UUAUAAUCGACGUCAUAGCCAAGUUCGAUCGUGUUUAUUGUGGACCUU---GCCGUGUGACGUCACAGUAAG--GCACGCGGUGAAUGCCAACGAACUCGCGCUGCAU miRbase ENSEMBL reftig_262:49392-49494(+) -36.4 ...............((((..((((((...((((((((((((..((((((.(((......))).))))))..))))))))))))...))))))...))))...
dme ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
** ** * * ****** ** * * ****** ******** *
***** * * ******* * ** * ***** * ******************
******** * ******* ***** **** ***** ** *******************
* ****************** ******* **** ********* *******************
* * * ****************** ******* **** ********* ******************* *
* ** * ****************** ******* **** ********** *********************
* ** * ****************** ******* **** ********** *********************
* ** * ****************** ******* **** ********** *********************
**** * ****************** ******* **** ********** *********************
**** * ****************** ******* **** ********** *********************
**** * ****************** ******* **** ********** *********************
**** * ****************** ******* **** ********** *********************
****** ****************** ******* **** ********** ********************* *
****** ****************** ******* **** ********** ********************* *
* ****** ****************** ******* **** ********** ********************* * *
* ****** ****************** ******* **** ********** ********************* ** *
* * ****** ****************** ******* **** ********** ********************* ** *
*** ****** ****************** ******* *************** ********************* ** *
********** ****************** ******* *************** ********************* ** *
************ ****************** *********************** ********************* ** **
************* ****************** *********************** ********************** ** **
************* ****************** *********************** ********************** ** **
************** ****************** *********************** ********************** *****
************** ****************** *********************** ****************************
************** ****************** *********************** ******************************
************** ****************** *********************** ******************************
************** ****************** *********************** ******************************
************** ****************** *********************** ******************************
************** ****************** *********************** ******************************
************** ****************** *********************** ******************************
************** ****************** *********************** ******************************
************** ****************** *********************** ******************************
************** ****************** *********************** ******************************
************** ****************** *********************** ******************************
************** ****************** *********************** ******************************
************** ****************** *********************** ******************************
************** ****************** *********************** ******************************
************** ****************** *********************** ******************************
************** ****************** *********************** ******************************
************** ****************** *********************** ******************************
********************************* *********************** ******************************
* * * ********************************** *********************** ******************************
***************************************************************************************************************************