hsa -------------------------------------------------CGCUGGCGACGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCCGUCCACGGCA----------- miRbase UCSC ENSEMBL 9:139565054-139565138(+) -39.6 .((((..(((((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..)))))..)))). ptr --------------------------------------------------GCUGGCGACGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCCGUCCACGGCA----------- miRbase UCSC ENSEMBL 9:136919747-136919830(+) -39.3 ((((..(((((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..)))))..)))). ggo ----------------------------------------------------------CGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCCGUC------------------ ENSEMBL 9:120659425-120659494(+) -27.4 (((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..))).. ppy -------------------------------------------------CGCUGGCGACGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCCGUCCAC--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 9:133658664-133658744(+) -32.5 .......(((((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..)))))... mml -------------------------------------------------CGCUGGUGAUGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCUGUCCACAGCA----------- miRbase UCSC ENSEMBL 15:1616032-1616116(-) -35.9 .((((..(((((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..)))))..)))). cja -------------------------------------------------------UGACAGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCUGUC------------------ ENSEMBL Contig269:3309420-3309492(+) -29.9 .(((((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..))))) tsy -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mmr ----------------------------------------------------------CGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCCGUC------------------ ENSEMBL GeneScaffold_3629:16228-16297(+) -27.4 (((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..))).. oga --------------------------------------------------------GACGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCUGUC------------------ ENSEMBL scaffold_117060:8699-8770(-) -29.2 (((((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..))))) tbe -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cpo --------------------------------------------------------GACGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCUGUCA----------------- UCSC ENSEMBL scaffold_18:39180085-39180157(+) -30.9 (((((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..))))). dor ----------------------------------------------------------CGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCCGUCA----------------- ENSEMBL GeneScaffold_5414:8399-8469(+) -27.4 (((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..)))... mmu -------------------------------------------------------UGACAGCACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCGGUCA----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 2:26446877-26446949(+) -31.7 .(((.((.(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).))))))))))).)).))). rno -------------------------------------------------------UGACAGCACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGUGGUCA----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:4768117-4768189(+) -30.1 .(((.((.(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).))))))))))).)).))). str -------------------------------------------------------------GGCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCCGUCUG---------------- ENSEMBL scaffold_156174:616-684(-) -27.1 .((((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).))))))))))))........ opr --------------------------------------------------------GACGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCUGUCA----------------- ENSEMBL GeneScaffold_4122:1592-1664(+) -30.9 (((((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..))))). ocu -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- bta -------------------------------------------------------UGACGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCUGUCA----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:108009392-108009464(+) -30.9 .(((((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..))))). ttr ----------------------------------------------------------CGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCCGUU------------------ ENSEMBL GeneScaffold_711:431968-432037(+) -27.4 (((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..))).. vpa -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ssc -------------------------------------------------------CGACGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCUGUCG----------------- miRbase ENSEMBL 1:294113069-294113141(+) -31.6 ((((((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..)))))) cfa ---------------------------------------------------------------CAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCG----------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 9:52212252-52212310(-) -22.4 (((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).))))))))))).. fca --------------------------------------------------------GACGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCUGUC------------------ ENSEMBL GeneScaffold_3909:113362-113433(+) -29.2 (((((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..))))) eca -------------------------------------------------------CGACGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCCGUCG----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 25:37315402-37315474(-) -33.8 ((((((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..)))))) mlu -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- pva --------------------------------------------------------GACGGAACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCUGAC------------------ ENSEMBL GeneScaffold_3104:16166-16237(+) -27.2 ..(((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..))).. eeu --------------------------------------------------------GACGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCUGUC------------------ ENSEMBL GeneScaffold_7120:16835-16906(+) -29.2 (((((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..))))) sar -----------------------------------------------------------GGGCCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UGCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCCGUC------------------ ENSEMBL scaffold_101253:456-524(+) -29.8 .((((((((((((((.(((((((...(((......)))....))))))).))))))))))).)))... cho -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ete --------------------------------------------------------GACGGGACAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-GUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCUGUC------------------ ENSEMBL GeneScaffold_6963:3615-3686(+) -30.5 (((((..(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).)))))))))))..))))) laf -------------------------------------------------------------GGCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-GUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCUGUCGG---------------- ENSEMBL scaffold_166:756459-756527(-) -28.4 .((((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).))))))))))))........ pca -------------------------------------------------------------GGCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-GUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGUUGUCGGC--------------- ENSEMBL GeneScaffold_6049:2159-2228(+) -28.4 .((((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).))))))))))))......... meu -----------------------------------------------------------GGGUCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-AUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCCAUU------------------ ENSEMBL GeneScaffold_7795:19901-19969(+) -27.1 .((((((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).))))))))))).)))... mdo -----------------------------------------------------------GGGUCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-AUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCCAUUG----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:464882831-464882899(-) -27.1 .((((((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).))))))))))).))).... oan -----------------------------------GAAGCAUCAGUGACAGCUGGCAACUGCCCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACGC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGUGGCUGGCAGCACUGGCAGCGCC miRbase UCSC ENSEMBL Ultra157:304102-304211(-) -43.3 ...((.((((((...((..((....((.(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).))))))))))).)).))..))..))))))..))... gga --------------------------------------------------GCUGGUGACGGCCCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCUGUGGUCAGCA----------- miRbase UCSC ENSEMBL 17:8431742-8431825(-) -40.7 (((((..(((((.(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).))))))))))).)))))..))))). mga -----------------------------------------------------------GGCCCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCUGUG------------------ UCSC ENSEMBL 19:8412373-8412441(-) -27.2 (((.(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).))))))))))).)))... tgu AUCCUCGUUCCUGCAGGGCGGGUCUGGAGCCACGAGGAGCGGCGGGCGCCGCUGGUGACGGCCCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGACAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCUGUGGCCAG------------- miRbase ENSEMBL 17:8833549-8833680(-) -66.6 .(((((((..((.((((.....)))).))..)))))))(((((....)))))((((.(((((.(((((((((((.(((((((.....(((....)))....))))))).))))))))))).))))).)))). aca -------------------------------------------------------CCGCGGUCCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGCCAC-UUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCUGAGGG---------------- UCSC ENSEMBL scaffold_2164:15776-15850(-) -29.7 ((.((((.(((((((((((.(((((((.....((......))....))))))).))))))))))).)))).)). xtr --------------------------------------------------------GGCUGUGCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUGUGUCAC-AUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCGCAG-------------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_137:1684934-1685002(-) -32.8 ..((((((((((((((((.(((((((.....((......))....))))))).)))))))))))))))) dre --------------------------------------GAGCCAUUUUAACUGCUUCACAGUCCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUAGGCCAGACUCAAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCACUGUGGCAGUGGGUUU------- miRbase UCSC ENSEMBL 8:11385601-11385701(-) -40.9 (((((......(((((..((((((.(((((((((((.(((((((....((......))......))))))).))))))))))).))))))))))).))))) gac -------------------------------------------------------UCGCGGCCCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUAUGCCAC-UCUCAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCACUGCG------------------ UCSC ENSEMBL groupXIV:1917955-1918027(+) -27.11 .(((((..(((((((((((.(((((((...................))))))).)))))))))))..))))) ola ---------------------------------------------------------GCGGUCCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUAUGCCAC-UCUCAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCACUGCG------------------ UCSC ENSEMBL 12:5052123-5052193(+) -28.41 (((((.(((((((((((.(((((((...................))))))).))))))))))).))))). tru -------------------------------------------------------UCGCGGCCCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUAUGCCAC-UCUCAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGCACUGCG------------------ UCSC ENSEMBL scaffold_49:988576-988648(+) -27.11 .(((((..(((((((((((.(((((((...................))))))).)))))))))))..))))) tni ----------------------------------------------------------CGGCCCAUUAUUACUUUUGGUACGCGCUAUGCCAC-UCUCAACUCGUACCGUGAGUAAUAAUGC------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 4:5708445-5708507(-) -19.41 .....(((((((((((.(((((((...................))))))).))))))))))). cin ----------------------------------------------------UUUCGAUGCUGCCUUGUUACCUACGGUACCAGGUAGAAAGUAUGUCAUCUCGUACCGUGAGUAAUAAAGCAUUCUCGGGAG------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1q:1582551-1582631(+) -29.6 ((((((...(((.(((((((.((((((((.((((.((.......)))))).)))))))).))))))).)))...)))))). csa ------------------------------------GUGUCAUAAUUAUGGUUUUCGAUGCUGCCUUGUUACCUACGGUACCAGGUAGAAAGUAAGUCAUCUCGUACCGUGAGUAAUAAAGCAUUCUCGGAGGCUCA--------- miRbase ENSEMBL reftig_27:688926-689026(-) -34.3 .............(((((((((...(((.(((((((.((((((((.((((.((.......)))))).)))))))).))))))).)))...))))))))).. dme -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- * ** **** * ***** * * * ******************* ** * ** **** * ***** * * * ******************* ** *********************** * * ************************ *********************** ** *** ************************ *********************** ** *** ************************ *********************** ** *** ************************ * *********************** ** *** ************************** * * ****************************** ***************************** * * ****************************** ****************************** * * ****************************** ****************************** ** ** ****************************** ****************************** ** *** ****************************** ****************************** ** *** ****************************** ****************************** ** *** ****************************** ****************************** ** *** ****************************** ****************************** ** *** ****************************** ****************************** *** *** ****************************** ****************************** *** **** ****************************** ****************************** *** ***** ****************************** ********************************** ****** ****************************** ********************************** ************************************* ********************************** ************************************* ********************************** ************************************* ********************************** ************************************* ********************************** ************************************* ********************************** ************************************* ********************************** ************************************* ********************************** ************************************* ********************************** ************************************* ********************************** ************************************* *********************************** ************************************* *********************************** ************************************** *********************************** * ************************************** *********************************** * * ************************************** *********************************** * * ******************************************* ************************************* * ******************************************* ************************************* ** ******************************************* ***************************************** * ******************************************** ***************************************** * ** * ************************************************************************************** ****** *********************************************************************************************** **************************************************************************************************************************************************