hsa ----------------UGCUGCUGGCCAGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CACCUGUCACUA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUUGGCCGUGUAGUG---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:57408671-57408759(+) -42.6 .((((((((((((.((((((((.((((((..((.(((...((....))...))).))..)))))).)))))))).))))))).))))). ptr -----------------GCUGCUGGCCAGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CACCUGUCACUA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUUGGCCGUGUAGUG---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11_random:5956048-5956135(+) -42.4 ((((((((((((.((((((((.((((((..((.(((...((....))...))).))..)))))).)))))))).))))))).))))). ggo ----------------UGCUGCUGGCCAGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CACCUGUCACUA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUUGGCCGUGUAGUG---------------- miRbase -42.6 .((((((((((((.((((((((.((((((..((.(((...((....))...))).))..)))))).)))))))).))))))).))))). ppy ----------------UGCUGCUGGCCAGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CACCUGUCACUA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUUGGCCGUGUAGUG---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:19239577-19239665(-) -42.6 .((((((((((((.((((((((.((((((..((.(((...((....))...))).))..)))))).)))))))).))))))).))))). mml ----------------UGCUGCUGGCCAGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CACCUGUCACUA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUUGGCC------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 14:15771851-15771931(-) -34.4 .......((((((.((((((((.((((((..((.(((...((....))...))).))..)))))).)))))))).)))))) cja ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tsy ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mmr ----------------UGCUGCUGGCCAGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CACCUGUCACUA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUUGGCCGUGUAGUG---------------- ENSEMBL GeneScaffold_4061:539328-539417(+) -42.6 .((((((((((((.((((((((.((((((..((.(((...((....))...))).))..)))))).)))))))).))))))).))))). oga ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tbe ----------------UGCUGCUGGCCGGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CAUCUGUCACUA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUUGGC------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_4100:47772-47852(+) -30.3 ........(((((.((((((((.((((((..((.(((...((....))...))).))..)))))).)))))))).))))) cpo ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dor ----------------UGCUGCUGGCCAGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUA-CACCUGUCACGA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUUGGCC------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_4996:9235-9316(+) -33.3 .......((((((.((((((((.((((((..((.((((..((....)).)).)).))..)))))).)))))))).)))))) mmu ----------------------------GAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUA--ACGUGUACCGA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUC---------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 2:84581272-84581335(-) -22.16 ..((((((((.((((((..((.((...............)).))..)))))).))))))))... rno ----------------UGCUGCUGGCCGGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUA-CACGUGUACCGA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUCGGCCUUGUAGU----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:67949594-67949681(-) -42.3 .(((((.(((((..((((((((.((((((..((.((...(((....)))...)).))..)))))).))))))))..)))))..))))) str ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- opr ------------------------GCCAGCGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CGCCUAUCACGA--GCAGUGCAAUGUCA-AAAGGGCAUUGGCCUGGUAGU----------------- ENSEMBL scaffold_13234:11531-11611(+) -30.2 (((((.((((((((.(((((((...((((.((.((.......))))))))))))))).)))))))).)))))........ ocu ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- bta ----------------UGCUGCGGGCCGGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CGCCUGUCACUA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUUGGCUGUGCAGCG---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 15:81392289-81392377(+) -42.5 .((((((((((((.((((((((.((((((..((.(((...((....))...))).))..)))))).)))))))).)))))).)))))). ttr ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- vpa ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ssc ---------------------CGGGCCGGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CACCUAUCACUA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUUGGCCACG--------------------- miRbase ENSEMBL 2:11301854-11301932(-) -33.64 ((((((((.((((((((.((((((..((.(((..............))).))..)))))).)))))))).)))))).)) cfa ------------------------------GCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CACCUACCACUA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAU----------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 18:41608990-41609051(-) -22.7 ((((((((.((((((..((.(((..((.......)).))).))..)))))).)))))))).. fca ----------------UGCUGCGGGCCGGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CACCUACCACUA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUUGGCCGUGUAGU----------------- ENSEMBL GeneScaffold_4670:172286-172374(+) -39.3 .((((((((((((.((((((((.((((((..((.(((..((.......)).))).))..)))))).)))))))).)))))).)))))) eca ----------------------------GAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CACCUACCACUA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAU----------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 12:17657890-17657953(+) -22.9 ..((((((((.((((((..((.(((..((.......)).))).))..)))))).)))))))).. mlu ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- pva ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- eeu ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- sar ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cho ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ete ----------------UGCUGCUGGCCAGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CACCGAUCACUA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUUGGCC------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_6924:13280-13361(+) -33.3 .......((((((.((((((((.((((((..((.(((((......)))....)).))..)))))).)))))))).)))))) laf ----------------UGCUGCUGGCCAGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CACCUAUCACUA--GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUUGGCC------------------------ ENSEMBL scaffold_115:1425407-1425488(+) -32.54 .......((((((.((((((((.((((((..((.(((..............))).))..)))))).)))))))).)))))) pca ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- meu ---------------------CUGGCCGGGGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CGCUUGUCACUA--GCAGUGCAAUGUAA-AAAGGGCAUUGGC------------------------- ENSEMBL Scaffold75640:586-661(+) -29.6 ...(((((.((((((((.((((((..((.(((...((....))...))).))..)))))).)))))))).))))) mdo ----------------------UGGCCAGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CACCUAUCACUA--GCAGUGCAAUGUAA-AAAGGGCAUUGGCUG----------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 5:291845601-291845676(+) -31.74 .((((((.((((((((.((((((..((.(((..............))).))..)))))).)))))))).)))))). oan GCCCGGUCCUGUCCUUCGCUCCCGGCCGGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUG-CGCCCGUCACUA--GCAGUGCAAUGUAAUAAGGGGCUUCGGCGGGGCAGCUGCUACCAUCUCCGGGU miRbase UCSC ENSEMBL Contig83413:58-179(-) -58.3 ((((((...((......((((((.(((((((((((((..((((((..((.(((...((....))...))).))..))))))...))))))))))))).))).)))......))...)))))) gga ----------------UGCUGUUGUCCAGAGCCCUUUUUCUGUUGUACUACUGGCAAUUAUG-AUGA-----GCAGUGCAAUAUUA-AAAGGGCAUUGGCUGGCAG------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 15:408399-408481(-) -33.2 ..((((((.((((.((((((((..(((((((((.((..((....))...)).)))))))))..)))))))).)))).)))))) mga -------------------------CCAGCGCCCUUUUUAUGUUGUACUACUAGUGAUCAUACACAAA----GCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUUGGCC------------------------ UCSC ENSEMBL 21:7571659-7571730(-) -29.4 ((((.((((((((.((((((((((.((.(((......)))..)).)))))))))).)))))))).)))).. tgu ---------------------------AGAGCCCUUUUUCUGUUGUACUACUGGCAAUUAUG-AUGA-----GCAGUGCAAUAUUA-AAAGGGCAUUGGCUGGCAG------------------- miRbase ENSEMBL 15:8478910-8478981(+) -24.2 ...((((((((..(((((((((.((..((....))...)).)))))))))..))))))))............ aca ----------------------UGUCCGGAGCCCUUUUUCUGUUGUACUACUGGCAAGUAUG-AGUA-----GCAGUGCAAUAUUA-AAAGGGCAUUGGCUGGCAG------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_348:575327-575404(+) -29.5 ((.((((.((((((((..(((((((((.(((.((....))..))).)))))))))..)))))))).....)))))). xtr ---------------------CUGUCCAGUGCCCUUUUUAUGUUGUACUACUAGUGGUCACACACAAAAAAAGCAGUGCAAUGUUA-AAAGGGCAUUGGCCAGGG-------------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_92:2370211-2370293(-) -37.8 (((.(((((((((((((.((((((((((.((.(((......)))......)).)))))))))).))))))))))))).))).. dre ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- gac ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ola ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tru -----------------------AUCCAAAGCCCUUUUUCUGUUGUACUACUGUGAAAUCAG-AUGA-----GCAGUGCAAUAUUA-AAAGGGCAUUGGC------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_442:91861-91931(+) -27.02 ..((((.((((((((..(((((((((.((.............)).)))))))))..)))))))).)))). tni --------------------GUUGUCCUCUGCCCUUUUUCUGUUGCACCACUGGACACUGAG-AUGA-----GCAGUGCAAUAUUA-AAAGGGCAUUGGCUGAUGA------------------- UCSC ENSEMBL 4:1515775-1515854(+) -27.32 ((((.((..(((((((((..((((((((..((.............))..))))))))..)))))))))..)).)))).. cin ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ** ***** *** * *** ********** * * ** **** * ** ***** **** ***** ********** * * ********* ** ***** **** ****** * ********** * * ********* * ** ***** **** ****** * ********** * * ********* *** ** * ** ***** **** ****** * * ********** *** ********* *** ** * ** ***** * **** ****** * * ************** ************* ** **** ***** * **** ******** ** * * * ************** ************* * ** **************************** *** * ** * ************** ************* * ** **************************** *** * ** * ************** ************* * ** ***************************** *** * **** * ************** ************* **** ***************************** ***** **** * ************** ************* ****** ***************************** ***** ****** ************** ************* ************************************ ***** ****** ************** ************* **************************************** ************ ************** ************** **************************************** ************ ************** ************** ***************************************** ************ ************** *************** ***************************************** ************ ************** *************** * ***************************************** ************ ************** *************** * * ***************************************** ************ ************** *************** * ** ***************************************** ************ ************** *************** * ** ***************************************** ************ ************** ********************* ***************************************** ************ ************** ********************* ***************************************** ************ ************** ********************** ***************************************** ************ ************** ********************** ****************************************************** ************** ********************** ****************************************************** ************** ********************** ****************************************************** ************** ********************** *****************************************************************************************************************************