hsa CCGCCCCCGCGUCUCCAGGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACUGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCCCGCAGCACGCCCACGCGC miRbase UCSC ENSEMBL 17:1953202-1953302(-) -44.9 .(((....((((((...((((.(((((((((...((((((((((............))))))))))...))))))))).))))...)).))))....))).
ptr -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
ggo -------------------------GCGGAUGGGGAGUGGCUAAAGCGGGAACUGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCCCGCAGCACGC-------- ENSEMBL 17:2026020-2026089(-) -27.6 (((..(((((.(((((((..((.(((.(((.......))))))...))..)))))))))).))...)))
ppy CCGCCCCCGCGUCUCCAGGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACUGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCCCGCAGCACGCCCACGCGC miRbase UCSC ENSEMBL 17:1926594-1926694(-) -44.9 .(((....((((((...((((.(((((((((...((((((((((............))))))))))...))))))))).))))...)).))))....))).
mml CCGCCCCCGCGUCUCCAGGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACUGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCCCGCAGCACGCCCACGCGC miRbase UCSC ENSEMBL 16:1845434-1845534(-) -44.9 .(((....((((((...((((.(((((((((...((((((((((............))))))))))...))))))))).))))...)).))))....))).
cja -----------------GGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACUGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCCCG---------------- ENSEMBL Contig421:213346-213414(+) -35.5 ((((.(((((((((...((((((((((............))))))))))...))))))))).))))..
tsy -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
mmr CCGCCCCCGCGUCUCCAGGGCAACCGUGGCU-UCGAUUGUUACUGU-GGGAACCGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCCCGCAACAGGCCCACG--- ENSEMBL GeneScaffold_1841:223460-223557(-) -43.5 ..(((...(((......((((.(((((((((..((((((((((.(((...)))..))))))))))...))))))))).)))))))....))).....
oga -------CGCGUCUCCAGGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU--GGAACCGGA-----GUAAACAGCCUACAGUCAUGAUCGCCCCGCAGCACGC-------- ENSEMBL GeneScaffold_5721:10884-10969(-) -28.1 .((((((...((((...(((((((.....((((((((.((....)).))).))))).....)))))))...))))...)).))))
tbe -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
cpo -----------------GGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACCGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCC------------------ UCSC ENSEMBL scaffold_32:20419185-20419251(+) -37.3 ((((.(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...))))))))).))))
dor -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
mmu -----------------GGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACCGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCC------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 11:74987184-74987249(+) -37.3 ((((.(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...))))))))).))))
rno CCGCCCCCGCGUCUCCAGGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACCGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCCCGCAGCACGCCCACGCUC miRbase UCSC ENSEMBL 10:62480727-62480827(+) -45.9 ..((....((((((...((((.(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...))))))))).))))...)).))))....))..
str -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
opr -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
ocu -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
bta CCGCCCCCGCGUCUCCAGGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACCGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCCCGCAGCACGCCCACGCGC miRbase UCSC ENSEMBL 19:23161083-23161183(-) -47.5 .(((....((((((...((((.(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...))))))))).))))...)).))))....))).
ttr -----------------GGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACCGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCC------------------ ENSEMBL GeneScaffold_3179:203094-203160(-) -37.3 ((((.(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...))))))))).))))
vpa -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
ssc -----------------GGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACCGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCC------------------ ENSEMBL 12:45599490-45599556(-) -37.3 ((((.(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...))))))))).))))
cfa ---------------------AACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACCGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGC-------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 9:49478539-49478598(-) -28.3 .(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...)))))))))...
fca -----------------GGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACCGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCC------------------ ENSEMBL GeneScaffold_1115:788360-788426(-) -37.3 ((((.(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...))))))))).))))
eca -----------------GGACAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACCGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCC------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 11:45639836-45639901(-) -30.6 ((...(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...)))))))))..)).
mlu -----------------GGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACCGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCC------------------ ENSEMBL GeneScaffold_1320:114593-114659(-) -37.3 ((((.(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...))))))))).))))
pva -----------------GGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACCGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCC------------------ ENSEMBL GeneScaffold_2866:287660-287726(-) -37.3 ((((.(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...))))))))).))))
eeu -----------------GGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACCGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCC------------------ ENSEMBL scaffold_354418:3968-4034(-) -37.3 ((((.(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...))))))))).))))
sar -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
cho -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
ete -----------------GGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACCGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCC------------------ ENSEMBL GeneScaffold_2024:58974-59040(-) -37.3 ((((.(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...))))))))).))))
laf -----------------GGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACCGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCC------------------ ENSEMBL scaffold_47:5203278-5203344(-) -37.3 ((((.(((((((((...((((((((((.(((...)))..))))))))))...))))))))).))))
pca -----------------GGGCAACCGUGGCUAUCGAUUGUUACUGUAGGGAACCGGA-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCCCG---------------- ENSEMBL GeneScaffold_1767:90452-90521(-) -38.5 ((((.(((((((((...((((((((((...((...))...))))))))))...))))))))).))))..
meu -----------------GGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACCGGG-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCCCG---------------- ENSEMBL Scaffold3745:40288-40356(-) -37.0 ((((.(((((((((...((((((((((.(((...))).)).))))))))...))))))))).))))..
mdo -----------------GGGCAACCGUGGCUUUCGAUUGUUACUGU-GGGAACCAGG-----GGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCC------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 2:517586549-517586614(-) -36.9 ((((.(((((((((...((((((((((.(((...))).)).))))))))...))))))))).))))
oan -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
gga -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
mga -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
tgu -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
aca -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
xtr --------CUGUCUCCAGGGCAACCGUGGCUUUAGAUUGUUACUGU-AGU-UCUGCAU---UGGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCUCGGGCAAGAUGC------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_267:945048-945134(-) -43.3 ..((((((.((((.(((((((((.(((((((((((((((....)))...)))))))))))).))))))))).)))).))..))))..
dre ----------------------ACCGUGGCUUUAGAUUGUUACUGU-AGCGUUGGCACG--UGGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCCAAGGGG------------- UCSC ENSEMBL 10:33927514-33927583(+) -33.1 (((((((((.((((((((((((...((((....)))))))))))))))).)))))))))..........
gac ----------------------ACCGUGGCUUUAGAUUGUUACUCU-AGCAACAGCAGCA-UGGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGUUAGGG--------------- UCSC ENSEMBL groupVII:19497340-19497408(+) -31.7 (((((((((.((((((((((((((.((....))))...)))))))))))).)))))))))........
ola ----------------------ACCGUGGCUUUAGAUUGUUACUCU-AGCAAAAGCACUG-UGGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGUUAGGG--------------- UCSC ENSEMBL 14:9212087-9212155(+) -32.6 (((((((((.((((((((((((.(((........))).)))))))))))).)))))))))........
tru -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
tni ----------GUCUCCAUGGUUACCGUGGCAUUAGAUUGUUACUGU-AGCAACUGCACCAGCGGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCUAGGGGGCA----------- miRbase UCSC ENSEMBL Un_random:63608560-63608644(+) -47.7 ((((((.((((.((((((((..((((((((((((((.((....))....))))))))))))))..)))))))).)))))))))).
cin -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
csa -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel -----------------------------------------------------------------------------------------------------------
* ** ** ** * * ***** ****** **** ***
********* * ********** * * * ************************
********* * ********** * * *** * * *************************
*********** ************ * *** * * *************************
*********** ************ * *** * * *************************
* ************ ************ ***** *** ***************************
***************************** ****** *** ***************************
***************************** ****** *** ***************************
***************************** ****** *** ***************************
***************************** ****** *** ***************************
***************************** ********** ***************************
***************************** ********** ***************************
***************************** ********** ***************************
***************************** ********** *************************** *
***************************** ********** *************************** *
***************************** ********** *************************** *
***************************** ********** *************************** *
***************************** ********** *************************** *
***************************** ********** *****************************
***************************** ********** *****************************
************************************ ********** ***************************** ***
************************************ ********** ********************************** **
*************************************** ********** **************************************
********************************************** ********** ******************************************
********************************************** ********** ******************************************* *
********************************************** ********** **********************************************
********************************************** *********** **********************************************
********************************************** ************* **********************************************
***********************************************************************************************************