hsa GGUCCUCUGACUCUCUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGGAGAGUACCAGCGGCA miRbase UCSC ENSEMBL 1:98511626-98511727(-) -47.9 .(((((...(((((((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))))))))...)).))). ptr GGUCCUCUGACUCUCUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGGAGAGUACCAGCGGC- miRbase UCSC ENSEMBL 1:99606251-99606351(-) -47.6 ...((.((((((((((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))))))))..))).)). ggo ------------------------------------------------------------------------------------------------------- ppy GGUCCUCUGACUCUCUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGGAGAGUACCAGCGGCA miRbase UCSC ENSEMBL 1:130594384-130594485(+) -47.9 .(((((...(((((((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))))))))...)).))). mml GGUCCUCUGACUCUCUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGGAGAGUACCAGCGGCA miRbase UCSC ENSEMBL 1:101111773-101111874(-) -47.9 .(((((...(((((((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))))))))...)).))). cja --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- ENSEMBL Contig91:6707843-6707916(-) -31.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) tsy --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- ENSEMBL scaffold_17821:652-725(+) -31.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) mmr ------------------------------------------------------------------------------------------------------- oga --------GACUAUCUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUAAGCGUAGUCGAUGAGAGUA--------- ENSEMBL scaffold_14933:4834-4919(+) -29.1 .(((.((.((((..(((..((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))..)))..)))).)).))). tbe ------------------------------------------------------------------------------------------------------- cpo ------------------------------------------------------------------------------------------------------- dor ---------------UUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUAGCUUAAGAAUACGUGUAGUCGAGG--------------- ENSEMBL scaffold_1765:47090-47162(+) -29.1 (((((..(((.((((((((((((..((((((((.....)).)))))).)))))))))))).)))..))))). mmu --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:118136775-118136847(+) -31.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) rno GGCCCUCUGACUCUCUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGGAGAGUACCAGCGGCA miRbase UCSC ENSEMBL 2:214802296-214802397(+) -50.6 .(((((...(((((((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))))))))...)).))). str ------------------------------------------------------------------------------------------------------- opr ------------------------------------------------------------------------------------------------------- ocu --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- ENSEMBL scaffold_0:46244806-46244879(+) -31.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) bta GGUCCUCUGACUCUCUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGGAGAGUACCAGCGGCA miRbase UCSC ENSEMBL 3:48211601-48211702(+) -47.9 .(((((...(((((((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))))))))...)).))). ttr --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- ENSEMBL scaffold_113917:2464-2537(+) -31.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) vpa ------------------------------------------------------------------------------------------------------- ssc --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- ENSEMBL 4:124680219-124680292(-) -31.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) cfa ------------------------GGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGU----------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 6:54695674-54695728(+) -19.2 ..(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).... fca ------------------------------------------------------------------------------------------------------- eca --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 5:67623778-67623850(+) -31.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) mlu ------------------------------------------------------------------------------------------------------- pva --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- ENSEMBL scaffold_9071:2192-2265(+) -31.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) eeu ------------------------------------------------------------------------------------------------------- sar --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- ENSEMBL scaffold_232542:81886-81959(-) -31.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) cho ------------------------------------------------------------------------------------------------------- ete --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- ENSEMBL scaffold_205842:1578-1651(+) -31.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) laf --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- ENSEMBL scaffold_60:2226182-2226255(+) -31.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) pca --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- ENSEMBL scaffold_40403:2218-2291(+) -31.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) meu --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- ENSEMBL Scaffold5463:1897-1970(-) -31.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) mdo -------------------------------CUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 2:463982402-463982457(-) -10.7 ((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))................. oan --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- UCSC ENSEMBL 4:52507096-52507169(-) -31.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) gga -----UCUGACUCUCUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGGAGAGUACCGGCGGC- miRbase UCSC ENSEMBL 8:13210193-13210288(+) -43.6 .((((((((((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))))))))..))).... mga ------------------------------------------------------------------------------------------------------- tgu ------------------GGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGGAGAG----------- miRbase ENSEMBL 8:8780107-8780179(+) -25.9 ((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..))........ aca --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- UCSC ENSEMBL scaffold_511:452982-453055(-) -31.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) xtr --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUUACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUUGAGG--------------- UCSC ENSEMBL scaffold_70:1251058-1251131(-) -29.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) dre --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGCUCUCGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- UCSC ENSEMBL 24:31540869-31540942(-) -30.5 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) gac --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUCACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUCGAGG--------------- UCSC ENSEMBL scaffold_37:1093847-1093920(+) -31.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) ola ----------------UCGACCACGGGUAUUCUUGGGUUGAUAAUACAGAUAUGGA-UGUUAUUGCUUGAGAAUACGCGUAGUCGAG---------------- UCSC ENSEMBL 1:12104476-12104546(+) -29.6 (((((.(((.(((((((..(((.(((((((((....))..))))))))))..))))))).))).))))). tru --------------CUUCGGUGACGGGUAUUCUUGGGUGGAUAAUACGGAUCACGU-UGUUAUUGCUUAAGAAUACGCGUAGUUGAGG--------------- UCSC ENSEMBL scaffold_9069:2216-2289(-) -29.7 ((((((..(((.(((((((((((((.((((((((.....)).))))))))))))))))))).)))..)))))) tni ----------------UCGACCACGGGUAUUCUUGGGUUGAUAAUACAGAUGUGGA-UGUUAUUGCUUGAGAAUACGCGUAGUCGAG---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 18:4783329-4783398(-) -30.2 (((((.(((.(((((((..((((((((.(((....)))..)))))..)))..))))))).))).))))). cin ------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa ------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme -------CAAUCUCCAAUGGCCACGUGUAUGCUCGUAGCUAUAACCUGAAAUCCAAAUGUUAUUGCUUGAGAAUACACGUAGUUCACCGAGAUUUGUU----- miRbase UCSC ENSEMBL 2R:11952759-11952849(-) -28.0 .((((((....(((.((((((((.((((.(((.(((((.((.....))...))))).))))))).)))))))).)))....)))))).... cel ------------------------------------------------------------------------------------------------------- ** * **** ****** **** ****** ** * **** ******* ******** *** * *********** ************** * * **************** ************ 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