hsa --------------------------------------CGUUGCUGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUGCAUCA-------------- miRbase UCSC ENSEMBL 16:56892430-56892513(+) -35.3 ...(((.((..(((((((((((((...(((((..(((.((......)))))...)))))..))))))))))))).)).)))... ptr ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ggo ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- ENSEMBL 16:46864967-46865038(+) -30.4 ...(((((((((((((...(((((..(((.((......)))))...)))))..)))))))))))))..... ppy --------------------------------------CGUUGCUGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUGCAUCA-------------- miRbase UCSC ENSEMBL 16:44110836-44110919(+) -35.3 ...(((.((..(((((((((((((...(((((..(((.((......)))))...)))))..))))))))))))).)).)))... mml ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- UCSC ENSEMBL 20:55215781-55215852(+) -30.4 ...(((((((((((((...(((((..(((.((......)))))...)))))..)))))))))))))..... cja ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- ENSEMBL Contig197:1976162-1976233(-) -30.4 ...(((((((((((((...(((((..(((.((......)))))...)))))..)))))))))))))..... tsy ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- ENSEMBL scaffold_268666:190-261(-) -30.4 ...(((((((((((((...(((((..(((.((......)))))...)))))..)))))))))))))..... mmr ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- ENSEMBL scaffold_91606:4143-4214(+) -30.4 ...(((((((((((((...(((((..(((.((......)))))...)))))..)))))))))))))..... oga ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- ENSEMBL GeneScaffold_5039:272607-272678(+) -30.4 ...(((((((((((((...(((((..(((.((......)))))...)))))..)))))))))))))..... tbe --------------------------------------------UGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAU-CUCUUACCCGGCGAUUUCACGACACAGGUGCAU------------------- ENSEMBL GeneScaffold_951:85720-85792(+) -28.3 ((((.(((.(((((((((....((((..(((.((.....)))))...))))...)))))))))))).)))). cpo ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_22:25185273-25185344(-) -30.4 ...(((((((((((((...(((((..(((.((......)))))...)))))..)))))))))))))..... dor ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGAC-AGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1281:71481-71551(+) -28.4 ...(((((((((((((...(((((..((.((......))))....)))))..)))))))))))))..... mmu ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 8:96848211-96848281(+) -30.4 ...(((((((((((((...(((((..(((.((......)))))...)))))..)))))))))))))..... rno ---------------------------------------GUUGCUGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAACGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUGCACC--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 19:11114660-11114741(-) -33.9 ..(((.((..(((((((((((((...(((((..(((.........))).....)))))..))))))))))))).)).))).. str ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1043:147798-147869(+) -30.4 ...(((((((((((((...(((((..(((.((......)))))...)))))..)))))))))))))..... opr ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- ENSEMBL GeneScaffold_3775:304366-304437(+) -30.4 ...(((((((((((((...(((((..(((.((......)))))...)))))..)))))))))))))..... ocu ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- ENSEMBL scaffold_43:5807575-5807646(+) -30.4 ...(((((((((((((...(((((..(((.((......)))))...)))))..)))))))))))))..... bta ---------------------------------------GUUGCUGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUGCAUCA-------------- miRbase UCSC ENSEMBL 18:24486250-24486332(+) -35.3 ..(((.((..(((((((((((((...(((((..(((.((......)))))...)))))..))))))))))))).)).)))... ttr GCCACAUCCAGAGGAGGAAGCUCGCCGAGUUCUGGUAUCGUUGCUGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUU------------------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_585:159140-159240(+) -31.1 (((......((((((....(((((.((.((.(((((.((......(((((....)))))))))))))))).)))))......)))))).....))).... vpa ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ssc ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cfa ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAUGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- UCSC ENSEMBL 2:62334159-62334230(-) -29.3 ...(((((((((((((....((((..(((.((......)))))...))))...)))))))))))))..... fca ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- eca -----------------------------------------------AGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGUUGCCA---AUCAGAGAA----CGGCUACUUCACAACACCAGG----------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 16:42248842-42248900(-) -30.8 ..(((((((((((((...(((((((...........)))))))..))))))))))))). mlu ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- pva ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGGGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- ENSEMBL GeneScaffold_698:107306-107377(+) -30.4 ...(((((((((((((...(((((..((..((........))..)))))))..)))))))))))))..... eeu ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- sar ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cho ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- ENSEMBL scaffold_409935:463-534(-) -30.4 ...(((((((((((((...(((((..(((.((......)))))...)))))..)))))))))))))..... ete ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- laf ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUACCCGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- ENSEMBL scaffold_43:1155696-1155767(-) -30.4 ...(((((((((((((...(((((..(((.((......)))))...)))))..)))))))))))))..... pca ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGCAUCCUCUUA--CGGCUAUUUCACGACACCAGGGUUG------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1402:103039-103108(+) -30.5 ...(((((((((((((...(((((..(((.........)))...)))))..)))))))))))))..... meu ---------------------------------GGUAUUGUUGCUGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACAAGCAGCUCAUCCUAUUACCCGGCUAUUUCACCACACCAGGGUUGCAUCAUACC---------- ENSEMBL Scaffold338761:592-685(+) -34.15 ((((.((.(((.((..(((((((.(((((...(((((......................)))))..))))).))))))).)).))).)))))) mdo ---------------------------------GGUAUUGUUGCUGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACAAGCAGCUCAUCCUAUUACCCGGCUAUUUCACUACACCAGGGUUGCAUCAUACC---------- UCSC ENSEMBL 1:447811935-447812028(+) -34.15 ((((.((.(((.((..(((((((.(((((...(((((......................)))))..))))).))))))).)).))).)))))) oan ---------------------GACGCUCACUCUGGUAUCGGUGCUGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGAGCAGCGAGUCCUAAUACCCGGCUAUUUCACUACACCAGGGUUGCAUCAUACCACUCCGCUUC miRbase UCSC ENSEMBL Ultra517:7784856-7784970(+) -41.0 ...((......((((((.(((((.((..(((((((.(((((...(((((.((.....)).((......)).)))))..))))).))))))).)).)))))))))))....))... gga ---------------------------------------GUUGCUGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGGCAAGCGCUUCCUACUAUCCGGCUAUUUCACUACACCAGGGUUGCAUCA-------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:2023954-2024036(-) -30.1 ..(((.((..(((((((.(((((...(((((..(((....)))..........)))))..))))).))))))).)).)))... mga --------------------------------------------UGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGGCAAGCGCUUCCUACUAUCCGGCUAUUUCACUACACCAGGGUUGCA----------------- UCSC ENSEMBL 13:774546-774621(+) -28.6 .(((((((((((.(((((...(((((..(((....)))..........)))))..))))).)))))..)))))). tgu -------------------------------------UUGUUGCUGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACGACAAGCGCUUCCUACAAUCCGGCUAUUUCACUACACCAGGGUUGCAUCAUACCACUC------ miRbase ENSEMBL 11:5991080-5991172(-) -30.35 .((.(((.((..(((((((.(((((...(((((......................)))))..))))).))))))).)).))).))........ aca ---------------------------------GGUAUUGUUGCUGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGACAAAAAGCGCAUCUUACUAUCCGGCUAUUUCACUACACCAGGGUUGCAUCAUACC---------- UCSC ENSEMBL scaffold_945:295660-295753(+) -34.15 ((((.((.(((.((..(((((((.(((((...(((((......................)))))..))))).))))))).)).))).)))))) xtr ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dre ----------------------------------------------CAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGAUGUCACACGUCAGCGAUAACCCGGCUAUUUCACAACACCAGGGU--------------------- UCSC ENSEMBL 18:17918079-17918148(+) -30.7 ...(((((((((((((...(((((.((((..........))))...)))))..)))))))))))))... gac ----------------------------------------GUGCUGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGAUGACAGACACCUCCUAUAACCCGGCUAUUUCACAACACCAGGGUGGCA----------------- UCSC ENSEMBL groupXIX:19604986-19605065(-) -35.65 .((((((..(((((((((((((...(((((......................)))))..))))))))))))).)))))) ola ----------------------------------------GUGUUGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGAUGACACACACCUCCUAAAAGCCGGCUAUUUCACAACACCAGGGUGGCA----------------- UCSC ENSEMBL 6:23333304-23333383(+) -33.15 .((((((..(((((((((((((...(((((......................)))))..))))))))))))).)))))) tru ----------------------------------------GUGCUGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGAUGACAGACACCUCCUAUAAGCCGGCUAUUUCACAACACCAGGGUGGCA----------------- UCSC ENSEMBL scaffold_241:338562-338641(+) -35.65 .((((((..(((((((((((((...(((((......................)))))..))))))))))))).)))))) tni ----------------------------------------GUGCUGCAGCUGGUGUUGUGAAUCAGGCCGAUGACAGACACCUCCUAGAAGCCGGCUAUUUCACAACACCAGGGUGGCA----------------- UCSC ENSEMBL 13:1437198-1437277(+) -35.65 .((((((..(((((((((((((...(((((......................)))))..))))))))))))).)))))) cin ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ****************** **** **** * * ************************* * * ************ **** * ************************* * * ** * ************* ********* ************************* * * **** * ************* ********** ************************* * * * **** * ************* ********** * ************************* ** * * **** * ************* ********** * **************************** * * * **** * ************* ********** * **************************** ***** **** ** ************* ********** * **************************** ***** **** *** ************* ************ **************************** ***** **** ***************** ************ **************************************** ***************** ************ **************************************** ***************** ************ **************************************** ***************** ************ ********************************************************** ************ *********************************************************************** *********************************************************************** *********************************************************************** *********************************************************************** *********************************************************************** ************************************************************************* ************************************************************************* ** *************************************************************************** ****************************************************************************** ****************************************************************************** ****************************************************************************** * ****************************************************************************** ******************************************************************************** * *********************************************************************************** *********************************************************************************** *********************************************************************************** * *********************************************************************************** ***** *************************************************************************************** ********************************************************************************************* ********************************************************************************************* * **************************************************************************************************** ****************************************************************************************************************************************