hsa ------------UGUGUCUCUCUCUGUGUCCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGGAUACCGGGGCACC----------- miRbase UCSC ENSEMBL 16:69966984-69967083(+) -55.0 .(((((((.....((((((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))))))).))))))). ptr ------------UGUGUCUCUCUCUGUGUCCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGGAUACCGGGGCACC----------- miRbase UCSC ENSEMBL 16:69777019-69777118(+) -55.0 .(((((((.....((((((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))))))).))))))). ggo -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ ENSEMBL 16:60277775-60277845(+) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) ppy ------------UGUGUCUCUCUCUGUGUCCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGGAUACCGGGGCACC----------- miRbase UCSC ENSEMBL 16:57411201-57411300(+) -55.0 .(((((((.....((((((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))))))).))))))). mml ------------UGUGUCUCUCUCUGUGUCCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGGAUACCGGGGCACC----------- miRbase UCSC ENSEMBL 20:68318877-68318976(+) -55.0 .(((((((.....((((((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))))))).))))))). cja -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ ENSEMBL Contig10:9052450-9052520(-) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) tsy --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mmr -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_850:238564-238634(+) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) oga --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tbe -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_2803:258220-258290(+) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) cpo -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ UCSC ENSEMBL scaffold_22:6810955-6811025(-) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) dor ----------------------------------CAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACAUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGGAUAC-------------------- ENSEMBL GeneScaffold_6487:88959-89028(+) -32.9 ..(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).)))))))))))))........... mmu -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 8:110075144-110075213(+) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) rno -------------GUGUCUCUCUCUGUGUCCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACAUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGGAUACUGGAGCACC----------- miRbase UCSC ENSEMBL 19:37422704-37422802(+) -55.0 (((.((((....((((((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))))))).))))))). str -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_5729:142247-142317(+) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) opr -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_2533:231445-231515(+) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) ocu -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ ENSEMBL scaffold_49:12654983-12655053(-) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) bta ------------------UCUCUCUGUGUCCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGGAUACCGGGGCACC----------- miRbase UCSC ENSEMBL 18:35987036-35987129(+) -51.1 ..((((.((((((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))))))).)))).... ttr -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_3381:141379-141449(+) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) vpa --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ssc -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ miRbase -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) cfa ----------------------------------CAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGA---------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 5:82820513-82820573(-) -32.2 ..(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).)))))))))))))... fca -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACGG------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_859:276957-277026(+) -35.6 .(((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).))) eca ---------------------------------CCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGG----------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:19908675-19908735(+) -32.2 ...(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))).. mlu -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_5811:111765-111835(+) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) pva -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_699:242741-242811(+) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) eeu -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_8494:154033-154103(+) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) sar --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cho --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ete -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_8422:191472-191542(+) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) laf -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ ENSEMBL scaffold_48:11188761-11188831(+) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) pca --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- meu -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_9654:105281-105351(+) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) mdo -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGG------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 1:699870957-699871026(+) -39.3 ((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))) oan UUUGUGUCUGUGUGUGUCUCUCUCUGUGUCCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGGAUACCGGGACGCUCUCUGCAUCGG miRbase UCSC ENSEMBL 11:4441983-4442105(-) -57.1 ...((((......(((((((.....((((((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))))))).))))))).....))))... gga --------------UGCGUCUCUCCGUGUCCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACGGGAUGCCGGGGC-------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:21030641-21030735(+) -50.6 .......((((((((((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).))))))).))))). mga -----------------------------CCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACGG------------------------- UCSC ENSEMBL 13:20169310-20169379(+) -35.6 .(((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).))) tgu ------------------------CGUGUCCUGCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGAC--------------------------- miRbase ENSEMBL 11:11805159-11805230(+) -34.2 ...((((.....(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))))) aca ---------------------------------CCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACGGGAUG--------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_777:361594-361663(+) -33.3 ((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).)))))))))))))))........ xtr -----------------CCCUCUCUGUGUCCUCCCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAGGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACAGGAUACGGGGAGCU------------ miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_303:222731-222824(+) -53.9 ..(((((((((((((.((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).)))))))))))))))..))))))))))))).. dre ------------GUGUUUGUCUCCUGUGUCCCGUCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUUACGUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACGGGAUGUCUGGAGGUGUCUGC------ miRbase UCSC ENSEMBL 25:34937136-34937240(-) -54.3 .......(((((..(((((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))).)))))))))...)))))....... gac ----------------------------------CAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUGACAUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACGGGAUG--------------------- UCSC ENSEMBL groupXIX:655646-655714(-) -33.2 ..(((((((((((((.((((((..((((......)))))))))).))))))))))))).......... ola ----------------------------------CAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUGACAUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACGGGAUG--------------------- UCSC ENSEMBL 6:22770475-22770543(+) -33.2 ..(((((((((((((.((((((..((((......)))))))))).))))))))))))).......... tru ----------------------------------CAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUGACAUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACGGGAUG--------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_30:61334-61402(-) -33.2 ..(((((((((((((.((((((..((((......)))))))))).))))))))))))).......... tni --------------------------------GUCAGUGGUUUUACCCUAUGGUAGGUGACAUCAUGCUGUUCUACCACAGGGUAGAACCACGGACGGG------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 13:1172498-1172564(+) -37.2 (((.(((((((((((((.((((((..((((......)))))))))).))))))))))))).)))... cin --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ************************ ** *** **************************** ************************ ** ********************************* ************************ ** ********************************** ************************ ** ********************************** * *************************** ********************************** * *************************** ********************************** ** 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