hsa CGGCCGGCCCUGGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCUCCCGGGUGGGUUC miRbase UCSC ENSEMBL 12:7073260-7073354(+)              -48.9 .((((.((((.(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))..))))))).)))).
ptr ------------------------------------------------------------------------------------------------                      
ggo CGGCCGGCCCUGGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGGUGGGUUC miRbase                                                 -50.8 .((((.((((.(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))).))).)))).)))).
ppy UGGCCGGCCCUGGGUUCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGGUGGGUUC miRbase UCSC ENSEMBL 12:7200096-7200190(+)              -49.3 .((((.((((.(((..((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))..))).)))).)))).
mml UGGCCGGCCCUGGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGGUCGGUUU miRbase UCSC ENSEMBL 11:7147486-7147580(+)              -53.6 .(((((((((.(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))).))).))))))))).
cja -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------              ENSEMBL Contig622:144312-144384(-)         -34.9            (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))            
tsy ------------------------------------------------------------------------------------------------                      
mmr -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------              ENSEMBL GeneScaffold_618:194721-194793(+)  -34.9            (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))            
oga -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------              ENSEMBL GeneScaffold_1320:130519-130591(+) -34.9            (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))            
tbe ---------------CCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUGAUCGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCUC-----------              ENSEMBL GeneScaffold_1360:29083-29152(+)   -29.1              (((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))....             
cpo -----------GGGUCCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGUUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------         UCSC ENSEMBL scaffold_107:310106-310178(-)      -33.8            (((.(((((((((((.((((((((((....((.......)).....))))))))))))))..))))))))))            
dor ------------------------------------------------------------------------------------------------                      
mmu -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUGCAGUGUUGGAUGGUUGAAGUAUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ miRbase UCSC ENSEMBL 6:124667932-124668003(-)           -34.4            (((.(((((((((((.((((((((((..((((.........)))).))))))))))))))..))))))))))            
rno -GGCUGACUCUGAGUCCAUCUUC-CAGUGCAGUGUUGGAUGGUUGAAGUACGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGGUCAGUUC miRbase UCSC ENSEMBL 4:160840904-160840997(-)           -40.7 (((((((((.....(((((((((((.((((((((((..((((.........)))).))))))))))))))..))))))).....))))))))). 
str -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCU--UUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------              ENSEMBL GeneScaffold_1478:28508-28578(+)   -35.2             (((.(((((((((((.(((((((((((...((.....))...))).))))))))))))..))))))))))             
opr -----------GGGUCCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUGAUUGGAAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------              ENSEMBL GeneScaffold_1208:355245-355317(+) -35.3            (((.(((((((((((.(((((((((((...(((....)))....))).))))))))))))..))))))))))            
ocu ---------------CCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUACUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------              ENSEMBL scaffold_40:4696202-4696270(+)     -29.1              (((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))...              
bta -GACCGGCUCUGGGUCCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUAAUGGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGCUGG---- miRbase UCSC ENSEMBL 5:10482928-10483017(-)             -45.6   ..((((((..(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))..))))))   
ttr ------------------------------------------------------------------------------------------------                      
vpa ------------------------------------------------------------------------------------------------                      
ssc ------------------------------------------------------------------------------------------------                      
cfa --GCCGGCUCUGGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAGUCACGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGG------- miRbase UCSC ENSEMBL 27:41110045-41110130(-)            -41.2     .((((....(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))))))))).     
fca -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------              ENSEMBL GeneScaffold_88:217615-217687(+)   -34.9            (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))            
eca -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ miRbase UCSC ENSEMBL 6:34423490-34423561(+)             -34.9            (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))            
mlu -----------GGGCCCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUAAUCGCGAAGCUCCUAAGACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------              ENSEMBL GeneScaffold_2110:3768-3840(+)     -30.4            (((((.(((((((((.(((((.(((((...((.......))...))).)).)))))))))..))))))))))            
pva -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------              ENSEMBL GeneScaffold_923:32173-32245(+)    -34.9            (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))            
eeu -----------GGGUCCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUGAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGC--------------              ENSEMBL GeneScaffold_3303:3501-3571(+)     -29.2             ....(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))).             
sar ------------------------------------------------------------------------------------------------                      
cho ------------------------------------------------------------------------------------------------                      
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laf -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUGGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------              ENSEMBL scaffold_15:51809546-51809618(+)   -34.9            (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))            
pca ---------------CCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------              ENSEMBL GeneScaffold_122:65102-65170(+)    -29.1              (((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))...              
meu ------------------------------------------------------------------------------------------------                      
mdo ----------UGGGGCCAUCUUC-CAGUACAGUGGUGGAUGGU--------GAAGCUUCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGCCC------------- miRbase UCSC ENSEMBL 8:108475859-108475922(+)           -28.2                ..((((.(((((((((.((((((.((((.((.....)))))).))))))))))..)))))))))                
oan ------------------------------------------------------------------------------------------------                      
gga ---------CUGUGGGCAUCUUA-CUAGACAGUGCUGGAUUUCUUGGAUCUA----UUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUU--------------         UCSC ENSEMBL 21:2583290-2583358(-)              -28.14              .....(((((((((((((((((((.((((..............)))).))))))))))))).))))))              
mga ---------CUGUGGGCAUCUUA-CUAGACAGUGCUGGAUUUCUUGGAUCUA----UUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUU--------------         UCSC ENSEMBL 23:2750718-2750786(-)              -28.14              .....(((((((((((((((((((.((((..............)))).))))))))))))).))))))              
tgu --------UCUGUGGGCAUCUUA-CUAGACAGUGCUGGAUUUGCUGCCUCUA----CUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUU--------------              ENSEMBL 21:5894322-5894391(+)              -27.34              ......(((((((((((((((((((.((((..............)))).))))))))))))).))))))             
aca ------------------------------------------------------------------------------------------------                      
xtr ------------------------------------------------------------------------------------------------                      
dre ----GUCUCUAGGGUACAUCUUA-CCUGACAGUGCUUGGCUGUUCA-CUGAUG---UUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGCACUCUGGUGAC---- miRbase UCSC ENSEMBL 6:44230790-44230872(-)             -35.9       (((.(((((((.(((((((((.(((((((.((((....((...))....))))))))))).))))).)))).))))))).)))      
gac ------------GAUCCAUCUUA-CCCGACAGUGCUGGAUUGUACGUCUGUUG---UUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUUUCCU----------         UCSC ENSEMBL groupXII:5709472-5709542(+)        -27.1             ((..(((((((((.(((((((.((((....((....))...)))).))))))).))))).))))..))..             
ola -------UCUAGGAUCCAUCUUA-CCUGACAGUGAUGGACUGUACAGCUGUUG---CUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUUUCCU----------         UCSC ENSEMBL 7:217693-217768(-)                 -31.4           ...((((..(((((((((.(((((((.((((....((....))...)))).))))))).))))).))))..))))          
tru ----------AGGAUCCAUCUUA-CCCGACAGUGCUGGAUUGUACUACUGUUG---UUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUUUUCU----------         UCSC ENSEMBL scaffold_147:355851-355923(-)      -29.2            ((((..(((((((((.(((((((.((((....((....))...)))).))))))).))))).))))..))))            
tni ------------------------------------------------------------------------------------------------                      
cin ----------UGGU-GUAUCUUGGUCAUAUAGUGUUGUAGA-UUCAUG--------AUCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGCAUUCGACGUGUCUC- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_71:128547-128621(+)       -23.8           .((((((((((..(((.(((((((..((((((...))))))))))))).)))..))))))))))...........          
csa --UUGGUCGUCGGUCGCAUCUUCAUCACGCGGUGUUCUAGAACUCAU----------UCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGCGAUCGGCGGCUACUU miRbase      ENSEMBL reftig_613:31866-31949(+)          -47.3      .(((((((((((((((((((.((((.(((((((..(((((....)))))))))))).)))).)))))))))))))))))))...      
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