hsa CGGCCGGCCCUGGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCUCCCGGGUGGGUUC miRbase UCSC ENSEMBL 12:7073260-7073354(+) -48.9 .((((.((((.(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))..))))))).)))).
ptr ------------------------------------------------------------------------------------------------
ggo CGGCCGGCCCUGGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGGUGGGUUC miRbase -50.8 .((((.((((.(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))).))).)))).)))).
ppy UGGCCGGCCCUGGGUUCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGGUGGGUUC miRbase UCSC ENSEMBL 12:7200096-7200190(+) -49.3 .((((.((((.(((..((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))..))).)))).)))).
mml UGGCCGGCCCUGGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGGUCGGUUU miRbase UCSC ENSEMBL 11:7147486-7147580(+) -53.6 .(((((((((.(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))).))).))))))))).
cja -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL Contig622:144312-144384(-) -34.9 (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))
tsy ------------------------------------------------------------------------------------------------
mmr -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL GeneScaffold_618:194721-194793(+) -34.9 (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))
oga -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL GeneScaffold_1320:130519-130591(+) -34.9 (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))
tbe ---------------CCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUGAUCGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCUC----------- ENSEMBL GeneScaffold_1360:29083-29152(+) -29.1 (((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))....
cpo -----------GGGUCCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGUUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ UCSC ENSEMBL scaffold_107:310106-310178(-) -33.8 (((.(((((((((((.((((((((((....((.......)).....))))))))))))))..))))))))))
dor ------------------------------------------------------------------------------------------------
mmu -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUGCAGUGUUGGAUGGUUGAAGUAUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ miRbase UCSC ENSEMBL 6:124667932-124668003(-) -34.4 (((.(((((((((((.((((((((((..((((.........)))).))))))))))))))..))))))))))
rno -GGCUGACUCUGAGUCCAUCUUC-CAGUGCAGUGUUGGAUGGUUGAAGUACGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGGUCAGUUC miRbase UCSC ENSEMBL 4:160840904-160840997(-) -40.7 (((((((((.....(((((((((((.((((((((((..((((.........)))).))))))))))))))..))))))).....))))))))).
str -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCU--UUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL GeneScaffold_1478:28508-28578(+) -35.2 (((.(((((((((((.(((((((((((...((.....))...))).))))))))))))..))))))))))
opr -----------GGGUCCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUGAUUGGAAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL GeneScaffold_1208:355245-355317(+) -35.3 (((.(((((((((((.(((((((((((...(((....)))....))).))))))))))))..))))))))))
ocu ---------------CCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUACUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL scaffold_40:4696202-4696270(+) -29.1 (((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))...
bta -GACCGGCUCUGGGUCCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUAAUGGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGCUGG---- miRbase UCSC ENSEMBL 5:10482928-10483017(-) -45.6 ..((((((..(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))..))))))
ttr ------------------------------------------------------------------------------------------------
vpa ------------------------------------------------------------------------------------------------
ssc ------------------------------------------------------------------------------------------------
cfa --GCCGGCUCUGGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAGUCACGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCCCCGGG------- miRbase UCSC ENSEMBL 27:41110045-41110130(-) -41.2 .((((....(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))))))))).
fca -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL GeneScaffold_88:217615-217687(+) -34.9 (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))
eca -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ miRbase UCSC ENSEMBL 6:34423490-34423561(+) -34.9 (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))
mlu -----------GGGCCCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUAAUCGCGAAGCUCCUAAGACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL GeneScaffold_2110:3768-3840(+) -30.4 (((((.(((((((((.(((((.(((((...((.......))...))).)).)))))))))..))))))))))
pva -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL GeneScaffold_923:32173-32245(+) -34.9 (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))
eeu -----------GGGUCCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUGAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGC-------------- ENSEMBL GeneScaffold_3303:3501-3571(+) -29.2 ....(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))).
sar ------------------------------------------------------------------------------------------------
cho ------------------------------------------------------------------------------------------------
ete ------------------------------------------------------------------------------------------------
laf -----------GGGUCCAUCUUC-CAGUACAGUGUUGGAUGGUCUAAUGGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL scaffold_15:51809546-51809618(+) -34.9 (((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..))))))))))
pca ---------------CCAUCUUC-CAGCACAGUGUUGGAUGGUCUAAUUGUGAAGCUCCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGGCCC------------ ENSEMBL GeneScaffold_122:65102-65170(+) -29.1 (((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))...
meu ------------------------------------------------------------------------------------------------
mdo ----------UGGGGCCAUCUUC-CAGUACAGUGGUGGAUGGU--------GAAGCUUCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGCCC------------- miRbase UCSC ENSEMBL 8:108475859-108475922(+) -28.2 ..((((.(((((((((.((((((.((((.((.....)))))).))))))))))..)))))))))
oan ------------------------------------------------------------------------------------------------
gga ---------CUGUGGGCAUCUUA-CUAGACAGUGCUGGAUUUCUUGGAUCUA----UUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUU-------------- UCSC ENSEMBL 21:2583290-2583358(-) -28.14 .....(((((((((((((((((((.((((..............)))).))))))))))))).))))))
mga ---------CUGUGGGCAUCUUA-CUAGACAGUGCUGGAUUUCUUGGAUCUA----UUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUU-------------- UCSC ENSEMBL 23:2750718-2750786(-) -28.14 .....(((((((((((((((((((.((((..............)))).))))))))))))).))))))
tgu --------UCUGUGGGCAUCUUA-CUAGACAGUGCUGGAUUUGCUGCCUCUA----CUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUU-------------- ENSEMBL 21:5894322-5894391(+) -27.34 ......(((((((((((((((((((.((((..............)))).))))))))))))).))))))
aca ------------------------------------------------------------------------------------------------
xtr ------------------------------------------------------------------------------------------------
dre ----GUCUCUAGGGUACAUCUUA-CCUGACAGUGCUUGGCUGUUCA-CUGAUG---UUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGCACUCUGGUGAC---- miRbase UCSC ENSEMBL 6:44230790-44230872(-) -35.9 (((.(((((((.(((((((((.(((((((.((((....((...))....))))))))))).))))).)))).))))))).)))
gac ------------GAUCCAUCUUA-CCCGACAGUGCUGGAUUGUACGUCUGUUG---UUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUUUCCU---------- UCSC ENSEMBL groupXII:5709472-5709542(+) -27.1 ((..(((((((((.(((((((.((((....((....))...)))).))))))).))))).))))..))..
ola -------UCUAGGAUCCAUCUUA-CCUGACAGUGAUGGACUGUACAGCUGUUG---CUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUUUCCU---------- UCSC ENSEMBL 7:217693-217768(-) -31.4 ...((((..(((((((((.(((((((.((((....((....))...)))).))))))).))))).))))..))))
tru ----------AGGAUCCAUCUUA-CCCGACAGUGCUGGAUUGUACUACUGUUG---UUCUAACACUGUCUGGUAACGAUGUUUUCU---------- UCSC ENSEMBL scaffold_147:355851-355923(-) -29.2 ((((..(((((((((.(((((((.((((....((....))...)))).))))))).))))).))))..))))
tni ------------------------------------------------------------------------------------------------
cin ----------UGGU-GUAUCUUGGUCAUAUAGUGUUGUAGA-UUCAUG--------AUCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGCAUUCGACGUGUCUC- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_71:128547-128621(+) -23.8 .((((((((((..(((.(((((((..((((((...))))))))))))).)))..))))))))))...........
csa --UUGGUCGUCGGUCGCAUCUUCAUCACGCGGUGUUCUAGAACUCAU----------UCUAACACUGUCUGGUAAAGAUGCGAUCGGCGGCUACUU miRbase ENSEMBL reftig_613:31866-31949(+) -47.3 .(((((((((((((((((((.((((.(((((((..(((((....)))))))))))).)))).)))))))))))))))))))...
dme ------------------------------------------------------------------------------------------------
cel ------------------------------------------------------------------------------------------------
***** *** * **** ************ ****
****** ***** * ***************** ****
****** * ***** **** ***************** ****
****** * ****** **** ***************** ****
* ****** * ****** ***** * * ***************** ****
* ****** * ****** ***** ** * ***************** ****
* ****** * ****** ***** ** * ***************** ****
** ******* * ****** ***** ** * **********************
*** ******** * ************ ** * * * **********************
*** ******** *** *************** * *** ***** ********************** *
************ *** *************** ** ************************************
************ *** ****************** ************************************
************ *** ********************************************************
************ *** ********************************************************
************ *** ********************************************************
************ ************************************************************
************ ************************************************************
************ ************************************************************
************ ************************************************************
************ *************************************************************
************ *************************************************************
************* *************************************************************
************* *************************************************************
************** *************************************************************
************** ************************************************************* *
* * ************** ************************************************************* ***
* * * ************** ******************************************************************
********************** ****************************************************************** **
********************** ***********************************************************************
********************** ************************************************************************
********************** ************************************************************************
*********************** ************************************************************************
************************************************************************************************