hsa -------------------------------------------AGCGGUGGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAAACUGUG--------------- UCSC ENSEMBL 7:157367028-157367115(-) -41.3 .(((((..(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).))))))..))))).
ptr -------------------------------------------AGCGGUGGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAAACUGU---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 7:158449969-158450054(-) -40.6 .(((((..(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).))))))..)))))
ggo -------------------------------------------AGCGGUGGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAAACUGUG--------------- miRbase -41.3 .(((((..(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).))))))..))))).
ppy -----------------------------------------CUCACAGCUGCCAGUGUCAUUUUUGUGAU-CUGCAGCU-AGUAUUCUCA-CUCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGCAGGUGUGGC------------- miRbase UCSC ENSEMBL 2b:111154492-111154581(-) -48.1 .(((((.((((((((((((((((((((((.((((((((((......)))..)))))))..))))))))))))).))))))))).))))).
mml ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cja ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tsy ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mmr ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
oga ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tbe -------------------------------------------AGCGGUGGCCAGUGUCAUUUUUGUGACGUUGCAGCU-AGUGAUAUGAAGCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAGACUGUG--------------- ENSEMBL scaffold_4084:5000-5088(-) -42.9 .(((((..(((((((((((((((((((..(((((((.((........))..)))))))..))))))))))))).))))))..))))).
cpo ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dor ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mmu ----------------------------------------------------CGGUGUCAUUUUUGUGACGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUG------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 12:118489290-118489358(+) -29.6 ((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).)))))
rno -------------------------------------------AGCGGUGGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAAACUGUG--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 6:144521037-144521123(+) -41.3 .(((((..(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).))))))..))))).
str ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
opr -------------------------------------------------GGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAAACUGUG--------------- ENSEMBL scaffold_21202:40733-40814(-) -33.6 ..(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).))))))........
ocu ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
bta ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ttr ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
vpa ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ssc -------------------------------------------AGCGGUGGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAAACUGUG--------------- miRbase -41.3 .(((((..(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).))))))..))))).
cfa -------------------------------------------AGCGGUGGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGA---------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 16:22886304-22886383(-) -33.6 ........(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).)))))).
fca -------------------------------------------AGCGGUGGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGA---------------------- ENSEMBL GeneScaffold_3014:61716-61796(-) -33.6 ........(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).)))))).
eca ------------------------------------------------------GUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUG------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 4:107797720-107797786(-) -25.9 ((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).)))..
mlu -------------------------------------------AGCGGUGGCCGGUGUCAUUUUUGUGGCGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAAACUGUG--------------- ENSEMBL scaffold_3905:3495-3582(-) -41.3 .(((((..(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).))))))..))))).
pva ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
eeu --------------------------------------------ACAGGUGCCAGUGUCAUUUUUGUGAU-CUGGAGCU-AGUAUUCUCA-CUCCAGUUGCAUAGUCACAAAAAUGAUCAUUGGCAGCUGUGGC------------- ENSEMBL GeneScaffold_8975:12247-12334(-) -43.71 ((((.(((((((((((((((((((((((((((..((....))..)))))).......))))))))))))).)))))))).))))...
sar ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cho ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ete ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
laf ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
pca ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
meu ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mdo -------------------------------------------AGCGGUUGCCGGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAAACUGUG--------------- UCSC ENSEMBL 8:224496550-224496637(-) -40.0 .((((((.(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).)))))).)))))).
oan UGUCUGUCUCUGCCUGUCUGUCUCUCUGUCUCUCUCUCUCUCUCACAGCUGCCAGUGUCAUUUUUGUGAU-CUGCAGCUUAGUACUCUGG-CUCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGCAGGUGUGGCGGCUGCACGGACG miRbase UCSC ENSEMBL Contig28100:5117-5261(-) -57.86 .((((((....(((.((..........................((((.((((((((((((((((((((((.(((((((.(((......)))..)))))))..))))))))))))).))))))))).)))))))))...)))))).
gga -------------------------------------------AGCGGUUGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAAACUGUG--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 2:8765687-8765773(-) -40.8 .((((((.(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).)))))).)))))).
mga -------------------------------------------AGCGGUUGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAAACUGUG--------------- UCSC ENSEMBL 6:9108338-9108425(-) -40.8 .((((((.(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).)))))).)))))).
tgu -------------------------------------------AGCGGUUGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAAACUGUG--------------- ENSEMBL 2:9797625-9797712(-) -40.8 .((((((.(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).)))))).)))))).
aca -------------------------------------------AGCGGUUGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUAA-GCCAAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAAACUGUG--------------- UCSC ENSEMBL scaffold_151:2274365-2274452(-) -40.4 .((((((.(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).)))))).)))))).
xtr --------------------------------------------------GCCAGUGUCAUUUUUGUGACGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUUAUUGGAAACUGU---------------- UCSC ENSEMBL scaffold_134:1948794-1948873(+) -33.1 .(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).)))))).......
dre -------------------------------------------AGCGGUUGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUUAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAAACUGU---------------- UCSC ENSEMBL 7:40988989-40989075(+) -41.1 .((((((.(((((((((((((((((((..(((((((.(((.....)))..)))))))..))))))))))))).)))))).))))))
gac --------------------------------------------GCGGUUGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAAACUGUG--------------- UCSC ENSEMBL groupXXI:9149828-9149914(-) -40.5 ((((((.(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).)))))).)))))).
ola --------------------------------------------GCGGUUGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAAACUGUG--------------- UCSC ENSEMBL 20:17951820-17951906(-) -40.5 ((((((.(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).)))))).)))))).
tru --------------------------------------------GCGGUUGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU-AGUAAUAUGA-GCCCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUCAUUGGAAACUGUG--------------- UCSC ENSEMBL scaffold_260:284132-284218(+) -40.5 ((((((.(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).)))))).)))))).
tni ---------------------------------------------------CCAGUGUCAUUUUUGUGGU-UUGCAGCU-AGUACUCUGG-CUCCAGUUGCAUAGUCACAAAAAUGAGCAUUGG----------------------- UCSC ENSEMBL 2:15371785-15371855(+) -30.8 ((((((((((((((((((..((((((((((......)))..)))))))...)))))))))))).))))))
cin ----------------------------UAAUAAAAUGAGAAUUCUGUGUACGUGUGUCAUUUUUCUAUU-AUGCAACU---UUUUUUUCAUGUUAGUUGCAUAGUAACAAAAGUGAUCAUACGUUCGCAUGAG------------- miRbase UCSC ENSEMBL 5q:1421653-1421754(+) -33.82 ...............((((((.(((((((((((((((.((((((((((((.............))))))))))))..)))))))).))))))).)))).)).
csa ---------------------------GGAAAACAUUGUCUUUACUGUUCACGAGUGUCAUUUUAAUACU-AUGCAGCU---UUGAAUA-AUGUUAGUUGCAUAGUAAUAAAAGUGAUCAUGCGUUUACAAGAA------------- miRbase ENSEMBL reftig_48:2357835-2357936(-) -27.7 ..................(((..(((.((((((((((..((((((((((((............))))))))))))...))))))).))).)))..)))....
dme ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
********** * ** * ** * * *********** * **** *** **
*********** * ******* * * * *********** ****** *******
* ************** ******* *** * * * *****************************
** ************** ******* *** * * *******************************
** **************** ******* **** * * * *******************************
******************** ******** **** ***** *******************************
***************************** ********** ********************************* *
* * ***************************** ********** ********************************* ***
*** ***************************** ********** *********************************** ****
**** ***************************** ********** *********************************** *****
***** ***************************** ********** *****************************************
***** ***************************** ********** *****************************************
****** ***************************** ********** *****************************************
****** ***************************** ********** *****************************************
****** ***************************** ********** *****************************************
************************************ ********** *****************************************
************************************ ********** *****************************************
************************************ ********** *****************************************
************************************ ********** *****************************************
************************************ ********** *****************************************
************************************ ********** *****************************************
************************************ ********** *****************************************
************************************ ********** *****************************************
************************************ ********** *****************************************
************************************* ********** *****************************************
* ************************************* ******************************************************
**** *** ******************************************* ******************************************************
***************************************************************************************************************************************************