hsa ----------------------------------CUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUGCC-UCCAACUGACUCCUACA-UAUUAGCAUUA--ACAG------------------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 21:26946292-26946356(+) -29.7 ((((((((((((((.(((.((((((((.(((....)))..))))))))))))))))))))))))) ptr -----------------------------------UGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUGCC-UCCAAAUGACUCCUACA-UAUUAGCAUUA--ACAG------------------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 21:25402135-25402198(+) -28.4 (((((((((((((.(((.((((((((((((....)))).)))))))))))))))))))))))). ggo ----------------------------------CUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUGCC-UCCAACUGACUCCUACA-UAUUAGCAUUA--ACAG------------------------------------ ENSEMBL 21:13926211-13926276(+) -29.7 ((((((((((((((.(((.((((((((.(((....)))..))))))))))))))))))))))))) ppy ----------------------------------CUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UCCAACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAG------------------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 21:26044414-26044478(+) -29.92 (((((((((((((.((((.((((((((.............))))))))))))))))))))))))) mml ----------------------------------CUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UCCAACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAG------------------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 3:21097273-21097337(-) -29.92 (((((((((((((.((((.((((((((.............))))))))))))))))))))))))) cja ----------------------------------CUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UCCAACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAG------------------------------------ ENSEMBL Contig146:3510600-3510665(+) -29.92 (((((((((((((.((((.((((((((.............))))))))))))))))))))))))) tsy ------------------------------UAUGCUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUU-ACC-UCCGACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAGGGUAUGAUG--------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_5154:18421-18498(+) -33.8 (((.(((((((((((((.((((.((((((((............))))))))))))))))))))))))).)))..... mmr ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- oga ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tbe ------------------------------UAUGCUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUGCC-UCCGACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAGGGUAUGAUG--------------------------- ENSEMBL scaffold_150603:65059-65137(+) -34.7 (((.(((((((((((((.((((.((((((((.(((....)))..))))))))))))))))))))))))).)))..... cpo ------------------------------UAUGCUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UCUGACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAGGGUAUGAUG--------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_52:7888272-7888350(-) -33.8 (((.(((((((((((((.((((.((((((((.(((....)))..))))))))))))))))))))))))).)))..... dor ------------------------------UAUGCUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UCAGACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAGGGUAUGAUG--------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_4147:15987-16065(+) -33.72 (((.(((((((((((((.((((.((((((((.............))))))))))))))))))))))))).)))..... mmu ----------------------------------CUGUUAAUGCUAAUUGUGAUAGGGGUUUUGGCC-UCUGACUGACUCCUACC-UGUUAGCAUUA--ACAG------------------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 16:84714385-84714449(+) -25.62 ((((((((((((((.....((((((((.............))))))))...)))))))))))))) rno ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- str ------------------------------UAUGCUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UCUGACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAGGGUAUGAUG--------------------------- ENSEMBL scaffold_143307:99462-99540(+) -33.8 (((.(((((((((((((.((((.((((((((.(((....)))..))))))))))))))))))))))))).)))..... opr ---------------------------------GCUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUACCU-CC-AGCUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAGGGUAUG------------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_3126:59415-59486(+) -31.5 .(((((((((((((.((((.((((((((............)))))))))))))))))))))))))...... ocu ----------------------------------CUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UCCAACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAG------------------------------------ ENSEMBL scaffold_7:59233760-59233825(+) -29.92 (((((((((((((.((((.((((((((.............))))))))))))))))))))))))) bta -----------------------------------UGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UCGGACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACA------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:10199629-10199691(-) -27.42 .(((((((((((.((((.((((((((.............))))))))))))))))))))))). ttr ------------------------------UAUGCUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UCUGACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--GCAGGGUA-------------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2054:89826-89899(+) -33.2 (((.(((((((((((((.((((.((((((((.(((....)))..))))))))))))))))))))))))).))) vpa ------------------------------UAUGCUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUAC--UCCGACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--GCAGGGUAUGAUG--------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2108:43061-43138(+) -33.8 (((.(((((((((((((.((((.((((((((............))))))))))))))))))))))))).)))..... ssc ---------------------------CUAUAUGCUGUUAAUGCUAAUUGUGAUAGGGGUUUUUACC-UCCGUCUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAGGGUAUGAUG--------------------------- miRbase ENSEMBL 13:135049633-135049713(-) -34.1 .(((((.((((((((((((((.(((.((((((((...((....))..))))))))))))))))))))))))).)))))... cfa -------------------------------------UUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UCCGACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACA------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 31:24096793-24096853(+) -23.52 ((((((((((.((((.((((((((.............)))))))))))))))))))))).. fca ------------------------------UAUGCUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UCCGACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAGGGUAUGAUG--------------------------- ENSEMBL scaffold_214635:163038-163116(+) -33.72 (((.(((((((((((((.((((.((((((((.............))))))))))))))))))))))))).)))..... eca ----------------------------------CUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UCGGACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAG------------------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 26:23253374-23253438(+) -29.92 (((((((((((((.((((.((((((((.............))))))))))))))))))))))))) mlu ------------------------------UAUGCUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUU-ACC-UCCGACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAGGGUA-------------------------------- ENSEMBL scaffold_174060:10844-10916(+) -33.2 (((.(((((((((((((.((((.((((((((............))))))))))))))))))))))))).))) pva ------------------------------UAUGCUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUU-ACC-UCCGACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAGGGUAUGAUG--------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2346:20906-20983(+) -33.8 (((.(((((((((((((.((((.((((((((............))))))))))))))))))))))))).)))..... eeu ------------------------------UAUGCUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACU-U-UGACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAGGGUAUGAUG--------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_5449:11658-11735(+) -33.8 (((.(((((((((((((.((((.((((((((............))))))))))))))))))))))))).)))..... sar ------------------------------UAUGCUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-U-UGACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAGGGUAUGAUG--------------------------- ENSEMBL scaffold_253767:18466-18543(+) -33.8 (((.(((((((((((((.((((.((((((((............))))))))))))))))))))))))).)))..... cho ------------------------------UAUGCUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UUCAACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAGGGUAUGAUG--------------------------- ENSEMBL scaffold_5093:25126-25204(+) -33.72 (((.(((((((((((((.((((.((((((((.............))))))))))))))))))))))))).)))..... ete ------------------------------UAUGCUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-U-CAACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAGGGUAUGA----------------------------- ENSEMBL scaffold_190599:3872-3947(+) -33.8 (((.(((((((((((((.((((.((((((((............))))))))))))))))))))))))).)))... laf ---------------------------------GCUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UC-AAGCAACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACAGCGUAUGAUG--------------------------- ENSEMBL scaffold_13:30696113-30696187(-) -34.6 ((((((((((((((.((((.((((((((.((......)).))))))))))))))))))))))))))........ pca ---------------------------------GCCAUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUGCC-UC-AACUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--GCGGCAUA-------------------------------- ENSEMBL scaffold_26303:15004-15073(+) -31.0 (((.((((((((((.((((.((((((((.(((...)))..)))))))))))))))))))))).)))... meu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mdo ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- oan --------------GGGACGCCGUGGGCCGCAGGUCGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUCUCUGUCUGACUGACCCCUGCC-CGUUAGCAUUA--GCAACGUGCGGCCCCUCGAACCC----------------- miRbase UCSC ENSEMBL Contig248467:539-643(+) -54.4 (((....((.((((((((.((.(((((((((((.((...((((((((...((.....))..))))))))..))))))))))))).)).))))))))..))..))) gga -----------------------------------UGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UCUGAAUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACA------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:105930213-105930275(+) -28.0 .(((((((((((.((((.((((((((((((....)))).))))))))))))))))))))))). mga -----------------------------------UGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UCUGAAUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--ACA------------------------------------- UCSC ENSEMBL 1:109684590-109684653(+) -28.0 .(((((((((((.((((.((((((((((((....)))).))))))))))))))))))))))). tgu ---------------------------CUGUAUGUUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACC-UAUGACUGACUCCUACA-CGUUAGCAUUA--ACA------------------------------------- miRbase ENSEMBL 1:112588974-112589044(+) -29.32 ........((((((((((((.((((.((((((((.............)))))))))))))))))))))))) aca -------------------------------ACGUUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUAUC-UCUGACCGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--AGAAUGU--------------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_250:1057417-1057488(-) -28.62 (((((.((((((((((.((((.((((((((.............)))))))))))))))))))))).))))) xtr -----------------------------------UAUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUUAAUACAUAUUGACUCCUACA-UGUUAGCAUUA--UUAUCAUG-------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_164:663493-663561(+) -22.84 ...(((((((((.((((.((((((((..............)))))))))))))))))))))........ dre ---------------------------UGGUGCAGGUUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUAGUGC---UGAUGAACACCUAUGCUGUUAGCAUUA--AUCUUGCGCUA----------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:548816-548893(+) -35.7 (((((((((.(((((((((((.((.(((((.(((((.......))))).))))))).))))))))))).))))))))) gac ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ola ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tru ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tni ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cin ----------------------GGUUGAGAUUGAAUGUUAAUGCUAAUAGUGAUAGGGUUCAUAAACCUUAUAAAGUUUAUUAAUAUUCCAAAAUCAC-UCAAAAUGCCACCAAUAGUUUUCUC--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 4q:2177777-2177877(-) -18.4 (((((((((((((((((((((..(((....((((((((....))))))))...))))))))))))))...))))..)))....)))............... csa UAGCUAAUUGUACUACUCUUACUGACGUGUCACAUAAUUAACAGCAAUUACGGGACGGAUCACUGAG-CUGUAGUGAUACAGAAAGUCAGCGCAUCUGUAAUUAAUGCUAAUAAGUGAUUUAUGGUUUCGUUCUACAAA miRbase ENSEMBL reftig_1:133886-134023(-) -29.3 .......(((((..((....(((.....(((((...((((.((..(((((((((.((....(((...(((((....)))))..)))...))..)))))))))..)).))))..)))))....)))...))..))))). dme ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- **** *** * * ** * ** *********** ********* * * * ** ***** * *********** ************** * *** **** * ********* *********** ************** * ********* * ********* * ************************** * * *********** * ********* ** **************************** * * * *********** *********** ** **************************** ** * * *********** *********** *** **************************** ** * * *********** *********** *** ***************************** ** ** ************* *********** *** ***************************** ** ** ************* *********** *** ***************************** 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