hsa ----CCGCAGAGUGUGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCAGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCCACGA----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 7:129414745-129414854(-) -41.9 .......(((.((.(((((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))).))....))))).. ptr ----CCGCAGAGUGUGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCAGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCCACGA----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 7:130195575-130195684(-) -41.9 .......(((.((.(((((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))).))....))))).. ggo ----CCGCAGAGUGUGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCAGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCCACGA----------------- miRbase -41.9 .......(((.((.(((((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))).))....))))).. ppy -------CAGAGCGUGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCAGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCCACGA----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 7:126690908-126691014(-) -41.5 .....((((..(((((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))).....))..)))). mml ----CCGCAGAACGUGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCCACGA----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:167134006-167134115(-) -41.1 ........((((..(((((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))).....))..)))). cja -------------GUGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCAGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCC--------------------- ENSEMBL Contig399:685568-685665(-) -39.1 .((.(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))))).))..... tsy ---------------GACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCCACGA----------------- ENSEMBL scaffold_227141:3082-3181(+) -38.2 ..(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).)))))))))))............ mmr --------AGAGCGUGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_995:128051-128153(-) -38.7 .((...((.(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))))).))..)). oga --------AGAGCGUGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_3052:311693-311795(-) -38.7 .((...((.(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))))).))..)). tbe --------AGAGCGUGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGACAGUCUUCGGUUCAGUGAAUUACCGAAGGGUCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1146:181242-181345(-) -37.4 .((...((.(((.((((((((.((((((..(((((..((((((((.(((........))))))))))))))))....)))))).))))))))))).))..)). cpo ----------------ACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCAGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCC--------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_11:50142376-50142470(-) -38.9 .(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).)))))))))))........ dor --------AGAGUGUGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCC--------------------- ENSEMBL scaffold_44916:4232-4334(+) -39.6 ...((.((.(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))))).)).)).. mmu -------------------------CUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCAGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAG------------------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 6:30119668-30119737(-) -26.9 ((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).)))) rno ----CCAGAGAGUGUGACUCCUGUCCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCCGCGA----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 4:57075094-57075203(-) -37.3 .......(((.((.(((((..((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))..))).))....))))).. str --------------UGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCAGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_5392:35722-35818(-) -38.9 ...(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).)))))))))))........ opr --------------UGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAAUCUCGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCC--------------------- ENSEMBL scaffold_1670:128329-128425(-) -38.2 ...(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).)))))))))))........ ocu --------AGAGUGUGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCC--------------------- ENSEMBL scaffold_22:34942528-34942630(-) -39.6 ...((.((.(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))))).)).)).. bta -------------------------CUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAG------------------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 4:96835927-96835996(-) -26.2 ((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).)))) ttr --------AGAGUGCGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCAGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCCGCGA----------------- ENSEMBL GeneScaffold_2149:528111-528217(-) -41.5 ...(((.((.(((((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))).))....))))).. vpa --------AGAGUGUGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2208:587670-587772(-) -39.6 ...((.((.(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))))).)).)).. ssc -------------------------CUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAG------------------------------------ miRbase ENSEMBL 18:17172238-17172307(-) -26.2 ((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).)))) cfa ------------------------------UAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAA--------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 14:10022403-10022464(+) -21.8 ((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).. fca ---------------GACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1006:261763-261858(-) -38.2 ..(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).)))))))))))........ eca -------------------------CUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACA------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 4:84472003-84472071(-) -23.7 ..((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).)). mlu ---------------GACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCCACGA----------------- ENSEMBL GeneScaffold_1229:160772-160871(-) -38.2 ..(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).)))))))))))............ pva ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ eeu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ sar -----CGCAGAGUGUCACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUGGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCCACGA----------------- ENSEMBL scaffold_85843:664-773(+) -41.3 ((..((.((((....(((((((((.((((((..(((((..((((((((....((...))...)))))))))))))....)))))).))))))))).))))..))..)). cho ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ete ---------GAGUGUGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCGGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUACACAGAGCAGAGACAGAUCC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1864:76522-76623(-) -45.6 ..((.((.(((.(((((((((((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))))))))))))))).)).)).. laf ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ pca ---------------GACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAACAGUCUCAGU-CAGUGAAUUACCGAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGACAGAUCC--------------------- ENSEMBL scaffold_21780:25218-25313(+) -38.9 ..(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).)))))))))))........ meu ----------------ACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAAAACACACUAU-CAGUGAAUUACCAAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGAAAGAUCCAC------------------- ENSEMBL Scaffold365943:1270-1366(+) -37.94 .(((.((((((((.((((((..(((((..((((((((..............)))))))))))))....)))))).))))))))))).......... mdo ----------------ACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAAAACACACUAU-CAGUGAAUUACCAAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGAA--------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 8:189668265-189668352(-) -37.94 .(((.((((((((.((((((..(((((..((((((((..............)))))))))))))....)))))).))))))))))).. oan GGAGGGGGAGACCCUCACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAAAACACACUAU-CAGUGAAUUACCAAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGAAAGAACCACAAGACUCUCCCAUCUCUCC miRbase UCSC ENSEMBL 10:4569067-4569197(-) -51.44 (((((((....)))((..(((((((((((.((((((..(((((..((((((((..............)))))))))))))....)))))).))))))))).))..))...........))))......... gga ----------------ACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGCAACCCCGCGGU-CAGUGAAUUACCAUAGGGCCAUAAACAAAGCAGAGAAAGACCCGCGA----------------- miRbase -34.7 .(((.((((.(((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))).)))))))............ mga ----------------ACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGCAACCCCGCGGU-CAGUGAAUUACCAUAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGA---------------------------- UCSC ENSEMBL 1:483639-483726(+) -40.9 .(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))))). tgu ----------------ACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGCAACCCCGCGGU-CAGUGAAUUACCAUAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGA---------------------------- ENSEMBL 1A:193610-193697(-) -40.9 .(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((......)))..)))))))))))))....)))))).))))))))))). aca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ xtr ------------CAUCCCUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAAAACACAAAAU-CAGUGAAUUACCAUAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGAAAGAAC---------------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_11:1016139-1016235(-) -38.74 ..((..(((((((((((.((((((..(((((..((((((((..............)))))))))))))....)))))).))))))))).))..)).. dre ---------------GACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAAAGCACACUAU-CAGUGAAUUACCAAAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGAAAGAACCACG------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 4:14884975-14885072(+) -37.94 ..(((.((((((((.((((((..(((((..((((((((..............)))))))))))))....)))))).)))))))))))........... gac --------------UGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAGAGCUCACUAU-CAGUGAAUUACCAUAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGA---------------------------- UCSC ENSEMBL groupIV:29062029-29062118(+) -39.4 ...(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((....))))....))))))))))))....)))))).))))))))))). ola --------------UGACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAGAGCUCACUAU-CAGUGAAUUACCAUAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGAAAGAACCAC------------------- UCSC ENSEMBL 23:14604483-14604581(+) -39.4 ...(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((....))))....))))))))))))....)))))).))))))))))).......... tru ---------------GACUCCUGUUCUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAGAGCUCACUAU-CAGUGAAUUACCAUAGGGCCAUAAACAGAGCAGAGAAAGAACCAC------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_8:1590756-1590853(-) -39.4 ..(((.((((((((.((((((..(((((..(((((((((((....))))....))))))))))))....)))))).))))))))))).......... tni -------------------------CUGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUGUGAGAGCUCACUAU-CAGUGAAUUACCAUAGGGCCAUAAACAG------------------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 19:3385637-3385706(-) -27.4 ((((.((((((..(((((..(((((((((((....))))....))))))))))))....)))))).)))) cin ---------------CUGGUGUUUUCGGUGUAUGGCACUGGUAGAAUUCACUG-------CCAAG--CCAGUGGUUCAACA-AGCGCCGUAAGCUGGAAACACUA--------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_36:549852-549931(+) -37.6 .(((((((((((((.((((((.((.((.((((.(((((......))))))))).)).)).)))))).))))))))))))) csa ---------------ACAGUGUUGACGAAAUAUGGCACUAGUAGAAAUCACUGU----AGCCAACACCCAGUGGUUUCACA-GGUGCCAUAAAUUGGAAACACUACUUUCUACAGCGAUAACA--------- miRbase ENSEMBL reftig_48:1818292-1818394(-) -37.8 ..((((((..(((..(((((((((.((.((((((((((...........)))))))))))).)))))))))..)))..))))))................... dme ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ cel ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ********* ****** ****** ***** * * * * * ** * ************************ * ***** *** * ** ******** * **************************** * * ************ ************ ****************************** * * ************ ************** ****************************** * * * ************ ************** ******************************* * * * ************ ************** * ******************************* * * * ************ ************** * * * * ******************************** * * * ************ ************** * * **************************************** * * * ************ ********************** ***************************************** * * * ************ ********************** ***************************************** * * * * ************ *********************** ***************************************** * ** * ** ************ *********************** * ***************************************** * ** * ** ************ *********************** *** * ***************************************** * ** * ** ************ *********************** *** ** ***************************************** * **** ** ************************************ *** ** ************************************************ ** ************************************ *** ** ************************************************ ** ************************************ *** ** ************************************************* ** ************************************ ****** ************************************************* ** ************************************ ****** ************************************************* ** ******************************************* **************************************************** ******************************************* ***************************************************** ******************************************* ***************************************************** ******************************************* ***************************************************** ******************************************* ***************************************************** ******************************************* ***************************************************** ******************************************* * ** ****************************************************** ******************************************* * *** ****************************************************** ******************************************* * **** ****************************************************** ********************************************* **** ****************************************************** ********************************************* **** ****************************************************** *********************************************** **** ****************************************************** *********************************************** *********************************************************** *********************************************** *********************************************************** *********************************************** *********************************************************** *********************************************** *********************************************************** *********************************************** ************************************************************** *********************************************** *************************************************************** *********************************************** *************************************************************** *********************************************** *************************************************************** *********************************************** *************************************************************************************************************** * * ************************************************************************************************************************************