hsa ----------------------------CCAGUCACGUCCCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUUGUGACUG-UAA----GUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGGUGAUUGA------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 15:79502130-79502213(+) -35.5 .(((((((...(((((((((.((((((...(((((((((......)))).)))))..)))))).)))))))))...))))))). ptr ----------------------------CCAGUCACGUCCCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUUGUGACUG-UAA----GUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGGUGAUUGA------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 15:77150848-77150931(+) -35.5 .(((((((...(((((((((.((((((...(((((((((......)))).)))))..)))))).)))))))))...))))))). ggo ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ppy ----------------------------CCAGUCACGUCCCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUUGUGACUG-UAA----GUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGGUGAUUGA------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 15:76674993-76675076(+) -35.5 .(((((((...(((((((((.((((((...(((((((((......)))).)))))..)))))).)))))))))...))))))). mml ----------------------------UCAGUCACGUCCCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUUAUGACUG-UAA----GUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGGUGAUUGA------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 7:58339711-58339794(+) -37.8 ((((((((...(((((((((.((((((...((((((((((....))))).)))))..)))))).)))))))))...)))))))) cja --------------------------------UCACGUCCCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUUGUGACUG-UAA----GUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGGUG----------------------- ENSEMBL Contig887:154311-154386(-) -27.7 .(((...(((((((((.((((((...(((((((((......)))).)))))..)))))).)))))))))...))) tsy ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mmr ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- oga ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tbe ----------------------------------ACAUCCCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUUGUGACUC-UGA----GUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUGGGUGA---------------------- ENSEMBL scaffold_135353:29981-30055(-) -28.6 .(((((((((((((.((((((...((((((((........))).)))))..)))))).))))))))..))))). cpo --------------------------------------CCCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUUGUGAUUG-UCA----GUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUGGGU------------------------ UCSC ENSEMBL scaffold_190:619296-619364(+) -27.6 .(((((((((.((((((...(((((.(((.......))).)))))..)))))).)))))))))..... dor ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mmu -----------------------------------CCUUUCCUUAUCACUUUUC--CAGCC-AGCUUUGUGACUC-UAA----GUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGG------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 9:89697098-89697166(-) -28.9 (((.(((((((((.((((((..(((((((((......)))).)))))..)))))).))))))))).))) rno ---------------------------------CACUUUCCCUUAUCAGUUUUC--CAGCCAGCUUUGUGACUGU-AAA-----UGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAAGUGACUG------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 8:94692573-94692649(-) -40.7 (((((.((((((((((((((((..(((((((((......)))).)))))..)))))))))))))))).))))).... str ----------------------------------ACAUCCCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUUGUGAAUC-UAA----GUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUUGGUGA---------------------- ENSEMBL scaffold_10138:167102-167176(-) -29.0 .(((((((((((((.((((((...(((((((((......)))).)))))..)))))).)))))))))..)))). opr --------------------------------UCAUGUACCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUUGUGAUUC-UGA----CUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGCGUAGGUGAU--------------------- ENSEMBL scaffold_14086:4335-4412(+) -28.0 ((((.(((.(((((((.((((((...(((((...((.......)).)))))..)))))).))))))).))).)))). ocu ----------------------------------ACAUCCCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUUGUGACUC-UGA----CUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGGUG----------------------- ENSEMBL scaffold_125:146928-147001(-) -27.9 .(((((((((((((.((((((...(((((...((.......)).)))))..)))))).)))))))))..)))) bta ----------------------------CCAGUCACAUCCCCUUAUCACUUUUC--CAGCC-AGCUUUGUGACUC-UAA----CUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGGUGAUUGA------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 21:25184435-25184517(+) -39.0 .(((((((...(((((((((.((((((..(((((...((.......)).)))))..)))))).)))))))))...))))))). ttr ------------------------------AGUCACAUCCCCUUAUCACUUUUC--CAGCC-AGCUUUGUAACUC-UAA----AUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGAGUAGGUGAU--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2230:353151-353229(+) -27.2 .(((((.....(((((((.((((((..(((((((((......)))).)))))..)))))).))))))).....))))) vpa --------------------------------------CCCCUUAUCACUUUUC--CAGCC-AGCUUUGUGACUC-UGA----GUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGGUG----------------------- ENSEMBL scaffold_3691:57806-57874(-) -27.5 .(((((((((.((((((..((((((((........))).)))))..)))))).)))))))))...... ssc ----------------------------CCAGUCACAUCCCCUUAUCACUUUUC--CAGCC-AGCUUUGUGACUC-UAA----AUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGGUGAUUGA------------------ miRbase ENSEMBL 7:54379989-54380071(+) -38.6 .(((((((...(((((((((.((((((..(((((((((......)))).)))))..)))))).)))))))))...))))))). cfa --------------------------------------CCCCUUAUCACUUUUC--CAGCC-AGCUUUGUGACUC-UAA----GUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGGUG----------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:60777003-60777070(-) -27.9 .(((((((((.((((((..(((((((((......)))).)))))..)))))).)))))))))...... fca --------------------------------------UCCCUUAUCACUUUUC--CAGCC-AGCUUUGUGACUC-UAA----GUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGGUG----------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2172:375371-375439(+) -27.7 .(((((((((.((((((..(((((((((......)))).)))))..)))))).)))))))))...... eca ----------------------------------ACAUCUCCUUAUCACUUUUC--CAGCC-AGCUUUGUGACUC-UAA----GUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGG------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:115216736-115216805(-) -25.4 .....(((((((((.((((((..(((((((((......)))).)))))..)))))).))))))))).... mlu ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- pva --------------------------------------CCCCUUAUCACUUUUC--CAGCC-AGCUUCGUGAUGC-UCA----GUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUGGGUGA---------------------- ENSEMBL GeneScaffold_225:89568-89637(+) -27.8 .(((((((((.((((((..(((((....((.....))..)))))..)))))).)))))))))....... eeu ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- sar ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cho ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ete ----------------------------------ACAUCCCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUGUGUGAUUC-UAA----GUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGGUG----------------------- ENSEMBL scaffold_50302:3818-3891(+) -27.26 .(((((((((((((.((((((...(((((...............)))))..)))))).)))))))))..)))) laf --------------------------------------GCCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUUGUGACUC-UAA----AUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGGUG----------------------- ENSEMBL scaffold_28:10321880-10321949(+) -28.2 ((((((((((.((((((...(((((((((......)))).)))))..)))))).))))))))))..... pca --------------------------------------GCCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUUUGGAUUC-UAA----GUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGGUG----------------------- ENSEMBL scaffold_34596:13710-13779(-) -30.0 ((((((((((.((((((...(((((.(((((...))))).)))))..)))))).))))))))))..... meu ------------------------------AGUCACGUCCCCUUAUCACUUU-C--CAGCCCAGCUUUCUAAUUC-UAA----UUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGGUGAC--------------------- ENSEMBL Scaffold4922:16189-16267(+) -28.76 .(((((...(((((((((.(((((...(((((...............)))))..)))))..)))))))))...))))) mdo ----------------------------CCAGUCACAUCCCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUUCUAAUGC-UAA----UUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAGGUGAUUGA------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 1:120539101-120539184(-) -35.86 .(((((((...(((((((((.((((((...(((((...............)))))..)))))).)))))))))...))))))). oan --UCCCAGAAGGCAGACGACGUCCAGGGCCCAUCACGUCUCUUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUUCUGGUUC-UAG----CCGUUGGACGGAGAAUUGAUAAGGGUACGGGGUCGGCAGGAGCAUCCUCCGGGA miRbase UCSC ENSEMBL Contig51342:2473-2600(-) -46.3 ((((.....((.(((...)))...(((((....(((..((((((((.((((((...(((((.....(((....))))))))..)))))).))))))))..)))))))).)).((((....)))))))) gga ----------------------------CCGCUCUCACCCCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUCUUCGCUC-UGA----CUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGU---------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 10:22146245-22146318(+) -27.1 ...........(((((((((.((((((...(((((.((........))..)))))..)))))).))))))))). mga --------------------------------------CCCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUCUUCGCUC-UGA----CUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUGUGC------------------------ UCSC ENSEMBL 12:20836588-20836656(-) -27.1 .(((((((((.((((((...(((((.((........))..)))))..)))))).)))))))))..... tgu CCCGCGGCUCCCCGCCGGUCUCCUGAGGCCGCUCUCGUGCCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUCUGCACUC-UGA----CUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUGCGCGAGUGA------------------ miRbase ENSEMBL 10:20485747-20485858(+) -53.3 ...((((....)))).(((((....)))))((((.((..(((((((((.((((((...(((((.((........))..)))))..)))))).)))))))))..)).)))).. aca ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- xtr ----------------------------CCAGUAUCACUUCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUUUUCAUGAC-AAA----CUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGCUGUGUGACUG------------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_40:1017907-1017989(+) -30.06 .((((..(((..((((((((.((((((...(((((...............)))))..)))))).))))))))..)))..)))) dre ---------------------------GUCGAACACGUCUCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUAUCCAUUUAGUAU----UCGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGCAUGUGCCCGAU----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 18:26309060-26309146(+) -32.29 ((((..(((((.(((((((((.((((((...(((((................)))))..)))))).))))))))).)))))..)))) gac --------------------------------GCACAUCUCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUAUCUAUCAAAUGU----UUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAUGUG----------------------- UCSC ENSEMBL groupXIX:12836840-12836916(-) -28.79 .(((((..((((((((.((((((...(((((................)))))..)))))).))))))))..))))) ola ---------------------------------CACAUCUCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUAUGUGGUCUGUAU----UCGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGCAUGUG----------------------- UCSC ENSEMBL 3:25857495-25857570(+) -28.3 (((((.(((((((((.((((((...(((((...(((.....)))..)))))..)))))).))))))))).))))) tru ----------------------------UCAAGCUCAUCUCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUAACUAUUGUAAAU----UUGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGGUAUGUGUCUG------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_217:127483-127567(+) -27.59 .((.((.(((..((((((((.((((((...(((((................)))))..)))))).))))))))..))).)).)) tni -----------------------------CGCUCACAUCUCCUUAUCACUUUUC--CAGCCCAGCUAUAGCUUCUGAAU----CCGUUGGACGGAGAACUGAUAAGGG----------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 5:2363269-2363341(-) -21.99 ...........((((((((.((((((...(((((................)))))..)))))).)))))))). cin ----------------------GCGUAAUAGAACUUGCCACUUCUUCGCUUUCCAUCAUUUUGGGGUUAAAUCACCCAAGCCAUUGAUGGACGGAGAACUGAUAAGGGCUCUUGCGUUGGUCAA------------- miRbase -37.0 ((((((.((..((((.((.(((((((...(((((((.((((((.........))))))....)))))))))))))).)).))))..)).))))))....... csa ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme -------------------GGUUGGCCGGUGCAUUCGUACCCUUAUCAUUCUCU--CGCCCCG--UGUGCACUUAAAGA----CAACUGGACGGAGAACUGAUAAGGGCUCGUAUCACCAAUUCAUC---------- miRbase UCSC ENSEMBL 2R:9216907-9217006(-) -35.3 ((....))((((.((.((..((((((((((((((.((((...(((..........)))...)).))))))).)))))))))..)).))))))........ cel ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- * * ** * * * *********** ******* * ****** *** * ** ** * * ******************* * ************ * ***** * * *********************** ************** ***** **** *********************** * ************** ***** **** *********************** * ************** ***** **** ************************* * ************** ***** **** * * * ************************* * ************** ***** ****** * * ************************* *** ************** ***** ****** * * * ************************* *** * ************** ***** ****** * * * * ************************* *** * **************** ***** ****** * * * * ************************* *** * ***************** ************ * * *** ************************** *** * ***************** ************ * * * *** ************************** *** * ***************** ************ * * ** *** ****************************** * ***************** ************ *** ** *** ****************************** ** ***************** **************** ** *** ****************************** *** ***************** ******************* *** ****************************** *** ***************** ******************* *** ****************************** *** ***************** ******************* *** ****************************** *** ***************** ******************* *** ****************************** *** ***************** ******************* *** ****************************** **** ***************** ******************* *** ******************************** ********************** ******************* *** ******************************** * ********************** ******************* *** ******************************** * ********************** ******************* *** ******************************** * * ********************** ******************* *** ******************************** ** ** ********************** ******************* *** ******************************** ** ************************** ******************* *** *********************************** ************************** ******************* *** ************************************ ************************** ******************* *** ************************************ ************************** ******************* *** ************************************ ************************** ******************* *** ************************************ ************************** ******************* *** ************************************ *************************** ******************* *** ************************************ * *************************** *********************** ************************************ * * * ****** **************************** *********************** ************************************ * * *****************************************************************************************************************************************