hsa GGUCGGGCUCACCAUGACACAGUGUGAGACCUCGGGCUACAACACAGGACCCGGGCGCUGCUCUGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGACGCAGGUCCGCA--------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 18:33484781-33484889(-) -47.04 .(((...(((((.((......))))))).((((.((((.(((((((((((.((((..............)))).))))))))))).)))).)))))))((......)). ptr -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ggo GGUCGGGCUCACCAUGACACAGUGUGAGACCUCGGGCUACAACACAGGACCCGGGCGCUGCUCUGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGACGCAGGUCCGCA--------------------------- miRbase -47.04 .(((...(((((.((......))))))).((((.((((.(((((((((((.((((..............)))).))))))))))).)))).)))))))((......)). ppy GGUUGGGCUCACCAUGACACAGUGUGAGACCUCGGGCUACAACAUAGGACCCGGGCGCUGCUCUGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGACGCAGGUCCGCA--------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 18:48015845-48015953(-) -43.14 ...(((.....))).(((...((((....((((.((((.(((((((((((.((((..............)))).))))))))))).)))).)))).))))..))).... mml GGUCAGGCUCACUAUGACACAGUGUGAGACCUCGGGCUACAACACAGGACCCGGGUGCUGCUCUGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGACGCAGGUCCGCA--------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 18:28861007-28861115(-) -47.64 .(((...(((((...........))))).((((.((((.(((((((((((.((((..............)))).))))))))))).)))).)))))))((......)). cja ------------------------------CUCGGGCUACAACACAGGACCCGGGCGCUGCUCUGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGAC-------------------------------------- ENSEMBL Contig18:15643048-15643116(-) -33.14 (((.((((.(((((((((((.((((..............)))).))))))))))).)))).))).... tsy -------------------------------UCAGGCUACAACACAGGACCCGGGCGCUGCUCUGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGG-------------------------------------------- ENSEMBL scaffold_93352:9263-9324(+) -27.84 ...((((.(((((((((((.((((..............)))).))))))))))).)))).. mmr ------------------------------CUCGGGCUACAACACAGGACCCGGGCGCUGCUCUGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGAC-------------------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2696:370715-370783(-) -33.14 (((.((((.(((((((((((.((((..............)))).))))))))))).)))).))).... oga -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tbe -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cpo ------------------------------CUUGGGCUACAACACAGGACCCGGGCGCUGAUUUGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGAC-------------------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_14:28433761-28433829(+) -31.64 (((.((((.(((((((((((.((((..............)))).))))))))))).)))).))).... dor ----------------------------------GGCUACAACACAGGACCCGGGCGCUGCUCUGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGACACAGGCUUGCAGCAGCAACAUUUCAAUCUGGGUCUUGG ENSEMBL scaffold_17492:14267-14369(+) -36.4 ..........(((((((((((((((((((((..(((((.((..(((.....))).)))))))...))))...))))).))...........)))))))))). mmu -------------------------------UCAGGCUACAACACAGGACCCGGGCGCUGCUCUGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGG-------------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 18:24587611-24587671(-) -27.84 ...((((.(((((((((((.((((..............)))).))))))))))).)))).. rno -----GGGCUCACAGGACACAAUGCGGAUCCUCAGGCUACAACACAGGACCCGGGCGCUGCUCUGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGACGCAGGUCUGCA--------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 18:16219576-16219679(-) -46.44 ..((.....((((....((((..(((((.((((.(((((((((((.((((..............)))).))))))))))).)))).))))).)))).)))))). str ----------------------------------GGCUACAACACAGGACCCGGGCGCUGUUCAGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGACACAG---------------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2886:341532-341600(-) -29.6 ((((.(((((((((((.((((..((....))....)))).))))))))))).))))............ opr ------------------------------CUCGGGCUACAACCCAGGACCCGGGCGCUGCUCUGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGAC-------------------------------------- ENSEMBL scaffold_992:157341-157409(-) -28.34 (((.((((.((((.((((((.((((..............)))).)))))).)))).)))).))).... ocu ------------------------------CUCGGGCUACAACACAGGACCCGGGCGCUGCUCUGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGAC-------------------------------------- ENSEMBL scaffold_16:30733454-30733522(-) -33.14 (((.((((.(((((((((((.((((..............)))).))))))))))).)))).))).... bta GGCCGGGCUCCCCACGACACGGUGUGAGACCUCGGGCUACAACACGGGACCCGGGCGCUGCUCCGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGACGCAAGUCCGCA--------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 24:22320849-22320957(+) -49.0 .((((...((.....))..))))(((...((((.((((.(((((((((((..(((((......)).))).....))))))))))).)))).))))(((....)))))). ttr ------------------------------CUCCGGCUACAACAUGGGACCCGGGCGCUGCUCCGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGAC-------------------------------------- ENSEMBL scaffold_92276:66462-66530(+) -35.9 ((((((((.(((((..((((..(((((......)).))).....))))..))))).)))))))).... vpa -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ssc ------------------------------CUCGGGCUACAACACGGGACUCGGGCGCUGCUCUGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGAC-------------------------------------- ENSEMBL 6:83322559-83322627(-) -33.14 (((.((((.(((((((((((.((((..............)))).))))))))))).)))).))).... cfa ------------------------------CUCGGGCUACAACACGGGACCCGGGCGCUGCUCCGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGAC-------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 7:57243104-57243171(+) -33.2 (((.((((.(((((((((((..(((((......)).))).....))))))))))).)))).))).... fca ------------------------------CUCGGGCUACAACACGGGACCCGGGCGCUGCUCCGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGAC-------------------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2438:3250-3318(-) -33.2 (((.((((.(((((((((((..(((((......)).))).....))))))))))).)))).))).... eca -------------------------------UCGGGCUACAACACGGGACCCGGGCGCUGCUCCGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGG-------------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 8:56143025-56143085(-) -27.7 ...((((.(((((((((((..(((((......)).))).....))))))))))).)))).. mlu ------------------------------CUCGGGCUACAACACGGGACCCGGGCGCUGCUCCGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGAC-------------------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2930:29380-29448(-) -33.2 (((.((((.(((((((((((..(((((......)).))).....))))))))))).)))).))).... pva --------------------------------CGGGCUACAACACGGGACCCGGGCGCUGCUCCGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGACGCAGGUCCGCAGCAGAGCCCACCCCGCCGCCC------ ENSEMBL GeneScaffold_1884:83779-83877(-) -40.1 .((((.......((((....((((.(((((.((..((..(((.((((..((....))..)))).)))..))..)).))))).))))..))))..)))) eeu -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- sar ------------------------------CUCGGGCUACAACACGGGACCCGGGCGCUACUCCGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGAC-------------------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_3643:217494-217562(-) -33.2 (((.((((.(((((((((((..(((((......)).))).....))))))))))).)))).))).... cho ------------------------------CUCGGGCUACAACACAGGACCCGGGCGCUGCUCCGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGAGGGAC-------------------------------------- ENSEMBL scaffold_462687:486-554(-) -34.0 (((.((((.(((((((((((..(((((......)).))).....))))))))))).)))).))).... ete -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- laf ------------------------------CUCGGGCUACAACACAGGACCCGGGUGCUGCUCUGAC----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCGGGGGGAC-------------------------------------- ENSEMBL scaffold_4:64566763-64566831(+) -32.54 (((.((((.(((((((((((.((((..............)))).))))))))))).)))).))).... pca -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- meu --------------------------------CUGGCUACAACACAGGACAUGGGAGCUUUUCUGAA----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCAGAGGGGCAC------------------------------------ ENSEMBL Scaffold13919:16909-16977(-) -35.04 ((((((.((((((((((((((((..............)))))))))))))))).))))))........ mdo --------------------AUUGUGAGACCUCUGGCUACAACACAGGACACGGGAGCUUUUCUGAA----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCAGAGGGGCACA----------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:87606200-87606280(+) -49.54 ..((((...(((((((((.((((((((((((((((..............)))))))))))))))).)))))))))..)))) oan ----------------------UGUGAGACCUCCGGCUACAACAGAGGACACAGGAGCUUUUCAGAA----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCAGAGGAGCACA----------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL X3:5316985-5317063(+) -38.3 .(((...((((.((((.(((((.((((((((((..((....))...))).))))))).))))).)))).))))..))). gga ---------------AAACUAUUGUGAGACCUCCGGCUACAACACAGGACAUGGGAGCUUUUCUGAA----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCAGAGGGGCACA----------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 2:85892470-85892555(+) -43.14 .......((((...((((.((((.((((((((((((((((..............)))))))))))))))).)))).))))..)))) mga ------------------------------CUCCGGCUACAACACAGGACAUGGGAGCUUUUCUGAA----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCAGAGGGGC-------------------------------------- UCSC ENSEMBL 3:32052411-32052479(+) -35.14 (((.((((.((((((((((((((((..............)))))))))))))))).)))).))).... tgu ------------------------------CUCCGGCUACAACACAGGACAUGGGAGCUUUUCUGAA----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCAGAGGGGCAC------------------------------------ miRbase ENSEMBL 2_random:838730-838799(+) -35.14 (((.((((.((((((((((((((((..............)))))))))))))))).)))).)))...... aca ---------------------UUGUGAGACCUUUGGCUACAACACAGAACAUGGGCGCUUUCUUGGA----CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCAGAGGGGCACA----------------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_452:410974-411054(+) -40.6 .((((...(((((((((.(((((((..(((((((..((.....))...)))))))..))))))).)))))))))..)))) xtr ----------------------UGGUAUACCUUUGGUUACAACACAGGACAUGGGAGCUUACUUGGAA---CCCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCAGUGGUGGCCAAA--------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_756:303898-303979(+) -41.2 ((((.((((.((((((.((((((((((((((((..((.....))..)))..))))))))))))).)))))).)))))))).. dre --------------UGACCUGUGGCUGGGCCAGGGGCUGCAACACAGGACAUGGGAGCUGUCUCUCACUCCCGCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCAGUGGAACG------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 19:33277157-33277245(+) -48.1 ...(((......)))(((..(((((((((((((((((((((((.((.....)))))))....))))))))))))))))))..))).... gac -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ola ---------------------------------CGGCUGCAACACAGGACAUGGGUCCUGCUUCUCCUCCCCGCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCAGUGGAGC-------------------------------------- UCSC ENSEMBL 11:7840476-7840545(+) -39.29 .((((((((((((((((((((((................))))))))))))))))))))))........ tru ----------------------------------GGCUGCAACACAGGACAUGGGUCAUGCCUCUGCCCACCGCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCAGUGGAGCU------------------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_45:756102-756171(-) -40.6 ((((((((((((((((((((((..((........))..))))))))))))))))))))))......... tni ----------------------------------GGCUGCAACACAGGACAUGGGUCUUGCCUCUGCCCGCCGCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCAGUGG----------------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 21:1019288-1019352(-) -41.2 ((((((((((((((((((((((...((........)).))))))))))))))))))))))..... cin -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ** * **** * ** ** * * ********************* * **** ***** **** *** * * ********************* * **** ***** **** *** ** * ********************* * **** ****** **** *** *** * ********************* * ** *********** **** *** *** * *********************** * ** *********** **** *** *** * * *********************** * ** * *********** **** *** *** * ** *********************** * ** * *********** **** *** *** ** ** *********************** * ** * * *********** **** *** *** ** ** *********************** * ** * ** **************** *** **** ** *** *********************** ***** * *** **************** **** **** ** *** *********************** ***** * *** **************** **** ******* *** *********************** ***** * *** **************** **** ******* *** ***************************** * *** ***************************** *** ***************************** * *** ***************************** *** ******************************* *** ********************************* ******************************* *** ********************************* ******************************* ************************************* ******************************* ************************************* ******************************* ************************************* ******************************* ************************************* ******************************* ************************************* ******************************* * ************************************* ******************************* * ************************************* ******************************* ** ************************************* ******************************* ** * ************************************** ******************************* ** ** ************************************** ******************************* ** ** ****************************************** ******************************* ** ********************************************* ******************************* ** * ********************************************* ************************************ *** *** * ********************************************* ************************************** *** ** * ****** ********************************************* ****************************************** ** ***** ******************************************************** ****************************************** ******************************************************************* ******************************************* ********************************************************************* ******************************************* ********************************************************************************************************************* * * * ********************************************************************************************************************************************