hsa -----------UGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCA-------------- miRbase UCSC ENSEMBL 13:92003005-92003075(+) -22.0 .(((..((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).))))..))). ptr -----------UGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCA-------------- miRbase UCSC ENSEMBL 13:92018920-92018990(+) -22.0 .(((..((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).))))..))). ggo ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL 13:74442740-74442832(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... ppy ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- UCSC ENSEMBL 13:93460168-93460260(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... mml --------UCUUGUGUUAAGGUGCAUCUAGUGCAGUUAGUGAAGCAGCUUAGAAUCUACUGCCCUAAAUGCCCCUUCUGGCACAGG---------- UCSC ENSEMBL X:132387522-132387600(-) -27.2 .((((((((((((.((((.(((.(((((..((.(((...)))...))..))))).))).)))).)))..))))))))) cja ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL Contig45:6265601-6265693(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... tsy ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL scaffold_642:93155-93247(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... mmr ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL scaffold_4070:81145-81237(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... oga ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL GeneScaffold_5369:528166-528258(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... tbe ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL GeneScaffold_5511:4270-4362(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... cpo ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- UCSC ENSEMBL scaffold_5:32029257-32029349(-) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... dor ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL scaffold_13652:22697-22789(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... mmu UGCGUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGACUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGUC miRbase UCSC ENSEMBL 14:115443073-115443168(+) -31.0 .(((((((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((((.((....))..)).))))))).)))..))).)))..))).)))))))).))))). rno UGCGUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGACUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGUC miRbase UCSC ENSEMBL 15:99853871-99853966(+) -31.0 .(((((((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((((.((....))..)).))))))).)))..))).)))..))).)))))))).))))). str ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL GeneScaffold_5709:128721-128813(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... opr ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGU------ ENSEMBL GeneScaffold_5286:74032-74119(+) -27.2 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).))))))))) ocu ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL scaffold_9:44488874-44488966(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... bta -----------UGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCA-------------- miRbase UCSC ENSEMBL 12:64665245-64665315(+) -22.0 .(((..((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).))))..))). ttr ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL GeneScaffold_3582:187028-187120(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... vpa ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAAUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL scaffold_680:539051-539143(+) -27.2 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((((...........)).))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... ssc ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL 11:60972593-60972685(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... cfa ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- miRbase UCSC ENSEMBL 22:45426637-45426728(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... fca ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL scaffold_143765:479-571(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... eca ----------------UAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUC------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 17:61792556-61792616(+) -19.3 .((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))). mlu ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL scaffold_163174:1571-1663(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... pva ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL scaffold_4231:107606-107698(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... eeu ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL scaffold_358553:3990-4082(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... sar ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL scaffold_234783:300-392(-) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... cho ------------------------------------------------------------------------------------------------ ete ------------------------------------------------------------------------------------------------ laf ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL scaffold_11:14397004-14397096(-) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... pca ------------------------------------------------------------------------------------------------ meu ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- ENSEMBL Scaffold76730:2046-2138(+) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... mdo ---GUGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGU- UCSC ENSEMBL 7:108468747-108468839(-) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... oan --------CCUUGUGUUAAGGUGCAUCUAGUGCAGUUAGUGAAGUAGCUUAGAAUCUACUGCCCUAAAUGCUCCUUCUGGCACAAG---------- UCSC ENSEMBL 6:8561233-8561311(+) -28.5 .((((((((((((.((((.(((.(((((..((.(((...)))...))..))))).))).)))).)))..))))))))) gga ---GUGCUUUUUGUACUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGUC miRbase UCSC ENSEMBL 1:152248626-152248718(-) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))...... mga ---GUGCUUUUUGUACUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUUAUGUC UCSC ENSEMBL 1:158418755-158418848(-) -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).)))))))))...... tgu ------CUUUUUGUACUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCU------------------ miRbase ENSEMBL 1:43202937-43203008(-) -19.7 ......(((((.(((.((((((.....)))).....(((((((....)))))))))))).)))))....... aca ----UGCUUUUUGUUCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAGAAGUU----- UCSC ENSEMBL scaffold_82:3902175-3902262(-) -27.3 .(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).)))..))).))))))))). xtr ---GUGCUUUUUGUCCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGAUUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAAAAGU------ miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_740:85669-85755(-) -29.6 ..(((((((((((.((((.(((..(((.((((.(((....((......))..))))))).)))..))).))))..)).))))))))) dre ------GGCUUUGUGCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGACUAGCACCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCACGAGGGU------- miRbase UCSC ENSEMBL 8:45337910-45337992(+) -33.7 ..(((((((((((((.(((..(((.((((.(((((.((....))..)).))))))).)))..))).)))..)))))))))).. gac ---------UUUGUGCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAAUAGACUAGCACCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAG---------- UCSC ENSEMBL groupII:7842886-7842963(+) -27.1 .(((((((((((.(((..(((.((((.(((((...........)).))))))).)))..))).)))..)))))))). ola ---------UUUGUGCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAAUAGACUAGCACCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAG---------- UCSC ENSEMBL 3:15107468-15107545(+) -27.1 .(((((((((((.(((..(((.((((.(((((...........)).))))))).)))..))).)))..)))))))). tru ---------UUUGUGCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAAUAGACUAGCACCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUAAG---------- UCSC ENSEMBL scaffold_1:5701156-5701233(+) -27.1 .(((((((((((.(((..(((.((((.(((((...........)).))))))).)))..))).)))..)))))))). tni -----------CAUGCUAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUAGUGAAGUAGACUAGCAUCUACUGCCCUAAGUGCUCCUUCUGGCAUGA----------- UCSC ENSEMBL 2:12892238-12892312(+) -28.9 ((((((((((.(((..(((.((((.(((((.((....))..)).))))))).)))..))).)))..))))))). cin ------------------------------------------------------------------------------------------------ csa ------------------------------------------------------------------------------------------------ dme ------------------------------------------------------------------------------------------------ cel ------------------------------------------------------------------------------------------------ ******************* ******* ** *** * ************ *** ***** * ******************* ******* *** *** * ************ ********** *** *************************** **** ***** *************************** *** **************************** **** ***** *************************** *** ********************************* ********************************* **** ********************************* ********************************* **** ********************************* ********************************* * ***** ******************************************************************* *** ***** *********************************************************************** ***** *********************************************************************** ****** *********************************************************************** ******** *********************************************************************** ************************************************************************************** *************************************************************************************** **************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ******************************************************************************************** ********************************************************************************************* ********************************************************************************************* ************************************************************************************************ ************************************************************************************************