hsa GCCGAGACCGAGUGCACAGGGCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGCUCUCGUCUCCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUCGCCUCAAUGCCAGC miRbase UCSC ENSEMBL 11:64658609-64658718(-) -38.89 ...(((.((.........)).)))((((((((((((((.(((((((................))))))).))))).)))))))))..(((((..........)))))... ptr GCCGAGACCGAGUGCACAGGGCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGCUCUCGUCUCCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUCGCCUCAAUGCCAG- miRbase UCSC ENSEMBL 11:63311885-63311993(-) -38.89 ...(((.((.........)).)))((((((((((((((.(((((((................))))))).))))).)))))))))..(((((..........))))).. ggo -----------GUGCACAGGGCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGCUCUCGUCUCCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUC-------------- ENSEMBL 11:61881435-61881520(-) -32.59 ....(((..(((.((((((((((((((.(((((((................))))))).))))).)))))))))..))).))).. ppy GCCGAGACCGAGUGCACAGGGCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGCUCUCGUCUCCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUCGCCUCAAUGCCAGC miRbase UCSC ENSEMBL 11:11059354-11059463(+) -38.89 ...(((.((.........)).)))((((((((((((((.(((((((................))))))).))))).)))))))))..(((((..........)))))... mml GCUGAGACCGAGUGCACAGGGCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGCUCUCGUCUCCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUCGCCUCAAUGCCAGC miRbase UCSC ENSEMBL 14:9556374-9556483(+) -41.89 ((((.....(((.(((((..(((.((((((((((((((.(((((((................))))))).))))).)))))))))..))).)))..))))).....)))) cja -----------GUGCACAAGGCUCUGACCU-AUGAGUUGACAGCCAGUGCUCUGGUCUCCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUC-------------- ENSEMBL Contig262:2941031-2941116(+) -32.3 ....(((..(((.((((((((((((((.(((((((......((.....)).))))))).))))).)))))))))..))).))).. tsy --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mmr --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- oga --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tbe --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cpo -----------GUGCACAGGGCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGCUGUCAGCUCCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUC-------------- UCSC ENSEMBL scaffold_42:5717217-5717302(-) -34.3 ....(((..(((.((((((((((((((.(((((((.((.....))......))))))).))))).)))))))))..))).))).. dor -----------GUGCACAAGGCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGCGCUG-UCUCCCC-CUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUC-------------- ENSEMBL GeneScaffold_5084:102615-102698(-) -31.04 ....(((..(((.((((((((((((((.(((((((..............))))))).))))).)))))))))..))).))).. mmu ----------CGUGCACAGGGCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUACUCUUUUCUCUCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUCACC----------- miRbase UCSC ENSEMBL 19:6264844-6264932(+) -36.99 .(((.(((..(((.((((((((((((((.(((((((................))))))).))))).)))))))))..))).))).))). rno GUCAAGAUGGAGUGCACAGGGCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUACUCUGAUCUCGCCUCUGGCUGCCAGUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUCGCCUCAAUGCCAGC miRbase UCSC ENSEMBL 1:209040256-209040365(+) -39.8 .......((..(((.(((..(((.((((((((((((((.(((((((.....((....))...))))))).))))).)))))))))..))).))).)))..))........ str --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- opr -----------GUGCACAGGGCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGCCC-CGUCUGCCCUCUGGCUGCCAAUUGCAUAGGUCACAGGUAUGUUC-------------- ENSEMBL GeneScaffold_5207:74541-74625(-) -34.4 ....(((..(((.((((((((((((((.(((((((.((.......))...))))))).))))).)))))))))..))).))).. ocu --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- bta ----AGACCGAGUGCACAGGGCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGCUCUUGUGUCCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUCGCCUCAAUGCCAGC miRbase UCSC ENSEMBL 29:44934706-44934811(-) -39.4 .....(((.(((((..(((.((((((((((((((.(((((((.((......)).....))))))).))))).)))))))))..))).)))..)))))......... ttr -----------GUGCACAGGGCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGCUCUCGUCUCCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUC-------------- ENSEMBL GeneScaffold_3353:272492-272577(-) -32.59 ....(((..(((.((((((((((((((.(((((((................))))))).))))).)))))))))..))).))).. vpa --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ssc -------------GCACAGGGCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGCUCUCAUCUCCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUG----------------- miRbase ENSEMBL 2:5685412-5685491(+) -31.29 ........((.((((((((((((((.(((((((................))))))).))))).))))))))).))..... cfa -----------------------CUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGCUCUCAUCUCUCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAG---------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 18:55305795-55305859(+) -29.49 .((((((((((((((.(((((((................))))))).))))).)))))))))... fca --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- eca -----------------------CUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGCUC-UUGUCUCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCA------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 12:25044238-25044298(-) -29.06 ..(((((((((((((.(((((((...............))))))).))))).)))))))). mlu --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- pva -----------GUGCACAGGGCUCUGACCU-AUGAGUUGACAGCCAGUGCUCUUGUCUCCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUC-------------- ENSEMBL GeneScaffold_2872:83860-83945(-) -32.59 ....(((..(((.((((((((((((((.(((((((................))))))).))))).)))))))))..))).))).. eeu -----------GUGCGCAGGGCUCUGACCU-AUGACUUGACAGCCAGUGCCC---UCUCCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUCACC----------- ENSEMBL scaffold_261857:12370-12455(-) -33.62 (((.(((..(((.(((((((((..(((.(((((((.............))))))).)))...)))))))))..))).))).))). sar --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cho --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ete -----------GUGCACAAGUCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGCCUUGGGCUCCCCUCUGGCUGCCAAUACCAUAGGUCACAGGUAUGUU--------------- ENSEMBL GeneScaffold_2101:788-872(-) -34.9 ....(((..(((.(((((((((.((((.(((((((.(((...)))......))))))).))))..))))))))).)))..))). laf -----------GUGCACAGGGCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGCCCUCGGCUCCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUC-------------- ENSEMBL scaffold_71:4591080-4591165(+) -35.8 ....(((..(((.((((((((((((((.(((((((.(((...)))......))))))).))))).)))))))))..))).))).. pca -----------GUGCACAGGGCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGCCCUCGGCUCCCCUUUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUC-------------- ENSEMBL GeneScaffold_1825:4766-4851(-) -33.6 ....(((..(((.((((((((((((((.(((((((.(((...)))......))))))).))))).)))))))))..))).))).. meu -------------GCA-GGGGCUCUGACCUUAUGAAUUGACAGCCAGUACUCAUUCUCCCUUUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUC-------------- ENSEMBL GeneScaffold_2476:19531-19614(-) -29.89 (((...(((.((((((...((((((.(((((((................))))))).))))))...))))))..))).))).. mdo --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- oan --------AGAGCGCACAGGGCUCUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUUCUCUC-UGACCCCUCUGGCUGCCAAUUCCAUAGGUCACAGGUAUGUUCGCCU---------- miRbase UCSC ENSEMBL Contig35411:1-91(-) -38.8 ((.(((.(((..(((.((((((((((((((.(((((((.((.....)).....))))))).))))).)))))))))..))).))).))))) gga --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mga --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tgu --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- aca --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- xtr ---------GAGUGUACGGGCCUAUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUG----GAUGUGAAGUCUGCCUGUCAAUUCUGUAGGCCACAGGUUCGUCCACCU---------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_296:1453300-1453386(+) -40.7 ..(((.((((((((.((.(((((((((((((((...((((((.....)))))))))))))))).))))).)).)))))))).))).. dre --------CUAGGACACAGGGUGAUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUGUUU--GCAGUCCAGCUGCCUGUCAGUUCUGUAGGCCACUGCCCUGUU--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 10:22538359-22538443(+) -38.4 .......(((((((..((.(((((((((((((((.((((............)))).)))))))))).))))).))..))))))). gac -------------ACACAAAGCGAUGACCU-AUUAAUUGACAGCCAGUGGUU--GUAAACU--CUGCCUGUCAGUUCUCUAGGCCACUGCUGUGUUU-------------- UCSC ENSEMBL groupVII:15576702-15576781(-) -27.0 (((((..(((.((.((((..(((((((((.(((.((((...))))))).)))))))))...)))).)).)))))))).. ola ------------GGCACAAGGUGAUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUUACU--UCUAACAC-CUGCCUGUCAGUUCUGUAGGCCACUGCUGCGU---------------- UCSC ENSEMBL 14:20215831-20215910(+) -27.62 .(((...((((....(((((((((((((((.(((.............))).)))))))))).))))).))))..))).. tru --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tni --------------CACGAGGUGAUGACCU-AUGAAUUGACAGCCAGUAACU--GG-AGCCU-CUGCCUGUCAGUUCUGUAGGCCACUGCUGCGUCCGUCCC--------- miRbase UCSC ENSEMBL 7:7655502-7655584(+) -29.4 .(((.(((..((.(((((((((((((((((((...)))).((....)))))))))))).))))).))..))).)))....... cin --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ****** ** * ************ ** *** ** * **** ** ****** **** ************ *** *** ** *** **** *** * ****** **** ************ *** *** ** *** **** *** * * *** * ****** ***************** *** *** ** *** **** *** * * ** *** ** ****** ***************** ** *** *** ** *** **** *** * * ** ***** *** ******* ***************** * ****************************** * *** ***** *********** ******************* ******************************** **** * ***** *********** ******************* * **************************************** * ***************** ******************* * **************************************** ******************* ********************** ****************************************** ******************* ********************** ****************************************** ******************* ********************** ****************************************** ******************* ********************** ******************************************* ******************* ********************** ******************************************* ******************* ********************** ******************************************* ******************* ****************************************************************** ******************* ****************************************************************** ******************* ****************************************************************** * ******************* ****************************************************************** ** ******************** ****************************************************************** ** ********************* ********************************************************************** ********************* *********************************************************************** *** ********************** ******************************************************************************* * ************************** ******************************************************************************** ****************************** ******************************************************************************** ****************************** ******************************************************************************** ****************************** ******************************************************************************** ***************************************************************************************************************