hsa -------AUGGUGUUAUCAAGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUGUGUAC-CAAUUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUGGUUACCAA-------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:220291499-220291583(-) -37.9 .(((((..((((((.(((((((((.((((((.((((..((......)).)))))))))).))))))))).))))))...))))). ptr ----------------------------------------------------------------------------------------------------- ggo ----------------UCAAGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUGUGUAC-CAAUUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUGG--------------- ENSEMBL 1:200838394-200838463(-) -30.7 (((((.(((((((((.((((((.((((..((......)).)))))))))).))))))))).)))))... ppy ----------------UCAAGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUGUGUAC-CAAUUUCCAGUGGAGAUGUUGUUACUUUUGAUG---------------- UCSC ENSEMBL 1:29611610-29611678(+) -28.3 (((((.(((((((((.((((((.((((..((......)).)))))))))).))))))))).))))).. mml -------AUGGUGUUAUCAAGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUGUGUAC-CAAUUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUGGUUACCAA-------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:150245289-150245373(+) -37.9 .(((((..((((((.(((((((((.((((((.((((..((......)).)))))))))).))))))))).))))))...))))). cja --------------UAUCAAGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACCGUGUAC-CAAUUUCCAGUGGAGACGCUGUUACUUCUGAUGG--------------- ENSEMBL Contig886:38569-38640(-) -28.5 (((((...((((((((..((((((.((((...((...))...))))))))))..))))))))...))))). tsy -------AUGGAGUUAUCAAGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGAUUGUGUAC-CAAUUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACGUUUGAUGAUUACCAA-------- ENSEMBL GeneScaffold_3794:147117-147202(-) -42.3 .(((((((((((((((((((((((.(((((((..(((((.....)))))..)).))))).)))))))))))))))))))).))). mmr ----------------------------------------------------------------------------------------------------- oga ---------------AUCAAGUGUAACAGCAACUCCAUAUGGACUAUGUGC-CAAUUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUGGUUACCAA-------- ENSEMBL GeneScaffold_376:45128-45205(-) -31.6 ((((((.(((((((((.((((((.((((..((......)).)))))))))).))))))))).))))))......... tbe -------AUGGAGUUAUCAAGUGUAACAGCAACUCCACGUGGACUGAAUAC-CGAUUUCCAGUGGAGAUGGUGUUACUUCUGAUGAUUACCAA-------- ENSEMBL GeneScaffold_5421:233961-234046(-) -34.82 .(((((((((((...((((((.((.((((((.((((.............)))))))))).)).))))))...)))))))).))). cpo ----------------------------------------------------------------------------------------------------- dor -----------------CAGGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUGUGAAG-CAAUUCCCAGUGGAGCUGCUGUUACUUCUGAUGG--------------- ENSEMBL GeneScaffold_4557:55112-55180(-) -30.9 ((((.(((((((((.((((((..(((.((.....))..)))..)))))).))))))))).)))).... mmu ---------------AUCGGGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUGUGCU--CGGAUUCCAGUGGAGCUGCUGUUACUUCUGAU----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:187137198-187137264(+) -34.1 ((((((.(((((((((.((((((.(((((((....)))..)))))))))).))))))))).)))))) rno -------AUGGAGUCAUCACGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUGUGCA--CAGAUCCCAGUGGAGCUGCUGUUACUUUUGAUGGCCUCCA--------- miRbase UCSC ENSEMBL 13:101312447-101312529(+) -44.7 .(((((((((((...(((((((((.((((((..((((((....))).)))..)))))).)))))))))...)))))).))))) str ----------------------------------------------------------------------------------------------------- opr ----------------------------------------------------------------------------------------------------- ocu -------AUGGAGUUAUCAAGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUAUGUAC-CAAUUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUGGUUACCAA-------- ENSEMBL scaffold_12:17292572-17292657(-) -37.8 .(((((..((((((.(((((((((.((((((.((((..((......)).)))))))))).))))))))).))))))..)).))). bta -UUCUUAACGGCGUCAUCGAUUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUGUGCGU-CAAUUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUGGCUGCCAAUUCACU-- miRbase UCSC ENSEMBL Un.004.2:1796071-1796167(+) -45.2 ........(((((((((((..(((((((((.((((((.((((..((......)).)))))))))).)))))))))..)))))))).)))........ ttr -----------------CAACUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUGUGCAC-CAAUUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUGG--------------- ENSEMBL GeneScaffold_3295:198985-199053(-) -28.9 (((..(((((((((.((((((.((((..((......)).)))))))))).)))))))))..))).... vpa ----------------CCAAGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUGUGUAC-CAAUUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUGG--------------- ENSEMBL GeneScaffold_245:1481706-1481775(-) -29.6 .((((.(((((((((.((((((.((((..((......)).)))))))))).))))))))).)))).... ssc -------------------GCUGUAACAGCGACUCCAUGUGGACUGUGCCC-CAAUUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACCUUUGACGGCGA------------ ENSEMBL 10:9750924-9750993(-) -27.11 ((((((((((((.((((((.((((..((......)).)))))))))).))))))))).......))).. cfa --------------------GUGUAACAGCAACUCCAUGUGGAUUGUGUGC-CAAUUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUGGUUAC----------- UCSC ENSEMBL 38:17895063-17895132(-) -27.4 ..(((((((((.(((((((..(((((.....)))))..)).))))).)))))))))............. fca ----------------UCAAGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUGUGUAC-CAAUGUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUGA--------------- ENSEMBL GeneScaffold_2186:212040-212109(-) -33.7 (((((.(((((((((.((((((.(((((...........))))))))))).))))))))).)))))... eca ----------------------------------------------------------------------------------------------------- mlu ----------------UCAAGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUGCGUAC-CAAUUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUGG--------------- ENSEMBL GeneScaffold_5684:133023-133092(-) -29.52 (((((.(((((((((.((((((.((((.............)))))))))).))))))))).)))))... pva ---------------AUCGAGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGGCUGUGUAC-CAACUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAU----------------- ENSEMBL scaffold_294:204641-204709(-) -31.7 ((((((.(((((((((.((((((...((..((......))..)).)))))).))))))))).)))))) eeu ----------------UCAAGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUGUGUAC--AAUUUCCAGUGGAGAUGCUGUUAUUUUUGAUGA--------------- ENSEMBL GeneScaffold_609:17085-17153(-) -29.1 (((((.(((((((((.((((((.((((..((.....)).)))))))))).))))))))).)))))... sar -------------------AGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACCGUGUCC-AAGC--CCAGUGGAGAUGCUGUUACUCUCGGCGGCUUC----------- ENSEMBL GeneScaffold_484:20969-21037(-) -28.9 ((.(((((((((.((((((.(((((...)))))......)))))).))))))))).)).......... cho -----------------CAAAUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUGUGUAC-CAAUUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUGG--------------- ENSEMBL GeneScaffold_582:23573-23641(-) -29.6 ((((.(((((((((.((((((.((((..((......)).)))))))))).))))))))).)))).... ete -----------------CAAAUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUGUGU-C-UAAUUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUGCUU------------- ENSEMBL GeneScaffold_570:38353-38422(-) -29.4 ((((.(((((((((.((((((.((((..((.....)).)))))))))).))))))))).))))...... laf -------AUGGAGUUAUCAAAUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACCAGGUAC-CGACUUCCAGUGGGGAUGCUGUUACUUUUGAUGGCUACCAA-------- ENSEMBL scaffold_74:8120690-8120775(-) -42.3 .(((((((((((((.(((((((((.((((((.((((...(((....))))))))))))).))))))))).)))))))))).))). pca ----------------------------------------------------------------------------------------------------- meu ----------------------------------------------------------------------------------------------------- mdo ----------------------------------------------------------------------------------------------------- oan GAGACCAACAGUGUUAUCAUAUGUAACAGCAACUCCAUGUGGAUUAUGC---UGAUUUCCAGUGGAGAGGCUGUUACUUUUGAUGGAAACUGGCAAACUAC miRbase UCSC ENSEMBL Contig27098:3308-3405(+) -35.5 ........((((..(((((...((((((((..((((((.((((...........))))))))))..))))))))...)))))...))))......... gga ---------------CUCAUAUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUACAC---UGACUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUAG--------------- UCSC ENSEMBL 3:19924494-19924562(+) -28.1 .(((...(((((((((.((((((.((((...........)))))))))).)))))))))...)))... mga ---------------CUCAUAUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUACAC---UGACUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUAG--------------- UCSC ENSEMBL 2:19251320-19251388(+) -28.1 .(((...(((((((((.((((((.((((...........)))))))))).)))))))))...)))... tgu -----------UGCUCUCAUAUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACUACAC---UGACUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUGG--------------- miRbase ENSEMBL 3:9653586-9653657(+) -28.5 ..((.(((...(((((((((.((((((.((((...........)))))))))).)))))))))...))).)) aca ----------------UCAAGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGAAUAAGUA---GAUUUCCAGUGGAGGUGCUGUUACUUUUGAAGCU-------------- UCSC ENSEMBL scaffold_172:760500-760568(-) -31.9 (((((.(((((((((.((((((.(((((.........))))))))))).))))))))).))))).... xtr -------UAGUGUGUAUCAGGUGUAACAGCAACUCCAUGUGGACU-UGU-C-CGUAUUCCAGUGGAGAUGCUGUUACUUUUGAUGGGCAC----------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_182:575333-575412(+) -38.7 ..((((.(((((((.(((((((((.((((((.((((...........)))))))))).))))))))).))))))).)))) dre ----------------------------------------------------------------------------------------------------- gac ----------------------------------------------------------------------------------------------------- ola ----------------------------------------------------------------------------------------------------- tru ----------------------------------------------------------------------------------------------------- tni ---------------GCUGGAUGUAACAGCAACUCCAUGUGGAAGCUGUAUGUGUGUUCCAGUGGAAGUGCUGUUACCUGCAG------------------ UCSC ENSEMBL 7:7655325-7655393(+) -27.4 .(((...(((((((((..(((((.(((((((.......)).))))))))))..)))))))))...))) cin ----------------------------------------------------------------------------------------------------- csa ----------------------------------------------------------------------------------------------------- dme ----------------------------------------------------------------------------------------------------- cel ----------------------------------------------------------------------------------------------------- ********* ****** *** ******* * ***** ********************** ********* * ****** * * ********************** * ********* ********* * *** ********************** *********** *********** *** * ********************** * * *********** *********** **** * ************************ * * ***************************** * ************************ * * ***************************** ** ************************ ** * ***************************** ** ************************ ** * ***************************** *** ************************ ** * * ***************************** *** **************************** * ********************************** ********************************* * ********************************** *********************************** ********************************** *********************************** ********************************** *********************************** ********************************** *********************************** ********************************** *********************************** ********************************** *********************************** ********************************** ************************************ ********************************** ************************************ ********************************** * ************************************ ********************************** * ************************************ ********************************** *** * ************************************* ********************************** *** * ** *************************************** **************************************** * ** *************************************** ***************************************** **** *************************************** ***************************************** **** *************************************** ***************************************** ******************************************** ***************************************** ******************************************** ***************************************** ******************************************** ***************************************** ********************************************* ***************************************** *** *****************************************************************************************************