hsa -------------------------GCCAACCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGAGGCUCUCAAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 19:10928102-10928172(-) -29.2 (((...(((((((.((((((((.(((.((.(((...)))....)).))))))))))).)))))))...)))
ptr -------------------------GCCAACCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGAGGCUCUCAAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGG------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 19:11093658-11093727(-) -26.0 .((...(((((((.((((((((.(((.((.(((...)))....)).))))))))))).)))))))...))
ggo -------------------------GCCAACCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGAGGCUCUCAAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ ENSEMBL 19:11053301-11053372(-) -29.2 (((...(((((((.((((((((.(((.((.(((...)))....)).))))))))))).)))))))...)))
ppy -------------------------GCCAACCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGAGGCUCUCAAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ UCSC ENSEMBL 19:10962011-10962082(-) -29.2 (((...(((((((.((((((((.(((.((.(((...)))....)).))))))))))).)))))))...)))
mml AGGAAGCUUCUGGAGAUCCUGCUCCGUCGCCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGA--CAAUGCCGUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGACUGGGCAAGGGAGAGCA-------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:201838740-201838849(-) -43.4 .....((((((((....))(((((.(((...(((((((.((((((((.(((...((......)).....))))))))))).)))))))...))).)))))..))).))).
cja -------------------------GCCAACCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGAGGCCGUCAAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ ENSEMBL Contig258:2946316-2946387(+) -27.4 (((...(((((((.((((((((.(((.((.((.....))....)).))))))))))).)))))))...)))
tsy ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mmr ----------------------------GGCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGGGCUGCUGCACGCGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGCUG---------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_483:280854-280924(-) -27.9 ((((((((((.((((((((.(((......((....))......))))))))))).))))))....)))).
oga ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tbe ----------------------------GCCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGA--CAAUGCCGUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGACUGGGCAA----------------------- ENSEMBL scaffold_14747:70010-70083(+) -28.3 ((((((((((.((((((((.(((...((......)).....))))))))))).))))))........))))..
cpo ----------------------------GGCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGCGCCUCUGCAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGCUG---------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_226:180912-180982(-) -28.1 ((((((((((.((((((((.(((.((.(((....))).))...))))))))))).))))))....)))).
dor -------------------------GCCAUCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGCGGCUGUGA-UGUGUACAGUAGUCUGCACACUGGUUAGGCUGGGUCGGCA-------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2599:107595-107675(-) -34.1 (((..((((((.....(((((..(((.(((((.((((((.....)))))).))))).))).)))))..))))))..))).
mmu -------------------------GCCAUCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGAGGCUGGGA-CAUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 9:21300939-21301008(-) -28.21 (((...(((((((.((((((((.(((((((....)))).......))))))))))).)))))))...)))
rno -----------------------------UCCCAGUGUUC----CUCGUGUUCAGGAGACCA-AGACAUGUACAGUAGUCAGCACAUUGGUUAGGCUGGGCUUGGGUCAGCAGUGACAGUGGGAAC UCSC ENSEMBL 8:20600478-20600570(-) -27.5 (((((.(((((((...((((((..((((((....((.((....)))).....))))))...))))))..)))........)))).)))))..
str -------------------------GCCAUCCCAGUGUUCAGACUAG-UGUUCAGGAGGCUCUGAAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_2212:324028-324098(-) -29.8 (((...(((((((.(((((((.((((((((....)))))......))).))))))).)))))))...)))
opr ----------------------------GCCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGA--CAAUGCCGUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGACUGGGCAA----------------------- ENSEMBL scaffold_2153:77706-77779(-) -28.3 ((((((((((.((((((((.(((...((......)).....))))))))))).))))))........))))..
ocu ----------------------------CGCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGGGACUCCAGAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGCUGGGCC------------------------ ENSEMBL scaffold_311:201978-202052(+) -28.4 .(((((((((.((((((((.(((.((.((....))...))...))))))))))).)).........))))))).
bta UGGAAGCUUCUGGAGAUCCUGCUCCGUCGCCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGA--CAAUGCCGUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGACUGGGCAAGGG-------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 16:36247788-36247891(-) -40.0 .................(((((((.(((...(((((((.((((((((.(((...((......)).....))))))))))).)))))))...))).)))).))).
ttr -------------------------GCCAACCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGGGGCUCUGAAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_1208:179140-179211(-) -30.5 (((...(((((((.((((((((.((((((((....)))))......))))))))))).)))))))...)))
vpa ----------------------------GCCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGA--CAAUGCCGUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGACUGGGCAA----------------------- ENSEMBL GeneScaffold_108:412277-412350(-) -28.3 ((((((((((.((((((((.(((...((......)).....))))))))))).))))))........))))..
ssc ----------------------UCCGUCGCCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGA--CAAUGCCGUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGACUGGG-------------------------- miRbase ENSEMBL 9:107644943-107645018(-) -31.6 .(((((...(((((((.((((((((.(((...((......)).....))))))))))).)))))))...))).)).
cfa -------------------------GCCAACCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGGGGCUCUGAAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ UCSC ENSEMBL 20:53414682-53414753(+) -30.5 (((...(((((((.((((((((.((((((((....)))))......))))))))))).)))))))...)))
fca --------------------------CCCACCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGGGGUUCUGAAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGCUGGG-------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_4666:344127-344201(-) -28.2 ((((((((((((.((((((((.((((((((....)))))......))))))))))).))))))....)).))))
eca ----------------------------CGCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGGGGCUCCGAAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGCUGGGCC------------------------ UCSC ENSEMBL 7:49327228-49327302(+) -27.3 .(((((((((.((((((((.(((.((.((....))...))...))))))))))).)).........))))))).
mlu -------------------------GCCAACCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGGGGCUCUGAAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_2199:170942-171013(-) -30.5 (((...(((((((.((((((((.((((((((....)))))......))))))))))).)))))))...)))
pva -------------------------GCCAGCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGGGGCUCUGAAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_1402:159197-159268(-) -30.5 (((...(((((((.((((((((.((((((((....)))))......))))))))))).)))))))...)))
eeu ----------------------------GGCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGA--CAAUGCCGUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGACUGGGCAA----------------------- ENSEMBL scaffold_371982:39940-40013(-) -27.9 .(((((((((.((((((((.(((...((......)).....))))))))))).)).........)))))))..
sar ----------------------------GGCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGA--CAGUGCCGUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGACUGGGCA------------------------ ENSEMBL scaffold_246602:35015-35087(+) -27.9 .(((((((((.((((((((.(((...((......)).....))))))))))).)).........))))))).
cho ----------------------------GCCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGA--CAAUGCCGUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGACUGGGCAA----------------------- ENSEMBL scaffold_39704:7084-7157(+) -28.3 ((((((((((.((((((((.(((...((......)).....))))))))))).))))))........))))..
ete ----------------------------GCCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGA--CAAUGCCGUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGACUGGGCAA----------------------- ENSEMBL scaffold_313277:38601-38674(+) -28.3 ((((((((((.((((((((.(((...((......)).....))))))))))).))))))........))))..
laf -------------------------GCCAACCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGGG-UUCUGAAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ ENSEMBL scaffold_26:32928975-32929045(+) -29.1 (((...(((((((.((((((((.(((((((.....))))......))))))))))).)))))))...)))
pca -------------------------GCCAACCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGGG-UUCUGAAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ ENSEMBL GeneScaffold_7523:112040-112110(-) -29.1 (((...(((((((.((((((((.(((((((.....))))......))))))))))).)))))))...)))
meu --------------------------CCAGCCCAGUGUUCAGACUACCUGUCCAGGAGAUUGCAAAUGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGCUGGG-------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1068:45606-45680(-) -30.54 ((((((((((((.((((((((.(((.((..............)).))))))))))).))))))....)))))).
mdo --------------------------CCAGCCCAGUGUUCAGACUACCUGUCCAGGAGAUUGCAAAGGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGCUGGG-------------------------- UCSC ENSEMBL 3:430288129-430288203(+) -30.54 ((((((((((((.((((((((.(((.((..............)).))))))))))).))))))....)))))).
oan ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
gga ----------------------------UGCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGA--CUACGAGAUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGCUGUGCUGGGA-------------------- UCSC ENSEMBL 17:5667162-5667238(+) -27.1 ..((((((...(((.((((((((...(((((((...........)))))))..)))..)).))).))).)))))).
mga ----------------------------UGCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGA--CUACGAGAUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGCUGUGCUGGGA-------------------- UCSC ENSEMBL 19:5336512-5336588(+) -27.1 ..((((((...(((.((((((((...(((((((...........)))))))..)))..)).))).))).)))))).
tgu ----------------------------UGCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGA--CUACGAGAUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGCUGUGCUGGGA-------------------- ENSEMBL 17:5549804-5549880(+) -27.1 ..((((((...(((.((((((((...(((((((...........)))))))..)))..)).))).))).)))))).
aca -------------------------GCCUUCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGAAGCUACAAAGGUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGACUGGGCU------------------------ UCSC ENSEMBL scaffold_86:429124-429201(+) -28.0 (((((((((((((.((((((((.(((.......(((.....)))..))))))))))).)))))))...))..)))).
xtr ------------------------------CCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGA--CAAUGCUGUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGACUGGGCAUGGGA------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_85:1809363-1809438(-) -29.3 ((((.(((((((.((((((((.((((....(((((.....))))).)))).)))..)).))).))))))))))).
dre -------------------------GCUUUCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGGCGUAG--AGAUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ UCSC ENSEMBL 5:65584115-65584184(+) -29.7 ((((..(((((((.((((((((.(((.(((..........))).))))))))))).)))))))..))))
gac --------------------------CCUGCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGAAGUAG--UGGUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ UCSC ENSEMBL groupXIV:5349671-5349739(+) -28.7 ((((.(((((((.((((((((.(((.(((..........))).))))))))))).))))))).)))).
ola --------------------------CCUGCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGAAGUAG--UGGUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ UCSC ENSEMBL 12:11677464-11677532(+) -28.7 ((((.(((((((.((((((((.(((.(((..........))).))))))))))).))))))).)))).
tru --------------------------CCUGCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGAAGUAG--UGGUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ UCSC ENSEMBL scaffold_27:1718128-1718196(+) -28.7 ((((.(((((((.((((((((.(((.(((..........))).))))))))))).))))))).)))).
tni --------------------------CCUGCCCAGUGUUCAGACUACCUGUUCAGGAAGUAG--UGGUUGUACAGUAGUCUGCACAUUGGUUAGGC------------------------------ UCSC ENSEMBL 4:2900520-2900588(-) -28.7 ((((.(((((((.((((((((.(((.(((..........))).))))))))))).))))))).)))).
cin ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
csa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
********** *** **** *********** ***** *******
***************** *** **** ************************** *
************************** ************************** *
************************** ************************** *
************************** ************************** *
************************** ************************** *
************************** ************************** *
************************** ************************** *
************************** ************************** *
************************** ************************** *
************************** ************************** *
************************** * ************************** *
************************** * ****************************
*************************** * ****************************
*************************** * ****************************
*************************** * ** ****************************
*************************** * ** ****************************
* *************************** * ** ****************************
* *************************** * ** ******************************
** *************************** ** *** ******************************
** **************************** ** *** ****************************** *
** **************************** ** **** ******************************* *
** ******************************* **** ******************************* *
*** ******************************* **** *********************************
*** ******************************* **************************************
*** ******************************* ***************************************
****************************************************************************
****************************************************************************
****************************************************************************
****************************************************************************
****************************************************************************
****************************************************************************
*****************************************************************************
*****************************************************************************
*******************************************************************************
********************************************************************************
********************************************************************************
********************************************************************************
*********************************************************************************
************************************************************************************
********************************************************************************************************** ****
******************************************************************************************************************************