hsa -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 13:92003145-92003226(+) -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) ptr -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 13:92019060-92019141(+) -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) ggo -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- miRbase -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) ppy -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 13:93460316-93460397(+) -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) mml -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1099214568803:180-261(-) -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) cja -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- ENSEMBL Contig45:6265750-6265832(+) -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) tsy -------------------------------------------GCAGUCUUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGA-GAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUG--------------------- ENSEMBL scaffold_642:93303-93378(+) -29.5 ........(((((((((((((((((((((((((((......))))...))))))..))))))))))))))))).. mmr -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAA-UCUAUGCAAA-CUGAUGGUGGCC------------------ ENSEMBL scaffold_4070:81293-81370(+) -29.4 .....((.((((((((((.((((((((((((((((.......))))...)))))).)))))))))))))))).)).. oga -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- ENSEMBL GeneScaffold_5369:528314-528396(+) -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) tbe -------------------------------------------GCAGUUCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- ENSEMBL GeneScaffold_5511:4416-4498(+) -36.6 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) cpo -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- UCSC ENSEMBL scaffold_5:32029122-32029204(-) -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) dor -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- ENSEMBL scaffold_13652:22847-22929(+) -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) mmu -------------------------------------------GCAGCCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 14:115443222-115443303(+) -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) rno -------------------------------------------GCAGCCCUCUGUUCGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 15:99854018-99854099(+) -34.9 ((((.((.(((((.(((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))).))))).)).)))) str -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- ENSEMBL GeneScaffold_5709:128868-128950(+) -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) opr -------------------------------------------GCAGUCUUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- ENSEMBL GeneScaffold_5286:74180-74262(+) -36.5 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) ocu -------------------------------------------GCAGUCUUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- ENSEMBL scaffold_9:44489022-44489104(+) -36.5 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) bta -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 12:64665384-64665465(+) -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) ttr ----------------------------------------------GUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- ENSEMBL GeneScaffold_3582:187179-187258(+) -32.4 ..((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).))..... vpa -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ssc -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- miRbase ENSEMBL 11:60972741-60972822(+) -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) cfa --------------------------------------------------------AGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA-------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 22:45426797-45426854(+) -23.0 ((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..)))))))))))).. fca -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- ENSEMBL scaffold_143765:627-709(+) -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) eca -------------------------------------------GCAGUCUUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 17:61792692-61792773(+) -36.5 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) mlu -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- ENSEMBL scaffold_163174:1716-1798(+) -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) pva -------------------------------------------GCAGUCUUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- ENSEMBL scaffold_4231:107751-107833(+) -36.5 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) eeu -------------------------------------------GCAGUUCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- ENSEMBL scaffold_358553:4140-4222(+) -36.6 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) sar -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUG---------------- ENSEMBL scaffold_234783:165-246(-) -35.9 .(((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).))) cho -------------------------------------------GCAGUCCUCUAUUAGUUUUGCGUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUG---------------- ENSEMBL scaffold_85492:15643-15724(+) -36.5 .(((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).))) ete -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- laf -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- ENSEMBL scaffold_11:14396863-14396945(-) -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) pca -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- meu -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- ENSEMBL Scaffold76730:2195-2277(+) -39.1 ((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).)))) mdo -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUG---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 7:108468609-108468689(-) -35.9 .(((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).))) oan UUGGGGUGGUCUUGUUUUUGUUUGUUUUUUUUUUUUUUUGUUUGCAGCUCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGACGGUGGCCUGCUAUUUCCUACAUCGA miRbase UCSC ENSEMBL Ultra284:6728409-6728548(+) -40.5 .(((((.((........))........................((((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).))))....)))))...... gga -------------------------------------------GCAGUCUUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAGGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUG---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:152248492-152248572(-) -34.1 .(((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).))) mga -------------------------------------------GCAGUCUUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAGGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUG---------------- UCSC ENSEMBL 1:158418621-158418702(-) -34.1 .(((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).))) tgu ---------------------------------------------------CUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAGAGUGGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAGCUGAUGGUGGC------------------- miRbase ENSEMBL 1:43202791-43202860(-) -28.4 (((((((((((((((((((((((.((............)).))))))..))))))))))))))))).... aca -------------------------------------------GCAGUCCUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAGAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUUGUGGCCUG---------------- UCSC ENSEMBL scaffold_82:3902048-3902129(-) -32.5 .(((.((...(((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..)))))))))))))))...)).))) xtr -------------------------------------------GCAGUCUUCUGUUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAAAAUGUAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGCAGCCUG---------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_740:85527-85607(-) -33.3 .(((.((.(((((((((((((((((((((((((((.......))))...))))))..))))))))))))))))).)).))) dre ---------------------------------------UGGUGCAGUUCUCUGCUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAAACGGGAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGCUGC------------ miRbase UCSC ENSEMBL 8:45338062-45338150(+) -34.0 ....((((.((.((..(((((((((((((((((((........(((....)))))))))..)))))))))))))..)).)).))))... gac -------------------------------------------GCAGUUCUCUGCUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAUAGAUGAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- UCSC ENSEMBL groupII:7843020-7843102(+) -32.7 ((((.((.((..(((((((((((((((((((.((............)).))))))..)))))))))))))..)).)).)))) ola -------------------------------------------GCAGUUCUCUGCUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAUAGAUGAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- UCSC ENSEMBL 3:15107602-15107684(+) -32.7 ((((.((.((..(((((((((((((((((((.((............)).))))))..)))))))))))))..)).)).)))) tru -------------------------------------------GCAGUUCUCUGCUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAUAGAGGAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUGC--------------- UCSC ENSEMBL scaffold_1:5701295-5701377(+) -32.7 ((((.((.((..(((((((((((((((((((.((............)).))))))..)))))))))))))..)).)).)))) tni -------------------------------------------GCAGUUCUCUGCUAGUUUUGCAUAGUUGCACUACAAGAAUAGAGGAGUUGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGAUGGUGGCCUG---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 5:8188589-8188669(-) -29.5 .(((.((.((..(((((((((((((((((((.((............)).))))))..)))))))))))))..)).)).))) cin -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ******* ************* ** * ********* ********** **** ** *********************** *** * ********************* **** * * **** *************************** * * ********************************* **** **** *************************** * * ********************************** **** **** *************************** * * ************************************ ***** **** *************************** * ************************************** ***** ************************************************************************** ***** ************************************************************************** ***** ************************************************************************** ***** ************************************************************************** ********************************************************************************* ********************************************************************************* ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ********************************************************************************** ************************************************************************************ ********************************************************************************************************************************************