hsa AAAGAUCCUCAGACAAUCCAUGUGCUUCUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAGGCAUGGAGCUGACA- miRbase UCSC ENSEMBL 1:209605478-209605587(+) -49.02 ........((((....(((((((....((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))))))))).))))..
ptr AAAGAUCCUCAGACAAUCCAUGUGCUUCUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAGGCAUGGAGCUGACA- miRbase UCSC ENSEMBL 1:189866769-189866878(+) -49.02 ........((((....(((((((....((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))))))))).))))..
ggo AAAGAUCCUCAGACAAUCCAUGUGCUUCUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAGGCAUGGAGCUGACA- miRbase -49.02 ........((((....(((((((....((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))))))))).))))..
ppy AAAGAUCCUCAGACAAUCCAUGUGCUUCUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAGGCAUGGAGCUGAC-- miRbase UCSC ENSEMBL 1:40697508-40697616(-) -49.02 ........((((....(((((((....((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))))))))).)))).
mml AAAGAUCCUCAGGCAAUCCAUGUGCUUCUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAGGCAUGGAGCUGACG- miRbase UCSC ENSEMBL 1:160974166-160974275(-) -47.92 ........((((....(((((((....((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))))))))).))))..
cja ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCGUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- ENSEMBL Contig330:13714-13783(-) -34.72 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
tsy ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- ENSEMBL scaffold_6456:9032-9101(+) -34.72 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
mmr ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUGGUCUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- ENSEMBL scaffold_172:759204-759274(+) -39.7 ((((((..(((((((((((.((((((((((..........)))))))))).)))))))))))..))))))
oga ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- ENSEMBL GeneScaffold_75:239508-239577(+) -34.72 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
tbe ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- ENSEMBL scaffold_14612:289417-289486(+) -34.72 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
cpo ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCU-GCGGC-AACC-AGACUUCAGUGGAGUGAAGCUCAGGAGUC------------- UCSC ENSEMBL scaffold_12:13745517-13745586(-) -38.2 ((((((..(((((((((((.((((((((..((...))..)))))))).)))))))))))..))))))..
dor -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mmu ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUUAUGCC-AACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGCUCAGGAG--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:195333657-195333724(-) -33.9 ((((((..(((((((((((.((((((((............)))))))).)))))))))))..))))))
rno -AAACAGCCCCAGACAAUCCAUGGGUCCUCCUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUUAUGCC-AACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGCUCAGGAGGCAUGGAGCUGCCA- miRbase UCSC ENSEMBL 13:109352371-109352478(-) -50.9 ...((((.........((((((...(((((((..(((((((((((.((((((((............)))))))).)))))))))))..)))))))))))))))))...
str -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
opr ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- ENSEMBL GeneScaffold_1446:1501322-1501391(+) -34.72 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
ocu ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- ENSEMBL scaffold_12:6976257-6976326(+) -34.72 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
bta ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCGUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 16:72083257-72083325(-) -34.72 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
ttr ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- ENSEMBL scaffold_115498:112418-112487(+) -34.72 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
vpa -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ssc ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGCUCAGGAG--------------- miRbase ENSEMBL 9:126011588-126011656(-) -33.82 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
cfa ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCGUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 7:11048072-11048140(+) -34.72 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
fca ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCGUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- ENSEMBL GeneScaffold_74:168726-168795(+) -34.72 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
eca ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 5:28811800-28811868(-) -34.72 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
mlu ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UUUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- ENSEMBL scaffold_185744:296970-297039(+) -34.72 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
pva ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCGUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- ENSEMBL scaffold_1111:247619-247688(+) -34.72 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
eeu -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
sar -------------------------------UGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUC-UGCACAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGAGCAGGAGGCGU----------- ENSEMBL scaffold_222846:17458-17526(-) -29.2 ((..(((((((((((.((((((((............)))))))).)))))))))))..))........
cho ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- ENSEMBL scaffold_1965:40973-41042(+) -34.72 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
ete ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUUAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- ENSEMBL scaffold_288378:10683-10752(+) -34.72 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
laf ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUACCCAAUC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- ENSEMBL scaffold_13:15715564-15715633(+) -35.22 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
pca ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UUUCAUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGUUCAGGAG--------------- ENSEMBL scaffold_26942:16401-16470(+) -34.72 ((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))
meu ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUAUGUAAUC-AGAUUUCAGUGGGGUGAAGCAUAAGA---------------- ENSEMBL Scaffold2297:12172-12240(-) -30.52 .((((((.(((((((((((.((((((((.............)))))))).))))))))))).))))))
mdo ---------------------------CUCUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUAUCUAAUC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGCAUAAGA---------------- UCSC ENSEMBL 2:116544493-116544561(+) -31.52 .((((((.(((((((((((.((((((((.............)))))))).))))))))))).))))))
oan ---GAAUUCGGAACGAUCCAUGGGUUUCUGUUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UUUCGUACCUAAUC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGCACAAGAGGCAUGGAGUUGAAUC miRbase UCSC ENSEMBL 7:39687501-39687608(+) -43.22 ..((((((.....((((((....(((.((((.(((((((((((.((((((((.............)))))))).))))))))))).)))).))))))))).)))))).
gga ------------------------------UUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCGUACCUAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGCACAAGAGACA------------ UCSC ENSEMBL 26:2896065-2896134(+) -29.12 ((((.(((((((((((.((((((((.............)))))))).))))))))))).))))......
mga ------------------------------UUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCGUACCCAACC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGCACAAGAGGCA------------ UCSC ENSEMBL 28:2574886-2574955(+) -29.12 ((((.(((((((((((.((((((((.............)))))))).))))))))))).))))......
tgu ---------------------GCCUUCCUGGUGCCCUUCAUUCCACCGGAAUCUG--UCGAUGCAGAACCCGGAUUUCAGUGAAAUGAAGCCCCUCAGAAAGGC--------- miRbase ENSEMBL 1A:622279-622359(-) -29.8 (((((.((((....(((((((.(((.((((((((((......))...)))))))).))).)))))))....)))).)))))
aca ------------------------------UUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUAUCUAAUC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGCACAAGAGACA------------ UCSC ENSEMBL scaffold_13:6764339-6764408(+) -29.62 ((((.(((((((((((.((((((((.............)))))))).))))))))))).))))......
xtr -------------------------------UGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG-UCUCAUACAUAAUC-AGAUUUCAGUGGAGUGAAGCACAAGAGGCA------------ UCSC ENSEMBL scaffold_61:840385-840453(+) -28.72 (((.(((((((((((.((((((((.............)))))))).))))))))))).))).......
dre ---------------AAACUACUGUGCAUUCUAUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUGUGUAGUUGUUCAAUC-AGAUUUCAGUGGUGUGAAGUGUAGGAAACACGGA-------- miRbase UCSC ENSEMBL 23:32809227-32809315(+) -35.3 ......(((((..(((((..((((((.((((.((((((((((........))..)))))))).)))).))))))..)))))..))))).
gac -------------------------GUGUUCUGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUGUCUGUUU--CACACC-AGAUUUCAGUGGUGUGAAGUGUAAGAGACAU----------- UCSC ENSEMBL groupXII:13937700-13937774(-) -27.5 ((.((.((..((((((.((((.((((((((..((.....)).)))))))).)))).))))))..)).)).))..
ola -------------------------------UGUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUGUGCCUGUAUGGAACC-AGAUUUCAGUGGUGUGAAGUGUAAAAGACAUG---------- UCSC ENSEMBL 7:22980137-22980208(-) -27.11 ((((((((((.((((.((((((((..((.....))...)))))))).)))).)))))).......))))..
tru -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tni -------------------------------UAUCCUUCAUUCCACCGGAGUCUGUAACUGUUUUUAACC-AGAUUUCAGUGGUGUGAAGUGUAAGAG--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 9:9353930-9353995(-) -22.64 ((..((((((.((((.((((((((..............)))))))).)))).))))))..))....
cin -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
csa -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
* **************** **** * * ** ******* ***** *
* ********************** * ** * ************ ****** * *
************************ * ** * ************ ****** * **
************************ * ** * ************ ****** * ***
************************ * ** * ************ ****** * ***
************************ * * * ** * ******************* * ***
************************ * * * ** * ******************* ** ***
* ************************ *** * * **** ******************* ** ***
* ************************* *** **** **** ******************* ** ***
** ************************* **** **** **** ******************* ** ***
** ************************* **** **** **** ******************* ** ***
**************************** **** **** **** ******************* ******
**************************** **** **** **** ******************* ******
**************************** **** ********* ***************************
**************************** ************** ***************************
**************************** ************** ***************************
**************************** ************** ***************************
**************************** ************** ***************************
**************************** ************** ***************************
**************************** ************** ***************************
**************************** ************** ***************************
**************************** ************** ***************************
**************************** ************** ***************************
**************************** ************** ***************************
**************************** ************** *************************** *
**************************** ************** *************************** **
**************************** ************** *************************** **
**************************** ************** *************************** **
**************************** ************** *************************** **
**************************** ************** *************************** **
**************************** ************** ********************************
**************************** ************** ********************************
* * * * **************************** ************** **********************************
* * * * ****************************** ************** *********************************** **
**** * * * ********* ****************************** ************** ****************************************
******************************************************* ************** ****************************************
********************************************************************** *****************************************
********************************************************************** *****************************************
********************************************************************** *****************************************
*****************************************************************************************************************