hsa -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACACCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 17:57918627-57918698(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
ptr -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACACCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 17:59045657-59045728(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
ggo -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACACCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- miRbase -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
ppy -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACACCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 17_random:1832400-1832471(-) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
mml -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACACCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 16:44086558-44086629(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
cja -------------------------------UGUCAGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- ENSEMBL Contig204:2651767-2651839(-) -36.5 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
tsy -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_493:72104-72176(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
mmr -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1056:1375-1447(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
oga -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_827:533668-533740(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
tbe -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_307:141450-141522(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
cpo -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_32:7682930-7683002(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
dor -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- ENSEMBL scaffold_113651:327-399(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
mmu ---------------------UGUACCACCUUGUCGGAUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACAUUUUGGUAUC----------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:86397569-86397660(-) -46.2 .((((((...((((((((((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))))))))))...)))))).
rno ---------------------UGUACCACCUUGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACAUUUUGGUAUC----------- miRbase UCSC ENSEMBL 10:74864500-74864591(-) -43.6 .((((((...((((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))))...)))))).
str -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
opr ------------------------------------GAUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACAUU------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1119:269943-270012(+) -29.8 (((((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))))).......
ocu -------------------------------UGUCGGAUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- ENSEMBL scaffold_23:6023770-6023842(-) -38.4 .(((((((((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))))))))).
bta -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 19:10049133-10049204(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
ttr -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2997:1064140-1064212(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
vpa -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_790:366250-366322(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
ssc ---------------------UGUACCACCUUGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACAUUUUGGUAUC----------- miRbase ENSEMBL 12:34201565-34201656(+) -43.6 .((((((...((((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))))...)))))).
cfa --------------------------------------UAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUC-------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 9:37662765-37662824(+) -24.9 (((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).))))))))))))))..
fca -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_270:356744-356816(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
eca -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:33863745-33863816(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
mlu -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1309:261533-261605(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
pva -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_243:92806-92878(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
eeu -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGCCUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGAC---------------------- ENSEMBL scaffold_275137:4928-4999(-) -39.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((((...((.....)).))))))).)))))))))))))..)))))
sar -------------------------------UGUCAGGUAGCUUAUCAGAUUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_400:140895-140967(+) -34.2 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
cho -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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laf -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- ENSEMBL scaffold_31:9107325-9107397(-) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
pca -------------------------------UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_460:103470-103542(+) -35.8 .(((((..((((((((.(((((.(((((.(((.((.....)))))))))).)))))))))))))..))))).
meu -------------------------------UGUCGGAUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGGA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2351:99998-100070(+) -38.1 .(((((((((((((((.(((((.(((((.((((........))))))))).)))))))))))))))))))).
mdo -------------------------------UGUCGGAUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGGA-UCUCAUGGCAACAGCAGUCGAUGAGCUGUCUGACAUU------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 2:172169920-172169993(-) -39.4 ((((((((((((((((.(((((.(((((.((((........))))))))).)))))))))))))))))))))..
oan ----------AUCUCCACGACUGGACCAUCCUAUCGGAUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUAGA-UCUCCUGGCAACAGCAGUCGAUGGGCUGUCUGACAUUUUGGUAUCUGUCAUCCGAU miRbase UCSC ENSEMBL Ultra324:945547-945660(+) -43.0 ........(((.((((((.....((((((((((((((.(((((.(((....((((((.....))))))))).))))))))))))))))))).....)))).)).))).......
gga ---------------------UGUACCAUCCUGUCGGAUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGGA-UCUCAUGGCAACAACAGUCGGUAGGCUGUCUGACAUUUUGGUAUCUCUCA------ miRbase UCSC ENSEMBL 19:7322072-7322168(+) -45.7 .((((((...((((((((((((((((.(((((.(((((.((((........))))))))).)))))))))))))))))))))...))))))......
mga -------------------------------UGUCGGAUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGGA-UCUCAUGGCAACAACAGUCGGUAGGCUGUCUGACA--------------------- UCSC ENSEMBL 21:7754789-7754861(+) -37.9 .(((((((((((((((.(((((.(((((.((((........))))))))).)))))))))))))))))))).
tgu ----------------------------UCCUGUCGGAUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGGA-UCUCAUGGCAACAACAGUCGGUAGGCUGUCUG------------------------ miRbase ENSEMBL 19:8993795-8993866(+) -31.7 ......(((((((((((((.(((((.(((((.((((........))))))))).))))))))))))))))))
aca -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
xtr -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dre -------------------------------UGUCAGAUAGCUUAUCAGACUGGUGUUGGCUGUUACAUUCGCCCGGCGACAACAGUCUGUAGGCUGUCUGACA--------------------- UCSC ENSEMBL 10:25808281-25808354(-) -39.6 .(((((((((((((.(((((((.(((((.(((...........)))))))).)))))))))))))))))))).
gac -------------------------------------AUAGCUUAUCAGACUGGUGUUGGCUGUUAAGAUUGCAAGGCGACAACAGUCUGUAGGCUGUCUGACAUU------------------- UCSC ENSEMBL groupVII:14122553-14122622(-) -28.7 ((((((((.(((((((.(((((.((((.......)).)).))))).)))))))))))))))........
ola ------------------------ACCACCUUGUCGGCUAGCUUAUCAGACUGGUGUUGGAGGUUCCAUUUGCACGGCAACAACGGUCUGUAAGCUGGC-------------------------- UCSC ENSEMBL 13:24451909-24451984(-) -29.0 ............(((((((((.(((((((.(((((...((.......))....))))).))))))))))))))))
tru ------------------------------------GAUAGCUUAUCAGACUGGUGUUGGCUGUUAGGUUCCCAUGGCAACAGCAGUCUGUAAGCUGUCUGAAG--------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_165:494428-494496(+) -32.6 (((((((((.(((((((.(((((.((((..((...))))))))))).)))))))))))))))).....
tni AUUGUCGUCUUUACAUCUGUCACUCUCGGCCUGUCAAAUAGCUUAUCAGACUGGUGUUGGCUGUUAAGAUUGCAAGGCGACAACAGUCUGAAGGCUGUCUGACAUUUCGGGCUCUUUCAUCU--- miRbase UCSC ENSEMBL 7:1044906-1045027(-) -41.8 ........................(((((..(((((.(((((((.((((((((.(((((.((((.......)).)).))))).))))))))))))))).)))))..)))))...........
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