hsa ACCCGG-CAGUG-CCUCCAGGCGCAGGGC--AGCCCCUGCCC-ACCGCACACUGCGCUGCCCC--AGACC-CAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUGCCUG-GGCAGCGCGACCC miRbase UCSC ENSEMBL 11:568089-568198(-) -60.4 ....((..((((.(((((((((((..(((((.(((..(((((((((.((..(((...)))...)).)))))).))).))).)))))..)))))))))))..))))..)). ptr ACCCGG-CAGUC-CCUCCAGGCGCAGGGC--AGCCCCUGCCC-ACCGCACACUGCGCUGCCCC--AGACC-CAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUGCCUG-GGCAGCGCGACC- miRbase UCSC ENSEMBL 11:604255-604363(-) -53.8 .....((.((...(((((((((((..(((((.(((..(((((((((.((..(((...)))...)).)))))).))).))).)))))..)))))))))))..)))).... ggo ACCCGG-CAGUC-CCUCCAGGCGCAGGGC--AGCCCCUGCCC-ACCGCACACUGCGCUGCCCC--AGACC-CAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUGCCUG-GGCAGCGCGACCC ENSEMBL 11:493547-493657(-) -54.5 ....((..((...(((((((((((..(((((.(((..(((((((((.((..(((...)))...)).)))))).))).))).)))))..)))))))))))....))..)). ppy ACCCGGGCAGUCUCCUCCAGGCGCAGGGCC-AGCCCCUGCCCCACCGCACACUGCGCUGCCCCCAAGACCACACGUGUGCCGUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUGCCUGAGGCAGCGCGACCC miRbase UCSC ENSEMBL 11:335370-335489(-) -55.9 ....(((..((((((((.(((((((((..(((((.(((...(((.((((((((..((.......))....)).)))))).)))...))).))))).))))))))))))).)).))..))) mml ACCCGG-CAGUC-CCUCCAGGCGCAGGGC--AGCCCCUGCCC-ACCGCACACUGCGCUGCCCC--AGACC-CAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUGCCUG-GGCAGCGCGACCC miRbase UCSC ENSEMBL 14:372934-373043(-) -54.5 ....((..((...(((((((((((..(((((.(((..(((((((((.((..(((...)))...)).)))))).))).))).)))))..)))))))))))....))..)). cja --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tsy --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mmr --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- oga -------------CCUCCAGGCGCAGGGC--AGCCACUGCCC-ACCGCACACUGCGCUGCUCC--AGACC-CAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUCCCUG-GGCAGC------- ENSEMBL GeneScaffold_5141:242535-242627(-) -46.4 ..((((((.((((..(((((.(((..(((((((((.((..(((...)))...)).)))))).))).))).)))))..)))).)))))).... tbe --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cpo -------------CCUCCAGGCGCAGGGC--AGCCACUGCCC-ACCGCACACUGCGCUGCUCC--CGACC-CAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUCCCUG-GGCAGCGCGA--- UCSC ENSEMBL scaffold_218:305328-305424(+) -43.1 ..((((((.((((..(((((.(((..(((((((((.((((.......))...)).)))))).))).))).)))))..)))).))))))........ dor --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mmu --CCGGGGCAGUCCCUCCAGGCUCAGGAC--AGCCACUGCCC-ACCGCACACUGCGUUGCUCC--GGACC-CAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUCCCUG-GGCAGCGCGAACC miRbase UCSC ENSEMBL 7:148407283-148407392(-) -48.6 ..(((.....)))((((((..((((.(((((.(((..(((((((((.((.(((......))).)).)))))).))).))).))))).))))..))))))........... rno --CCGGGGCAGUCCCUCCAGGCUCAGGAC--AGCCACUGCCC-ACAGCACACUGCGUUGCUCC--GGACC-CAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUCCCUG-GGCAGCGCGAACC miRbase UCSC ENSEMBL 1:201415656-201415765(-) -47.1 ..(((.....)))((((((..((((.(((((.(((..(((((((((.((.(((......))).)).))))).)))).))).))))).))))..))))))........... str --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- opr -------------CCUCCAGGCGCAGGGC--AGCC-CUGCCC-ACCGCACACUGCGCUGCUCC--GGACC-CAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUCCCUG-GGCAGCGCGA--- ENSEMBL scaffold_69898:769-864(-) -44.8 ..((((((.((((..((((((((..(((((((((.((..(((...)))...)).)))))).))).))).)))))..)))).))))))........ ocu --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- bta -------------CCUCCAGGCGCAGGGC--AGCCACUGCCC-ACCGCACACUGCGCUGCUCC--GGACC-CAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUCCCUG-GGCAGCGCGACC- miRbase -45.7 ..((((((.((((..(((((.(((..(((((((((.((..(((...)))...)).)))))).))).))).)))))..)))).)))))).......... ttr -------------CCUCCAGGCGCAGGGC--AGCCACUGCCC-ACCGCACACUGCGCUGCUCC--GGACC-CAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUCUCUG-GGCUGCGCGACC- ENSEMBL scaffold_103543:53684-53782(-) -43.3 ..((((((.((((..(((((.(((..(((((((((.((..(((...)))...)).)))))).))).))).)))))..)))).)))))).......... vpa --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ssc --------------------GCGCAGGGC--AGCCACUGCCC-ACCGCACACUGCGCUGCUCC--GGACC-CAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUCC----------------- miRbase ENSEMBL 2:331306-331381(+) -34.3 ..((((..(((((.(((..(((((((((.((..(((...)))...)).)))))).))).))).)))))..)))).. cfa -------------CCUCCAGGCGCAGGGC--AGCCACUGCCC-AUCGCACACUGCGCUGCUCC--GGACC-CAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUCCCUG-GGCAGCGCGACC- miRbase UCSC ENSEMBL 18:28664843-28664940(-) -43.1 ..((((((.((((..(((((.(((..(((((((((.((..(((...)))...)).)))))).))).))).)))))..)))).)))))).......... fca --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- eca --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mlu -------------CCUCCAGGCGCAGGGC--AGCCACUGCCC-ACCGCACACUGCGCUGCUCC--GGACC-CAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUUCCUG-GGCAGCGCGACC- ENSEMBL scaffold_155225:8297-8395(-) -45.7 ..((((((.((((..(((((.(((..(((((((((.((..(((...)))...)).)))))).))).))).)))))..)))).)))))).......... pva --------------CUCCAGGCGCAGGGC--AGCCACUGCCC-ACCGCACACUGCGCUGCUCC--GGACC-CAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUCCCUG-GGCAGCGCGA--- ENSEMBL GeneScaffold_2542:32307-32402(-) -45.7 .((((((.((((..(((((.(((..(((((((((.((..(((...)))...)).)))))).))).))).)))))..)))).))))))........ eeu --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- sar --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cho --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ete --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- laf --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- pca -------------CCUCCAGGUGCAGGGC--AGCCCCUGCCC-ACCGCACACUGCGCUGCUCC--GGACC-CAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUGAUCU--GUCCCUG-GGCUGCGCGAC-- ENSEMBL GeneScaffold_4986:38434-38531(-) -45.3 ..((((((..(((..(((((.(((..(((((((((.((..(((...)))...)).)))))).))).))).)))))..)))..))))))......... meu ----------------------GCAGGGG--AGCCACUGACC-AACGCACAUUGCGCU------GAGGACCCAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUACCGU--GCA------------------ ENSEMBL GeneScaffold_9031:28229-28299(-) -30.8 (((.((.((((.(((....(((((((.((...........)).)))))))....))).)))).)).))). mdo ----------------CCGGCCGCAGGGG--AGCCACUGACU-AACGCACAUUGCGCU------CAGGACCCAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUACCGU--GCAACCGGC------------ miRbase UCSC ENSEMBL Un:46252493-46252574(+) -37.0 ((((..(((.((.((((.(((....(((((((.((...........)).)))))))....))).)))).)).)))..)))). oan --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- gga --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mga --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tgu --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- aca -------------------GGAGCAGAUG--AGCCACUGACU-AACGCACAUUGUGCUUCUCG-UGUCC-CCAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUAACCU--GCUUUU--------------- UCSC ENSEMBL scaffold_73:2238434-2238514(-) -31.0 (((((((...((((.(((....(((((((.((.((.......))...)).)))))))....))).))))...))))))). xtr ---------------UCCAGAUGCAGGUC--AGCCACUGACU-AACGCACAUUGCGCUGCUCCUAAAAUGCCAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUAACCA--GCAUCUAGGAA---------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_398:268957-269047(+) -42.6 (((((((((.(((.((((.(((....(((((((.((.((............)))).)))))))....))).)))).))).)))))).))). dre ----------------------GCAGGUA--AGCCACUGACU-AACGCACAUUGCGCCUAUUCUCCACU-CCAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUAACCA--G-------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 25:26951388-26951460(+) -25.69 ...(((.((((.(((....(((((((.((................)).)))))))....))).)))).))).. gac ---------------UCUAAAAGCAGGUA--AGCCACUGACU-AACGCACAUUGUGCCAGUGUCCAAAU-UCAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUAACCU--GGUUUUGGGA----------- UCSC ENSEMBL groupXIX:13828838-13828927(-) -38.2 (((((((.(((((.((((.(((....(((((((..(((..(((......)))))))))))))....))).)))).))))).))))))). ola --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tru ---------------UCUAAAAGCAGGUG--AGCCACUGACU-AACGCACAUUGCGCCAGUUGACAGUU-CCAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUAACCU--GGUUUUGGGAACGCUUCUG-- UCSC ENSEMBL scaffold_119:784663-784761(-) -37.3 (((((((.(((((.((((.(((....(((((((.((.((.........))..)).)))))))....))).)))).))))).))))))).......... tni -----------------------CAGGUG--AGCCACUGACU-AACGCACAUUGUGCCAGUUGACAGUU-CCAC-UGUGC-GUGUGACAGCGGCUAACCU--GGUUUUGGGGA---------- miRbase UCSC ENSEMBL 13:6095025-6095106(+) -30.2 (((((.((((.(((....(((((((.((.((.........))..)).)))))))....))).)))).))))).......... cin --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme ----------------AAAGGUGCUUAUUGCAGCUGCUGGCC-ACUGCACAAGAUUAGACUUA--AGACU---CUUGUGC-GUGUGACAGCGGCUAUUGUAAGAGGCCAUAGAAGCAACAGCC miRbase UCSC ENSEMBL X:18022252-18022351(+) -38.12 ...(((.(((((...((((((((..((((((((((((.............))))))))).))).))))))))...)))))..)))......((....)). cel --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- * *** *** * * ***** * ***** ************** * *** **** *** * * ***** ** * *** ***** ************** * **** **** *** * * ****** ** * *** ***** ************** * * ***** **** *** * * ****** ** ** *** ***** ************** * ** * ***** **** *** * * ****** ***** * *** ***** ************** * ** * ***** **** *** * * ****** ****** * *** ***** ************** * ** * * * ** ***** **** *** * * ****** ****** * ** *** ***** ************** * ** * ** * ** *** ***** **** *** ** * ****** ****** **** **** *** ***** ************** * ** * *** * ****** ***** * ******** ** * ****** *********** **** *** ***** ************** **** * *** ** ** ************** *********** ******************** **** *** ***** ******************* ** *** ** ** *************** *********** ******************** **** *** ***** ******************* ** **** *** ** * **************** *********** ******************** **** *** ***** ******************* ** **** ********** **************** *********** ******************** **** *** ***** ******************* ** **** ********** **************** *********** ******************** ***** *** ***** ******************* ** **** ********** **************** *********** ******************** ***** *** ***** ******************* ** **** ********** * **************** *********** ******************** ***** *** ***** ******************* ******* ********** * **************** *********** ******************** ***** *** ***** ******************* ******* ************ **************** *********** ******************** ***** *** ***** ******************* ******* ************ **************** *********** ******************** ***** *** ***** ******************* ******* ************ **** **************** *********** ******************** ********* ***** ******************* ******* ************* **** **************** *********** ******************** ********* ***** ******************* ******* ************* ****** **** **************** *********** ******************** ********** ***** ******************* ********************* ****** ***** **************** *********** ******************** ********** ***** ******************* ********************* ************ **************** *********** ******************** ********** ***** ******************* ********************* ***************************** *********** ******************************* ***** ******************* ********************* ***************************************************************************************************************************