hsa -CGGGGCACCCCGCCCGGACAGCGCGCCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCGACGCCUGGCCCCGCC miRbase UCSC ENSEMBL 17:1953565-1953674(-) -52.6 ((((((...((....)).(((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))).))))))))))))..
ptr ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ggo ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ppy ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mml -CGGGGCACCCCGCCCGGACAGCGCGCCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCAGGGCCACCGACGCCUGGCCCCGCC miRbase UCSC ENSEMBL 16:1845794-1845903(-) -56.4 ((((((...((....)).(((.(((.(((..((((((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))))))...))).))))))))))))..
cja ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tsy ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mmr -------------------CAGCGCGCCGGCACCUUGGCUGUAGACUGCUUACUGCCUGGGCCGCCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCGACGCCUGGCCC---- ENSEMBL GeneScaffold_1841:223861-223949(-) -42.0 (((.(((.(((..((.((((((.((((((.((((((...(((...))).)))))))))))).)))))).))...))).))))))....
oga ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tbe ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cpo ----------------GGGCAGCGCGCCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCGACGCCUGGCCC---- UCSC ENSEMBL scaffold_32:20418776-20418867(+) -42.7 ((.(((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))).)))))).)).
dor ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mmu ----------------GGGCAGCGCGCCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCUU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCGACGCCUGGCCC---- miRbase UCSC ENSEMBL 11:74986890-74986980(+) -41.3 ((.(((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...((....))..))))))))))))..))))).))...))).)))))).)).
rno CGGGAUAUCCCCGCCCGGGCAGCGCGCCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCGACGCCUGGCCCCGCC miRbase UCSC ENSEMBL 10:62480434-62480544(+) -49.2 .(((.....)))((..((((((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))).))))).)))).)).
str ----------------GGGCAGUGCGCCGGCACCUUG-CUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCGACGCCUGGCC----- ENSEMBL GeneScaffold_4890:38841-38930(-) -37.5 ((.(((.(((.(((..((.((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..)).)).))...))).)))))).))
opr ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ocu ----------------GGGCAGAGCGCCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCGACGCCUGGCCC---- ENSEMBL scaffold_36:13131703-13131794(+) -42.7 ((.(((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))).)))))).)).
bta CGGAGCCACCCUGCCCGGGCAGCGCGCCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCGACGCCUGGCCCCGCC miRbase UCSC ENSEMBL 19:23161513-23161623(-) -49.6 (((.((((..((((....)))).(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))).))).)))).)))..
ttr ----------------GGGCAGCGCGCCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCGACGCCUGGCCC---- ENSEMBL GeneScaffold_3179:203502-203593(-) -42.7 ((.(((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))).)))))).)).
vpa ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ssc ----------------GGGCAGCGCGCCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCGACGCCUGGCCC---- ENSEMBL 12:45599908-45599999(-) -42.7 ((.(((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))).)))))).)).
cfa -------------------------------ACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCA------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 9:49478921-49478982(-) -24.9 .((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...
fca ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
eca --------------------------------CCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCC------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:45640251-45640310(-) -24.4 ((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))..
mlu ----------------GGGCAGCGCGCCGGCACCUUGGCUGCAGACUGCUUACUGCCCGG--CGCCCC------GAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCGCCGACGCCUGGCCC---- ENSEMBL GeneScaffold_1320:114934-115023(-) -47.0 ((.(((.(((.((((.((.((((((.((((((.(((((...(((....)))))))))))))).)))))).))..)))).)))))).)).
pva ----------------GGGCAGUGUGCCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCGACGCCUGGCC----- ENSEMBL GeneScaffold_2866:288061-288151(-) -40.0 ((.(((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))).)))))).))
eeu ----------------GGGCAGCGCGCCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCAAAGCCUGGCCC---- ENSEMBL scaffold_354418:4313-4404(-) -37.4 ((.(((.((...((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))...))))).)).
sar ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cho ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ete ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
laf ----------------GGGCAGUGCGCCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCGACGCCUGGCCC---- ENSEMBL scaffold_47:5203668-5203759(-) -42.7 ((.(((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))).)))))).)).
pca ----------------GGGCAGUGCGCCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCGCCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCGACGCCUGGCCC---- ENSEMBL GeneScaffold_1767:90851-90942(-) -42.7 ((.(((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))).)))))).)).
meu ----------------GGGCAGCGCGCCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCACCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCGACGCCUGGCCC---- ENSEMBL Scaffold3745:41122-41213(-) -42.7 ((.(((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))).)))))).)).
mdo ----------------GGGCAGCGCGCCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCCCGGGCCACCCU------CAGUAACAGUCUCCAGUCACGGCCACCGACGCCUGGCCC---- miRbase UCSC ENSEMBL 2:517587363-517587453(-) -42.7 ((.(((.(((.(((..((.(((((..((((((.((((((...(((...))).))))))))))))..))))).))...))).)))))).)).
oan ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
gga ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mga ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tgu ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
aca ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
xtr ---------------UGGUCAUUGCAUCGGCACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGUGAAACUGUGCUAUAGGAACAGUAACAGUCUACAGUCAUGGCUACUGACGUAUGAC------ miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_267:950770-950865(-) -36.9 ..(((((.((.((((..((.(((((.(((((((.(((((((....((((...))))..)))))))))))))).))))).))...)))).)))))))
dre -----------------GUCAGUGCAUCAAUACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCUAAAUGUGUCUGAAAGUACAGUAACAGUCUACAGUCAUGGCUACUGACGUCUGGC------ miRbase UCSC ENSEMBL 15:26203827-26203920(+) -31.61 (((((.((.(((.((((.(((((.(((((((.((((((...................))))))))))))).))))).)).)).))).)))))))
gac -----------------GUCAGUGCAUCAAUACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCUAAAACUGUCCCGAAGUACAGUAACAGUCUACAGUCAUGGCUACUGAAG------------ UCSC ENSEMBL groupI:11722816-11722904(+) -27.2 .((((((........((.(((((.(((((((.((((((.....(((.......))).))))))))))))).))))).)).))))))..
ola -----------------GUCAGUGCACCAAUACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCUAAAAGUGCUCCAAAGUACAGUAACAGUCUACAGUCAUGGCUACUGACGCCUG-------- UCSC ENSEMBL 13:10158105-10158197(-) -31.61 (((((((..(((......(((((.(((((((.(((((.......(((((....))))))))))))))))).)))))))).))))))).....
tru ----------------GGUCAGCGCAUCAACACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCUAAAACCGCUCAUAAGUACAGUAACAGUCUACAGUCAUGGCUACUGACGCCUGAC------ UCSC ENSEMBL scaffold_156:196702-196797(-) -33.51 .(((((.((.(((...((.(((((.(((((((.((((((...................))))))))))))).))))).))....))).)))))))
tni ----------------GGUCAGCGCAUCAACACCUUGGCUCUAGACUGCUUACUGCUAACACCGCUCUGAAGUACAGUAACAGUCUACAGUCAUGGCUACUGACGCCUGGC------ miRbase UCSC ENSEMBL Un_random:63608290-63608384(+) -33.3 .(((((.((.(((...((.(((((.(((((((.((((((.((.((......))...))))))))))))))).))))).))....))).)))))))
cin ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
csa ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
***** ** ************* *********** ****** ***
********* *************** ************ ****** ***
** * * ************************* ************ ****** *** ** * *
* *** ** * ************************* **** ************ ****** *** ** ** * **
* *** ** * ************************* ****** ************ ****** *** ** **** *** *
* *** ** * ************************** ****** ************ ****** *** ** ******** *
** *** ** * *************************** ** ******* ******************* ****** **********
** *** ** ****************************************** ************************** **********
** *** ********************************************* **************************************
** *** ********************************************* **************************************
** *** ********************************************* ***************************************
**************************************************** ***************************************
**************************************************** ***************************************
**************************************************** ***************************************
**************************************************** ***************************************
**************************************************** ***************************************
**************************************************** ***************************************
**************************************************** ***************************************
**************************************************** ***************************************
**************************************************** ***************************************
**************************************************** * * ****************************************
**************************************************** ********************************************
* *** ******************************************************** ************************************************
*** ************************************************************** ************************************************
*********************************************************************************************************************
*********************************************************************************************************************