hsa ------------UACAGCCAUACCACCCUGAACGUGCCUGAUAUCAUCUGAUCUCAGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUAC---------- UCSC ENSEMBL 14:77870258-77870333(-) -27.7 ((((((((..((((((((...((..((((.(((....))).))))..))....)))))).))...))))).))).
ptr ------------------CAUACCACCCUGAACGAGCCUGAUCUCGUCUGAUCUUGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGA UCSC ENSEMBL X:68987337-68987416(+) -28.9 .......(((....((((.((((((..(((((((((((.........)))))))))))..))))))..))))...))).
ggo ---------------GGCUACACCACCCUGAACAUGCCGGAUCUCAUCUGAUCUCAGAAGCUGGGCAGGGUGGGGCCUGGUUA-------------- ENSEMBL 16:43243812-43243880(+) -30.3 ((((...((((((((..((.((.(((((......))))).....))))..))))))))))))......
ppy ------------UACAGCCAUACCACCCUGAACAUGCCCGAUCUCAUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUAC---------- UCSC ENSEMBL 14:79392563-79392638(-) -27.0 ((((((((..((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))...))))).))).
mml ------CUGACCUAUGGCCAUACCACCCUGAACAUGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGU------------ UCSC ENSEMBL 13:20322518-20322597(-) -32.2 ((((((...((((.....((((((.....((((((..((....))..))))..))....))))))..)))).)))))).
cja -------AAGUCUAUGGCCAUACCACCCUGAACAUGCCUGAUCUCAUCAGAUCUCAGAAGCUAAGCAGGGUAGGGCCUGGUUAGUACUUGG------ ENSEMBL Contig13:19771219-19771303(-) -27.1 ((((...((((((..((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))...))))))..))))..
tsy --------------CGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCUGAUCUCAUCUGAUCUUGGAGGCCAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUA-------------- ENSEMBL GeneScaffold_5201:103137-103206(-) -27.2 .(((((..((((((((...((.((.((((......))))..))..))....)))))).))...))))).
mmr -------GAGUCUACAGCCAUACCACCCUGAACGUGCCUGAUCUCGUCUGAUCUCAGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGG------ ENSEMBL GeneScaffold_895:217194-217278(-) -27.0 (((((((..((((..((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))...))))))).))))..
oga --------CAUCUAUGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCUGAUCUCAUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUGCUUGGAU---- ENSEMBL GeneScaffold_1610:176650-176735(+) -27.7 .(((((((((((..((((((((...((.((.((((......))))..))..))....)))))).))...)))))).....)))))
tbe CCAGAUGCUGUCUAUAGCCAUACCACCCUGAACGUGCCGGAUCGCAUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCAGACCUGGUUAGUACUUGG------ ENSEMBL scaffold_147902:61081-61172(-) -27.0 ((((.(((((......((((....((((((...((.((((((((....))))).)))..))....))))))......))))))))).))))
cpo -----AGUAGUCUACAGCCAUACCACCCUGAACAUGCUUGAUCUCAUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAUUACUU-------- UCSC ENSEMBL scaffold_54:4885353-4885437(+) -27.5 ((((((....(((((..((((((((.....((((((((......))))....))))....)))))).))...))))))))))).
dor -ACUCAUUAGUCUAUGGCCAUACCACCCUGAACACGCCUGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGA ENSEMBL scaffold_20078:3016-3112(+) -32.14 .(((((((((...((((((..((((((((......((.((((......))))..))........)))))).))...))))))..)))..)))))).
mmu ---AAUCAUGUCUAUAGUCAUACCACCCUGAACAUGCUUGAUCCCAUCUGAUCUCAGAAGCCGAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAAUGCAUAGACGUGG miRbase UCSC ENSEMBL 4:58950891-58950984(+) -33.9 ...(((((((((.((...((((.(((((...((((((......((((....))))...))))))...)))))..))))....))))))))))).
rno ---------GUCUAUGACUAUACCACCCUGAAUGUGCCUGAUCUCAUCUGAUCUGGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUAGAUGG-- UCSC ENSEMBL 13:52179145-52179231(-) -27.4 (((((((((((..((((((((...((.((.((((......)))).))...))....)))))).))...)))))).....)))))..
str ----CUACAGUCUACGGCCAUACCACCCUGAACACGCCCGAUCUCAUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAU---- ENSEMBL scaffold_140228:30922-31011(+) -27.7 (((.((((((..((((..((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))...))))))).))))))..
opr ------GCUGCCUAUGGCCAUACCACCCUGAACAUGCUUGAUCUCAUCUGAUCUUGGAAGCUAAGCAGGGUCAGGCCUGGUUAUUACUUGGAUGGGA ENSEMBL scaffold_14345:35390-35481(-) -27.6 .(((((.(((((((..((((((((.....((((((((......))))....))))....))))))..))..))))))).....)).)))..
ocu ------GUAGUCUAUGGCCCUACCACCCUGAACAUGCCUGAUCUCAUCUGAUCUCAGAAGCCAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUUGUACU--------- ENSEMBL scaffold_6:10519562-10519644(+) -27.2 (((..(((.(((((....((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))))))))....))).
bta -----CCUGGUCUACAGCCAUACCACCCUGAACACGCCUGAUCACAUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGAACUUGG------ UCSC ENSEMBL 24:47676542-47676628(-) -27.84 ((.((((((..((((..((((((((......((.(((((....)))))..))........)))))).))...))))))).))).))
ttr ---------GUCUAUGGCCAUACCACCCUGAACACGCCCGAUCUCAUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGA-- ENSEMBL GeneScaffold_273:375806-375892(-) -27.5 (((((((((((..((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))...)))))).....)))))..
vpa -----CUCAGUCUACAGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCAUCUGAUCUCAGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGGU---- ENSEMBL GeneScaffold_1218:96447-96535(-) -28.4 (((((..((((((((..((((((((...((....((((......))))......))....)))))).))...))))).))).))))).
ssc ------CGGGUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGUGCCUGGUCUCAUCUGAUCUCAGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGCACUUGA------ ENSEMBL 6:43268879-43268964(+) -28.3 ((((((((..((((..((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))...))))))).))))).
cfa ------AGAGUCUACGGCCAUACCACCCUGAACAUGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUU-------- UCSC ENSEMBL 3:64777891-64777974(+) -27.5 .(((((((..((((..((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))...))))))).))))
fca -------AAGUCUAUGGCCAUACCACCCUGAACACGCUUGAUCGCAUCUGAUCUCAGAAGCUGCGCAGGGUCAGGCCUGGUUAGUACUC-------- ENSEMBL GeneScaffold_5000:308679-308761(+) -27.1 .(((...((((((..((((((((..((.(((((((((....)))))....))))))..))))))..))..))))))..))).
eca -------------------------------------------------------------------------------------------------
mlu --------------CGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCAUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUA-------------- ENSEMBL scaffold_181348:58682-58751(+) -27.2 .(((((..((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))...))))).
pva -------CAGUCUACAGCCAUACCACCCUGAACCAGCUUGAUCCCAUCUGAUCUCAGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGG------ ENSEMBL scaffold_1946:161542-161626(+) -27.0 (((..((((((((..((((((((....(((((((((......))))....)))))...)))))).))...))))).))).))).
eeu ------ACCGUUUACAGCCAUACCACCCUGAACAUGCUCAAUCUCAUCUGAUCUCAGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACAUAGAUGGG- ENSEMBL scaffold_265355:20624-20714(+) -29.4 .(((((((((((((..((((((((.....(((........((((....)))))))....)))))).))...))))).)))....))))).
sar ---------GUCUACAGCCAUACCACCCUGAAAGUGCCUGAUCCCGUCUGAUCUCAGAAUCUAAGCAGGGUCAGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGG-- ENSEMBL scaffold_261090:48210-48296(-) -28.7 ........((((.(((..((((.((.(((((((((.((..(((......)))...)).)))))))))))..))))....)))))))
cho ------------UGCGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUAC---------- ENSEMBL scaffold_125230:5238-5313(-) -27.1 ((((((((..((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))...))))).))).
ete ----------UCUAAGGCCAUACCACCCUGAACAUGUCUGAUCUCGUCUGAUCUCAGAAGCUAAGCAGGGUUGGGCCUGGUUAGUACUUGGAU---- ENSEMBL scaffold_220389:10374-10457(-) -27.62 ((((((((((..((((((((......(((((..((....))..))))).......))))).)))...)))).....)))))).
laf --------CAUCUACAGCCAUACCACCCUGAACGUGCUCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGG------ ENSEMBL scaffold_5:82586221-82586304(+) -27.3 ((..((((((((..((((((((.....((((((((......))))...)).))....)))))).))...))))).)))..)).
pca ------------UACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUAC---------- ENSEMBL scaffold_63056:2968-3043(-) -27.1 ((((((((..((((((((...((..((((..((....))..))))..))....)))))).))...))))).))).
meu ----------------GCCAUACCACCCUGAACGUGCCUGAUCUUGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUUGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGA ENSEMBL GeneScaffold_2123:13626-13707(-) -27.21 .((((.(((..((((.((.(((..((((((((((....))).......)))))))..))).)).))))....)))))))..
mdo ------ACUGUCUACAGCCAUACCACCCUGAACACGCCUGAUCUCAUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUUGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGG-- UCSC ENSEMBL 2:85001651-85001740(-) -27.74 .(((((((((((((..((((((((......((.((((......))))..))........))))).)))...))))).))....))))))
oan -------------------------------------------------------------------------------------------------
gga ------CGUGCCUACGGCCAUCCCACCCUGGUAACGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUU-------- UCSC ENSEMBL 9:1892363-1892446(-) -28.0 .((((....(((((.(((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).)))..))))).))))..
mga -------------------------------------------------------------------------------------------------
tgu -------------------------------------------------------------------------------------------------
aca ------AGUGCCUACGGCCAUACCACCCUGAACAUGCCCGAUCUCAUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUU-------- UCSC ENSEMBL scaffold_726:158873-158956(-) -29.4 (((((..((((((.....((((((.....((((((..((....))..))))..))....))))))..))))..))..))))).
xtr -------------------------------------------------------------------------------------------------
dre ------UUCGCUUACGGCCAUACCACCCUGAACACGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCUUGGUUAGUACUUGGAU---- UCSC ENSEMBL 8:38538657-38538744(+) -27.6 ((((..((((((((..((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))...))))).)))..)))).
gac ----------CUUACGGCCAUACCACCCUGAACACGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUCAGUAC---------- UCSC ENSEMBL groupVIII:9798435-9798512(+) -27.0 ..((((((((..((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))...))))).))).
ola --ACCCUUCGCUUACGGCCAUACCACCCUGAACACGCCCGAUCUCGUCCGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGA UCSC ENSEMBL 18:9564963-9565058(-) -34.2 .(((((((..((((((((..((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))...))))).)))..)))).))).
tru ------CUCGCUUACGGCCAUACCACCCUGAGAAUGCCCGAUCUCGUCCGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGG------ UCSC ENSEMBL scaffold_5151:5292-5377(-) -27.0 ..((..((((((((..((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))...))))).)))..)).
tni ------UCCGCUUACGGCCAUACCACCCUGAGAACGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGG------ UCSC ENSEMBL 13:1533383-1533468(+) -27.4 .(((..((((((((..((((((((.....((((((..((....))..))))..))....)))))).))...))))).)))..)))
cin -------------------------------------------------------------------------------------------------
csa -------------------------------------------------------------------------------------------------
dme -------------------------------------------------------------------------------------------------
cel -------------------------------------------------------------------------------------------------
******** * * ** ***** ** * ******* * * ****
************ ** **** * ** ***** ***** ******* **********
*************** ** **** * ** ***** ***** ******** **********
**************** ** **** * ******** *************** **********
**************** ** **** * ********* *************** *********** *
* ***************** ** **** * ********* *************************** * *
** ***************** ** ****** ********* *******************************
** ***************** *** ****** ********* *******************************
** ***************** *** ****** ********* *******************************
** ***************** *** ****** ********* *******************************
** ***************** *** ****** ********* *******************************
** ***************** *** ****** ********* *********************************
** ***************** *** ****** ********* *********************************
** ***************** *** ****** *******************************************
* ** ***************** *** ****** *******************************************
* ********************** *** ****** *******************************************
* *********************** *** ****** ******************************************* *
* *********************** *** ************************************************** *
************************* *** ****************************************************
***************************** ****************************************************
**********************************************************************************
**********************************************************************************
**********************************************************************************
**********************************************************************************
**********************************************************************************
************************************************************************************
************************************************************************************
************************************************************************************
************************************************************************************
*************************************************************************************
**************************************************************************************
***************************************************************************************
****************************************************************************************
*****************************************************************************************
******************************************************************************************
*******************************************************************************************
*******************************************************************************************
*********************************************************************************************
* *********************************************************************************************
*************************************************************************************************