hsa ---AUCAUUCAGAAAUGGUAUACAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACAAUAUAGC-UGAG-UUUGUCUGUCAUUUCUUUAGGCCAAUAUUCUGUAUGACUGUGCUACUUCAA------ miRbase UCSC ENSEMBL 1:220291195-220291304(-) -33.4 ........(((.((((((((((((...((.((((.(((.((((((((((...........)))))))))).)))..)))).))...))))))......)))))).)))..
ptr ---AUCAUUCAGAAAUGGUAUACGGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACAAUAUAGC-UGAG-UUUGUCUGUCAUUUCUUUAGGCCAAUAUUCUGUAUGACUGUGCUACUUCAA------ miRbase UCSC ENSEMBL 1:200725113-200725222(-) -32.7 ........(((.((((((((((((...((.((((.(((.((((((((((...........)))))))))).)))..)))).))...))))))......)))))).)))..
ggo ---AUCAUUCAGAAAUGGUAUACGGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACAAUAUAGC-UGAG-UUUGUCUGUCAUUUCUUUAGACCAAUAUUCUGUAUGACUGUGCUACUUCAA------ miRbase -29.7 .((((.(((((.((((....((........))...(((.((((((((((...........)))))))))).))).....))))...))))).))))..............
ppy ---AUCAUUCAGAAAUGGUAUACAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACAAUACAGC-UGAG-UUUGUCUGUCAUUUCUUUAGGCCAAUAUUCUGUACAACUGUGCUACUUCAA------ miRbase UCSC ENSEMBL 1:29611880-29611989(+) -34.3 ........(((.((((((((((((...((.((((.(((.((((((((((.((......)))))))))))).)))..)))).))...))))))......)))))).)))..
mml ---AUCAUUAAGAAAUGGUAUACAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACACUAUAGC-UGAG-UUUGUCUGUCAUUUCUUUAGGCCAAUAUUCUGUAUGACUGUGCUACUUCAA------ miRbase UCSC ENSEMBL 1:150245571-150245680(+) -31.7 ........(((.((((((((((((...((.((((.(((.(((((((((..((......)).))))))))).)))..)))).))...))))))......)))))).)))..
cja ---AUCAUUCAGAAAUGGUAUACAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACAAUAUGGC-UAAG-UUUGUCUGUCAUUUCUUUAGGCCAAUAUUCUGUCUGACUAUGCUACUUCA------- ENSEMBL Contig886:38137-38246(-) -33.1 ........(((.((((((((((((...((.((((.(((.((((((((((...........)))))))))).)))..)))).))...))))))......)))))).))).
tsy ----------------UGGUUACAGGAAA-UGACCUAUGAAUUGACAGACAAUAUGGC-UAAG-UUUGUCUGUCAUUUCUAUAGGCCAAUAUUCUGUAUGUCUCUGCCACUUCAA------ ENSEMBL GeneScaffold_3794:146817-146913(-) -32.01 (((((((((((..((.((((((((.((((((((((...........)))))))))).))).))))).))...))))))).......))))......
mmr -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
oga -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tbe -------------------AUACAGGAAAAUGACCUAUGACUUGACAGACAAUGUGGC-UAGU-UCUGUCUGUCAUUUCCGUAGGCCAAUAUUCUGUAUA--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_5421:233626-233705(-) -28.22 ((((((((...((.((((((...(((((((((.............)))))))))....)))))).))...)))))))).
cpo -----------------------AGGAGUAUGACCUACAAAUUGACAGACGAUGUGCC-UGAG-UCUGUCUGUCACUUCUGUAGGCCAACAUCCU-------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_13:2522058-2522128(+) -27.1 ((((...((.((((((((.(((((((((((........))).)))))))).)).)))))).))...))))
dor ----------------GGUGUACAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACGAUGUGGC-UGAA-UUUGUCUGUCACUUCUAUAGGCCAAUAUUCUGUAUGUCUCUGCUACUU--------- ENSEMBL GeneScaffold_4557:54819-54913(-) -34.0 ((..(((((((...((.((((((((.((((((((((...........)))))))))).))).))))).))...)))))))..))..........
mmu AGCUCUCAGCAUCAACGGUGUACAGGAGAAUGACCUAUGAUUUGACAGACCGUGCAGC-UGUG-UAUGUCUGUCA-UUCUGUAGGCCAAUAUUCUGUAUGUCACUGCUACUUAAA------ miRbase UCSC ENSEMBL 1:187137460-187137571(+) -37.3 .......((((.....((..(((((((...((.(((((((..((((((((.(((((....))))))))))))).)).))))).))...)))))))..))..)))).......
rno ----------------GGUGUACAGGACAAUGACCUAUGAUUUGACAGACAGUGUGGC-UGCG-UGUGUCUGUCA-UUCUGUAGGCCAAUAUUCUGUAUGUCUCUCCUCCUUACAA----- miRbase UCSC ENSEMBL 13:101312688-101312784(+) -31.2 ((..(((((((...((.(((((((..(((((((((..((....))...))))))))).)).))))).))...)))))))..))..............
str -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
opr -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ocu -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
bta ------------------UGUACAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACAACGUGAC-UAAG-UCUGUCUGUCAUUUCUGUAGGCCAAUGUUCUGUAU---------------------- miRbase UCSC ENSEMBL Un.004.2:1796376-1796454(+) -32.3 .((((((((...((.((((((((.(((((((((((........)).))))))))).))).))))).))...))))))))
ttr ------AUUCAGAAAUGGUGUACAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACAGUAUGGU-UG---UUUGUCUGUCAUUUCUGUAGGCCAAUAUUCUGUAUAUCU------------------ ENSEMBL GeneScaffold_3295:198690-198783(-) -36.0 ..........(((((((((((...((.((((((((.((((((((((.........)))))))))).))).))))).))...))))))))))).
vpa ----------AGAAAUGGUGUACAGGAGAAUGACCUAUGAAUUGACAGACAAUAUGGC-UAAG-UUUGUCUGUCAUUUCUGUAGGCCAAUAUUCUGUAUAUCUCUGCUACUUC-------- ENSEMBL GeneScaffold_245:1481397-1481498(-) -37.8 ((....(((((((((((...((.((((((((.((((((((((...........)))))))))).))).))))).))...)))))))))))....)).....
ssc ----------AGAGAUGGUGUACAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACAAUGUGGC-UAAA-UCUGUCUGUCAUUUCUGUAGGCCAAUAUUCUGUAUAUCUCUGCU------------- miRbase ENSEMBL 10:9750609-9750704(-) -36.9 ..(((.(((((((((((...((.((((((((.(((((((((((........)).))))))))).))).))))).))...))))))))))))))...
cfa ------------------UGUACAGGAAAAUGACCUACGAAUUGAUAGACAAUUUGGC-UAAG-UUUGUCUGUCAUUUUUGUAGGCCAAUAUUCUGUAU---------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 38:17894774-17894852(-) -31.0 .((((((((...((.((((((((.((((((((((.((.....)).))))))))))..)))))))).))...))))))))
fca ---AUCACUCAGAAAUGGUGUACAGGAAAAUGACCUAUGAACUGACAGACAAUUUGCC-UAAG-UCUGUCUGUCAUUUCUGUAGGCCAAUAUUCUGUAUAUCU------------------ ENSEMBL GeneScaffold_2186:211734-211832(-) -35.1 .............(((((((((((...((.((((((((.(((((((((..((.....))..))))))))).))).))))).))...))))))))))).
eca ---AUCAUUAAGAAAUGGUAUACAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACAAUAUGAC-UAAG-UUUGUCUGUCAUUUCUGUAGGCCAAUAUUCUGUAUAUCUCUGCUACUUCAA------ miRbase UCSC ENSEMBL 30:10337621-10337730(-) -37.0 .......((....(((((((((((...((.((((((((.((((((((((...........)))))))))).))).))))).))...)))))))))))....)).......
mlu ------------AAAUGGUGUACAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACAGUGUGGC-UAAG-UGUGUCUGUCAUUUCUGUAGGCCAAUAUUCUGUAU---------------------- ENSEMBL GeneScaffold_5684:132761-132846(-) -28.72 .......((((((((...((.((((((((.(((((((((.............))))))))).))).))))).))...))))))))
pva -------------------GCACAGGAAAAUGACCUAUGCAUCGACAGACAGUAUAGU-CGAG-UGUGUCUGUCGUUUCUAUAGGCCAAUAUUCUGUAU---------------------- ENSEMBL scaffold_294:203964-204042(-) -27.1 ..((((((...((.((((((...(((((((((.(((......))))))))))))....)))))).))...))))))..
eeu ---------CAGACAUGGUGUACAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGAUAAUGUGGC-UGAG-CUUGUCUGUCAUUUCUGUAGGCCAAUAUUCUGUAU---------------------- ENSEMBL GeneScaffold_609:16782-16870(-) -30.5 ..........((((((((...((.((((((((.((((((((((.((......)))))))))))).))).))))).))...))))))))
sar -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cho -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ete ---------------------ACAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACAAUAUGGC-CAAG-CUUGUCUGUCAUUUCUGUAGGCCAAUAUUCUGUAUGUCUCUGCUACUUCAA------ ENSEMBL GeneScaffold_570:38049-38141(-) -28.3 ((((((...((.((((((((.(((((((((....(((...)))))))))))).))).))))).))...))))))..................
laf ----------------GGUGUACAGGAAAAUGACCUAUGAACUGACAGACAAUAUGGC-UAAG-UUUGUCUGUCAUUUCUGUAGGCCAACAUUCUGUA----------------------- ENSEMBL scaffold_74:8120443-8120523(-) -28.8 ....(((((((...((.((((((((.((((((((((...........)))))))))).))).))))).))...)))))))
pca -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
meu -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mdo -------GUAAGAAAUGGUGUGUAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACAUUAUAUU-UAAAGUUUGUCUGUCAUUUCUGUAGGCCAAUGCCUUGUAUGUCUGUGCUGCU---------- miRbase UCSC ENSEMBL 2:130471225-130471327(-) -27.84 ((.((....((..((((((....((.((((((((.(((((((((..............))))))))).))).))))).))....))))))..))....)))).
oan CAAUCCAGGAAGAAAUGGUGUACAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACAGUAUAUU-UAGA--UUGUCUGUCAUUUCUGUAGGCCAAAGUUCUGCAUGCCUUCACUGCUCCGGCGCCAG miRbase UCSC ENSEMBL Contig27098:4335-4452(+) -39.7 .......((..(((..(((((.(((((...((.((((((((.(((((((((((........))))))))))).))).))))).))...))))).))))))))...((....)).))..
gga ----UCAGUAAGAACUGGUGUCCAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACUG--CUUU-CAAAAUGUGCCUGUCAUUUCUAUAGGCCAAUAUUCUGUGCACUUUUCCUACUU--------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:19924793-19924897(+) -33.2 ..((((.(((..((((..(((((...((.((((((((.((((((...((...........)))))))).))).))))).))...)))))..)))).))).)))).
mga -----------------GUGUCCAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACUG--CUUU-CAAAAUGUGCCUGUCAUUUCUAUAGGCCAAUAUUCUGUGCACUU------------------ UCSC ENSEMBL 2:19251632-19251715(+) -27.4 (((..(((((...((.((((((((.((((((...((...........)))))))).))).))))).))...)))))..)))..
tgu -------------------GUCCAGGAAAAUGACCUAUGAAUUGACAGACUG--UCUU-UUGCAUUUGCCUGUCACUUCUAUAGGCCAAUAUU---------------------------- miRbase ENSEMBL 3:9653905-9653975(+) -15.6 ...........((.((((((((.((((((..........((....)))))))).))).))))).)).....
aca ------------------GGCUUAGGGUAAUGACCUAUGAUUUGACAGACUGUGCUUU-CUAUGUCUGCCUGUCAUUUCUGUAGGCCAAUACUCUGUACGCCC------------------ UCSC ENSEMBL scaffold_172:760213-760297(-) -28.4 (((.(((((((.((.(((((((..((((((.....((.......))....))))))..)).))))).)).)))))))...))).
xtr ------------AACUGGUAACCAGGAGGAUGACCUAUGAAAUGACAGCCACUUCCAUACCAAACAUGUCUGUCAUUUCUGUAGGCCAAUAUUCUGAUUGCUUUGUUGA------------ miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_182:576168-576264(+) -29.86 (((.(((((.(((((...((.(((((((((((((((.((...............)).)))))))))).))))).))...))))).)))))..)))..
dre -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
gac -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ola -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tru -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tni -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cin -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
csa -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
** ******* ** ** ** ***** ** *** ****
*** ******** ** ******** ** ****** **** ******** *
**** ************ ******** ** ****** **** ******** *****
***** ************ ********* ** ****** **** ***************
***** ********************** * * ********* **** ****************
* ***** ********************** * * ************** ****************
* **************************** * * * * * ************** *****************
* ******************************* * * * * * ************** ******************
** ******************************* * * * * * ************** ******************
** ******************************* * * * * * * ************** ******************
*** ******************************* * * * * * * ************** ******************
*** ******************************* * * ** * ** * ************** ****************** *
*********************************** * * ** * ** * ********************************* **
************************************* * ** * ** *********************************** **
* ************************************** **** * ** *********************************** ** *
* ***************************************** **** **** *********************************** ** * ** **
************************************************ **** *********************************** ** * ** **
************************************************ **** ************************************ ** ********
************************************************ **** ************************************ ** ********
************************************************ **** ************************************ ** ********
* * ************************************************ **** *************************************** *********
** * ************************************************ **** *************************************** ***********
*** ************************************************** **** *************************************** ***********
******************************************************* **** ***************************************************
******************************************************* **** ***************************************************
******************************************************* **** ***************************************************
******************************************************* **** ***************************************************
******************************************************* ********************************************************
******************************************************* ********************************************************
******************************************************* ********************************************************
*************************************************************************************************************************