hsa AGUAUAAUUAUUACAUAGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCAGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAAG---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 2:56210102-56210211(-)             -31.9 .(((.......)))...((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).))))...
ptr AGUAUAAUUAUUACAUAGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCAGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 2a:57299675-57299783(-)            -31.9 .(((.......)))...((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).)))).. 
ggo AGUAUAAUUAUUACAUAGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCAGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAAG---------------- miRbase                                                 -31.9 .(((.......)))...((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).))))...
ppy AGUAUAAUUAUUACAUAGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCAGCCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAAG---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 2a:55027671-55027780(+)            -31.4 .(((.......)))...((((..(((((...((.((.(((((.(((((((((((((...........)))..)))))))))).))))).)).))...))))).))))...
mml AAUAUAAUUAUUACAUAGUUUUUGAUGUCGC-AGAUUCUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCAGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAAG---------------- miRbase                                                 -31.2 .................((((..(((((.((((....(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))))))).....))))).))))...
cja ----------------AGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCAGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------              ENSEMBL Contig64:1062696-1062789(+)        -31.3         .((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).))))..         
tsy -----------AUUACAGCUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCAGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAAGC---------------              ENSEMBL scaffold_129346:2371-2471(-)       -30.3      ......((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).....))))     
mmr --------------ACAGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAGUCGGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------              ENSEMBL scaffold_2624:40018-40113(-)       -31.4        ...((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).))))..        
oga ----------------AGUU-UUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGGGAACUGAUUGGAUAAGAAUCAGUCACCAUCAGUUCCUCAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------              ENSEMBL scaffold_40297:660-753(+)          -30.2         .((((.(((((...((.((.(((((..((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).))))..         
tbe --------------ACAGCUUUUGAUGUCGC-GGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCGGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAAGC---------------              ENSEMBL GeneScaffold_1551:200980-201077(-) -31.4       ...((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).))))....))))).....))))       
cpo --------------ACAGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCAGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------         UCSC ENSEMBL scaffold_48:8653810-8653905(+)     -31.3        ...((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).))))..        
dor ---------UCAUUACAGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCGGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------              ENSEMBL scaffold_12639:30396-30496(-)      -31.4      ........((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).))))..     
mmu -AAACAUAGUCAUUACAGUUUUUGAUGUUGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGACUGGAUAAGACUUAAUCCCCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA----------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:28663728-28663835(+)            -37.1  ................((((..(((((((.((.((.(((((.(((((((((..((((........))))...))))))))).))))).)).)).))))))).)))).. 
rno --ACCACAGUCAUUGUAGUUUU-GAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGACUGGAUAAGACUCAGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACA------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 14:109673480-109673584(+)          -32.6   ...............((((.(((((...((.((.(((((.(((((((((.(((....(((...))).)))))))))))).))))).)).))...))))).)))).   
str --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
opr -----------AUUAAAGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUACAAAUAUAUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------              ENSEMBL GeneScaffold_224:8485-8583(-)      -32.1       ......((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..((((......))))...)))))))))).))))).)).))...))))).))))..      
ocu -----------AUUACAGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCUGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------              ENSEMBL scaffold_2:30353847-30353945(-)    -32.5       ......((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..((((......))))...)))))))))).))))).)).))...))))).))))..      
bta AAUAUAAUUAACACAGAGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCGGUCACCAUCAGUUCCUCAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAAG---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:40134638-40134747(-)            -31.4 .................((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).))))...
ttr --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
vpa ----------------AGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCAGUCACCAUCAGUUCCUGAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------              ENSEMBL scaffold_1134:53815-53908(-)       -37.5         .((((..(((((...((.((.((((((((((((((((..(((........)))...)))))))))))))))).)).))...))))).))))..         
ssc ---AUAAUUAUUACAGAGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUUGGUCACCAUCAGUUCUUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAAG---------------- miRbase      ENSEMBL 3:79172584-79172690(+)             -28.7  ..............((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).))))...  
cfa ---------------------UUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUGGGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCU----------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 10:59902985-59903066(-)            -28.7               ..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).              
fca ----------------AGUUUUUGAUGUCGU-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUGGGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------              ENSEMBL GeneScaffold_1371:221309-221402(-) -32.1         .((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).))))..         
eca -----------------------------------UACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCAGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUG----------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 15:44376604-44376660(+)            -22.6                           ...(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).)))))...                           
mlu ----------------AGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCGGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------              ENSEMBL scaffold_1270:59069-59162(-)       -31.4         .((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).))))..         
pva ----------------AGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCGGUUACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------              ENSEMBL GeneScaffold_1048:114192-114285(-) -31.0         .((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((.((.(((.......))))))))))))))).))))).)).))...))))).))))..         
eeu ------------------UUUUUGAUGUCGU-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGUAUAAGAAUGUGCCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUACCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------              ENSEMBL scaffold_304608:22935-23026(+)     -29.4          .....(((((...((.((.(((((.((((((((((.(((((....)))))....)))))))))).))))).)).))...))))).......          
sar -------------------UUUUGAUGUCGU-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAAAAUGGGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------              ENSEMBL scaffold_229366:93335-93425(+)     -29.4           ....(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).......          
cho ---------------CAGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAGAAUCAGUCAUCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------              ENSEMBL scaffold_12477:22191-22285(-)      -31.3         ..((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).))))..        
ete -------------------UUUUGAUGUUGC-AGGUACUGCAUCAGG-AACUGAUCGGAUAAGUAUCUGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCACUGCCUUCAGCAUCUAA---------------------              ENSEMBL GeneScaffold_2472:195251-195337(-) -41.7             ....(((((((.(((((.(((((.((((((((((..((((......))))...)))))))))).))))).))))).)))))))...            
laf ----------------AGUUUUUGACGUUGC-AGGUACUGCAUCAGG-AACUGAUCGGUUAAGUAUCCGUCACUGUCAAUUCCUAAUGCGCUGCCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------              ENSEMBL scaffold_52:6068114-6068207(+)     -32.8         .((((..((.((((.(((((.(((((.(((((.(((((((........))).....)))).))))).))))).))))).)))).)).))))..         
pca --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
meu ----------------AGUUUUUGAUGUCGU-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAUAUUCAGGCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------              ENSEMBL Scaffold6573:39116-39209(+)        -31.04         .((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((.((..............)))))))))))).))))).)).))...))))).))))..         
mdo ---------------------UUGAUGUCGU-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAUAUUCAGGCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCU----------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:638507640-638507721(+)           -28.34               ..(((((...((.((.(((((.((((((((((.((..............)))))))))))).))))).)).))...))))).              
oan --------CCGAGCCGAGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAUAAUCAGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAAGCUUCCAUG-------- miRbase UCSC ENSEMBL Contig92704:622-731(+)             -33.8 ..((((...((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).))))..)))).....
gga ---AAAGUCACUGCAGAGUUCUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAUAAUCAGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAAG---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:280139-280245(-)                 -30.1  ..............(((...(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...)))))..)))...  
mga ----------------AGUUUUUGAUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAUAAUCAGUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCAGCAUCUAAACAA-----------------         UCSC ENSEMBL 2:2304447-2304540(+)               -31.3         .((((..(((((...((.((.(((((.((((((((((..(((........)))...)))))))))).))))).)).))...))))).))))..         
tgu ------------------------AUGUCGC-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUAAUAAUCACUCACCAUCAGUUCCUAAUGCAUUGCCUUCA----------------------------- miRbase      ENSEMBL 3:28151737-28151809(+)             -24.04                   .....((((....(((((.((((((((((.((..............)))))))))))).))))))))).....                   
aca --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
xtr ---------------------UUGAUGUUGU-AGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUCCCAGGGAGCAGCCAUCAGUUCCUAAUGCACUGCCUUCGGCAUCUA---------------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_242:1208817-1208899(+)    -35.8              ..(((((((.((.((.(((((.((((((((((.((.(((...)))....)))))))))))).))))).)).)).)))))))..              
dre ----------------------UGAUGUUGG-UGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGAUGAUAUUCAGGAGCCAUCAGUUCCUGAUGCACUCCCA--------------------------------         UCSC ENSEMBL 22:31474885-31474957(-)            -33.1                    ......(((.((...((((((((((((((((.((.((.....))....)))))))))))))))))).)))))                   
gac --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
ola ------------------------------A-UGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGCUGAUACUCAGUUGCCAACAGUACCUGGUGCAUUACCUUCAGCAUC------------------------         UCSC ENSEMBL 15:21350212-21350284(-)            -27.2                    .(((((.(((((((((.((((.(((((............))))))))).))))))))).))...))).....                   
tru --------------------------GCGGA-UGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGCUGAUGCUUUUUACCCAACAGUACCUGAUGCAUUGCCUUCAGCAU-------------------------         UCSC ENSEMBL scaffold_86:820228-820303(-)       -29.2                  ((.((...((.(((((((((.((((.((((.(((......))).)))))))).))))))))).))...)).))..                  
tni -------------------UCUUGAUGUGGA-UGAUACUGCAUCAGG-AACUGAUUGGCUGAUGCUUAGUACCCAACAGUACCUGAUGCAUUGCCUUCAGCAUUGAAAGA------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 17:5748304-5748392(+)              -31.0           (((((((((((......))))))))))).((((..(((.((((((((((((......))).)))).)))))))).))))..........           
cin --------------------AUAGUUGUCGUGAUUUACUGCAUUAGG-AACUGAUUGGUCCAAAAAC--CUCCAAUCAUAUCCUUGUGCAUUAUAUUUCGGGA--ACGACUCACUUCAAAGUUAAACA miRbase                                                 -28.2    ...(((.(((.(((.((.(((((.((((..(((((((...........)))))))..)))).))))).)).))).))).)))((((........)))).....    
csa --------------------GAAAGUGGGGCGAGAUACUGCAUUAGG-AACUGAUUGGUUGUUAA----UUUCACUCAGUUUCAGGUGCAUUAAAUUGCUACACUAUAUGUCAUCCACCAGUAUGAG- miRbase      ENSEMBL reftig_16:3925235-3925336(+)       -31.1     ...((((..((((..((.(((((..((((((((.(((.........))).))))))))..))))).))..))))..)))).....((((........)))).    
dme --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
cel --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
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