hsa ------GUGAUAAUGUAGCGAGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGCGAGGU----AUGAGUAAAACAUGGUUCCGUCAAGCACCAUGGAACGUCACGCAGCUUUCUACA----------- UCSC ENSEMBL 4:20529898-20530008(+) -42.9 (((..((.((.(((.(((.((((((.(((((((((..((((((((..((((.........)))).))))))))..))))))))).)))))).))).))).))))..))).
ptr -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ggo ------GUGAUAAUGUAGCGAGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGCGAGGU----AUGAGUAAAACAUGGUUCCGUCAAGCACCAUGGAACGUCACGCAGCUUUCUACA----------- miRbase -42.9 (((..((.((.(((.(((.((((((.(((((((((..((((((((..((((.........)))).))))))))..))))))))).)))))).))).))).))))..))).
ppy -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mml -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cja --------------------AGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGCAAGGU----AUGAGUAAAACAUGGUUCCGUCAAGCACCAUGGAACGUCACG----------------------- ENSEMBL Contig25:10609088-10609172(+) -35.0 .(((.((((((.(((((((((..((((((((..((((.........)))).))))))))..))))))))).)))))).)))...
tsy -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mmr -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
oga --------------------AGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGCCAGGU----CUGAGUACAACAUGGUUCCGUCAAGCACCAUGGAACGUCACG----------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2798:350278-350362(+) -35.5 .(((.((((((.(((((((((..((((((((...(((((....)).)))..))))))))..))))))))).)))))).)))...
tbe -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cpo -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dor --------------------AGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUUUAACCAUGUGGUUGCGAGGU----AUGAGUAAAACAUGGUUCCGUCAAGCACCAUGGAACGUCACG----------------------- ENSEMBL GeneScaffold_3653:229812-229896(+) -35.7 .(((.((((((.(((((((((..((((((((..((((.........)))).))))))))..))))))))).)))))).)))...
mmu --------------------AGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGCUUGCGAGGU----AUGAGAAAAACAUGGUUCCGUCAAGCACCAUGGAACGUCACG----------------------- UCSC ENSEMBL 5:48615195-48615279(+) -33.3 .(((.((((((.(((((((((..((((((((.(((.........)))....))))))))..))))))))).)))))).)))...
rno --------------------AGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGCUUGCGAGGU----AUGAGUAAAACAUGGUUCCGUCAAGCACCAUGGAACGUCACG----------------------- UCSC ENSEMBL 14:67642369-67642453(-) -35.5 .(((.((((((.(((((((((..((((((((..((((.........)))).))))))))..))))))))).)))))).)))...
str -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
opr --------------------AGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGCGAGGA----AUGAGUAAAACAUGGUUCCGUCAAGCACCAUGGAACGUCACG----------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2732:379352-379436(+) -35.7 .(((.((((((.(((((((((..((((((((..((((.........)))).))))))))..))))))))).)))))).)))...
ocu -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
bta -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ttr -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
vpa --------------------AGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGCCAGGU----AUAAGUAAAACAUGGUUCCGUCAAGCACCAUGGAACGUCACG----------------------- ENSEMBL scaffold_48:763156-763240(-) -34.5 .(((.((((((.(((((((((..((((((((..((((.........)))).))))))))..))))))))).)))))).)))...
ssc --------------------AGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGCCAGGU----AUGAGUAAAACAUGGUUCUGUCAAGCACCAUGGAACGUCACG----------------------- miRbase ENSEMBL 8:11840694-11840777(+) -37.3 .(((.((((((.(((((((((..((((((((..((((((....)).)))).))))))))..))))))))).)))))).)))...
cfa ------------------------------UUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGCCAGGU----AUGAGUAAAACAUGGUUCCGUCAAGCACCA----------------------------------- UCSC ENSEMBL 3:91870795-91870857(-) -28.4 ..(((((((((..((((((((..((((((....)).)))).))))))))..)))))))))..
fca -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
eca ------------------------------UUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGCCAGGU----AUGAGUAAAACAUGGUUCCGUCAAGCACCA----------------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:103550490-103550551(-) -28.4 ..(((((((((..((((((((..((((((....)).)))).))))))))..)))))))))..
mlu -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
pva --------------------AGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGCCAGGU----AUGAGGAAAACAUGGUUCCGUCAAGCACCAUGGAACGUCACG----------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2007:497324-497408(+) -34.8 .(((.((((((.(((((((((..((((((((.....((........))...))))))))..))))))))).)))))).)))...
eeu -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
sar -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cho -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ete -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
laf --------------------AGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGCGAGGU----AUGAGUAAAACAUGGUUCCGUCAAGCACCAUGGAACGUCACG----------------------- ENSEMBL scaffold_18:20102467-20102551(+) -35.7 .(((.((((((.(((((((((..((((((((..((((.........)))).))))))))..))))))))).)))))).)))...
pca -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
meu -------UGAUUAUGUGGCGAGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGUGAGGU----AUGAGUAAAACAUGGUUCUGUCAAGCACCAUGGAACGUCACGCAGCUUUCUACA----------- ENSEMBL GeneScaffold_5499:114382-114491(+) -38.05 .((....((.(((.(((.((((((.(((((((((..((((((((....................))))))))..))))))))).)))))).))).))).))..))....
mdo -------UGAUUAUGUGGCGAGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGUGAGGU----AUGAGUAAAACAUGGUUCUGUCAAGCACCAUGGAACGUCACGCAGCUUUCUACA----------- miRbase UCSC ENSEMBL 5:208287227-208287335(-) -38.05 .((....((.(((.(((.((((((.(((((((((..((((((((....................))))))))..))))))))).)))))).))).))).))..))....
oan GCAGUAUUGACGGUUUAGCGAGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGCAAGGU----AUGAGUAAAACAUGGUUCUGUCAAGCACCAUGGAAAGUCACGCAGCUUUCUACAGC--------- miRbase UCSC ENSEMBL 18:2674598-2674715(+) -47.1 ((.(((..((.((((..(((.((((((((((.(((((((((..((((((((..((((.........)))).))))))))..))))))))).)))))))))).))))))).))))).))
gga --------------------AGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGUGAGGU----AUGAGUAAAACAUGGUUCUGUCAAGCACCAUGGAACGUCACG----------------------- UCSC ENSEMBL 4:77774710-77774794(-) -31.85 .(((.((((((.(((((((((..((((((((....................))))))))..))))))))).)))))).)))...
mga -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tgu -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
aca --------------------AGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGCGAGGU----AUGAGUAAAACAUGGUUCUGUCAAGCACCAUGGAACGUCACG----------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_48:2431709-2431793(-) -36.0 .(((.((((((.(((((((((..((((((((..((((.........)))).))))))))..))))))))).)))))).)))...
xtr --------------------AGAUUUUCUGUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGUGAGGU----AUGAGUAAAACAUGGUUCUGUCAAGCACCAUGGAACGUCACG----------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_231:380401-380485(+) -31.85 .(((.((((((.(((((((((..((((((((....................))))))))..))))))))).)))))).)))...
dre ------------------------------UUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGUUGCAGACU----CAGACUAAUACAUGGUUCUGUCAAGCACCAUGGAAGGUCUUGCAGCAUCUACAGCAUGGCAAGCA UCSC ENSEMBL 1:27656253-27656350(+) -33.0 ...((((((......((((((.((((((.....(((((....((((((.((....)).))))))...))))))))))).......))))))))))))
gac --------------------------UCCUUUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGUCUGAACGGUUCCUAUA-GUAAAACAUGGUUCUGUCAAGCACCAUGGAACG---------------------------- UCSC ENSEMBL groupIX:1818288-1818364(-) -27.4 (((...(((((((((..((((((((..(((...........)))....))))))))..)))))))))...)))...
ola ------------------------------UUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGCUGCCAGGUUCCUAAAAGUGGAACAUGGUUCUGUCAAGCACCAUGGAACG---------------------------- UCSC ENSEMBL 1:17054076-17054149(-) -27.8 ..(((((((((..((((((((.(((...((....))...)))...))))))))..))))))))).........
tru -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tni ------------------------------UUGUGCUUGAUCUAACCAUGUGGCUGCCAGGUUCUUAUC-GUGGAACAUGGUUCUGUCAAGCACCAUGGAACG---------------------------- UCSC ENSEMBL 18:234311-234383(+) -28.4 ..(((((((((..((((((((.....((((((....))).))).))))))))..))))))))).........
cin -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
csa -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
*********** ********** ** ********* ***********
********************** ** *** * ********** ***********
********************** ** **** ** **** ********** **************** *
************************** **** ** *************** **************** *
************************** **** ****************** ******************
** *************************** **** ****************** ******************** *
************************************* **** ****************** ***********************
************************************* **** ****************** ***********************
************************************* **** ****************** ***********************
************************************* **** ****************** ***********************
************************************* **** ****************** ***********************
************************************* **** ******************************************
****************************************** ******************************************
****************************************** ******************************************
****************************************** ******************************************
****************************************** ******************************************
****************************************** ******************************************
****************************************** ******************************************
****************************************** ********************************************** *
*** * * ********************************************* ******************************************************
**** **** ********************************************* ******************************************************
**** **************************************************** *******************************************************
******************************************************************************************************************
***********************************************************************************************************************************