hsa CCGCCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAGCGGG miRbase UCSC ENSEMBL 6:33175612-33175721(+)             -54.44 ((((...((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))...........)))).
ptr -CGCCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCCGGCUGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAGCGG- miRbase UCSC ENSEMBL 6:33908728-33908835(+)             -49.64  (((...((((.(((((((..(((.(((((.((.((((((((.((((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))...........))). 
ggo CCGCCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAGCGGG              ENSEMBL 6:34230765-34230875(+)             -54.44 ((((...((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))...........)))).
ppy CCGCCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCCCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAGCGGG         UCSC ENSEMBL 6_qbl_hap2:1044940-1045050(+)      -54.44 ((((...((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))...........)))).
mml CCGCCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCUGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAGGGGG miRbase UCSC ENSEMBL 4:32922221-32922330(+)             -56.9 ...((((((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))...........)))).
cja -CGCCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACUUCGAG----              ENSEMBL Contig532:652183-652288(+)         -51.0   ......((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))............   
tsy ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
mmr -CGCCCCGGGCCGCGGCUCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUUU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCAGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAG----              ENSEMBL GeneScaffold_4622:54350-54455(+)   -53.5   ......((((.((((((((.(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).)))))))).)))))))).))))............   
oga -CGCCCCGGGCCGUGGCUCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUUU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCAGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAG----              ENSEMBL GeneScaffold_1372:71390-71495(+)   -51.6   ......((((.((((((((.(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).)))))))).)))))))).))))............   
tbe -----CCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCG------              ENSEMBL scaffold_118349:931-1030(+)        -51.0      ..((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))..........      
cpo ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
dor ----CCCGGGCCGCGGCUCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGGGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAG----              ENSEMBL GeneScaffold_6602:55560-55662(+)   -52.7     ...((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))............    
mmu CCGUCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUCU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGCGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAGGGGG miRbase UCSC ENSEMBL 17:34161928-34162037(-)            -61.7 ....(((((((.(((((((..(((.(((((.((((((((((((.(((.........))))))))))))))).))))))))..))))))).)))).....((....)))))
rno CUGUCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUCU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGCGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAGGGGG miRbase UCSC ENSEMBL 20:4967801-4967910(+)              -61.7 ....(((((((.(((((((..(((.(((((.((((((((((((.(((.........))))))))))))))).))))))))..))))))).)))).....((....)))))
str ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
opr ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
ocu CCGCCGCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGGGUUUGGACGUCCCGAGCCGCUGCCCCCAGACCUCGAG----              ENSEMBL scaffold_8:630512-630618(+)        -56.1   .......((((.(((((((..(((.((((((((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)))))))))))..))))))).))))............  
bta --ACUCAGGAGCUUCGCCACUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUUGUACGAGU--CUGCGGCCAACCGAGAAUUGUGGCUGGACAUCUGUGGCUGAGCUCUGG-------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:102549645-102549740(-)          -47.0        .....(((((((.(((((.(((.(((((..(((((((((((.....((.....))....)))))))))))..)))))))).))))).)))))))..       
ttr CCGCCCCGGGCCGCGGCUCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUCU----AGCUCUGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGUCGCCCCCAAACCUCGA-----              ENSEMBL GeneScaffold_3463:240947-241052(+) -50.1   .......((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))...........   
vpa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
ssc CCGCCCCGGGCCGCGGCUCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----AGCUCUGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGUCGCCCCCAAACCUCGAG----              ENSEMBL 7:29626546-29626652(+)             -50.1   .......((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))............  
cfa --------------------UGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUCU----GGCUCUGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCG--------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 12:5674314-5674376(+)              -26.2                        .(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))...                        
fca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
eca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
mlu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
pva CCGCCCCGGGCCGCGGCUCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUCU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAG----              ENSEMBL GeneScaffold_3909:46649-46755(+)   -51.1   .......((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))............  
eeu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
sar ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
cho ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
ete ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
laf CCGCCCCGGGCCGCGGCUCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAG----              ENSEMBL scaffold_105:2731759-2731865(-)    -51.1   .......((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))............  
pca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
meu ------CGGGCCGUGGCUCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGUGGCUCC----GGCCCU---CGAGAGUUGGGUCUGGACAUCCCGAGCCGCGGCCCCCA-------------              ENSEMBL GeneScaffold_9814:99561-99649(+)   -60.5            .((((((((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((....)))..))))))))).)).))))))))..))))))))))))...           
mdo ----CCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGUGGCUCC----GGCCCU---CGAGAGUUGGGUCUGGACAUCCCGAGCCGCGGCCCCCA-------------         UCSC ENSEMBL 2:270698629-270698719(+)           -62.3           ...((((((((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((....)))..))))))))).)).))))))))..))))))))))))...          
oan ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
gga ---------------GCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUUGUGCGCUGGAGCCGUACGAACCAAGAAUUGUGUCUGGACAUCU-----------------------------         UCSC ENSEMBL 17:5577821-5577891(+)              -27.1                     ......(((.(((((.(((((((((((((((((....)).)))).....))))))))))).)))))))).                    
mga ---------------GCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUUGUGCGCUGGAGCCGUACGAACCAAGAAUUGUGUCUGGACAUCU-----------------------------         UCSC ENSEMBL 19:5220136-5220206(+)              -27.1                     ......(((.(((((.(((((((((((((((((....)).)))).....))))))))))).)))))))).                    
tgu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
aca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
xtr ---------------GCCCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUUGUUCCAAUAGAAAUAUCAAGCCAAGAAUUGUGCCUGGACAUCUGUGGCUGG---------------------         UCSC ENSEMBL scaffold_1845:25843-25921(+)       -29.8                 (((...(((.(((((..(((((((((((.....(((....))).....)))))))))))..))))))))...)))...                
dre ------AGGGUCCCAGAGAUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUUGUAACAU--AUAAUAUAAAUCCAAGAAUUGUGCCUGGACAUCUGUUGCUGGAGAUUC--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 10:14184299-14184389(+)            -33.97          .(((((((((..((.(((.(((((..(((((((((((..................)))))))))))..)))))))).))..)))).)))))          
gac ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
ola ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
tru ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
tni ----UCUGAGCACUAGCAGCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUUGUGAAAAU-CCAAAGCCUACCCGAGAAUUGUGCCUGGACAUCUGUUGCUGGACGCUCC-------------- miRbase UCSC ENSEMBL 12:10155044-10155138(-)            -39.91        ...((((.((((((((.(((.(((((..(((((((((((...................)))))))))))..)))))))).))))))))..)))).        
cin ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
csa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
dme ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
cel ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------                      
                        ********************* *                      *** *** *  ***** **                              
                   *    ********************* *               *    * *** *** * ****** **                              
                   **   ********************* *               *   ** *** *** * ****** **                              
                   **   ********************* * *             *   ** *** *** * ****** **    ** *                      
           *       ** * ********************* * * *        *  *   ****** *** ******** **    ** *                      
           *** *   **** ********************* * * *  *     *  *   ****** *** ******** **    ** *    * *               
           *****   **** *********************** * ** *     ** *   ********** ******** *** * ** *  * * **              
         ******** ***** *********************** * ** *    *****  *********** ******** *** ******  *******             
         ************** **************************** *    ***** ************ *******************  *******             
        *************** **************************** *    ***** ************ ******************** ******* ** ***      
        *************** **************************** *    ***** ************ ************************************     
      * ******************************************** *    ****************** *************************************    
     *********************************************** *    ********************************************************    
     *************************************************    ********************************************************    
     *************************************************    ********************************************************    
    **************************************************    ********************************************************    
    **************************************************    ********************************************************    
    **************************************************    ********************************************************    
    **************************************************    ********************************************************    
    **************************************************    ******************************************************** ** 
    **************************************************    ******************************************************** ***
    **************************************************    ******************************************************** ***
    **************************************************    ************************************************************
    ************************************************** * *************************************************************
    ******************************************************************************************************************
    ******************************************************************************************************************