hsa CCGCCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAGCGGG miRbase UCSC ENSEMBL 6:33175612-33175721(+) -54.44 ((((...((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))...........)))).
ptr -CGCCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCCGGCUGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAGCGG- miRbase UCSC ENSEMBL 6:33908728-33908835(+) -49.64 (((...((((.(((((((..(((.(((((.((.((((((((.((((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))...........))).
ggo CCGCCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAGCGGG ENSEMBL 6:34230765-34230875(+) -54.44 ((((...((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))...........)))).
ppy CCGCCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCCCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAGCGGG UCSC ENSEMBL 6_qbl_hap2:1044940-1045050(+) -54.44 ((((...((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))...........)))).
mml CCGCCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCUGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAGGGGG miRbase UCSC ENSEMBL 4:32922221-32922330(+) -56.9 ...((((((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))...........)))).
cja -CGCCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACUUCGAG---- ENSEMBL Contig532:652183-652288(+) -51.0 ......((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))............
tsy ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mmr -CGCCCCGGGCCGCGGCUCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUUU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCAGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAG---- ENSEMBL GeneScaffold_4622:54350-54455(+) -53.5 ......((((.((((((((.(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).)))))))).)))))))).))))............
oga -CGCCCCGGGCCGUGGCUCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUUU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCAGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAG---- ENSEMBL GeneScaffold_1372:71390-71495(+) -51.6 ......((((.((((((((.(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).)))))))).)))))))).))))............
tbe -----CCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCG------ ENSEMBL scaffold_118349:931-1030(+) -51.0 ..((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))..........
cpo ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dor ----CCCGGGCCGCGGCUCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGGGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAG---- ENSEMBL GeneScaffold_6602:55560-55662(+) -52.7 ...((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))............
mmu CCGUCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUCU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGCGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAGGGGG miRbase UCSC ENSEMBL 17:34161928-34162037(-) -61.7 ....(((((((.(((((((..(((.(((((.((((((((((((.(((.........))))))))))))))).))))))))..))))))).)))).....((....)))))
rno CUGUCCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUCU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGCGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAGGGGG miRbase UCSC ENSEMBL 20:4967801-4967910(+) -61.7 ....(((((((.(((((((..(((.(((((.((((((((((((.(((.........))))))))))))))).))))))))..))))))).)))).....((....)))))
str ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
opr ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ocu CCGCCGCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGGGUUUGGACGUCCCGAGCCGCUGCCCCCAGACCUCGAG---- ENSEMBL scaffold_8:630512-630618(+) -56.1 .......((((.(((((((..(((.((((((((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)))))))))))..))))))).))))............
bta --ACUCAGGAGCUUCGCCACUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUUGUACGAGU--CUGCGGCCAACCGAGAAUUGUGGCUGGACAUCUGUGGCUGAGCUCUGG-------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:102549645-102549740(-) -47.0 .....(((((((.(((((.(((.(((((..(((((((((((.....((.....))....)))))))))))..)))))))).))))).)))))))..
ttr CCGCCCCGGGCCGCGGCUCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUCU----AGCUCUGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGUCGCCCCCAAACCUCGA----- ENSEMBL GeneScaffold_3463:240947-241052(+) -50.1 .......((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))...........
vpa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ssc CCGCCCCGGGCCGCGGCUCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----AGCUCUGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGUCGCCCCCAAACCUCGAG---- ENSEMBL 7:29626546-29626652(+) -50.1 .......((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))............
cfa --------------------UGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUCU----GGCUCUGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCG--------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 12:5674314-5674376(+) -26.2 .(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))...
fca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
eca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mlu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
pva CCGCCCCGGGCCGCGGCUCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUCU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAG---- ENSEMBL GeneScaffold_3909:46649-46755(+) -51.1 .......((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))............
eeu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
sar ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cho ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ete ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
laf CCGCCCCGGGCCGCGGCUCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAU----GGCUCCGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCCGCCGCCCCCAAACCUCGAG---- ENSEMBL scaffold_105:2731759-2731865(-) -51.1 .......((((.(((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((.........)))))))))))).)).))))))))..))))))).))))............
pca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
meu ------CGGGCCGUGGCUCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGUGGCUCC----GGCCCU---CGAGAGUUGGGUCUGGACAUCCCGAGCCGCGGCCCCCA------------- ENSEMBL GeneScaffold_9814:99561-99649(+) -60.5 .((((((((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((....)))..))))))))).)).))))))))..))))))))))))...
mdo ----CCCGGGCCGCGGCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGUGGCUCC----GGCCCU---CGAGAGUUGGGUCUGGACAUCCCGAGCCGCGGCCCCCA------------- UCSC ENSEMBL 2:270698629-270698719(+) -62.3 ...((((((((((((..(((.(((((.((.(((((((((.(((....)))..))))))))).)).))))))))..))))))))))))...
oan ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
gga ---------------GCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUUGUGCGCUGGAGCCGUACGAACCAAGAAUUGUGUCUGGACAUCU----------------------------- UCSC ENSEMBL 17:5577821-5577891(+) -27.1 ......(((.(((((.(((((((((((((((((....)).)))).....))))))))))).)))))))).
mga ---------------GCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUUGUGCGCUGGAGCCGUACGAACCAAGAAUUGUGUCUGGACAUCU----------------------------- UCSC ENSEMBL 19:5220136-5220206(+) -27.1 ......(((.(((((.(((((((((((((((((....)).)))).....))))))))))).)))))))).
tgu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
aca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
xtr ---------------GCCCUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUUGUUCCAAUAGAAAUAUCAAGCCAAGAAUUGUGCCUGGACAUCUGUGGCUGG--------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_1845:25843-25921(+) -29.8 (((...(((.(((((..(((((((((((.....(((....))).....)))))))))))..))))))))...)))...
dre ------AGGGUCCCAGAGAUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUUGUAACAU--AUAAUAUAAAUCCAAGAAUUGUGCCUGGACAUCUGUUGCUGGAGAUUC--------------- miRbase UCSC ENSEMBL 10:14184299-14184389(+) -33.97 .(((((((((..((.(((.(((((..(((((((((((..................)))))))))))..)))))))).))..)))).)))))
gac ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ola ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tru ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tni ----UCUGAGCACUAGCAGCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUUGUGAAAAU-CCAAAGCCUACCCGAGAAUUGUGCCUGGACAUCUGUUGCUGGACGCUCC-------------- miRbase UCSC ENSEMBL 12:10155044-10155138(-) -39.91 ...((((.((((((((.(((.(((((..(((((((((((...................)))))))))))..)))))))).))))))))..)))).
cin ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
csa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
********************* * *** *** * ***** **
* ********************* * * * *** *** * ****** **
** ********************* * * ** *** *** * ****** **
** ********************* * * * ** *** *** * ****** ** ** *
* ** * ********************* * * * * * ****** *** ******** ** ** *
*** * **** ********************* * * * * * * ****** *** ******** ** ** * * *
***** **** *********************** * ** * ** * ********** ******** *** * ** * * * **
******** ***** *********************** * ** * ***** *********** ******** *** ****** *******
************** **************************** * ***** ************ ******************* *******
*************** **************************** * ***** ************ ******************** ******* ** ***
*************** **************************** * ***** ************ ************************************
* ******************************************** * ****************** *************************************
*********************************************** * ********************************************************
************************************************* ********************************************************
************************************************* ********************************************************
************************************************** ********************************************************
************************************************** ********************************************************
************************************************** ********************************************************
************************************************** ********************************************************
************************************************** ******************************************************** **
************************************************** ******************************************************** ***
************************************************** ******************************************************** ***
************************************************** ************************************************************
************************************************** * *************************************************************
******************************************************************************************************************
******************************************************************************************************************