hsa ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 17:1617197-1617281(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
ptr ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 17:1683461-1683545(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
ggo ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL 17:1661566-1661651(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
ppy ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 17:1575636-1575720(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
mml ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- miRbase -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
cja ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--CGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL Contig421:586042-586127(+) -39.7 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
tsy ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL scaffold_133461:5278-5363(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
mmr ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL GeneScaffold_4022:12040-12125(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
oga ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL GeneScaffold_2745:203698-203783(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
tbe ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL GeneScaffold_4359:88008-88093(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
cpo ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- UCSC ENSEMBL scaffold_32:20705562-20705647(+) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
dor ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL GeneScaffold_600:80445-80530(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
mmu -----------------ACCUGGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCCCCUGGC---------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:75277218-75277312(+) -42.0 .((.(((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))...)).
rno -----------------ACCUGGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCCACUGGC---------- miRbase UCSC ENSEMBL 10:62782723-62782817(+) -42.8 .((((((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).))))..)).
str ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
opr ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL scaffold_1014:161663-161748(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
ocu ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL scaffold_36:13435644-13435729(+) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
bta ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 19:22901894-22901978(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
ttr ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL GeneScaffold_3352:224725-224810(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
vpa ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL GeneScaffold_2598:13811-13896(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
ssc -------------------------GAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGC----------------- miRbase ENSEMBL 12:45319043-45319122(+) -34.7 (((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).)))...
cfa -----------------------------------AGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGU--------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 9:49177554-49177613(-) -25.9 (((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))..
fca ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL GeneScaffold_1115:435618-435703(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
eca ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 11:45377845-45377929(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
mlu ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL GeneScaffold_4428:165299-165384(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
pva ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL GeneScaffold_2866:54302-54387(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
eeu ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL scaffold_232603:1653-1738(+) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
sar ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL GeneScaffold_604:85476-85561(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
cho ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ete ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
laf ---------------------GGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCU--GACCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCC---------------- ENSEMBL scaffold_47:4903005-4903090(-) -39.8 (((.(((..((((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).))))))))))))))).))).)))
pca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
meu -------------------------GAGCCACAGCAGUUCUUCAGUGGCGAGCUUUAUGUCUU--GUCCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUG---------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_7565:66691-66760(-) -28.0 .........(((((((((((((((.(((((((.((.........))))))))))))).)))))))))))
mdo -----------------------CCGAGCCACAGCAGUUCUUCAGUGGCGAGCUUUAUGUCUU--GUCCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGCUGAGCUCUG------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 2:517205525-517205605(-) -42.7 ..((((..((((((((((((((((((.(((((((.((.........))))))))))))).)))))))))))))).))))..
oan CCCGUGUGCCGGCCCGGGCCUGGCUGAGUCACAGCAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUACGUCCU--GUCCC--AGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGAACUCAGCCCCUGUCUGCCACGAGG miRbase UCSC ENSEMBL Contig225389:256-377(+) -62.6 ((((((.((.(((..(((...((((((((..(((((((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).)))))))))))))).)))))))))))))).)))))).))
gga ---------------GCUCCUGGCUGCCCGGCAGCAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCUU-CUCUAGUAGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGAAUGUAGCCACGUUC---------- miRbase UCSC ENSEMBL 19:5352096-5352195(-) -46.1 .....(((((((....(((((((((((((((((((.((((((.((.((.....))..))))))))))))).))))))))))))))...))))))).....
mga ------------------------------GCAGCAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCUU-CUCUAGUAUCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUG------------------------- UCSC ENSEMBL 21:5872708-5872778(-) -34.5 .(((((((((((((((((((.((((((.((.((.....)).)).))))))))))).))))))))))))))
tgu ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
aca ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
xtr -------------------CUGGCCCGCUAGAAGCAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUUGUU-CCUCUGU-GCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGAAAGUGGCUACU------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_184:1524287-1524378(-) -41.1 .(((((.(((...((((((((((((((((((.((((((.((...........))))))))))))).)))))))))))))...))))))))..
dre ---------------------GGCUGACCUGCAGCAGUUCUUCACUGGCAAGCUUUAUGUCCUU-GUGUACCAGCUAAAGCUGCCAGCUGAAGAACUGUUG------------------------- UCSC ENSEMBL 15:25105989-25106068(-) -35.2 ..........(((((((((((((((((((.((((((.((............)))))))))))))).)))))))))))))
gac -----------------------------------AGUUCUUCACUGGCAAGCUUUAUGUCCUC-AUCUACCAGCUAAAGCUGCCAGCUGAAGAACUGUUGUGGU--------------------- UCSC ENSEMBL groupI:7684503-7684572(-) -27.9 (((((((((((((((.((((((.((............)))))))))))))).)))))))))........
ola ---------------------GGCUGACCCACAGCAGUUCUUCACUGGCAAGCUUUAUGUUCUC-GUGCACCAGCUAAAGCUGCCAGCUGAAGAACUGUUGUG----------------------- UCSC ENSEMBL 13:16589482-16589563(-) -40.3 ........(((((((((((((((((((((.(((((((((......))).....)))))))))))).)))))))))))))))
tru -------------------------------CAGUCGUUCUUCACUGGCUAGCUUUAUGUCCUCUGACCC-AUGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAGCUGUUG------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_50:997446-997515(-) -27.7 (((..(((((((((((((.(((((((.(((....)))......)))))))))))).))))))))..)))
tni -------------------------------CAGUCGUUCUUCACUGGCUAGCUUUAUGUCCUCCGACCCCACGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAGCUGUUG------------------------- UCSC ENSEMBL 12:6138916-6138986(+) -28.0 (((..(((((((((((((.((((((((((...........))).)))))))))))).))))))))..)))
cin ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
csa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
******** **** ******* ** * ************* ****** ***
******** **** ********** * ************** ****** ***
** ********* **** *********** * ************** *************
*** ********* **** ************* * ****************************
*** ********* ****************** * ** *****************************
*** **************************** * ** *****************************
* *** **************************** * *** *****************************
* ** * *** **************************** * *** *****************************
*** ** ****** **************************** * *** ***************************** *
************* **************************** ***** ***************************** * **
****************************************** ***** ***************************** *** **
****************************************** ***** ***************************** *******
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
****************************************** ***** **************************************
******************************************** ***** ************************************** *
********************************************** ****** ************************************** ** *
********************************************** ************************************************* *
* *********************************************** ***************************************************
******************************************************************************************************************************