hsa UGAACAUCCAGGUCUGGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUC-GUUAGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAACAUGUUCUC miRbase UCSC ENSEMBL X:45605585-45605694(-) -47.2 .((((((((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).))))))))))....))))).. ptr UGAACAUCCAGGUCUGGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUC-GUUAGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAACAUGUUCU- miRbase UCSC ENSEMBL X:46054683-46054791(-) -47.2 .((((((((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).))))))))))....))))). ggo UGAACAUCCAGGUCUGGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUC-GUUAGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAACAUGUUCUC miRbase -47.2 .((((((((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).))))))))))....))))).. ppy UGAACAUCCAGGUCUGGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUC-GUUAGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAACAUGUUCUC miRbase UCSC ENSEMBL X:46470821-46470930(-) -47.2 .((((((((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).))))))))))....))))).. mml UGAACAUCCAGGUCUGGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUC-GUUAGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAACAUGUUCUC miRbase UCSC ENSEMBL X:43559275-43559384(-) -47.2 .((((((((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).))))))))))....))))).. cja --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tsy --AACAUCCAGGUUUGGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-GUUGGACAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAACACGUUCUC ENSEMBL scaffold_541:18587-18695(-) -44.5 ....(((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).))))))))))........... mmr --AACAUCCAGGUCUGGGGCAUGAACCUGGCACACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-GUUAGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAACAUAUUCUC ENSEMBL scaffold_60421:4867-4975(-) -44.0 ....(((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).))))))))))........... oga --AACAUCCAGGUCUCUGGCUUGAACCUGGCACACAAUGUAGAUUUCUGUGUUA-GUUAGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAACA------- ENSEMBL scaffold_118079:3451-3552(-) -47.7 ....(((((((....((((((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).))))))))))))))).... tbe UGAAUAUCCAGGUCUAGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-GUUGGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAACA------- ENSEMBL scaffold_148117:54226-54329(-) -44.0 ......(((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).)))))))))).... cpo -GAACCUCCAGGUCUGGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-GUUGAACAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAACAUGUUCU- UCSC ENSEMBL scaffold_33:12035251-12035359(+) -45.6 ((((.(((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....((((((((...)))).))))))))))))).)))..)).)))).)))))))))).....)))). dor -AACAUCCAGGUCUUGAGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-GUUAAGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAUCAUGUUCUC ENSEMBL scaffold_12543:7893-8002(-) -43.4 ....(((((((.....(((.((((((..(((.(((((((((....((((((((...)))).))))))))))))).)))..)).)))).))))))))))........... mmu -----AUCCAGGUCUGGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-GUUAGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAA---------- miRbase UCSC ENSEMBL X:18723420-18723514(-) -44.0 .(((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).)))))))))). rno UGAAUAUCCAGGUCUGGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-GUUAGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAGCAU-UUCUC miRbase UCSC ENSEMBL X:14935617-14935725(+) -44.0 ......(((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).)))))))))).......... str UGAAUAUCCAGGUCUGUGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-AUUUGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGA----------- ENSEMBL scaffold_16359:32451-32550(-) -43.4 ......(((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).)))))))))) opr UGAAUAUCCAGGUGUGUGGCUUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUAUUU-UCUGGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAAC-------- ENSEMBL scaffold_99320:406-508(-) -45.3 ......(((((((....((((((((((..(((.(((((((((....((((............))))))))))))).)))..)).)))))))))))))))... ocu ------UCCAGGUCUGGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-UUUGGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAGCAUGUUCUC ENSEMBL scaffold_24:3423045-3423149(+) -43.7 (((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).))))))))))........... bta CCAACAUCCAGGUCUAGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-GUUGAGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAACACGUUCUU miRbase UCSC ENSEMBL X:61412746-61412855(+) -44.2 ......(((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....((((((((...)))).))))))))))))).)))..)).)))).))))))))))........... ttr --AACAUCCAGGUCUAGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-GUUGGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAACACGUUCU- ENSEMBL scaffold_106408:66978-67085(-) -44.0 ....(((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).)))))))))).......... vpa --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ssc ---------------------UGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-GUUGGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGC------------------- miRbase ENSEMBL X:40478094-40478163(-) -28.6 .(((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)))))..... cfa ------------------------ACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-GUUGGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUU------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL X:39471453-39471514(-) -26.2 (((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..))).. fca ------UCCAGGUCUGGGGCGUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUAUCUGUGUUU-CUUGGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAAGCUACCUGGAAACAUGUUCU- ENSEMBL scaffold_98051:105-208(+) -43.7 (((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).)))))))))).......... eca CCAACAUCCAGGUCUGGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-CUUGGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAACAUGUUCUC miRbase UCSC ENSEMBL X:37090647-37090756(-) -44.0 ......(((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).))))))))))........... mlu --AACAUCCAGGUCUGGGGCUUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUUUGGUAAGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGGUUCAGGCUACUUUGGA---------- ENSEMBL scaffold_15728:5838-5937(-) -42.3 ....((((((.....((((((((((..(((.(((((((((....((((((((....)))).))))))))))))).)))..)).))))))))..)))))) pva --AACAUCCAGGUCUAGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGGUUUCUGUGUUU-GUUAGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAAUAUGUUCU- ENSEMBL scaffold_9651:5103-5210(-) -44.0 ....(((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).)))))))))).......... eeu --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- sar -----AUCCAGGUUUGGGGCGUGAACCUGGCACACAAUGUAGAUUUCUGUAUUU-AUUUAACAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACUUGGAAA--------- ENSEMBL scaffold_231252:5168-5264(-) -40.9 .(((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....((((............))))))))))))).)))..)).)))).)))))))))).. cho --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ete ----CAUCCAGGUCUGGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUAUCUGUGUUU-CUUGGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAA--------- ENSEMBL scaffold_301248:15738-15835(+) -44.0 ..(((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).)))))))))).. laf -GAACAUCCAGGUCUGGGGCGUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-GUUGGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAACA------- ENSEMBL scaffold_56:5382671-5382773(+) -46.1 .....(((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).)))))))))).... pca -GAACAUCCAGGUCUUGGGCAUGGACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-GUUGGGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGGAAACA------- ENSEMBL scaffold_5553:8670-8772(-) -43.5 .....(((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....(((((((.....))).))))))))))))).)))..)).)))).)))))))))).... meu ------UCCAGGUUUGGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAAUUCUGUGUUU-AUUAAGUAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUACCUGG------------ ENSEMBL Scaffold80757:945-1037(-) -39.5 .((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....((((............))))))))))))).)))..)).)))).))))))))) mdo ------------------GCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAAUUCUGUGUUU-AUUAAGUAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCU------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 4:17427280-17427353(+) -30.1 ((.((((((..(((.(((((((((....((((............))))))))))))).)))..)).)))).)). oan ------UUCAGGUUUGAGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAAUUCUGUAUUU-GUUAAGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAAGCUACCUGGA----------- miRbase UCSC ENSEMBL Ultra222:5162753-5162845(+) -38.2 (((((((....(((.((((((..(((.(((((((((....((((...((.....))))))))))))))).)))..)).)))).)))))))))) gga -GACUGUCCAGGUUUGGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-GUUAAGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCCAGCUGCCUGGAA---------- miRbase UCSC ENSEMBL 1:114218926-114219024(+) -43.2 .....(((((((....((...(((((..(((.(((((((((....((((((((...)))).))))))))))))).)))..)))))))....))))))). mga ------UCCAGGUUUGGGGCAUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-GUUAAGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCCAGCUGCCUGGAAA--------- UCSC ENSEMBL 1:118645572-118645667(+) -43.0 (((((((....((...(((((..(((.(((((((((....((((((((...)))).))))))))))))).)))..)))))))....))))))).. tgu ------------------------ACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUUU-GUUAAGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCCAGCUGCCUG------------- miRbase ENSEMBL 1:5261236-5261308(+) -26.0 (((..(((.(((((((((....((((((((...)))).))))))))))))).)))..)))............. aca --------------UGGGGCCUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAAUUCUG--UUU-GUUAAGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCUGUCUGGAAA--------- UCSC ENSEMBL scaffold_118:1316440-1316525(+) -39.2 ...((((((((((..(((.(((((((((....((((.((.....))))))))))))))).)))..)).))))))))......... xtr -----ACCCAGACUU-UGGCGUGCACCUGGCAUACAAUGUAGAAAACUGUGUUU-GCAAAGCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAUGCUGAAUGGA----------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_169:2026912-2027004(+) -38.7 ..(((...((..(((((.(((..(((.(((((((((....((((((((...)))).))))))))))))).)))..)))..)))))..))))). dre -----------------GUCGUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUGG-UACUAUCUACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCCAGCAGAAUAAUUCUGCUC miRbase -38.3 (((..(((((..(((.(((((((((....(((((.(((...))))))))))))))))).)))..)))))..))).(((((((...))))))). gac ---------------------UGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUGGUUAAAUUCAACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCUG--------------------- UCSC ENSEMBL groupXVI:18014866-18014935(+) -28.7 .(((((..(((.(((((((((....((((.(((......)))))))))))))))).)))..)))))... ola ------------------------ACCUGGCAUACAGUGUAGUAUUCUGUGUGC-GUCCGUCUACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCAGGCCU----------------- UCSC ENSEMBL 2:28254384-28254453(-) -28.1 (((..(((.(((((((((....(((((.((....)).)))))))))))))).)))..)))......... tru ---------------------UGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUGCUUGGAUUCUACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUCCG--------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_81:980180-980249(+) -27.0 .(((((..(((.(((((((((....(((((...........)))))))))))))).)))..)))))... tni -------------------CCUGAACCUGGCAUACAAUGUAGAUUUCUGUGUGCUUGGAUUCUACAGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUC----------------------- miRbase -27.0 ...(((((..(((.(((((((((....(((((...........)))))))))))))).)))..))))). cin --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ******** *** ***** *** * ********************* ** ******** ********* ***** * ************************* ******** ********** ***** * * ************************* ** ******************* ****** * * ************************* ** ******************* ******** *************************** ** ********************** ********* *************************** ** * ******************************** * *************************** ** * ******************************** ** **************************** *** *** ******************************** ** ********************************* ** * *** ******************************** ** ********************************* *** * * *** ******************************** ** ********************************* ****** **** * *** ********************************* ** ********************************* ****** ******* * *** ********************************* ** **************************************** ******* * *** ********************************* *** 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