hsa -GCUGCUGGAAGGUGUAGGUACCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUC-GUAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUUCUAGCU-- miRbase UCSC ENSEMBL X:45606421-45606530(-) -54.1 ...(((((((((((......((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).))))))))))))). ptr ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ggo -GCUGCUGGAAGGUGUAGGUACCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUC-GUAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUUCUAGCU-- ENSEMBL X:46590299-46590409(-) -54.1 ...(((((((((((......((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).))))))))))))). ppy -GCUGCUGGAAGGUGUAGGUACCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUC-GUAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUUCUAGCU-- miRbase UCSC ENSEMBL X:46471641-46471750(-) -54.1 ...(((((((((((......((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).))))))))))))). mml -GCUGCUGGAAGGUAUAGGUACCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUC-GUAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUUCUAGCU-- miRbase UCSC ENSEMBL X:43560139-43560248(-) -50.4 ...((((((((((.......((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).)).)))))))))). cja --------GAAGGUGUGGGUACCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUU-GUAAUCAGUAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUUUUAGCUUC ENSEMBL Contig308:2020779-2020884(-) -46.9 ((((.((.((((.((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).)).))))..)).)))) tsy ------------GUGUUGGUACCCUCAGUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUGUUUU-GUAAUCAGUAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUUCUAGCU-- ENSEMBL scaffold_541:19340-19439(-) -45.8 ..(((((..((.((((.(((((((((((((((((((...(((.(((....))))))...))))).)))))))))))))).)))).))......))))). mmr ------------------------------GCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUGUUUA-GUAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGC------------- ENSEMBL scaffold_2401:73044-73114(-) -31.0 ((((((((((((((((((...(((.(((....))))))...))))).))))))))))))).......... oga --------GAAGAUGUAGAUACCCUCGAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUA-GUAAUCAGUAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUUCU------ ENSEMBL scaffold_118079:4105-4204(-) -45.4 (((((((......((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).))))))))). tbe ---------------------CCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUU-GUAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAU---------------- ENSEMBL scaffold_148117:54882-54958(-) -36.3 ...(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))). cpo -----------------GAUGCCCUCAGUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUU-GUAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUUACAUCUUCUA----- UCSC ENSEMBL scaffold_33:12034572-12034663(+) -43.6 ((((...((((.(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).)))))))))))))).))))...))))..... dor ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mmu ---------------------CCCUCAGUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUG-GUAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGGUGGC------------- miRbase UCSC ENSEMBL X:18724019-18724097(-) -41.2 ((.((((.(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).)))))))))))))).)))).)). rno --------AAGGAUUAGGGUGCCCUCAGUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUG-GUAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCAUCUAGCU-- miRbase UCSC ENSEMBL X:14935056-14935158(+) -52.5 ..((((...((((((.((((.(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).)))))))))))))).)))).)))))))))).... str ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- opr --------GAAGGUUUAGGUGCCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUG-GUAAUCAGUAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUUCUAGCU-- ENSEMBL scaffold_99320:1042-1145(-) -51.1 ...((((.(((((((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).)))))))...)))) ocu ---------------UAGGUACCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUU-GUAAUCAGUAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUUCUAGCU-- ENSEMBL scaffold_24:3422384-3422480(+) -42.0 .((((.((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).)).))))....... bta -GCUGCUGGAAUGUGUAGGUACCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUU-GUAAUCAGUAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUUCUACCU-- miRbase UCSC ENSEMBL X:61412052-61412161(+) -43.0 ...........(((.((((.((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).)).))))..))).. ttr -GCUGCUGGAAUGUGUAGGUACCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUU-GUAAUCAGUAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUUCUACC--- ENSEMBL scaffold_106408:67626-67735(-) -43.0 ...........(((.((((.((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).)).))))..))). vpa ------------GUGUAGGUACCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUG-GUAAUCAGUAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUUCUA----- ENSEMBL scaffold_1047:277657-277753(-) -42.0 ....((((.((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).)).)))).... ssc -------------------UGCCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCAUUU-GUAAUCAGUAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGG-------------- miRbase ENSEMBL X:40478834-40478913(-) -38.5 ..((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).)) cfa ---------------------CCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUU-GUAAUCAGUAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUUCUAGCU-- miRbase UCSC ENSEMBL X:39472082-39472171(-) -38.7 ((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).))............ fca ------------GUGUAGGUACCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUU-GUAAUCAGUAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUUCU------ ENSEMBL scaffold_203036:389-484(-) -42.0 ....((((.((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).)).))))... eca -GCUGCUGGAAAGUGUAGGUACCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUU-GUAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUUCUAGCU-- miRbase UCSC ENSEMBL X:37091426-37091535(-) -49.0 ...((((((......((((.((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).)).)))))))))). mlu -------------UGUAGGUGCCCUCAGUGGCUCAGUAG-UCAGUGUAGAUCCUGUCUUUU-AUAAUCAGUAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUU-------- ENSEMBL scaffold_15728:6528-6620(-) -49.3 ...(((((((.((((.(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).)))))))))))))).)))).))))))). pva --CUGCUGGAAUGUGUAGGUACCCUCAAUGGCUCAGUAGUCCAGUGUAGAUCCUGUCUUU--GUAAUCAGUAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUUCUAGCU-- ENSEMBL scaffold_9651:5812-5921(-) -45.3 ..((((((......((((.((.(((..((((((((((.(((((((((...(((..........)))...))))).))))))))))))))..))).)).)))))))))). eeu ---------------------CCCUCAAUGGCUCAGUAG-UCAGUGUAGAUCCUGUGUUUU-GUAAUCAGUAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGUAUCUUCUAG---- ENSEMBL scaffold_372987:456-544(-) -36.5 ((.(((..(((((((((((((((((((...(((.(((....))))))...))))).))))))))))))))..))).)).......... sar ------------GUGUAGGUGCCCUCAAUGACUCAGUAG-CCGGUGUAGAUCCUGUGUUUA-GUAAUCAGUAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCAUCUAG---- ENSEMBL scaffold_231252:6083-6180(-) -48.8 .....((((((.(((..(((((((((((((((((((...(((.(((....))))))...))))).))))))))))))))..))).))))))...... cho -------------------GUCCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUU-GUAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGACAUCUUCUAGCU-- ENSEMBL scaffold_202039:645-737(-) -39.4 (((..(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).)))........... ete ----------------------CCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCUUUU-GUAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCU--------- ENSEMBL scaffold_301248:15108-15190(+) -38.1 (((((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).))..... laf ---------------------CCCUCAAUGGCUCAGUAG-CUAGUGUAGAUCCUGUCUUUU-GUAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUCCUAGCU-- ENSEMBL scaffold_56:5382000-5382090(+) -36.4 ((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).))............ pca ---------------------CCCUCAAUGGCUCAGUAG-CCAGUGUAGAUCCUGUCAUUUUGUAAUCAGUAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUCCUAGC--- ENSEMBL scaffold_5553:9307-9397(-) -38.6 ((.(((..(((((((((((((((((((...(((............)))...))))).))))))))))))))..))).))........... meu ---------------------CCCUCAUUCGCUCAGUAG-UCAGUGUAGAUCCUGUCUCUG-A--AUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAU----------- ENSEMBL Scaffold80757:1486-1565(-) -32.3 ((.(((...((((((((((((((((((...(((.........)))...))))).)))))))))))))...))).))... mdo ---------------------CCCUCAUUCGCUCAGUAG-UCAGUGUAGAUACUGUCUCUU-UCCAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUCUU-------- UCSC ENSEMBL 4:17426694-17426778(+) -32.1 ((.(((...((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).)))))))))))))...))).))...... oan ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- gga ------------------------UCAAUCGCUCAGUAG-UCAGUGUAGAUUCUGUCUUUA--CAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGACAUCU--------- UCSC ENSEMBL 1:114216039-114216118(+) -29.7 (((...((((((((((((((((((...(((..........)))...))))).)))))))))))))...)))........ mga ------------------------UCAAUCGCUCAGUAG-UCAGUGUAGAUUCUGUCUUUA--CAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGACAUCU--------- UCSC ENSEMBL 1:118645075-118645154(+) -29.7 (((...((((((((((((((((((...(((..........)))...))))).)))))))))))))...)))........ tgu --------------------------AGUCGCUCAGUAG-UCAGUGUAGAUUCUGUCUUUA--CAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGACAUCU--------- ENSEMBL 1:5260723-5260800(+) -29.91 .(((((((((((((((((((((...(((..........)))...))))).))))))))))))).......))).... aca ----------------------CCUCAGUCGCUCAGUAG-UCAGUGUAGAUUCUGUCUUCU--CAAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAGGACAUCUUGUAGC--- UCSC ENSEMBL scaffold_118:1315497-1315584(+) -40.5 ((((((..((((((((((((((((((...(((..........)))...))))).)))))))))))))..))))))............ xtr -----------------------------CGCUCAGUAA-UCAGUGUAGAUCCUGUAUAUC---UGUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUA------------------ miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_169:2026404-2026467(+) -23.2 .((((((((..((((((((...(((.........)))...))))).)))..))))))))..... dre GCCGGUGGCUUGUUCGGGUGCUCAUGAGAUGCUCAGUAG-UCAGUGUAGAUCCUGUGUCAC---AAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGAUGGCAUUUUCUGCU--- miRbase -45.6 .((((........))))((((.(((.(((.((((((((((((((((((...(((.........)))...))))).))))))))))))).))).)))))))........ gac --------------------------GGUUGCUCAGUAG-GCAGUGUAGAUCCUGUGUAGC---AAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCCGGC---------------- UCSC ENSEMBL groupXVI:18014354-18014423(+) -30.9 ((..(((((((((.((((((((...(((.........)))...))))).))).)))))))))..))... ola -------------------------------CUCAGUAG-UCAGUGUAGAUCCUGUGGGGC---UGACAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCCGCCGACG------------ UCSC ENSEMBL 2:28254497-28254565(-) -28.6 (((((((((((((((((...((((.......))))...))))).))))))))))))............ tru --------------------------AGUUGCUCAGUAG-GCAGUGUAGAUCCUGUGUAGC---AAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUGA----------------- UCSC ENSEMBL scaffold_81:979897-979965(+) -28.2 ((..(((((((((.((((((((...(((.........)))...))))).))).)))))))))..)).. tni -------------------------CAGUUGCUCAGUAG-GCAGUGUAGAUCCUGUGUAGC---AAUCAGCAGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUCUG------------------ miRbase -30.1 (((..(((((((((.((((((((...(((.........)))...))))).))).)))))))))..))) cin ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ******* ******** **** *** ************************ ******** ********** **** **** ************************ * ********* ********** **** ***** ************************** ********* ********** **** * ***** ************************** * ********* ********** **** * ****** ************************** * * ********* *************** * ****** *************************** * * ********* *************** * * ****** ***************************** *** * ********* *************** * * ****** ***************************** * *** * ********* *************** *** ****** ***************************** * * *** * ********* *************** *** ****** ***************************** *** ***** * ********* ******************* ****** ***************************** *** ***** * ********* ******************* ****** ***************************** **** ****** * ********* ******************* ******* *********************************** ****** *********** ******************* ******** *********************************** ****** *********** ******************** ******** *********************************** ****** *********** ******************** ******** *********************************** ****************** ******************** ********************************************* * ****************** ******************** ********************************************* * ****************** ******************** *********************************************** ****************** ******************** ************************************************ ****************** ******************** ************************************************ * * ****************** ******************** ************************************************ * * ****************** ********************* ************************************************ * * * ****************** ********************* ************************************************** * * *** ****************** ********************* ************************************************** * * *** ****************** ********************* ************************************************** * ***** ****************** ********************* *************************************************** *************************** ********************* *************************************************** *************************** ********************* *************************************************** * *************************** ********************* *************************************************** *** *************************** ********************* *************************************************** *** *************************** ********************* *************************************************** * * ******************************** ********************* *************************************************** ************************************* ********************* *************************************************** ************************************** ********************* *************************************************** ************************************** ********************* *************************************************** ************************************** ********************* *************************************************** ************************************** ********************* *************************************************** ************************************** ********************* *************************************************** ************************************** ********************* *************************************************** *******************************************************************************************************************