hsa --------CCUGGCCUCCUGCAGUGCCACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCAUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCACAUGCUUACCAG----- miRbase UCSC ENSEMBL X:65238712-65238821(+) -47.2 .((((......((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).))))).)))...)))) ptr --------CCUGGCCUCCUGCAGUGCCACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCAUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCACAUGCUUACCAG----- miRbase UCSC ENSEMBL X:65229619-65229728(+) -47.2 .((((......((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).))))).)))...)))) ggo --------CCUGGCCUCCUGCAGUGCCACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCAUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCACAUGCUUACCAG----- miRbase -47.2 .((((......((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).))))).)))...)))) ppy --------CCUGGCCUCCUGCAGUGCCACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUAGACACUCCGUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCACAUGCUUACCAG----- miRbase UCSC ENSEMBL X:63380851-63380960(+) -47.2 .((((......((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).))))).)))...)))) mml --------CCCGGCCUCCUGCAGUGCCACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCGUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCAUAUGCUUACCAG----- miRbase UCSC ENSEMBL X:64563509-64563618(+) -42.4 ...((......((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).))))).)))...)).. cja --------CCUGGCCUCCUGCAGUGCCACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUAGACACUCCGUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGUGACACAUGCUUA--------- ENSEMBL Contig615:578273-578379(+) -40.6 ...........((((((.((((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))))).))).)))... tsy --------CCUGGUCUCCUGCAGUGCCACACUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUGGGACACUCCAUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCAUAUGC------------ ENSEMBL GeneScaffold_5208:38296-38399(+) -40.7 ...........((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).))))).))) mmr ------------GCCUCCUGCAGUGCCACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCGUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCACAUGC------------ ENSEMBL scaffold_5858:31606-31705(+) -42.6 .......((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).))))).))) oga -----------------CUGCAGUGCCACACUCUGUGUAUUUGACAGGCUGAGUGGAACACUCAGUUUA-AUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUG---------------------- ENSEMBL scaffold_17181:44076-44160(+) -28.3 ...........((((.((.((((((((((((((((......(((((.........)))))))))))))))))))))..)))))) tbe ---------CUGGCCUCCUGCAGUGCUUCACUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCAUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCACCUGCUUA--------- ENSEMBL GeneScaffold_4687:166021-166126(+) -41.5 ..........((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).)))).))))... cpo ------------------UGCAGUACCACACUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCAUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCACAUGC------------ UCSC ENSEMBL scaffold_122:2726051-2726144(+) -36.4 .(((((.((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).)).)).))) dor ---------CUGGCUUCCAGCAGUGCCACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCAUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCACCUGCCUAGCA------ ENSEMBL GeneScaffold_4193:59528-59636(+) -46.8 ...(((....((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).)))).))))..))). mmu --------UCUGGCCAUCUGCAGUGUCACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCUGUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGUGGCUCAUGCCUAUCAG----- miRbase UCSC ENSEMBL X:93438156-93438265(+) -44.5 .((((......(((..((((((((....((((((((((((((......(((((((((.....)))))))))))))))))))))))....))))))))...)))...)))) rno --------UCUGGCCUUCUGCAGUGUUACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCUGUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGUGGCUCAUGCUUAUCAG----- miRbase UCSC ENSEMBL X:83869053-83869162(+) -43.1 .((((......(((..((((((((....((((((((((((((......(((((((((.....)))))))))))))))))))))))....))))))))...)))...)))) str --------CCUGGCCUCCAGCAGUGCCACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCGUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCC-AAGUGCGGCACAUGCUUA--------- ENSEMBL GeneScaffold_3572:36168-36273(+) -44.2 ..........(((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))...)))).))))).)))).. opr ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ocu --------CCUGGCCUCUUGCAGUGCCUCGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCGUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCACAUGCUUA--------- ENSEMBL scaffold_54:3120746-3120852(+) -43.4 ...........((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).))))).)))... bta --------CCCAGCCUCCUGCAGUGCCAUGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCAUGUA-GUAG--UGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGUGGCAUAUGCCUAGCAG----- miRbase UCSC ENSEMBL X:56723506-56723613(-) -41.0 ....((.....(((((((((((((....((((((((((((((((.....((((.....)).))....))))))))))))))))....)))))))))).)))...)).. ttr ------------GCCUCCUGCAGUGCCACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUAGACACUCCAUGUA-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCAUAUGC------------ ENSEMBL scaffold_96670:13286-13385(+) -40.3 .......((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).))))).))) vpa ------------GCCUCCUGCAGUGCCACACUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCAUGUA-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCAUAUGC------------ ENSEMBL scaffold_5225:9168-9267(+) -40.7 .......((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).))))).))) ssc ----------------CCUGCAAUGCCACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCAUGUA-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCAUAUGC------------ ENSEMBL X:51247491-51247586(-) -40.3 ...((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).))))).))) cfa --------CCUGGCCUCCUGCAGUGCCACACUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUAGACACUCCAUGUG-GAAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCACAUGC------------ miRbase UCSC ENSEMBL X:53762315-53762417(+) -43.0 ...........((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).))))).))) fca ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- eca -------GCCCAGCCUCCUGCAGUGCCACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCAUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCACAUGC------------ miRbase UCSC ENSEMBL X:48492588-48492691(+) -42.6 ............((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).))))).))) mlu -----------GGCCUCCUGCAGUGCCACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCAUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCAUGUG------------- ENSEMBL GeneScaffold_3652:28397-28496(+) -38.9 ........(((.((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).))))))). pva --------CCUGGCCUCCUGCAGUGCCACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCAUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCACAUGC------------ ENSEMBL GeneScaffold_2372:67467-67570(+) -42.6 ...........((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).))))).))) eeu -------------CCUCUUGCAAUGUCACGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUAGACACUCCAUAUG-GAAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCAUAUGCU----------- ENSEMBL scaffold_364297:5396-5495(+) -38.8 ......((((((((.((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....)))).))))).))). sar --------------------------------CCGCGUAUUUGACAAGCUGAAUUGGACACUCCAUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCA----------------- ENSEMBL scaffold_196592:11835-11909(+) -30.31 ((((((((((((((((((((.((...(((.....)))...))...)))))))))))))))).......)))).. cho ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ete --------------CUCCUGCAGUGCCACGCUCCGUGUAUUUGAUAAACUGAAUUAGACACUCCAUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCUCAUGC------------ ENSEMBL scaffold_304610:43393-43490(+) -36.9 .....(((..(((.((((....(((((((((((((((((((...(((.....)))....))).))))))))))))))))....)))).)))...))) laf --------CCUGGCCUCCUGCAGUGUCACGCUCCGUGUAUUUGAUAAGCUGAGUUGGACACUUCAUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGCGGCACAUGC------------ ENSEMBL scaffold_24:41857362-41857465(+) -36.8 ...........((((((((.((((....((((((((((((((((.((...(((.....)))...))...))))))))))))))))....)))).))))).))) pca --------CCUGGCCUCCUGCAGUGCUAUGCUACGUGUAUUUGAUAAGCUGAGUUGGACACUUCAUGUU-GUACAGUGUCAGUUUGUCAAAUACUCUAAGUACAGCACAUGC------------ ENSEMBL scaffold_53998:6932-7035(+) -35.5 ...........((((((((.((((....((((((((((((((((..((.((((.....)).)).))...))))))))))))))))....)))).))))).))) meu ----------------CCUGCAGUGCCACACUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUCAGACACUCCGUGUG-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGAGACAUUU-------------- ENSEMBL Scaffold20791:36632-36725(-) -29.8 .....((((...((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....))))...)))). mdo ----UCUGGCCCAGAUCCUUCAGUGCCACACUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCGUGUC-GUAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGAGGCAUUUGCCUAG-------- miRbase UCSC ENSEMBL X:10078238-10078348(-) -42.9 ...(((...((....))((((((.((((....((((((((((((((((.((((((((...))))).)))....))))))))))))))))....)))).)))))).)))... oan GCGACCACGUGACCACACCGCAGUGCCGCGCUCCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCCGUGUGGUUUGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCUAAGUGAGGCAUGCUCACCCAUGUUUGC miRbase UCSC ENSEMBL Contig3675:6073-6196(+) -44.11 ((((.((.((((.......(((.((((.((((....((((((((((((((......(((((((..........)))))))))))))))))))))....)))).)))))))))))...)).)))) gga -----------------CUGCAGUGCAGCACUGCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUUGACACUCAGUCUG-GCAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGAGGCACUUGCUGAGCA------ miRbase UCSC ENSEMBL 4:232949-233048(+) -42.9 ..(((((((..((((....((((((((((((((......(((((((.((...)).)))))))))))))))))))))....))))..)))).)))...... mga -----------------------UGCAGCACUGCGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUUGACACUCAGUCUG-GCAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGAGGCACUUGCU----------- UCSC ENSEMBL 9:220102-220191(+) -35.7 (((..((((....((((((((((((((......(((((((.((...)).)))))))))))))))))))))....))))..)))...... tgu ----------------------------------GUGUAUUUGACAAGCUGAGUCCGACACUCAGUGUG--CAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGAGGCA----------------- miRbase ENSEMBL 4A:6644931-6645001(-) -26.6 ..((((((((((((((......(((((((........))))))))))))))))))))).((......)).. aca ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- xtr ---------------------AGUGUGGCACUGAGUGUAUUUGACAAGCUGAGUCCGACACUCAAUGAG-ACAGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGAGGCAC---------------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_239:973555-973640(-) -36.3 .((((..((((....((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))....))))..)))) dre -----CUCUCCUCCUGAUCUAGACUCUUCUCUUAGAGUAUUUGACAGACUGUGGUUGACACUCGAUCUA-AAGGGGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGAGAGG------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 5:20263881-20263979(-) -34.2 ....................((((((((...((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))...)))))))) gac ----------------------------CACUUAGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCUGUAUC-UCUGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUG---------------------- UCSC ENSEMBL groupVII:17148077-17148150(-) -30.0 (((((...((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))...))))) ola ----------------------------CACUUAGUGUAUUUGACAAGCUGAGUUGGACACUCUAUCUC-UGUGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUG---------------------- UCSC ENSEMBL 14:17328713-17328786(-) -30.0 (((((...((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))...))))) tru ----------------------------CACUUAGUGUAUUUGACAAGCUGUUCUUGACACUCUUUAUA-CGCGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUG---------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_6:1249743-1249816(+) -29.4 (((((...((((((((((((((......(((((((.........)))))))))))))))))))))...))))) tni -------------------CAGGCCCUUCACUUAGUGUAUUUGACAAGCUGUGUUUGACACUCUGUAUC-UGCGAGUGUCAGUUUGUCAAAUACCCCAAGUGAGG------------------- miRbase UCSC ENSEMBL Un_random:92603284-92603368(-) -35.8 ......((((((((...((((((((((((((......(((((((.((....)))))))))))))))))))))))...)))))))) cin ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- * ******** * *** ***** * ****************** * *** * ******** * *** ****** * * * ********************* ***** ** ********** ****** * ******* * * *********************** ***** ** ******************** ******* * * ***************************** * ** ******************** ******* * * ***************************** * ** ********************* ******* * * ***************************** * * ** ********************* ******* * * ****************************** *** * * ** ********************* ******* * * ****************************** *** * ** * ** ********************** ******* * * ****************************** *** ***** * ** ********************** ******* *** * ****************************** **** ******* * ************************* ******* *** * ****************************** **** * ******* * ************************* ******* *** ******************************** **** *** ********* * ************************* ******** **** ******************************** **** *** ************ ************************* ******** **** ******************************** **** *** ************ ********************************** **** ******************************** **** *** ************* ********************************** **** ******************************** **** *** * ************** ********************************** **** ******************************** **** *** **************** ********************************** **** ************************************* **** ********************************************************* ************************************* **** ********************************************************* ****************************************** * ********************************************************* ****************************************** * ********************************************************* ****************************************** * ********************************************************* ****************************************** * ********************************************************** ****************************************** * ********************************************************** ****************************************** ************************************************************ ****************************************** ************************************************************* ****************************************** * ************************************************************* ****************************************** ** ************************************************************* ********************************************* ************************************************************* ********************************************* ************************************************************* ********************************************* ************************************************************* ********************************************* ** ************************************************************* ********************************************* *** ************************************************************* ********************************************* *** ************************************************************* ********************************************* *** ************************************************************* ************************************************* ************************************************************* ************************************************* ************************************************************* ************************************************* * ************************************************************* ************************************************* **************************************************************** ************************************************* ****************************************************************************************************************************