hsa -------------CUCUGCCUCCCGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGG-UUUGUGUACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGG------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 19:13947101-13947173(-) -27.3 (((((..(((..(((..(((((((((..((((((.....))))))....)))))))))...)))))).))))) ptr -------------CUCUGCCUCCCGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGG-UUUGUGUACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGG------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 19:14233021-14233093(-) -27.3 (((((..(((..(((..(((((((((..((((((.....))))))....)))))))))...)))))).))))) ggo -------------CUCUGCCUCCCGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGG-UUUGUGUACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGG------------------------ ENSEMBL 19:14145420-14145493(-) -27.3 (((((..(((..(((..(((((((((..((((((.....))))))....)))))))))...)))))).))))) ppy -------------CUCUGCCUCCCGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGG-UUUGUGUACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGG------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 19_random:5335658-5335730(-) -27.3 (((((..(((..(((..(((((((((..((((((.....))))))....)))))))))...)))))).))))) mml -------------CUCUGCCUCCCGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGG-UUUGUGCACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGA------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 19:13518238-13518310(-) -26.1 .......(((.((.(((.(((((((((....((((..((....))..))))..))))))))).))).)).))) cja -------------CUCUGCCUCCCGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGG-UUUGUGCACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGGGU---------------------- ENSEMBL Contig258:114160-114235(+) -29.1 ....(((.((.((.(((.(((((((((....((((..((....))..))))..))))))))).))).)).))))) tsy --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mmr ------------------CCUCCGGUGCCUACUGAGCUGAU-AUCAGUUCUCAUUUUACACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1777:599188-599259(+) -27.22 .((((.((.(((.(((((((((..(((((.............))))).))))))))).))).)).)))).. oga ------------------CCUCCGGUGCCUACUGAGCUGAU-AUCAGUUCUCAUUUUACACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2957:381964-382035(+) -27.22 .((((.((.(((.(((((((((..(((((.............))))).))))))))).))).)).)))).. tbe ------------------CCUCCGGUGCCUACUGAGCUGAU-AUCAGUUCUCAUUUUACACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_3146:395092-395163(+) -27.22 .((((.((.(((.(((((((((..(((((.............))))).))))))))).))).)).)))).. cpo -------------------CUCCGGUGCCUACUGAGCUGAU-AUCAGUUCUC-UUGUACACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUC--------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_42:4055060-4055129(-) -27.0 ((((.((.(((.(((((((((..(((((............))))).))))))))).))).)).)))).. dor ----------------UGCCUCCCGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGG-UUUGAUCGCACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGGGU---------------------- ENSEMBL scaffold_59555:10344-10416(+) -29.0 .(((.((.((.(((.(((((((((....((((((((...)))).))))..))))))))).))).)).))))) mmu GCCUCUCUCCGGGCUCCGCCUCCCGUGCCUACUGAGCUGAAA--CAGUUGA-UUCCAGUGCACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUCCAGCCCCC-UAGGAGCUGGCA miRbase UCSC ENSEMBL 8:86732714-86732820(+) -48.9 (((...(((((((((....((((.((.(((.(((((((((..((((..((....))..))))..))))))))).))).)).))))...)))))....))))..))). rno GCCUCUCCCUGGGCUCCGCCUCCUGUGCCUACUGAGCUGAAA--CAGUUGA-UUCCAGUGCACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUCCAGCCCCCAUAGGAGCUGGCA miRbase UCSC ENSEMBL 19:25638430-25638537(-) -53.5 (((.((((..(((((....(((((((.(((.(((((((((..((((..((....))..))))..))))))))).))).)))))))...))))).....))))..))). str ---------------------CCCGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGG-UUCGUGCACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGGGUCA-------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2338:2360-2429(-) -27.7 (((((.(((.(((((((((....((((..((....))..))))..))))))))).))).)).))).... opr ------------------CCUCCGGUGCCUACUGAGCUGAU-AUCAGUUCUCGUUUCACACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_2856:296777-296848(+) -27.22 .((((.((.(((.(((((((((..(((((.............))))).))))))))).))).)).)))).. ocu ------------------CCUCCGGUGCCUACUGAGCUGAU-AUCAGUUCUCGUUUCACACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUG--------------------- ENSEMBL scaffold_57:2942406-2942477(+) -27.22 .((((.((.(((.(((((((((..(((((.............))))).))))))))).))).)).)))).. bta -------------CUCUGCCUCCCGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGA-UUUGUGCACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGG------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 7:10102457-10102528(+) -23.4 ..(((..(((..(((..((((((((....(((((.....)))))......))))))))...)))))).))). ttr -------------CUCUGCCUCCCGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGA-UUUGUGCAGACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAG----------------------- ENSEMBL GeneScaffold_643:72768-72842(-) -28.8 ......((((.((.(((.(((((((((....(((((..........)))))..))))))))).))).)).)))) vpa ------------------CCUCCGGUGCCUACUGAGCUGAU-AUCAGUUCUCAUUUUACACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1313:532627-532698(+) -27.22 .((((.((.(((.(((((((((..(((((.............))))).))))))))).))).)).)))).. ssc -----------GACCCGCCCUCCGGUGCCUACUGAGCUGAU-AUCAGUUCUCAUUUUACACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUCGA------------------- miRbase ENSEMBL 10:26148230-26148309(-) -27.92 ....((..((((.((.(((.(((((((((..(((((.............))))).))))))))).))).)).)))).)). cfa -----------------------CGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGA-UUUGUGCAGACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGG------------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 20:51622100-51622161(+) -23.1 .((.(((.(((((((((....(((((..........)))))..))))))))).))).))... fca ------------------CCUCCGGUGCCUACUGAGCUGAU-AUCAGUUCUCAUUUUACACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_4883:444447-444518(+) -27.22 .((((.((.(((.(((((((((..(((((.............))))).))))))))).))).)).)))).. eca -------------------CUCCGGUGCCUACUGAGCUGAU-AUCAGUUCUCAUUUUACACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAG----------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 23:2317177-2317244(-) -26.32 ((((.((.(((.(((((((((..(((((.............))))).))))))))).))).)).)))) mlu --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- pva -------------CUCUGCCUCCCGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGA-UUUGUGUAGACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAG----------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1489:19805-19879(-) -29.4 ......((((.((.(((.(((((((((....(((((.((....)).)))))..))))))))).))).)).)))) eeu ------------------CCUCCGGUGCCUACUGAGCUGAU-AUCAGUUCUCAUUUUACACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_5001:199203-199274(+) -27.22 .((((.((.(((.(((((((((..(((((.............))))).))))))))).))).)).)))).. sar ------------------CCUCCGGUGCCUACUGAGCUGAU-AUCAGUUCUCGUUUCACACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_4066:339283-339354(+) -27.22 .((((.((.(((.(((((((((..(((((.............))))).))))))))).))).)).)))).. cho ------------------CCUCCGGUGCCUACUGAGCUGAU-AUCAGUUCUCAUUUCACACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUC--------------------- ENSEMBL GeneScaffold_4526:116299-116370(+) -27.22 .((((.((.(((.(((((((((..(((((.............))))).))))))))).))).)).)))).. ete --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- laf -------------CUCUGCCUCCCGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGA-UUUGUGCAGACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAG----------------------- ENSEMBL scaffold_26:29291371-29291445(+) -28.8 ......((((.((.(((.(((((((((....(((((..........)))))..))))))))).))).)).)))) pca -------------CUCUGCCUCCUGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGA-UUUGUGCAGACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGG------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_3049:48277-48349(-) -28.7 ........(((((.(((.(((((((((....(((((..........)))))..))))))))).))).))))) meu -------------CUCUGCCUCCUGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGC-UUUGUAUAAACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGG------------------------- ENSEMBL GeneScaffold_4142:29728-29800(-) -28.9 ........(((((.(((.(((((((((....(((((..........)))))..))))))))).))).))))) mdo -----------------GCCUCCUGUGCCUACUGAGCUGAAACACAGUUGC-UUUGGAUAAACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUCU-------------------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:446526144-446526216(+) -34.2 ..(((((((.(((.(((((((((....(((((..........)))))..))))))))).))).)))))))... oan --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- gga ------------------CCUCCGGUGCCUACUGAGCUGAU-AUCAGUUCUGAUUUUACAUACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAG----------------------- UCSC ENSEMBL Z:41158174-41158243(+) -27.9 .((((.((.(((.(((((((((..(((((..((......)).))))).))))))))).))).)).)))) mga ------------------CCUCCGGUGCCUACUGAGCUGAU-AUCAGUUCUGAUUUUACACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAG----------------------- UCSC ENSEMBL Z:18235985-18236054(+) -27.7 .((((.((.(((.(((((((((..(((((..((......)).))))).))))))))).))).)).)))) tgu ------------------CCUCCGGUGCCUACUGAGCUGAU-AUCAGUUCUGAUUUUACACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAG----------------------- ENSEMBL Z:9899770-9899839(-) -27.7 .((((.((.(((.(((((((((..(((((..((......)).))))).))))))))).))).)).)))) aca ---------------UGGCCUUCCGUGCCUACUGAGCUGAUACUCAGUUGC-UUUAGAUAAACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUCCA------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_2:12610592-12610668(-) -30.4 .((.((((.((.(((.(((((((((...((((((..........)))))).))))))))).))).)).)))).)). xtr -------------------CUCUUGUGCCUACUGAACUGAU-AUCAGUUCU-AUUUCACACACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUC--------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_122:2025091-2025160(+) -28.9 (((((((.(((.(((((((((..(((((............))))).))))))))).))).))))))).. dre -----------GGGCUGGUCUCCUGUGCCUGCUGUGCUGAUAAUCAGUGGA--CGGCUGUGACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGGGCCUGGUC---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 3:9701534-9701615(+) -40.7 .((((((.(((((((.(((((((.(((((...(((((...........))))).))))).))))))).))))))).)))))) gac ------------------CCUCCCGUGCCUACUGAACUGGU-AUCAGUGUUUUUUCUAAAAACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAG----------------------- UCSC ENSEMBL groupVIII:13312716-13312785(-) -27.7 .((((.((.(((.(((((((((..(((((.(((.....))).))))).))))))))).))).)).)))) ola --------------------UCCUGUGCCUACUGAGCUGAUUAUCAGUCCU-AUAGAAC-CACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUC--------------------- UCSC ENSEMBL 9:8309636-8309704(-) -29.2 ((((((.(((.(((((((((...(((((...........))))).))))))))).))).))))))... tru --------------------UCCUGUGCCUACUGAGCUGAUAUGCAGUUG--UACAGAACCACUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGAGUC--------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_11:1590454-1590522(+) -30.6 ((((((.(((.(((((((((....((((.((.....)).))))..))))))))).))).))))))... tni -----------GGGUCAGUCUCCUGUGCCUGCUGUGCUGAUAAUCAGUGUG--UGACGUUGGCUGGCUCAGUUCAGCAGGAACAGGGGACUGG------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 3:8971059-8971138(+) -43.3 ....(((((((((((.(((((((.(((((...(((((...........))))).))))).))))))).))))))))))). cin --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ****** *** *** **** ************************ ****** *** **** **** ************************* *** **************** **** * ************************* *** **************** **** * ************************* **** **************** ***** * ************************* **** **************** ***** * ************************* **** **************** ***** * ************************* **** **************** ***** ** * ************************* **** **************** ***** ** * ************************* ***** **************** ***** ** * ************************* * ***** **************** ***** ** * ************************* * ***** **************** ***** ** * ************************* * ***** **************** ***** ** *************************** * ***** **************** ***** ** ***************************** ***** **************** ***** ** * ****************************** ***** **************** 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