hsa ------GGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCC----- miRbase UCSC ENSEMBL 7:99691183-99691266(-) -37.6 ((((((((((.((.(((((....((.(((....))).))..))))))).))))))(((((.(((.......)))))))).)))) ptr ------GGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGCUGAGACGCGCCCGCC----- miRbase UCSC ENSEMBL 7:99946670-99946753(-) -33.2 ((((((((((.((.(((((....((.(((....))).))..))))))).))))))).....(((((....)))))..))).... ggo ------GGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCC----- miRbase -37.6 ((((((((((.((.(((((....((.(((....))).))..))))))).))))))(((((.(((.......)))))))).)))) ppy ------GGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCC----- miRbase UCSC ENSEMBL 7:9078853-9078936(-) -37.6 ((((((((((.((.(((((....((.(((....))).))..))))))).))))))(((((.(((.......)))))))).)))) mml ------GGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCC----- miRbase UCSC ENSEMBL 3:47372723-47372806(-) -37.6 ((((((((((.((.(((((....((.(((....))).))..))))))).))))))(((((.(((.......)))))))).)))) cja GGGACUGGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCCCA--- ENSEMBL Contig329:748907-748999(+) -41.3 (((.((((.((.((((...((((.(((((..(((((((.(((((.......))..)))))))).)).))))).)))))))).))))))))). tsy ------GGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUGGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUCGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCC----- ENSEMBL GeneScaffold_6327:4652-4736(-) -39.8 ((((.((..((..((((.(((((....((((((.((((........)))).))))))....))))).))))..))..)).)))) mmr ----------------------------------------------------------------------------------------------- oga GGGACUGGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCCCA--- ENSEMBL scaffold_84374:43444-43536(+) -41.3 (((.((((.((.((((...((((.(((((..(((((((.(((((.......))..)))))))).)).))))).)))))))).))))))))). tbe GGGACUGGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCCCA--- ENSEMBL GeneScaffold_1134:96135-96227(-) -41.3 (((.((((.((.((((...((((.(((((..(((((((.(((((.......))..)))))))).)).))))).)))))))).))))))))). cpo GGGACUGGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCCCU--- UCSC ENSEMBL scaffold_30:4036337-4036429(+) -40.8 (((.((((.((.((((...((((.(((((..(((((((.(((((.......))..)))))))).)).))))).)))))))).))))))))). dor ----------------------------------------------------------------------------------------------- mmu ------GGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCC----- miRbase UCSC ENSEMBL 5:138606549-138606632(-) -37.6 ((((((((((.((.(((((....((.(((....))).))..))))))).))))))(((((.(((.......)))))))).)))) rno ------GGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACACGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCC----- miRbase UCSC ENSEMBL 12:17607970-17608053(-) -36.9 ((((.((..((..((((.((((((.(((((((.(((((.......))..)))))))).)))))))).))))..))..)).)))) str ------GGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGUUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCC----- ENSEMBL GeneScaffold_4329:18827-18911(-) -36.0 ((((.((..((..((((.(((((..(((((((.(((((.......))..)))))))).)).))))).))))..))..)).)))) opr ------GGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCCGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCC----- ENSEMBL GeneScaffold_2800:180244-180328(-) -37.2 ((((.((..((..((((.(((((..(((((((.(((((........)).)))))))).)).))))).))))..))..)).)))) ocu GGGACUGGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCCCU--- ENSEMBL scaffold_144:103159-103251(+) -40.8 (((.((((.((.((((...((((.(((((..(((((((.(((((.......))..)))))))).)).))))).)))))))).))))))))). bta ------GGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCCGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCC----- miRbase UCSC ENSEMBL 25:38455975-38456058(+) -37.2 ((((.((..((..((((.(((((..(((((((.(((((........)).)))))))).)).))))).))))..))..)).)))) ttr GGGACUGGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCCCC--- ENSEMBL GeneScaffold_685:111324-111416(-) -40.4 (((.((((.((.((((...((((.(((((..(((((((.(((((.......))..)))))))).)).))))).)))))))).))))))))). vpa ------GGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCA--UGCUGGCCGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCC----- ENSEMBL GeneScaffold_2620:4158-4240(-) -37.7 ((((.((..((..((((.(((((..((((((((((((....)))...)))).))).)).))))).))))..))..)).)))) ssc ----------------------------------------------------------------------------------------------- cfa -------------------AGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCC-GCGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA---------------- miRbase UCSC ENSEMBL 6:12505745-12505803(+) -25.0 ((((.(((((..((((((((((.((......)).))).))))).)).))))).)))).. fca ------GGCCAGCGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCC-GCGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCC----- ENSEMBL GeneScaffold_996:170464-170547(-) -39.1 ((((.((((((..((((.(((((..((((((((((.((......)).))).))))).)).))))).))))..)))))).)))) eca ------GGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCC----- miRbase UCSC ENSEMBL 13:8034246-8034329(-) -37.6 ((((((((((.((.(((((....((.(((....))).))..))))))).))))))(((((.(((.......)))))))).)))) mlu GGGACUGGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCCCC--- ENSEMBL GeneScaffold_4456:12592-12684(-) -40.4 (((.((((.((.((((...((((.(((((..(((((((.(((((.......))..)))))))).)).))))).)))))))).))))))))). pva GGGACUGGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCCCC--- ENSEMBL GeneScaffold_2077:189724-189816(-) -40.4 (((.((((.((.((((...((((.(((((..(((((((.(((((.......))..)))))))).)).))))).)))))))).))))))))). eeu ------GGCCAGCGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCC-GGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCC----- ENSEMBL GeneScaffold_6502:4792-4875(-) -38.3 ((((.((((((..((((.(((((..(((((((.(((((.......)).)))))))).)).))))).))))..)))))).)))) sar GGGACUGGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCCCC--- ENSEMBL GeneScaffold_5416:10861-10953(-) -40.4 (((.((((.((.((((...((((.(((((..(((((((.(((((.......))..)))))))).)).))))).)))))))).))))))))). cho ----------------------------------------------------------------------------------------------- ete GGGACUGGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCCCA--- ENSEMBL GeneScaffold_6516:47055-47147(-) -41.3 (((.((((.((.((((...((((.(((((..(((((((.(((((.......))..)))))))).)).))))).)))))))).))))))))). laf GGGACUGGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGGACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCCCA--- ENSEMBL scaffold_152:713615-713707(+) -41.3 (((.((((.((.((((...((((.(((((..(((((((.(((((.......))..)))))))).)).))))).)))))))).))))))))). pca ------GGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGCACGCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCC----- ENSEMBL GeneScaffold_5645:5184-5268(-) -35.9 ((((.((..((..((((.(((((..(((((((.(((((.....))....)))))))).)).))))).))))..))..)).)))) meu ----------------------------------------------------------------------------------------------- mdo ------GGCCAGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCUGAACUCUGCCCUGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCUGGC------ miRbase UCSC ENSEMBL 2:257690280-257690362(+) -37.8 .(((((((((.((.(((((((..((.(((....))).))))))))))).))))))(((((.(((.......)))))))).))) oan ----------------------------------------------------------------------------------------------- gga ----------------------------------------------------------------------------------------------- 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.(((..((((.(((((..(((((((.((((((...)))....)))))))).)).))))).))))..)))....... tru -------------GUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCCGGCCAUCACAGAGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGCACAGCU UCSC ENSEMBL scaffold_5:2013098-2013180(-) -28.6 ((((...((((.(((((.((((((.(((..(((.((...)).)))...))).)))))).))))).....))))....)))). tni -------GCUGGUGUUGAGAGGCGGAGACUUGGGCAAUUGCCGGCCAUCACAGAGGGCAUUGCACUUGUCUCGGUCUGACAGUGCCGGC------ miRbase UCSC ENSEMBL 1:5569529-5569610(-) -38.42 (((((..(((..((((.(((((..(((((((.(((.............)))))))).)).))))).))))..)))..))))) cin ----------------------------------------------------------------------------------------------- csa ----------------------------------------------------------------------------------------------- dme ----------------------------------------------------------------------------------------------- cel ----------------------------------------------------------------------------------------------- **** ***** * *** ** * ********** ******* ********** ***** 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