hsa GGCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGCAAUAGU-AAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUGCACGUUGUGGGGCCC miRbase UCSC ENSEMBL 1:9211727-9211836(-) -50.7 ((((.((((((((..(((((..(((((((((((.((((((((((....((....)).....))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))..))..)))). ptr GGCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGCAAUAGU-AAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUGCACGUUGUGGGGCCC miRbase UCSC ENSEMBL 1:9263128-9263237(-) -50.7 ((((.((((((((..(((((..(((((((((((.((((((((((....((....)).....))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))..))..)))). ggo GGCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGCAAUAGU-AAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUGCACGUUGUGGGGCCC miRbase -50.7 ((((.((((((((..(((((..(((((((((((.((((((((((....((....)).....))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))..))..)))). ppy GGCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGCAAUAGU-AAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUGCACGUUGUGGGGCCC miRbase UCSC ENSEMBL 1:221288574-221288683(+) -50.7 ((((.((((((((..(((((..(((((((((((.((((((((((....((....)).....))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))..))..)))). mml GGCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGCAAUAGU-AAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUACACAUUGUGGGGCCU miRbase UCSC ENSEMBL 1:12202771-12202880(-) -51.8 ((((.((((((((..(((((..(((((((((((.((((((((((....((....)).....))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))..))..)))). cja --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- tsy --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mmr GGCCGGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGAAAU-GCAAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUGCACGCUGUGGG---- ENSEMBL GeneScaffold_3913:60934-61040(-) -46.03 ...((((.(((((..(((((..(((((((((((.((((((((((.................))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))))).... oga GGCCGGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGUAAUAGUGAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUGCACGCUGAGGGGCC- ENSEMBL GeneScaffold_2096:193209-193319(-) -49.57 (((((((.(((((..(((((..(((((((((((.((((((((((..................))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))))....)))) tbe --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cpo GGCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGUAUUGGUGCAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUGCACGUUGUGGG---- UCSC ENSEMBL scaffold_25:24334333-24334440(+) -46.6 ...((((.(((((..(((((..(((((((((((.((((((((((....(((....)))....))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))))).... dor GGCCAUCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGUAUCAAUGAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCUCUAGAAGUGCUGCACGUUGUCU----- ENSEMBL scaffold_55628:947-1053(-) -40.87 (((....((((((..(((((..(((((((((((.((((((((((..................))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))..))). mmu --CCAGCUGUGAGUAAUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGUAUUAGCUAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUGCACAUUGU------- miRbase UCSC ENSEMBL 4:149442563-149442664(+) -43.3 .(((.((((((((.((((..(((((((((((.((((((((((...(((....))).....))))))))))))).))))))))..)))).)))).))))))). rno --CCGGCUGUGAGUAAUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGUAUUAGCUAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUGCACGUUGU------- miRbase UCSC ENSEMBL 5:167187897-167187998(+) -43.9 .((((.(((((((.((((..(((((((((((.((((((((((...(((....))).....))))))))))))).))))))))..)))).)))).))))))). str GGCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGUAAUAGUGAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUGCACGUUGUUGGGCC- ENSEMBL GeneScaffold_2325:281614-281724(-) -49.07 (((((((((((((..(((((..(((((((((((.((((((((((..................))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))..))).)))) opr --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ocu --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- bta GGCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGUAAUAAUGCAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUGCACGUUGUGGG---- miRbase UCSC ENSEMBL 16:41392736-41392842(+) -46.3 ...((((.(((((..(((((..(((((((((((.((((((((((....(((....)))....))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))))).... ttr GGCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGUAAUAAUGAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUGCACGUUGU------- ENSEMBL scaffold_112635:58074-58178(-) -44.27 ...((((.(((((..(((((..(((((((((((.((((((((((..................))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))))). vpa --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ssc ---------------UUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGUAAUAGCAAAGGAAGCAAUCAGCA-GCAUCCUGCCCUAGAACA------------------- miRbase -24.2 .((((..(((((.((((..((((((((((.((........)).....)))))))))))).)).)))))..)))).. cfa ---------------------UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGUAAUAGUGAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUA------------------------ miRbase UCSC ENSEMBL 5:65484406-65484471(-) -27.07 .(((((((((((.((((((((((..................))))))))))))).))))))))... fca --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- eca --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- mlu GGCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGUCAUAAUGAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAAUGCUGCACCUUGUUGGGC-- ENSEMBL GeneScaffold_260:4897-5006(-) -50.2 ..(((((.((((((((((((..(((((((((((.((((((((((.....((.....))....))))))))))))).))))))))..))))))))).)))...))))).. pva --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- eeu --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- sar --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cho GGCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGUAAUAGUGAAGGAAGCAAUCAGCAAGUCUACUGCCCUAGAAGUGCGGCACGUUG-------- ENSEMBL scaffold_241332:673-776(-) -38.67 ...((((.(((.((..((((..(((((((.(((.((((((((((..................)))))))))))))..)))))))..))))..))..))))))) ete --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- laf GGCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGUAAUAGUGAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUUCACGUUG-------- ENSEMBL scaffold_26:13394642-13394745(+) -43.67 ...((((.(((((..(((((..(((((((((((.((((((((((..................))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))))) pca -----GCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGUAAUAGUGAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUGCACGUUG-------- ENSEMBL scaffold_43286:8615-8713(-) -41.27 ...(((((..(((((..(((((((((((.((((((((((..................))))))))))))).))))))))..)))))..)).))).... meu GGCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGUAAUACAUGAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUACACGUUGU------- ENSEMBL Scaffold5537:24668-24772(+) -44.27 ...((((.(((((..(((((..(((((((((((.((((((((((..................))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))))). mdo GGCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGUAAUAGAUAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUGCACGUUGUUAGGCCC miRbase UCSC ENSEMBL 4:433575257-433575367(+) -49.87 (((((((((((((..(((((..(((((((((((.((((((((((..................))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))..))).)))). oan --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- gga -GCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGCAAUAGUUAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUACACAUUGUUGGGCC- miRbase UCSC ENSEMBL 21:3251514-3251622(-) -50.6 .(((((((((((..(((((..(((((((((((.((((((((((...(((....))).....))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))..)))))... mga -GCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGCAAUAGUUAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUACACAUUGUUGGGCC- UCSC ENSEMBL 23:3469177-3469286(-) -50.6 .(((((((((((..(((((..(((((((((((.((((((((((...(((....))).....))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))..)))))... tgu -----------AGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGCAAUAGUCAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGC---------------------------- miRbase ENSEMBL 21:5249928-5249999(+) -25.0 ............((((((((((.((((((((((.(((.......)))....))))))))))))).))))))) aca -----GCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGCGCAGUGAUUGAGGAAGCAAUCAGCAAGAAUACUGCCCCAGAAGUGCUGCACG----------- UCSC ENSEMBL scaffold_996:95768-95863(-) -41.2 ...(((((..(((((..(((((((((((.((((((((((.....(((...)))....))))))))))))).))))))))..)))))..)).))). xtr ------CUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGGCACGUUAUAGAAGUAGCAAUCAGCAAAUAUACUGCCCUAGAAGUUCUGCACAUU--------- miRbase UCSC ENSEMBL scaffold_207:56384-56479(+) -36.19 .((((((..(((((..((((((((.((.(((((((((((................))))))))))).)).))))))))..)))))..)).)))).. dre -----GCUGUGAGUGGUUCUCUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGUGGAGUGA-GAACGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCGCAGAAACUC----------------- UCSC ENSEMBL 23:22084410-22084498(+) -36.9 .....((((..((((.((((((((((((.((((((((((.(((.........))).))))))))))))).))))))))).)))))))) gac -----GCUGUGGGUGUUUCUCUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGGAGUGA-GAACGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCGCAGAAAC------------------- UCSC ENSEMBL groupXII:9931607-9931693(-) -34.8 .........((((((.((((((((((((.((((((((((.......((....))..))))))))))))).))))))))).)))))) ola -----GCUGUGGGUGUUUCUCUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGGAGUGA-GAACGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCGCAGAAAU------------------- UCSC ENSEMBL 7:10606086-10606172(-) -33.7 .........((((((.((((((((((((.((((((((((.......((....))..))))))))))))).))))))))).)))))) tru ------CUGUGGGUGUUUCUCUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGGAGUGA-GAACGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCGCAGAAAU------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_20:268843-268928(+) -33.7 ........((((((.((((((((((((.((((((((((.......((....))..))))))))))))).))))))))).)))))) tni ------CUGUGGGUGUUUCUCUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGGAGUGA-GAACGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCGCAGAAAC------------------- UCSC ENSEMBL 9:2828348-2828433(-) -34.8 ........((((((.((((((((((((.((((((((((.......((....))..))))))))))))).))))))))).)))))) cin --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ************************** * * *********** * **** **** ************************** * * * *************** ******* * ** **** ************************** * * * * ************************ **** ***** ** **** **************************** * * * ************************ **** ***** ******** **************************** * * * ************************ **** ***** ******** **************************** * * ** ************************ **** ******************************************* * * **************************** **** * ******************************************** * * ********************************* * * ******************************************** * * ********************************* * * *** ******************************************** * ** ************************************** *** * ******************************************** * ** ************************************** *** ** ** ******************************************** **** * ************************************** *** *** ** ******************************************** ****** ************************************** *** *** *** ******************************************** ****** ****************************************** *** ************************************************ ****** *********************************************** ************************************************* ****** *********************************************** ******************************************************************************************************** ******************************************************************************************************** ******************************************************************************************************** * ******************************************************************************************************** ** ******************************************************************************************************** ** ******************************************************************************************************** **** ******************************************************************************************************** ***** ************************************************************************************************************** ************************************************************************************************************** ************************************************************************************************************** ************************************************************************************************************** *************************************************************************************************************** *************************************************************************************************************** *************************************************************************************************************** *************************************************************************************************************** ***************************************************************************************************************