hsa ---CCUGUGCCAUAUGGCAGACUGUGAUUUGUUGUCGAUUUAGUUAUCUAAAAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCACACAGA----------         UCSC ENSEMBL 9:86584677-86584756(+)             -29.1       .(((((.....(((.(((((((((((((((((...(((((....))))).))))).))))))).))))).)))))))).      
ptr --------------------------------------------------------------------------------------------                      
ggo --------ACCAUUAGGCAGACUGGGAUUUGUUGUUGAGC-GCAGUA-AGACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGAUGGG----------              ENSEMBL 15:68566274-68566346(-)            -30.5          .(((((.((.(((((((((((((((((((............))))))).))))).))))))).)).))))).          
ppy ------GCACCAUUAGGCAGACUGGGAUUUGUUGUUGAGC-GCAGUA-AGACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGACGGGGC--------         UCSC ENSEMBL 15:85252433-85252509(-)            -27.4        ((.((.((.((.(((((((((((((((((((............))))))).))))).))))))).)).)).)).))        
mml --------------------------------------------------------------------------------------------                      
cja --------------------------------------------------------------------------------------------                      
tsy --------------------------------------------------------------------------------------------                      
mmr --------------------------------------------------------------------------------------------                      
oga -----CGCACCAUGCGGCAGACUGGGACUUGUUGUUGAGC-ACAGUA-AGACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGAUGGAGC--------              ENSEMBL GeneScaffold_3901:939607-939684(-) -28.1        .((.((((..((.(((((((((.(((((((((............)))))))))..)).))))))).))..)))).))       
tbe --------------------------------------------------------------------------------------------                      
cpo ---------CUGUGCGGCAGACUGGGACUUGUUGUUGGGC-ACAGUG-AGACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGACAGG----------         UCSC ENSEMBL scaffold_10:35249129-35249200(+)   -27.4           ((((..((.(((((((((.(((((((((..((...))...)))))))))..)).))))))).))..)))).          
dor -----GGCUCCGUGCGGCAGACUGGGAUUUGUUGUUUAAC-AGAGAG-ACACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGACAGAGCCG------              ENSEMBL scaffold_10374:46959-47038(-)      -31.74       (((((.((..((.((((((((((((((((((..............)))))).))))).))))))).))..)).))))).      
mmu -------CACCAUGUGGCAGACUGGGACUUGUUGUUGGAU-ACAGAG-ACACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAAACGGGGC--------         UCSC ENSEMBL 7:86033140-86033215(-)             -27.3         ..((...(((.(((((((((.(((((((((............)))))))))..)).))))))).)))....))..        
rno -----AACACCAUGUGGCAGACUGGGACUUGUUGUUGGAC-ACAG---ACACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGACAGGGCUGGU----         UCSC ENSEMBL 1:134607239-134607318(-)           -27.0       ..((((.(((((.(((((((((.(((((((((..........)))))))))..)).))))))).))..))).)).))..      
str -----AGCACCAUGCGGCAGACUGGGACUUGUUGUUGAGA-G--GUG-AAACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGAUGGGGC--------              ENSEMBL GeneScaffold_4723:124616-124691(-) -28.2         .((.((((..((.(((((((((.(((((((((..........)))))))))..)).))))))).))..)))).))        
opr ---CCAGCAUCGUGUGGCAGACUGGGACUUGUUGCUGGGC-AUAGUA-AGACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGACAGGGCUG------              ENSEMBL scaffold_7075:59820-59901(-)       -28.8      .((((...((.(((.(((((((((.((((((.((............)).))))))..)).))))))).))).))...))))     
ocu --------------------------------------------------------------------------------------------                      
bta -----AGCACCAUGCGGCAGACUGGGACUUGUUGUUGAGC-GCAGG--AGACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGAUGGGGC--------         UCSC ENSEMBL 21:19210155-19210231(-)            -28.1        .((.((((..((.(((((((((.(((((((((...........)))))))))..)).))))))).))..)))).))        
ttr -----GGCACCAUGCGGCAGACUGGGACUUGUUGUUGAGC-GCAGGG-AGACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGAUGGGGC--------              ENSEMBL scaffold_114290:37885-37962(-)     -27.8        .((.((((..((.(((((((((.(((((((((............)))))))))..)).))))))).))..)))).))       
vpa --------------------------------------------------------------------------------------------                      
ssc -----GGCACCAUGCGGCAGACUGGGACUUGUUGUUGAGC-GCAGUG-AGACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGAUGGGGC--------              ENSEMBL 1:200316400-200316477(+)           -27.8        .((.((((..((.(((((((((.(((((((((............)))))))))..)).))))))).))..)))).))       
cfa ---------CCAUGUGGCAGACUGGGACUUGUUGUUGGAU-GCAGUG-AGACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGAUG------------         UCSC ENSEMBL 3:54663924-54663993(-)             -27.3            .(((.(((.(((((((((.(((((((((............)))))))))..)).))))))).))).)))           
fca --------ACCAUGAGGCAGACUGGGACUUGUUGUUGGGU-GCAGCG-AAACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGAUGGG----------              ENSEMBL GeneScaffold_4195:35472-35544(-)   -28.2          .((((..((.(((((((((.(((((((((............)))))))))..)).))))))).))..)))).          
eca --------------------------------------------------------------------------------------------                      
mlu ---------CCAUGCGGCAGACUGGGACUUGUUGCUG-AU-GCAGCG-AGACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAUAUGGG----------              ENSEMBL GeneScaffold_4805:89991-90061(-)   -27.9           (((((.((.(((((((((((((((((....))))))))............)).))))))).)).))))).           
pva --------------------------------------------------------------------------------------------                      
eeu --------------------------------------------------------------------------------------------                      
sar --------------------------------------------------------------------------------------------                      
cho --------------------------------------------------------------------------------------------                      
ete --------------------------------------------------------------------------------------------                      
laf -------CACCAUACGGCAGACUGGGACUUGUUGUUGAACGGUAAUG-AGACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGAUGGG----------              ENSEMBL scaffold_28:18401618-18401692(+)   -27.0         ..((((..((.(((((((((.(((((((((..((....))...)))))))))..)).))))))).))..)))).         
pca ---------CCGUGCGGCAGACUGGGAUUUGUUGUUGAACUGUAGUG-AGACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGAUGGG----------              ENSEMBL scaffold_27362:17032-17104(-)      -28.7          ((((..((.(((((((((((((((((((.((....))....))))))).))))).))))))).))..)))).          
meu --------ACCAUGAGGCAGACUGGGAUUUGUUGUCAAUCUUUAUGUUAGAGAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGAUGGG----------              ENSEMBL Scaffold19082:20726-20800(+)       -28.8         .((((..((.(((((((((((((((((...((((((...))))))))))).))))).))))))).))..)))).         
mdo --------ACCAUAAGGCAGACUGGGAUUUGUUGUCAAUCUUUACGUUAGAGAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGAUGGG----------         UCSC ENSEMBL 1:123558717-123558791(+)           -29.2         .((((..((.(((((((((((((((((...((((((...))))))))))).))))).))))))).))..)))).         
oan --------------------------------------------------------------------------------------------                      
gga GGCCGUGCGCCCUAAGGCAGACUGUGACUUGUUGUGGUGGGAUGAGCCAUACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGAGGGCACCGCGGCC- miRbase UCSC ENSEMBL 10:14823529-14823619(+)            -48.7 (((((((.(((((..((.(((((((((.(((((((.((((......))))...)))))))..)))).))))).))..)))))..)))))))
mga GGCCGUGCGCCCUAAGGCAGACUGUGACUUGUUGUGGUGGGAUGAGCCAUACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAGAGGGCACCGCGGCC-         UCSC ENSEMBL 12:13590106-13590197(+)            -48.7 (((((((.(((((..((.(((((((((.(((((((.((((......))))...)))))))..)))).))))).))..)))))..)))))))
tgu GGCCGUGUGCCCUAGGGCAGACUGUGACUUGUUGUGGUGGGAUGAGCCAUACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCACAGGGAAGC-------              ENSEMBL 10:13221449-13221534(+)            -33.2    ....((...((((..((.(((((((((.(((((((.((((......))))...)))))))..)))).))))).))..))))..))   
aca GGCCAGGCCCCAUAAGGCAGACUGUGACUUGUUGUCGUGAGAUGAACUACAGAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCAUAAGAAGCAGGGCA--         UCSC ENSEMBL scaffold_1167:159667-159757(+)     -29.0 .(((..((....((.((.(((((((((.(((((((..((((.....)).))..)))))))..)))).))))).)).))....))..))). 
xtr ----GGGCACUGUGAGGCAGACUGUGACUUGUUGUCAUGCAAUAAGGCUUACAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCACAAAGAGUCAGCCUGC         UCSC ENSEMBL scaffold_22:1242948-1243036(-)     -27.4  (((((((.((.((.(((((((((.(((((((...((......)).....)))))))..)))).))))).)).))...)))..))))..  
dre --------------------------------------------------------------------------------------------                      
gac --------------------------------------------------------------------------------------------                      
ola -------UGCCGUUUGGCAGACUGUGAUUUGUUGUCGGUUAAUCUAACUAAAAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCACACAGCAG--------         UCSC ENSEMBL 9:10099937-10100014(+)             -28.2        (((.((.(((.(((((((((((((((((.(((((...)))))....))))).))))))).))))).))).)).))).       
tru ---------CUGUUUGGCAGACUGUGAUUUGUUGUCAGUUGAUCUAACUAAAAACAACAAAAUCACUAGUCUUCCACACAGC----------         UCSC ENSEMBL scaffold_11:607854-607927(-)       -27.1          ((((.(((.(((((((((((((((((.(((((...)))))....))))).))))))).))))).))).)))).         
tni --------------------------------------------------------------------------------------------                      
cin --------------------------------------------------------------------------------------------                      
csa --------------------------------------------------------------------------------------------                      
dme --------------------------------------------------------------------------------------------                      
cel --------------------------------------------------------------------------------------------                      
                *  ********* ** ******                * ************************ *              
             *  *  ********* ** ******                * ************************ *              
             *  *  ********* ** *******               * ************************ *  *           
             ** *  ********* ** *******               * ************************ *  *           
             ** *  ********* ** *******             * * ************************ *  *           
             ** *  ********* ** ******* *           * * ************************ *  *           
             ** *  ********* ** ******* *           * ************************** *  *           
             ** *  ********* ** ******* *           * ************************** *  *           
             ** *  ************ ******* *      *    * **************************** **           
             ** *  ******************** *      *    * **************************** **           
             ****  **********************      *    * **************************** **           
             ***** **********************      **   * **************************** ***          
           ******* ********************** **   **   * **************************** ***          
          ******** ********************** ** * **   ****************************** ***          
          ******** ************************* * **   ********************************** *        
          ******** ************************* **** * ************************************        
          ******** ************************* **** * ************************************        
          ********************************** ****** ************************************        
          ********************************** ****** ************************************        
          ********************************** ****** ************************************        
          ********************************** *******************************************        
       *  ****************************************************************************** *      
       * *********************************************************************************      
    **************************************************************************************      
    ****************************************************************************************    
    ******************************************************************************************* 
    ********************************************************************************************