hsa --------------GGGUCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUCA-AGCUGGGAAAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCUCACAGGGGCCC-------------------- UCSC ENSEMBL 1:1103245-1103331(-) -41.5 (((((.(((.(((.((((.(((((.(((((((((.((.((......))...)).))))))))).))))))))).))).))))))))
ptr -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ggo --------------GGGUCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUCA-AGCUGGGAAAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCUCACAGGGGCCC-------------------- ENSEMBL 1:1055680-1055766(-) -41.5 (((((.(((.(((.((((.(((((.(((((((((.((.((......))...)).))))))))).))))))))).))).))))))))
ppy ---CGGCGAGCGGUGGGUCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUCA-AGCUGGGAAAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCUCACAGGGGCCC-------------------- UCSC ENSEMBL 1:229422402-229422499(+) -41.5 ...........(((((.(((.(((.((((.(((((.(((((((((.((.((......))...)).))))))))).))))))))).))).))))))))
mml -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cja -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tsy -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mmr -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
oga ---------------GGUCACCUGUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGCUG-AGUGGAGAAAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCCCACAGAGACCCAGG----------------- ENSEMBL GeneScaffold_5019:10310-10398(-) -40.3 ((((..(((((..((((.(((((.((((((((..........((((....)))))))))))).)))))))))..))))).))))....
tbe ----------------GCCAC-UUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGCC---GUUGAGAAGUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCCCACAGGGGCCCAGG----------------- ENSEMBL GeneScaffold_3701:76050-76134(-) -30.9 (((.((.((..((((.(((((.(((((((((.((............)).))))))))).)))))))))..)).)).))).....
cpo -------------UGGGUCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUCA-AGCCAAGAAAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCCCACAGAGGCCCAGGU---------------- UCSC ENSEMBL scaffold_186:1149686-1149777(+) -35.9 ((((((..((.((..((((.(((((.(((((((((.((.((.......))..)).))))))))).)))))))))..)).)).))))))...
dor --------------GGGUCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUCG-AGCCGAGAAAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCCCACAGAUGCCCAGG----------------- ENSEMBL scaffold_7421:19301-19390(+) -34.7 (((.((.((.((..((((.(((((.(((((((((.((.((.......))..)).))))))))).)))))))))..)).)).)))))...
mmu -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
rno CUUCGGCGAGUGUUGGGUCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUCA-AGCCAAGAAAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCCCACAGAGGCCCAGGUAUGCUUUGGUAGGAAG miRbase UCSC ENSEMBL 5:172898207-172898326(+) -41.4 ((((.((((((((((((((..((.((..((((.(((((.(((((((((.((.((.......))..)).))))))))).)))))))))..)).)).))))))...))))))..))..))))
str ---CGGCGAGUGGUGGGUCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUUG-AGCCAAGAAAUCCAGCACUGUCUGGUAAGAUGCCCACAGAGGCCCAGGUGCAC------------ ENSEMBL scaffold_150529:3890-3995(+) -42.6 ..(((.....((((((..((.((..((((.(((((((((((((((.((.((......))...)).)))))))))))))))))))..)).)).))))))..)))..
opr -------------UGGGUCACCUU-GAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUCG-AGCCAAGAAAUCCAGCACUGUCCAGUAAGAUGCCCACAGAGGCCC-------------------- ENSEMBL GeneScaffold_3407:31080-31166(-) -29.0 .(((((..((((..((((.((((..(((((((((.((.((.......))..)).)))))))))..))))))))..)).)).)))))
ocu -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
bta ---CGGCGGGUGGUGGGUCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUCG-AGCCGAGAAAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGUCCACAGAGGCCCCGGUGC-------------- UCSC ENSEMBL 16:48594348-48594451(+) -40.3 ......(((.((((...((((((.(((((.(((((.(((((((((.((.((.......))..)).))))))))).))))))))))...)))))).)))).)))
ttr -------------UGGGUCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUCG-AGCCGAGAAAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCCCACAGAGGCCCAGGU---------------- ENSEMBL GeneScaffold_2240:50787-50878(-) -36.6 ((((((..((.((..((((.(((((.(((((((((.((.((.......))..)).))))))))).)))))))))..)).)).))))))...
vpa -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ssc -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cfa -------------UGGGUCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUCA-AGCCAAGAAAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCCCACAGAGGCCCAGGU---------------- UCSC ENSEMBL 5:59370254-59370345(-) -35.9 ((((((..((.((..((((.(((((.(((((((((.((.((.......))..)).))))))))).)))))))))..)).)).))))))...
fca -------------UGGGUCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUCA-AGCCAAGAAAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCCCACAGAGGCCCAGGU---------------- ENSEMBL GeneScaffold_5080:328086-328177(-) -35.9 ((((((..((.((..((((.(((((.(((((((((.((.((.......))..)).))))))))).)))))))))..)).)).))))))...
eca -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mlu -------------UGGGUCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUCG-AGCCGAGAAAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCCCACAGAGGCCCAG------------------ ENSEMBL GeneScaffold_3920:217-306(-) -36.6 ((((((..((.((..((((.(((((.(((((((((.((.((.......))..)).))))))))).)))))))))..)).)).)))))).
pva --------------GGGUCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUCA-AGCCGAGAAAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCCCACAGAGGCCCAGG----------------- ENSEMBL GeneScaffold_2563:16751-16840(-) -35.2 (((((..((.((..((((.(((((.(((((((((.((.((.......))..)).))))))))).)))))))))..)).)).)))))...
eeu -------GAGUGGUGGGCCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGU-G-AGCGAA--AAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCCCACAGAGGCCC-------------------- ENSEMBL GeneScaffold_5889:40389-40479(-) -35.9 .......(((((..((.((..((((.(((((.(((((((((.((...........)).))))))))).)))))))))..)).)).)))))
sar --------------------CCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGCCA-AGCCGU-AAGUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCUCACAGAGGCCC-------------------- ENSEMBL scaffold_141740:909-988(+) -29.3 ((((((..((((.(((((.(((((((((.((((......))...)).))))))))).)))))))))....))))))...
cho -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ete --------------GGGUCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUCU-AGCCGGGAAAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCCCACAGAGGCCCAG------------------ ENSEMBL scaffold_232887:8625-8713(-) -36.8 (((((..((.((..((((.(((((.(((((((((.((.(((....)))...)).))))))))).)))))))))..)).)).)))))..
laf -----------GUUGGGUCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUCU-AGCUGAGAAAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCCCACAGAGGCCCAG------------------ ENSEMBL scaffold_26:22278048-22278139(+) -37.6 ..((((((..((.((..((((.(((((.(((((((((.((.(((.....)))..)).))))))))).)))))))))..)).)).)))))).
pca -------------UGGGUCACCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUCU-AGCUGAGAAAUCCAGCACUGUCCGGUAAGAUGCCCACAGAGGCCCAG------------------ ENSEMBL scaffold_25591:6222-6311(+) -37.4 ((((((..((.((..((((.(((((.(((((((((.((.(((.....)))..)).))))))))).)))))))))..)).)).)))))).
meu -----------------CCCUCUUUAAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAAUGC-AUCCAA-AAAUCCAGCACUGUCUAGUAAGAUGCCCACAGAGGCCCA------------------- ENSEMBL Scaffold20221:9757-9840(+) -27.72 .(((((.....((((.((((.((((((((((.((.............)).)))))))))).)))))))).....)))))....
mdo -----------------CCCUCUUUAAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUAC-AUCCAA-AAAUCCAGCACUGUCUAGUAAGAUGCCCACAGAGGCCCA------------------- UCSC ENSEMBL 4:389169606-389169689(-) -28.52 .(((((.....((((.((((.((((((((((.((.............)).)))))))))).)))))))).....)))))....
oan -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
gga ------------UGGUUCACCCUUUAAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAAUAG-AUCCAAGAAAUCCAGCACUGUCUAGUAAGAUGCCCACAGAGGACCACU----------------- UCSC ENSEMBL 21:2583316-2583407(+) -27.04 ((((....(((((...((((.((((.((((((((((.((..............)).)))))))))).)))))))).....)))))))))..
mga ------------UGGUUCACCCUUUAAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAAUAG-AUCCAAGAAAUCCAGCACUGUCUAGUAAGAUGCCCACAGAGGACCAUU----------------- UCSC ENSEMBL 23:2750744-2750835(+) -27.14 ((((....(((((...((((.((((.((((((((((.((..............)).)))))))))).)))))))).....)))))))))..
tgu ------GCGGUUUGGAUCACCCUUUAAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAGUAG-AGGCAGCAAAUCCAGCACUGUCUAGUAAGAUGCCCACAGAGGACCAGCAAGUCCGGC-------- ENSEMBL 21:5894301-5894407(-) -30.74 .(((((((......(((((...((((.((((.((((((((((.((..............)).)))))))))).)))))))).....))))).....)))).)))..
aca --------------------CCUUUGAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAAUCA-GAGCACACAAUCCAGCACUGUCUAGUAAGAUGUCCACAGAGG----------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_876:288031-288108(-) -28.44 ((((((.(((((.((((.((((((((((.((..............)).)))))))))).)))))))))...))))))
xtr -------------------CUCUUUAAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAAAAG-AUAAAAUAAAUCCAGCACUGUCUAGUAAGAUGUCCAUAGAGG----------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_985:54453-54531(-) -27.34 ((((....(((((.((((.((((((((((.((..............)).)))))))))).)))))))))....)))).
dre -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
gac ----------------------AGGAAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAACAACAGACGUACAAUCCAGCACUGUCGGGUAAGAUGGAUCCU--------------------------- UCSC ENSEMBL groupXII:5709509-5709581(-) -29.9 ((((..((((.(((((.(((((((((.((...((....))....)).))))))))).)))))))))..))))
ola -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tru --------------------CCAGAAAACAUCGUUACCAGACAGUGUUAGAACAACAGUAGUACAAUCCAGCACUGUCGGGUAAGAUGGAUCCUGA------------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_147:355849-355925(+) -27.1 .(((....((((.(((((.(((((((((.((...((....))....)).))))))))).)))))))))....))).
tni -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cin -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
csa -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
************************* * ************ ********
************************* * ************ ******** * *
** ************************* * ************** ******** *****
**** ************************* * ************** ******** ***** **
***** ************************* * *************** ******** ***** ** **
***** ************************* * *************** ********* ******** **
***** ************************* * ** *************** ****************** **
***** *************************** *** *************** *********************
* ********************************* *** *************** **********************
* * ********************************* *** ***************** **********************
* * *********************************** **** ****************************************
*** ************************************ **** *****************************************
**************************************** **** *****************************************
**************************************** **** *****************************************
**************************************** ***********************************************
**************************************** ***********************************************
**************************************** ***********************************************
***************************************** ***********************************************
****************************************** ***********************************************
****************************************** ************************************************
****************************************** ************************************************
****************************************** ************************************************
****************************************** ************************************************
****************************************** *************************************************
* * ****************************************** *************************************************
* ********************************************** *************************************************
**************************************************** *************************************************
**************************************************** ************************************************* *
******************************************************************************************************** *
*************************************************************************************************************************