hsa AGUAGAUGAUGGUUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- UCSC ENSEMBL 1:198828176-198828274(+) -27.4 ..........((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)))))).
ptr -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ggo ---AGAUGAUGGUUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- ENSEMBL 1:179080574-179080669(-) -27.4 .......((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)))))).
ppy AGUAGAUGAUGGUUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- UCSC ENSEMBL 1:51520583-51520681(-) -27.4 ..........((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)))))).
mml -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cja AGUAGAUGAUGGUUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- ENSEMBL Contig113:2035763-2035861(+) -27.4 ..........((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)))))).
tsy --------AUGGUUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- ENSEMBL scaffold_499:98431-98521(-) -27.4 ..((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)))))).
mmr -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
oga AGUAGAUGAUGGUUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- ENSEMBL GeneScaffold_3076:487937-488035(+) -27.4 ..........((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)))))).
tbe ---AGAUGAUGGUUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUAU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- ENSEMBL GeneScaffold_3262:381881-381976(+) -27.4 .......((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)))))).
cpo AGUAGAUGAUGGUUGGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_12:23445085-23445183(-) -27.4 ..........((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)))))).
dor AGUAGAUGCUGGGUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- ENSEMBL scaffold_6873:44488-44586(-) -27.7 ..........((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)).))))
mmu -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
rno AGUAGAUAAUGGUUAGCUAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUUA-UUUG-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCUGUGAGCCAGAGGUGUGCUG miRbase UCSC ENSEMBL 13:51132498-51132614(-) -30.22 ((((.((..(((((.(((.(((...(((.((((((((((.((((((.............)))).)).))))..)))))).)))...))).)))........)))))...)).)))).
str --------AUGGUUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- ENSEMBL GeneScaffold_616:165775-165865(+) -27.4 ..((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)))))).
opr -GCAGAUCAUGGUUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUUCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCUGUAAACUCUG--------- ENSEMBL GeneScaffold_513:263017-263124(+) -31.1 .((((.((.((((.((..(((...(((.((((((((((.((..(((((........)))))..)).))))..)))))).)))...)))..)))))))).....))))
ocu AGUAGAUGAUGGUUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- ENSEMBL scaffold_46:2137236-2137334(-) -27.4 ..........((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)))))).
bta ---------UGGUUGGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUUUAAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- UCSC ENSEMBL 16:76125609-76125699(+) -27.7 .((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((........)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)))))).
ttr ---------UGGUUGGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1955:326237-326326(+) -27.4 .((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)))))).
vpa ---------UGGUUGGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUUAAAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- ENSEMBL GeneScaffold_1782:788531-788621(+) -27.7 .((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((........)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)))))).
ssc --------AUGGUUGGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUG-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- ENSEMBL 10:22839358-22839448(+) -27.4 ..((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)))))).
cfa AGUAGAUGAUGGUUAGCUAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- UCSC ENSEMBL 7:7011704-7011802(-) -29.7 ..........((((.(((.(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...))).))))))).
fca AGUAGAUGAUGGUUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- ENSEMBL scaffold_128991:52017-52115(+) -27.4 ..........((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)))))).
eca -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
mlu --------AUGGUUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-CUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAAACCU------------------ ENSEMBL scaffold_130180:4760-4851(+) -27.1 ..((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)).)))).
pva --UGGGUGACGGUUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-CUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCUAAAACU------------- ENSEMBL scaffold_5866:91337-91439(-) -27.2 ..(((...((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..))))))....)))
eeu AGUAGAUGAUGGGUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCGACCU------------------- ENSEMBL scaffold_377500:31118-31216(+) -27.7 ..........((((.((..(((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))..)).))))
sar -----------GGUAGCCUUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- ENSEMBL scaffold_247753:110631-110718(+) -29.2 (((.((.((((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))).)).))).
cho AGUAGAUGAUGGUUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCUCUGAAGCAACCU------------------- ENSEMBL scaffold_27452:9329-9427(-) -30.8 ..........((((.((..(((((.(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).))).)))))..)))))).
ete -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
laf AGUAGAUGUUGGUUAGCCUUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCU------------------- ENSEMBL scaffold_13:2235762-2235860(+) -29.5 ..........((((.((.((((...(((.((((((((((.((((((.((.......)).)))).)).))))..)))))).)))...)))).)))))).
pca ------CGAUGGUUAGCCAUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUGA-UUUU-AAUCCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCUUUCA--------------- ENSEMBL scaffold_24587:23951-24047(-) -27.4 .((.((((.((..(((...(((.((((((((((.((..((((..........))))..)).))))..)))))).)))...)))..))))))..)).
meu ------UGGCGGUUAGCUGUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUCA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCUCAAA--------------- ENSEMBL Scaffold9678:21564-21660(-) -27.52 (((.((((.(((.(((...(((.((((((((((.((((((.............)))).)).))))..)))))).)))...))).))))))))))..
mdo -----AUGGUGGUUAGCUGUAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUCA-UUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCUCA----------------- UCSC ENSEMBL 2:99873062-99873157(+) -27.02 .(((.((((.(((.(((...(((.((((((((((.((((((.............)))).)).))))..)))))).)))...))).))))))))))
oan ---------UGGUU-GCCGCAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUCUA-CUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACC-------------------- UCSC ENSEMBL 4:46540180-46540267(-) -29.12 .((((((..(((...(((.((((((((((.((((((.............)))).)).))))..)))))).)))...)))..))))))
gga --------AUGGUUAGCUGGAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUCA-CUUA-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCAC------------------ UCSC ENSEMBL 8:2001567-2001658(-) -27.32 .(((((.(((..((...(((.((((((((((.((((((.............)))).)).))))..)))))).)))...))..)))))))).
mga --------AUGGUUAGCUGGAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUCA-CUUA-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCAC------------------ UCSC ENSEMBL 10:9291747-9291838(+) -27.32 .(((((.(((..((...(((.((((((((((.((((((.............)))).)).))))..)))))).)))...))..)))))))).
tgu --------AUGGUUAGCUGGAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUCA-CUUU-AAUUCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCAC------------------ ENSEMBL 8:5108650-5108741(+) -27.32 .(((((.(((..((...(((.((((((((((.((((((.............)))).)).))))..)))))).)))...))..)))))))).
aca --------AUGGUUAGCUGGAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUCA-CUUU-AAUCCCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAAGCAACCAC------------------ UCSC ENSEMBL scaffold_286:1630591-1630682(-) -27.32 .(((((.(((..((...(((.((((((((((.((((((.............)))).)).))))..)))))).)))...))..)))))))).
xtr -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dre --------GGGCUCGGCCGCAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUUUUCCAUUUAGCUCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGAGGCAAACGGUGGCCU------------ UCSC ENSEMBL 22:24052688-24052787(+) -30.86 ((((((((((.(((...(((.((((((((((.((((((...............)))).)).))))..)))))).)))...))).)))...))..)))))
gac ------------CUCUCCACAGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUCC-CAACAUGGCAGAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACUGGGGCGA---------------------- UCSC ENSEMBL groupVIII:10666126-10666210(-) -27.3 .((.((.(((...(((.((((((((((.(((((((.((.....))..))))).)).))))..)))))).)))...))).)).))
ola -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
tru ---------------GCCACGGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUUC-CAAUUUAGCUCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACCGGGGCGA---------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_43:1123969-1124050(+) -27.34 (((.(((...(((.((((((((((.((((((..............)))).)).))))..)))))).)))...))).)))..
tni ---------------GCCACGGGGUACAAUCAACGGUCGAUGGUUUUUC-CAAUUUGGCUCAAACUCACCGACAGCGUUGAAUGUUCACCGGGGC------------------------ UCSC ENSEMBL 1:18565254-18565333(+) -28.9 (((.(((...(((.((((((((((.((((((..((.....))...)))).)).))))..)))))).)))...))).)))
cin -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
csa -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
dme -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
cel -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
* ************************* ************************** * * **
** ************************** ***************************** * ** *
** *************************** * ******************************* ** *
* ** *************************** * ******************************** ** * *
** * ** *************************** * * *** ************************************* *
** * ** *************************** * *** *** ****************************************
**** ** *************************** * *** ********************************************
***** ** *************************** * *** ********************************************
***** *** *************************** * *** ********************************************
***** *** **************************** * *** ********************************************
************************************** * *** *********************************************
************************************** * **** *********************************************
**************************************** **** *********************************************
***************************************** **** *********************************************
***************************************** **** *********************************************
***************************************** **** *********************************************
***************************************** **** *********************************************
***************************************** **** *********************************************
* ***************************************** **** *********************************************
******************************************* **** *********************************************
********************************************* **** *********************************************
********************************************** **** *********************************************
********************************************** **** *********************************************
************************************************ **** *********************************************
************************************************* **** *********************************************
************************************************* **** *********************************************
************************************************* **** *********************************************
************************************************* **** *********************************************
************************************************* **** *********************************************
************************************************* **** *********************************************
************************************************* **** *********************************************
************************************************* **** **********************************************
************************************************* **** ********************************************** *
************************************************* **************************************************** *
************************************************* ****************************************************** *
************************************************* *********************************************************
***********************************************************************************************************************