hsa ------GGAUUGC-CUAGCAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUA-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGAAACUCUGUAG-- UCSC ENSEMBL 18:56118295-56118396(-) -41.3 (((...((((((((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....))))))))).)))....))).... ptr ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ggo ------GGAUUGC-CUAGCAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUA-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGAAACUCUGUAG-- ENSEMBL 18:56518541-56518642(-) -41.3 (((...((((((((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....))))))))).)))....))).... ppy ------GGAUUGC-CUAGCAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUA-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGAGAAUCUGUAG-- UCSC ENSEMBL 18:71133214-71133315(-) -44.0 (((((.((((((((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....))))))))).)))..))))).... mml ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cja ------GGAUUGC-CUAGCAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUA-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGAAAAUCUGUAG-- ENSEMBL Contig89:4785354-4785455(+) -43.1 (((((.((((((((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....))))))))).)))..))))).... tsy ------GGAUGGC-CUAGCAAUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGG------------- ENSEMBL scaffold_10398:13529-13619(+) -34.7 ......(((((((..((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....)))).)))).))) mmr ------GGAUUGC-CUAGCAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGAAACUCUGUAG-- ENSEMBL GeneScaffold_216:300455-300556(-) -41.3 (((...((((((((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....))))))))).)))....))).... oga ------GGAUUGC-CUAGCAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGCUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGAAACUCUGUAG-- ENSEMBL GeneScaffold_251:486506-486607(-) -41.3 (((...((((((((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....))))))))).)))....))).... tbe ------GGAUUGC-CUAGCAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGCUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGAGAAUCUG----- ENSEMBL GeneScaffold_234:361216-361314(-) -44.0 (((((.((((((((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....))))))))).)))..))))). cpo -------GGAUUGCCUAGCAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCAUA-GCUCUGCUAAGGAGAGUCCGUAG-- UCSC ENSEMBL scaffold_14:7085925-7086026(+) -50.3 (((((.((((((((.((((((..(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))..))))))))))).)))..))))).... dor -------------CUUAGCAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUG-GACACAAACACCAAUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGAAAGUCAGUAG-- ENSEMBL GeneScaffold_297:170867-170962(-) -37.9 ((((((((.((((....(((((((((.(((.(((((............))))).))).)))))))))....))))))))))))............ mmu ---GACGGAUUGC-CUAGCAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUGGUUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGAAAGUCUGU---- UCSC ENSEMBL 18:65408497-65408599(-) -49.0 .(((((((.((((((((.((((....(((((((((((((.(((((.((.......))))))).)))))))))))))....))))))))).)))..))))))) rno GUAGACGGAUAGC-CUAGCAGUAGCUGUUUAGUGUGAUGAUGGCGUUUGAUGUUUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCAGA-GCUCUGCUAAGGAGAGUCUGUAGGC miRbase UCSC ENSEMBL 18:61512734-61512842(-) -50.9 ((..((((((..((((((((.((((....(((((((..((((.(((((.((((...))))))))).))))..)))))))....))))))))).)))...))))))..)) str ------GGAUUGCGCUAACAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUU-GAUAGUUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACAAGCUCUGCUAAGGAGAAUCUGU---- ENSEMBL GeneScaffold_256:347006-347106(-) -30.5 (((((...((..(((.((((....(((((((((((((.(((....((....))...))).))))))))))))).....)))))))....))..))))).. opr ------GGAUGGC-CUAGCAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGA------------ ENSEMBL GeneScaffold_189:350845-350936(-) -40.2 ......((((((((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....))))))))).))). ocu ------GGAUGGC-CUAGCAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGA------------ ENSEMBL scaffold_38:1288134-1288225(-) -40.2 ......((((((((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....))))))))).))). bta ------GGAUUGC-CUAACAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGG------------- UCSC ENSEMBL 24:59932223-59932313(-) -33.1 ......(((..(((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....)))))))...))) ttr ------GGAUGGC-CUAACAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUGGUUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGUUAAGGA------------ ENSEMBL GeneScaffold_3405:4694-4785(-) -40.4 ......((((((((.((((....(((((((((((((.(((((.((.......))))))).)))))))))))))....))))))))).))). vpa ------GGAUUGC-CUAACAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUG-GCCACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGAAACUCUGUAG-- ENSEMBL GeneScaffold_238:794329-794430(-) -35.3 (((...(((..(((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....)))))))...)))....))).... ssc ------GGAUUGC-CUAACAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGA------------ ENSEMBL 1:169284206-169284297(+) -34.2 ......(((..(((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....)))))))...))). cfa ------GGAUUGC-CUAACAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGAAAAUCUGUAG-- UCSC ENSEMBL 1:20601538-20601639(+) -37.1 (((((.(((..(((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....)))))))...)))..))))).... fca ------GGAUUGC-CUAACAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGACAGUUUG-CACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGAAAAUCUGUAG-- ENSEMBL scaffold_154375:79473-79574(-) -37.1 (((((.(((..(((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....)))))))...)))..))))).... eca ------GGAUUGC-CUAACAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGAAAAUCUGUAG-- UCSC ENSEMBL 8:75662519-75662620(-) -37.1 (((((.(((..(((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....)))))))...)))..))))).... mlu ------GGAUUGC-CUAACAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGA------------ ENSEMBL GeneScaffold_268:299192-299283(-) -34.2 ......(((..(((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....)))))))...))). pva ------GGAUUGC-CUAACAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGUUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGA------------ ENSEMBL GeneScaffold_3851:1337-1428(-) -34.2 ......(((..(((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....)))))))...))). eeu ------GGAUGGC-CUAACAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGAUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGA------------ ENSEMBL scaffold_377570:4111-4202(+) -34.2 ......(((..(((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....)))))))...))). sar ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cho ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ete ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------- laf ----GAGGAUUGC-CUAACAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUA-UUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGGAGACUCUGUAGG- ENSEMBL scaffold_4:41108792-41108895(+) -37.6 (((.....(((..(((.((((....(((((((((((((.(((((...........))))).)))))))))))))....)))))))...)))...)))...... pca ------GGAUUGC-CUAACAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUC-UUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUGCUAAGG------------- ENSEMBL scaffold_26464:12483-12572(+) -34.4 ......(((..(((.((((....(((((((((((((.(((((.((....))..))))).)))))))))))))....)))))))...))) meu ------------------CAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGACUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCAUA-GCUCUG------------------- ENSEMBL Scaffold19812:5393-5466(+) -34.1 (((.((((((..(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))..))))))))) mdo ------------------CAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGACUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCAUA-GCUCUG------------------- UCSC ENSEMBL 3:247368065-247368138(+) -34.1 (((.((((((..(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))..))))))))) oan ------------------CAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGACUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUG------------------- UCSC ENSEMBL 3:28911040-28911113(-) -30.5 (((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....))))))) gga ------------------CAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGAUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUG------------------- UCSC ENSEMBL Z:649337-649410(-) -30.5 (((.((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....))))))) mga ------------------CAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGAUUG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCAUA-GCUCUG------------------- UCSC ENSEMBL Z:41662-41735(-) -34.1 (((.((((((..(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))..))))))))) tgu ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------- aca --------------CUAGCAGUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGACGGAUUG-GAUACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCCAGC----------------- UCSC ENSEMBL scaffold_63:4307949-4308028(-) -28.6 ...((...((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....))))...)) xtr -----------------GCAGUAGCUCAUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGCUCU-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCAUA-GCUC--------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_228:287748-287820(-) -27.5 .....((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....)))). dre ---------------------UGGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGACGACAGAUGAUACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUG------------------- UCSC ENSEMBL 21:8712765-8712836(+) -27.42 .((((....(((((((((((((.(((((.............))))).)))))))))))))....))))... gac --------------------GUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUACACAG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCAAA-GCUC--------------------- UCSC ENSEMBL groupXIV:3950425-3950494(+) -27.5 ..((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....)))). ola --------------------GUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAUAGGCAG-GAAACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUG------------------- UCSC ENSEMBL 12:9243579-9243650(-) -27.5 ..((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....))))... tru --------------------GUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAAAGAAAG-GAAACAAACACCAUUGUCACACUCCAUA-GCUCUG------------------- UCSC ENSEMBL scaffold_44:1155535-1155606(-) -31.1 ..((((((..(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))..))))))... tni --------------------GUAGCUAUUUAGUGUGAUAAUGGCGUUUGAAAGAAAG-GACACAAACACCAUUGUCACACUCCACA-GCUCUG------------------- UCSC ENSEMBL 4:6516666-6516737(-) -27.5 ..((((....(((((((((((((.(((((............))))).)))))))))))))....))))... cin ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------- csa ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------- dme ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------- cel ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------- * *** ********** ******** ** ********** ************ * **** ***** *********************** ** *********************** * **** ****************************** ** *********************** * **** ****************************** ** *********************** * ****** ****************************** ************************** * ****** ********************************* * ************************** * ****** *********************************** ** ************************** * ****** *********************************** ** ************************** * ****** *********************************** *** **************************** ****** *********************************** *** **************************** ****** *********************************** *** **************************** ****** ** *********************************** *** **************************** ****** *** *********************************** *** **************************** ****** ***** * *** *********************************** *** **************************** ************ **** ** *** *********************************** *** **************************** ************ **** ** *** *************************************** **************************** ************* **** ** *** *************************************** **************************** ************* **** ** *** *************************************** **************************** ************* **** ** *** *************************************** **************************** ************* ******* *** *************************************** **************************** ************* ******* *** *************************************** **************************** ************* ******* *** *************************************** **************************** ************* ******* *** *************************************** **************************** ************* * ** * ******* ******************************************* **************************** ************* * ** ** ******* ******************************************* **************************** ************* * ***** ******* ******************************************* **************************** ************* * ******* ******* ******************************************* **************************** ************* * ******* ******* ******************************************* **************************** ************* * ******* ******* ******************************************* **************************** *************** ******* ******* ******************************************* **************************** *************** ******* ******* ******************************************* **************************** *************** ******* ******* ******************************************* **************************** *************** ******* ******* ******************************************* **************************** *********************** ******* ******************************************* **************************** *********************** ******* ******************************************* **************************** *********************** ******* ******************************************* **************************** *********************** ******* ******************************************* **************************** *********************** ****************************************************** **************************** ************************ ****************************************************************************************************************