hsa -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- UCSC ENSEMBL 17:1617199-1617280(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
ptr ---------------------------------------------------------------------------------------
ggo -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL 17:1661568-1661649(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
ppy -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- UCSC ENSEMBL 17:1575638-1575719(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
mml ---------------------------------------------------------------------------------------
cja -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCGGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL Contig421:586044-586125(-) -31.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.....((....)).)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
tsy -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL scaffold_133461:5280-5361(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
mmr -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL GeneScaffold_4022:12042-12123(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
oga -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL GeneScaffold_2745:203700-203781(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
tbe -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL GeneScaffold_4359:88010-88091(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
cpo -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- UCSC ENSEMBL scaffold_32:20705564-20705645(-) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
dor -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL GeneScaffold_600:80447-80528(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
mmu -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- UCSC ENSEMBL 11:75277224-75277305(-) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
rno -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- UCSC ENSEMBL 10:62782729-62782810(-) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
str ---------------------------------------------------------------------------------------
opr -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL scaffold_1014:161665-161746(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
ocu -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL scaffold_36:13435646-13435727(-) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
bta -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- miRbase UCSC ENSEMBL 19:22901896-22901976(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
ttr -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL GeneScaffold_3352:224727-224808(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
vpa -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL GeneScaffold_2598:13813-13894(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
ssc -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL 12:45319041-45319122(-) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
cfa -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- UCSC ENSEMBL 9:49177545-49177626(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
fca -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL GeneScaffold_1115:435620-435701(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
eca ---------------------------------------------------------------------------------------
mlu -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL GeneScaffold_4428:165301-165382(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
pva -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL GeneScaffold_2866:54304-54385(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
eeu -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL scaffold_232603:1655-1736(-) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
sar -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL GeneScaffold_604:85478-85559(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
cho ---------------------------------------------------------------------------------------
ete ---------------------------------------------------------------------------------------
laf -CAGAGGGCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGUCA---GGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUACUGCGGCUCAG-- ENSEMBL scaffold_47:4903007-4903088(+) -32.6 ..(((.(((..(((((((((..(((((((((((.((......))...)))))).))))).)))))))))..)))..)))..
pca ---------------------------------------------------------------------------------------
meu -----------CAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGACA---AGACAUAAAGCUCGCCACUGAAGAACUGCUGUGGCUC---- ENSEMBL GeneScaffold_7565:66691-66760(+) -28.6 ((((((((((..(((((((((((.((......))...))))))).)))).)))))))))).........
mdo -----------CAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUGGGACA---AGACAUAAAGCUCGCCACUGAAGAACUGCUGUGGCUC---- UCSC ENSEMBL 2:517205535-517205604(+) -28.6 ((((((((((..(((((((((((.((......))...))))))).)))).)))))))))).........
oan ---------------------------------------------------------------------------------------
gga --------CAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCUACUAGAGAAGGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUGCUGC--------- UCSC ENSEMBL 19:5352111-5352181(+) -28.9 ((.((((((((((..(((((((((((....((.....))....)))))).))))).)))))))))).)).
mga --------CAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGAUACUAGAGAAGGACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUGCUGC--------- UCSC ENSEMBL 21:5872708-5872778(+) -28.9 ((.((((((((((..(((((((((((....((.....))....)))))).))))).)))))))))).)).
tgu ---------------------------------------------------------------------------------------
aca ---------------------------------------------------------------------------------------
xtr GCCACUUUCAACAGUUCUUCAACUGGCAGCUUUAGCACAGAGG-AACAACAUAAAGCUUGCCACUGAAGAACUGCUUCUAGCGGGCC UCSC ENSEMBL scaffold_184:1524291-1524377(+) -30.89 (((.((.....((((((((((..(((((((((((................)))))).))))).)))))))))).....))..))).
dre --------CAACAGUUCUUCAGCUGGCAGCUUUAGCUGGUACACAAGGACAUAAAGCUUGCCAGUGAAGAACUGCUGC--------- UCSC ENSEMBL 15:25105989-25106059(+) -32.3 ((.((((((((((.((((((((((((....((........)).)))))).)))))))))))))))).)).
gac --------CAACAGUUCUUCAGCUGGCAGCUUUAGCUGGUAGAUGAGGACAUAAAGCUUGCCAGUGAAGAACUGCUG---------- UCSC ENSEMBL groupI:7684503-7684572(+) -31.9 ((.((((((((((.((((((((((((....((........)).)))))).)))))))))))))))).))
ola --------CAACAGUUCUUCAGCUGGCAGCUUUAGCUGGUGCACGAGAACAUAAAGCUUGCCAGUGAAGAACUGCUG---------- UCSC ENSEMBL 13:16589482-16589551(+) -32.7 ((.((((((((((.((((((((((((....((........)).)))))).)))))))))))))))).))
tru --------CAACAGUUCUUCAGCUGGCAGCUUUAGCUGUUGCACGAGGACAUAAAGCUUGCCAGUGAAGAACUGCUG---------- UCSC ENSEMBL scaffold_9:2572431-2572500(+) -32.7 ((.((((((((((.((((((((((((..((((.......)))))))))).)))))))))))))))).))
tni --------CAACAGUUCUUCAGCUGGCAGCUUUAGCGGUUGCACGAGGACAUAAAGCUUGCCAGUGAAGAACUGCUG---------- UCSC ENSEMBL 10:10460516-10460585(-) -33.2 ((.((((((((((.((((((((((((...(((.......))).)))))).)))))))))))))))).))
cin ---------------------------------------------------------------------------------------
csa ---------------------------------------------------------------------------------------
dme ---------------------------------------------------------------------------------------
cel ---------------------------------------------------------------------------------------
********** ************* ********** **** ********* **
********** ************** * ********** **** ********* ***
************* ************** * **************** ********* ***
************* **************** * ***************** ********* ***
************* **************** ** ***************** ********* ***
******************************* ** *************************** ***
******************************* ** *************************** ****
******************************** ** *************************** ****
******************************** ** *************************** *********
* ******************************** ** *************************** ********* *
****************************************** ***************************************
****************************************** ***************************************
****************************************** ***************************************
****************************************** ***************************************
****************************************** ***************************************
****************************************** ***************************************
****************************************** ***************************************
****************************************** ***************************************
****************************************** ***************************************
****************************************** ***************************************
****************************************** ***************************************
****************************************** ***************************************
****************************************** ***************************************
****************************************** ***************************************
****************************************** ***************************************
****************************************** ***************************************
****************************************** ***************************************
****************************************** ****************************************
****************************************** ****************************************
****************************************** ****************************************
****************************************** ****************************************
************************************************************************************
************************************************************************************
************************************************************************************
***************************************************************************************